From: The effect of measurement error of phenotypes on genome wide association studies
SNP | Â | gene symbol | Â | Chr | Â | position (bp) | Â | Allele | Â | fA | Â | b (mm) | Â | s.e. | Â | P |
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CHILLP8 | ||||||||||||||||
ARS-BFGL- NGS-97163 |  | proximal SOX14 |  | 1 |  | 133446995 |  | G |  | 0.01 |  | 2.85 |  | 0.64 |  | 1.1 × 10-5 |
BTB- 00174922 |  | proximal SEMA3D |  | 4 |  | 36143304 |  | C |  | 0.98 |  | -2.77 |  | 0.64 |  | 1.9 × 10-5 |
BTB- 00174955 |  | proximal SEMA3D |  | 4 |  | 36253391 |  | G |  | 0.98 |  | -2.77 |  | 0.64 |  | 1.9 × 10-5 |
Hapmap55575- rs29016266 |  | UNC5C |  | 6 |  | 31006416 |  | C |  | 0.31 |  | 0.77 |  | 0.19 |  | 6.1 × 10-5 |
ARS-BFGL- NGS-100395 |  | TNC |  | 8 |  | 109649680 |  | C |  | 0.23 |  | -0.81 |  | 0.20 |  | 4.6 × 10-5 |
BTB- 01530788 |  | XKR4 |  | 14 |  | 22720373 |  | C |  | 0.21 |  | 1.06 |  | 0.22 |  | 1.6 × 10-6 |
BTB- 01530836 |  | XKR4 |  | 14 |  | 22768980 |  | G |  | 0.79 |  | -1.08 |  | 0.22 |  | 1.2 × 10-6 |
BTB- 00557585 |  | XKR4 |  | 14 |  | 22803366 |  | C |  | 0.21 |  | 1.02 |  | 0.22 |  | 4.4 × 10-5 |
BTB- 00557532 |  | distal XKR4 |  | 14 |  | 22838801 |  | G |  | 0.21 |  | 0.93 |  | 0.22 |  | 2.8 × 10-5 |
Hapmap53460- rs29027620 |  | SUCLG2 |  | 22 |  | 34764990 |  | G |  | 0.41 |  | -0.69 |  | 0.17 |  | 3.5 × 10-5 |
P8FAT | ||||||||||||||||
Hapmap42233- BTA-49670 |  | proximal LOC615631 |  | 1 |  | 83842132 |  | C |  | 0.83 |  | -1.08 |  | 0.27 |  | 8.7 × 10-5 |
Hapmap50089- BTA-75090 |  | DMC1 |  | 5 |  | 117300831 |  | G |  | 0.06 |  | -2.12 |  | 0.44 |  | 1.8 × 10-6 |
ιHapmap55575- rs29016266 |  | UNC5C |  | 6 |  | 31006416 |  | C |  | 0.30 |  | 0.94 |  | 0.24 |  | 9.8 × 10-5 |
BTB- 00529060 |  | TLE1 |  | 8 |  | 60156808 |  | G |  | 0.18 |  | -1.21 |  | 0.31 |  | 8.8 × 10-5 |
Hapmap32434- BTC-011497 |  | NSMAF |  | 14 |  | 24607054 |  | G |  | 0.65 |  | 0.94 |  | 0.21 |  | 7.4 × 10-6 |
UA-IFASA- 7902 |  | TOX |  | 14 |  | 24933303 |  | C |  | 0.46 |  | 0.85 |  | 0.22 |  | 9.0 × 10-5 |