Table 2 Previously annotated protein coding genes predicted herein to be miRNA genes in tammar
From: Unique small RNA signatures uncovered in the tammar wallaby genome
miRNA count | Ensembl Meug 1.0 annotation | Symbol | Hairpin alignment | mRNA | mirBase |
|---|---|---|---|---|---|
1389 | ENSMEUG00000014939 | PANK3 | ((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(((......)))))))))))))).)))))).))))))).))))........(((((((......))))))). | X | age-mir-103 |
1145 | ENSMEUG00000004480 | NFYC | ((((((.((..((((...)))).))))))))(((((((.((((((((((((((((.(((((((((((........)))))))))))))))))))))))))))))))))). | X | eca-mir-30e |
554 | ENSMEUG00000000911 | CDC20B | ......((((.(((…))).))))..((.(((((((((((((((((((((.((.(((((((........))))))))).)))).))))))))))))))))).)). | X |  |
349 | ENSMEUG00000016575 | HOXD4 | .(((.(((((((....))).)))).))).(((((.((((((((.((((.(((((.((((((((((........)))))))))).))))))))).)))))))).))))). | X | aca-mir-10b |
79 | ENSMEUG00000012110 | PFDN5 | …((((((((((((...((((.((.......)).))))))))))((((((((.((...)).))))))))...)))))).....((((...)))). |  |  |
26 | ENSMEUG00000012937 | BCAS3 | ......((((.((((((((.......)))))))).))))(((((((.(((…((.((.(((…(((((((…)))))))..))).)).)).)))))))))). |  |  |
26 | ENSMEUG00000008344 | MYOZ2 | (((((((.((((.((.(((((((((((((.......((.((((…(((((((......))))))))))).))))))))))))))).)))))).)))…)))). | X |  |
26 | ENSMEUG00000004683 | GRIA1 | ...(((...(((((.((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))..))))))).(((.((((…)))))))...))))))))....))).. | X |  |