Table 2 Length and number of DNA fragments produced by cleavage of Alu repeats
From: A physical map of human Alu repeats cleavage by restriction endonucleases
Enzyme | Fragment length* | Positions* | Number of sequences, thousands | Total bp number in DNA fragment, millions bp | Total bp number in selected DNA fragment(s), millions bp |
|---|---|---|---|---|---|
AluI | 92 ± 2 | 136–228 | 9,9 | 0,9 |  |
|  | 80 ± 2 | 136–216 | 2,3 | 0,2 |  |
|  | 60 ± 2 | 168–228 | 151,8 | 9,1 | 9,1 |
|  | 48 ± 2 | 168–216 | 98,7 | 4,8 | 4,8 |
|  | 32 ± 2 | 136–168 | 221,8 | 7,1 | 7,1 |
|  | 12 ± 2 | 216–228 | 20,3 | 0,2 |  |
AsuHPI | 198 ± 3 | 61–259 | 13,6 | 2,7 |  |
|  | 159 ± 3 | 100–259 | 86,8 | 13,7 | 13,7 |
|  | 39 ± 2 | 61–100 | 97,0 | 3,9 |  |
Bpu10I | 135 ± 3 | 46–181 | 107,7 | 14,5 | 14,5 |
Bst2UI | 252 ± 4 | 3–255 | 10,4 | 2,6 |  |
|  | 202 ± 4 | 3–205 | 18,1 | 3,7 |  |
|  | 184 ± 3 | 71–255 | 4,4 | 0,8 |  |
|  | 167 ± 3 | 88–255 | 102,0 | 17,0 | 17,0 |
|  | 135 ± 3 134 ± 3 | 3–138 71–205 | 15,5 10,3 | 2,1 1,4 |  |
|  | 117 ± 3 117 ± 3 | 88–205 138–255 | 172,2 66,8 | 20,1 7,8 | 27,9 |
|  | 85 ± 2 | 3–88 | 123,7 | 10,5 | 10,5 |
|  | 68 ± 2 | 3–71 | 41,0 | 2,8 |  |
|  | 67 ± 2 | 138–205 | 125,1 | 8,4 | 11,8 |
|  | 67 ± 2 | 71–138 | 9,3 | 0,6 |  |
|  | 50 ± 2 | 88–138 | 139,5 | 6,9 | 22,9 |
|  | 50 ± 2 | 205–255 | 323,7 | 16,0 |  |
|  | 17 ± 2 | 71–88 | 110,0 | 2,0 |  |
BssECI | 208 ± 4 | 47–255 | 47,8 | 9,9 | 9,9 |
|  | 166 ± 3 | 89–255 | 15,8 | 2,6 |  |
|  | 158 ± 3 | 47–205 | 217,6 | 34,3 | 34,3 |
|  | 116 ± 3 | 89–205 | 53,5 | 6,2 | 6,2 |
|  | 50 ± 2 | 205–255 | 405,6 | 20,3 | 20,3 |
|  | 42 ± 2 | 47–89 | 41,5 | 1,7 |  |
BstDEI | 183 ± 3 | 47–230 | 2,3 | 0,4 |  |
|  | 165 ± 3 | 65–230 | 4,7 | 0,8 |  |
|  | 135 ± 3 | 47–182 | 68,1 | 9,2 | 9,2 |
|  | 126 ± 3 | 47–173 | 34,6 | 4,3 |  |
|  | 117 ± 3 | 65–182 | 114,1 | 13,3 | 13,3 |
|  | 108 ± 3 | 65–173 | 53,8 | 5,8 | 5,8 |
|  | 57 ± 2 | 173–230 | 6,7 | 0,4 |  |
|  | 48 ± 2 | 182–230 | 133,7 | 6,4 | 6,4 |
|  | 18 ± 2 | 47–65 | 65,4 | 1,2 |  |
BstMAI | 198 ± 3 | 80–278 | 38,6 | 7,6 | 7,6 |
|  | 190 ± 3 | 80–270 | 58,7 | 11,1 | 11,1 |
|  | 167 ± 3 | 111–278 | 78,9 | 13,1 | 13,1 |
|  | 159 ± 3 | 111–270 | 125,4 | 19,9 | 19,9 |
|  | 31 ± 2 | 80–111 | 235,0 | 7,3 | 7,3 |
|  | 8 ± 1 | 270–278 | 167,6 | 1,3 |  |
HinfI | 79 ± 2 | 193–272 | 144,4 | 11,4 | 11,4 |