Skip to main content

Table 8 Micromass culture-derived gene sets are enriched in DEX-treated primary chondrocytes (d3 vs d15_2). I.

From: Expression profiling of Dexamethasone-treated primary chondrocytes identifies targets of glucocorticoid signalling in endochondral bone development

HUGO gene symbol

Rank

RMS

RES

Itgbl1

32

0.391

0.015

Adrb2

54

0.308

0.026

Bst1

80

0.271

0.036

Gpx3

83

0.269

0.047

Myocd

90

0.259

0.058

Grk5

105

0.229

0.066

Ids

123

0.212

0.074

Ms4a6b

140

0.200

0.082

1810057c19rik

146

0.193

0.090

Igfbp2

149

0.190

0.097

Zfp36

218

0.159

0.100

Serpina3n

222

0.158

0.107

P2ry6

225

0.157

0.113

Adm

228

0.156

0.120

Crym

277

0.145

0.123

Ppap2a

303

0.139

0.128

Pycard

307

0.138

0.133

Kcns1

320

0.134

0.138

Cd80

321

0.134

0.144

Trim24

330

0.133

0.149

C1qtnf6

339

0.131

0.154

A330049m08rik

377

0.127

0.157

Adamts15

385

0.126

0.162

Elovl4

398

0.124

0.167

C1qa

402

0.124

0.172

Sox9

434

0.119

0.175

Htra3

455

0.116

0.179

Adam17

483

0.112

0.182

Mgll

493

0.112

0.186

Ibsp

507

0.110

0.190

C1qb

511

0.109

0.194

Bambi

516

0.109

0.199

Anxa4

551

0.105

0.201

Cd109

555

0.105

0.206

Nrk

559

0.104

0.210

Gstm1

619

0.099

0.211

Asb4

634

0.097

0.214

Pygl

654

0.095

0.217

Rasl11b

655

0.095

0.221

Cdc42ep4

674

0.093

0.224

Slc9a3r2

683

0.092

0.227

Lama1

688

0.092

0.231

Bb146404

707

0.091

0.234

Ai194308

724

0.090

0.237

Smn1

752

0.088

0.239

Alcam

772

0.087

0.242

Cst3

790

0.086

0.244

Pyp

847

0.083

0.245

2700017m01rik

870

0.082

0.247

Fgfr3

884

0.081

0.250

Mrpl34

912

0.080

0.252

C9orf46

972

0.077

0.252

Maf

981

0.077

0.255

8430420c20rik

1028

0.075

0.255

Gfm2

1030

0.075

0.259

Anxa6

1041

0.075

0.261

Isg20

1064

0.074

0.263

Auh

1068

0.074

0.266

Bsg

1100

0.072

0.267

Peg3

1179

0.070

0.266

Adam23

1208

0.069

0.268

Ezh1

1213

0.069

0.270

2810022l02rik

1214

0.069

0.273

0610011i04rik

1248

0.068

0.274

Pbx2

1257

0.067

0.277

Jup

1291

0.066

0.278

Zcwcc2

1301

0.066

0.280

Whsc2

1317

0.066

0.282

2410004l22rik

1344

0.065

0.283

Lmnb2

1388

0.064

0.284

Fndc1

1435

0.063

0.284

Rarres2

1460

0.062

0.285

Tap2

1512

0.061

0.285

Ctbs

1559

0.060

0.285

Jdp2

1574

0.059

0.287

Hck

1712

0.056

0.282

5031400m07rik

1792

0.054

0.281

Pkn1

1839

0.053

0.280

Dag1

1929

0.052

0.278

Fth1

1976

0.051

0.278

1110001e17rik

1979

0.051

0.280

Rbp4

1984

0.051

0.282

Pdcd6ip

2044

0.050

0.281

Siat7d

2050

0.050

0.283

Kcnd2

2074

0.050

0.284

2310004k06rik

2076

0.050

0.286

D19ertd678e

2106

0.049

0.286

Npdc1

2114

0.049

0.288

Fts

2116

0.049

0.290

Prickle1

2123

0.049

0.291

1110037f02rik

2171

0.048

0.291

Cdc42se1

2246

0.047

0.289

Chpt1

2261

0.047

0.290

Wwp2

2341

0.045

0.288

Dact1

2363

0.045

0.289

Rragd

2380

0.045

0.290

Irf5

2406

0.044

0.291

Nrbf2

2414

0.044

0.292

Cox4i2

2436

0.044

0.293

Bmp7

2456

0.044

0.294

1810008a18rik

2517

0.043

0.292

Asph

2533

0.043

0.293

Stat2

2550

0.042

0.294

Hoxa11

2560

0.042

0.296

Bax

2599

0.042

0.295

Sspn

2611

0.042

0.297

Ifngr2

2612

0.042

0.298

Glrx1

2672

0.041

0.297

Gba

2739

0.040

0.295

Fzd2

2759

0.040

0.296

Crtap

2772

0.040

0.297

Slc1a5

2786

0.040

0.298

Slco3a1

2831

0.039

0.297

3110040n11rik

2833

0.039

0.299

Tep1

2845

0.039

0.300

Fastk

2860

0.039

0.301

Tmed3

2869

0.038

0.302

Ephb4

2876

0.038

0.303

Asah2

2908

0.038

0.303

Pold4

2989

0.037

0.301

1110001a07rik

2995

0.037

0.302

Pcp4

3010

0.037

0.303

Mab21l2

3025

0.037

0.304

  1. Rank = position of genes in the context of the ranked list of array genes
  2. RMS = the ranked metric score
  3. RES = the running enrichment score