From: Discovering chromatin motifs using FAIRE sequencing and the human diploid genome
Region | Motif | Antisense motif | P value | Annotation | Ref | ||
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TFe | hDPI logo | hDPI motif | |||||
Genome-wide regions | CACGTG | CACGTG | 7.61E-08 | Â | USF1 USF2 | MAX USF1 USF2 CREB1 TSNAX ZBTB7A TFEB IRF3 MLX | |
 | CTCCTGAC | GTCAGGAG | 2.36E-06 | RXR/RAR |  |  | |
 | CTGCAG | CTGCAG | 3.34E-06 |  |  | MAX IRF3 ZBTB25 | [21] |
 | TTTAGTAGAG | CTCTACTAAA | 3.42E-06 |  |  |  |  |
 | AGTAGAGA | TCTCTACT | 5.71E-06 |  |  |  |  |
 | GTGAAACCC | GGGTTTCAC | 7.98E-06 |  | HCFC2 ZNF193 RAB18 |  | [28] |
 | GGTGAAACCC | GGGTTTCACC | 1.23E-05 |  | HCFC2 ZNF193 RAB18 |  | [28] |
 | CTCCTGACCT | AGGTCAGGAG | 1.33E-05 | RXR/RAR | RXRA CREB1 ZNF313 ZNF655 | MAX USF2 RCOR3 RBM9 GLRX2 ZNF606 CBFA2T3 YBX1 HTATIP IRF3 ESRRA | |
 | AGGTCAGGA | TCCTGACCT | 1.41E-05 | RXR/RAR | RXRA CREB1 ZNF313 ZNF655 | MAX USF2 RCOR3 RBM9 GLRX2 ZNF606 CBFA2T3 YBX1 HTATIP IRF3 ESRRA | |
 | TCAGGA | TCCTGA | 1.85E-05 |  |  |  |  |
Intergenic regions | CACGTG | CACGTG | 1.53E-07 | Â | USF1 USF2 | MAX USF1 USF2 CREB1 TSNAX ZBTB7A TFEB IRF3 MLX | |
 | TGTATACA | TGTATACA | 1.59E-05 |  |  |  |  |
 | ATCACAA | TTGTGAT | 2.45E-05 | SOX9 |  |  | [25] |
 | ATGTATACA | TGTATACAT | 3.20E-05 |  |  |  |  |
 | GGGTTTCAC | GTGAAACCC | 3.63E-05 |  | HCFC2 ZNF193 RAB18 |  | [28] |
 | GGTGAAACCC | GGGTTTCACC | 5.67E-05 |  | HCFC2 ZNF193 RAB18 |  | [28] |
 | ATGTATACAT | ATGTATACAT | 5.87E-05 |  |  |  |  |
 | GGTGAAAC | GTTTCACC | 8.17E-05 |  | ZNF193 RAB18 |  |  |
 | CCCGGG | CCCGGG | 1.24E-04 |  |  |  |  |
 | GGTGAAACC | GGTTTCACC | 1.37E-04 |  | ZNF193 RAB18 |  |  |
Genic regions | CAGGCTGGA | TCCAGCCTG | 1.58E-06 | Â | Â | Â | Â |
 | ACTCCAGCCT | AGGCTGGAGT | 2.46E-06 |  |  |  |  |
 | CTCCAGCCTG | CAGGCTGGAG | 2.66E-06 |  |  |  |  |
 | TCCAGCCTGG | CCAGGCTGGA | 6.96E-06 |  | PIR | MAX SIRT2 ZNF34 RFXANK ZBTB7A SCAND2 TSNAX KHDRBS1 ZNF655 TP73 IRF3 NFATC1 | [21] |
 | AGGCTGGA | TCCAGCCT | 6.96E-06 |  |  |  |  |
 | GGAGGA | TCCTCC | 1.16E-05 |  |  |  |  |
 | CTCCAGCCT | AGGCTGGAG | 1.17E-05 |  |  |  |  |
 | TCAGAT | ATCTGA | 1.57E-05 |  |  |  |  |
 | GGAGTG | CACTCC | 1.57E-05 |  |  |  |  |
 | CACTCCA | TGGAGTG | 2.17E-05 | MEF2A |  |  | [27] |