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Table 1 Number and chromosomal location of CT genes in human and chimpanzee

From: Rapid evolution of cancer/testis genes on the X chromosome

CT Number

Family Name

Human Chromosome

Human Gene Number

Chimpanzee Chromosome

Chimpanzee Gene Number

CT1

MAGEA

X

13 (0)

X

9 (0)

CT2

BAGE

5, 7, 9, 18, 21

7 (0)

7, 9, 18

4 (0)

CT3

MAGEB

X

7 (1)

X

7 (1)

CT4

GAGE

X

16 (0)

X

3 (0)

CT5

SSX

X

14 (0)

X

8 (0)

CT6

CTAG

X

3 (0)

X

1 (0)

CT7

MAGEC

X

2 (0)

X

1 (0)

CT8

SYCP1

1

1 (0)

1

1 (0)

CT9

BRDT

1

1 (0)

1

1 (0)

CT10

MAGEE

X

2 (2)

X

1 (1)

CT11

SPANX

X

11 (0)

X

4 (0)

CT12

XAGE

X

14 (0)

X

12 (0)

CT13

DDX43

6

1 (0)

6

1 (0)

CT14

SAGE

X

1 (0)

X

1 (0)

CT15

ADAM2

4, 8

2 (0)

4, 8

2 (0)

CT16

PAGE

X

7 (0)

X

6 (0)

CT17

LIPI

21

2 (0)

-

0 (0)

CT21

CTAGE

2, 6, 7, 9, 10, 13, 14, 18

21 (12)

2B, 6, 7, 9, 10, 13, 14, 18

15 (6)

CT24

CSAG

X

4 (0)

X

2 (0)

CT25

DSCR8

21

2 (0)

-

0 (0)

CT26

DDX53

X

1 (1)

X

1 (1)

CT27

CTCFL

20

1 (0)

20

1 (0)

CT28

LUZP4

X

1 (0)

X

1 (0)

CT29

CASC5

15

1 (0)

15

1 (0)

CT30

TFDP3

13, 15, X

4 (3)

15, X

2 (2)

CT32

LDHC

11

1 (0)

11

1 (0)

CT33

MORC1

3

1 (0)

3

1 (0)

CT34

DKKL1

19, 20

2 (1)

19, 20

2 (1)

CT35

SPO11

20

1 (0)

20

1 (0)

CT36

CRISP2

6

1 (0)

6

1 (0)

CT37

FMR1NB

X

1 (0)

X

1 (0)

CT38

FTHL17

X

4 (4)

X

5 (5)

CT39

NXF2

X

2 (0)

X

1 (0)

CT41

TDRD

6, 10

2 (0)

6, 10

2 (0)

CT42

TEX15

8

1 (0)

8

1 (0)

CT43

FATE1

X

1 (0)

X

1 (0)

CT44

TPTE

13, 21, Y

4 (0)

13

1 (0)

CT45

CT45

X

6 (0)

X

4 (0)

CT46

HORMAD1

1, 6

2 (1)

1, 6

2 (1)

CT47

LOC255313

X

12 (0)

X

2 (0)

CT48

SLCO6A1

5

1 (0)

5

1 (0)

CT49

TAG

5

1 (0)

5

1 (0)

CT50

LEMD1

1

1 (0)

1

1 (0)

CT51

HSPB9

17

1 (1)

17

1 (1)

CT53

ZNF165

6

1 (0)

6

1 (0)

CT54

SPACA3

17

1 (0)

-

0 (0)

CT55

CXorf48

X

3 (0)

X

1 (0)

CT56

THEG

19

1 (0)

19

1 (0)

CT57

ACTL8

1

1 (0)

1

1 (0)

CT58

NALP4

19

1 (0)

19

1 (0)

CT59

COX6B2

19

1 (0)

19

1 (0)

CT60

BC047459

15

2 (0)

Un

1 (0)

CT61

CCDC33

15

1 (0)

15

1 (0)

CT62

BC048128

15

1 (0)

15

1 (0)

CT63

PASD1

X

1 (0)

X

1 (0)

CT65

TULP2

19

1 (0)

19

1 (0)

CT66

AA884595

7

1 (1)

7

1 (1)

CT68

MGC27016

4

1 (0)

4

1 (0)

CT69

BC040308

6

1 (0)

6

1 (0)

CT71

SPINLW1

20

1 (0)

20

1 (0)

CT72

TSSK6

19

1 (1)

-

0 (0)

CT73

ADAM29

4

1 (0)

4

1 (0)

CT74

CCDC36

3

1 (0)

3

1 (0)

CT75

BC033986

2

1 (0)

2B

1 (0)

CT76

SYCE1

10

1 (0)

10

1 (0)

CT77

CPXCR1

X

1 (0)

X

1 (1)

CT78

TSPY1

Y

14 (0)

Y

22 (0)

CT79

TSGA

2, 21

3 (0)

2A

1 (0)

CT81

ARMC3

10

1 (0)

10

1 (0)

CTNA

PRAME

1, 22

36 (0)

1, 22, Un

37 (0)

  1. CT gene families are presented in numerical order according to proposed nomenclature [1]. The largest family, PRAME, has not yet been assigned official CT designation. Total gene number for each family was determined according to sequence identity and completeness (see Methods). Numbers in brackets denote the number of intronless gene copies, which in the case of multi-exon genes may indicate putative retrocopy genes.