Table 4 Validation of PR gene induction by qRT-PCR
| Â | Â | P. palmivora treatment | C. theobromicola treatment | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Â | Gene ID | Microarray fold induction | qRT-PCR fold induction | Microarray fold induction | qRT-PCR fold induction |
PR-1Â s | Tc01_g003940 | N.S. | Transcript not detected | N.S. | Transcript not detected |
Tc01_g034430 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc02_g002380 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc02_g002390 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc02_g002400 | N.S. | N.S. | N.S. | 8.3 (p = .001) | |
Tc02_g002410 | 125.4 | 763 (p < .001) | 91.3 | 55.7 (p < .001) | |
Tc02_g002420 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc02_g002430 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc02_g010380 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc05_g005530 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc09_g000720 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc09_g016580 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc09_g016590 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc10_g000980 | N.S. | Transcript not detected | N.S. | Transcript not detected | |
PR-3 s | Tc01_g000770 | 33.6 | 70.2 (p < .001) | 18.8 | 13.8 (p = .01) |
Tc02_g003890 | 27.1 | Transcript not detected | 22.31 | Transcript not detected | |
Tc04_g018100 | 22.5 | 5086.0 (p < .001) | 8.3 | 36.7 (p = .019) | |
Tc04_g018110 | 29.2 | 763.2 (p < .000) | 11.5 | 13.7 (p = .041) | |
Tc04_g018160 | 63.6 | 158.4 (p = .003) | 73 | 65.6 (p = .001) | |
Tc06_g000490 | N.S. | 3.4 (p = .016) | N.S | N.S. | |
PR-4Â s | Tc00_g012980 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. |
Tc05_g027210 | 24.9 | 1027.7 (p < .001) | 14.9 | 22.7 (p = .01) | |
Tc05_g027220 | 11.1 | 258.9 (p = .001) | 6.7 | N.S. | |
Tc05_g027230 | N.S. | 164.1 (p = .011) | N.S. | N.S. | |
Tc05_g027250 | N.S. | N.S. | N.S. | N.S. | |
Tc05_g027320 | 53.4 | 29.3 (p = .009) | 17.8 | 8.9 (p = .001) | |
Tc10_g011130 | N.S. | 61.5 (p < .001) | N.S. | N.S. | |
PR-10s | Tc01_g031100 | 39.7 | 28.0 (p = .019) | 57.2 | 32.3 (p = .002) |
Tc04_g028780 | 25.5 | 32.9 (p = .027) | 25.5 | 41.6 (p = .004) | |
Tc04_g028860 | 6.02 | 24.3 (p = .038) | 53.4 | 96.8 (p = .001) | |