Table 1 Distribution of small RNA sequences among the different categories in the 24 °C and 37 °C treatment libraries constructed from in vitro-grown pear shoots
| Â | T24 | T37 | ||
|---|---|---|---|---|
Unique sRNA reads (percent %) | Total sRNA reads (percent %) | Unique sRNA reads (percent %) | Total sRNA reads (percent %) | |
Total | 5529063 (100Â %) | 22592997 (100Â %) | 3974771 (100Â %) | 20411254 (100Â %) |
Exon antisense | 30748 (0.56Â %) | 113906 (0.5Â %) | 28998 (0.73Â %) | 96547 (0.47Â %) |
Exon sense | 50164 (0.91Â %) | 145765 (0.65Â %) | 46755 (1.18Â %) | 113202 (0.55Â %) |
Intron antisense | 154430 (2.79Â %) | 498616 (2.21Â %) | 116982 (2.94Â %) | 3441841 (1.69Â %) |
Intron sense | 264322 (4.78Â %) | 1148358 (5.08Â %) | 215436 (5.42Â %) | 856349 (4.2Â %) |
miRNA | 20376 (0.37Â %) | 9547708 (42.26Â %) | 18595 (0.47Â %) | 11115138 (54.46Â %) |
rRNA | 91764 (1.66Â %) | 1174482 (5.2Â %) | 92261 (2.32Â %) | 1337417 (6.55Â %) |
Repeat | 2480 (0.04Â %) | 8235 (0.04Â %) | 1913 (0.05Â %) | 5485 (0.03Â %) |
snRNA | 4025 (0.07Â %) | 10705 (0.05Â %) | 4470 (0.11Â %) | 13331 (0.07Â %) |
snoRNA | 1365 (0.02Â %) | 2996 (0.01Â %) | 1591 (0.04Â %) | 3814 (0.02Â %) |
tRNA | 7596 (0.14Â %) | 125805 (0.56Â %) | 9030 (0.23Â %) | 172127 (0.84Â %) |
Unannotated | 4901793 (88.66Â %) | 9816421 (43.45Â %) | 3438740 (86.51Â %) | 6353660 (31.13Â %) |