Skip to main content

Table 3 HD-Zip duplication events identified in kiwifruit

From: Genome-wide analysis and expression profiling of the HD-ZIP gene family in kiwifruit

Species

Duplicate pairs

Ka

Ks

Ka/Ks

Duplication

Duplication date (Mya)

A. chinensis

AcHB1/AcHB36

0.220

1.420

0.155

WGD

47.33

AcHB1/AcHB20

0.068

0.235

0.289

WGD

7.85

AcHB2/AcHB27

0.334

1.698

0.197

WGD

56.59

AcHB2/AcHB28

0.310

1.989

0.156

WGD

66.30

AcHB2/AcHB65

0.140

0.767

0.183

WGD

25.58

AcHB2/AcHB13

0.138

0.852

0.162

WGD

28.41

AcHB2/AcHB25

0.028

0.226

0.122

WGD

7.55

AcHB3/AcHB32

0.214

0.792

0.270

WGD

26.40

AcHB3/AcHB24

0.072

0.198

0.366

WGD

6.59

AcHB4/AcHB66

0.158

0.845

0.187

WGD

28.18

AcHB4/AcHB14

0.146

1.070

0.136

WGD

35.66

AcHB5/AcHB7

0.072

0.185

0.392

WGD

6.15

AcHB6/AcHB49

0.082

0.215

0.379

WGD

7.18

AcHB7/AcHB18

0.391

2.696

0.145

WGD

89.85

AcHB10/AcHB19

0.041

0.194

0.212

WGD

6.48

AcHB12/AcHB16

0.267

1.072

0.249

WGD

35.74

AcHB13/AcHB25

0.139

0.716

0.194

WGD

23.86

AcHB26/AcHB29

0.069

0.158

0.435

WGD

5.27

AcHB27/AcHB28

0.047

0.175

0.266

WGD

5.84

AcHB27/AcHB65

0.312

1.512

0.206

WGD

50.41

AcHB27/AcHB13

0.299

1.929

0.155

WGD

64.31

AcHB27/AcHB25

0.328

1.368

0.240

WGD

45.58

AcHB28/AcHB65

0.303

1.284

0.236

WGD

42.81

AcHB28/AcHB13

0.298

1.443

0.206

WGD

48.10

AcHB28/AcHB25

0.301

1.471

0.205

WGD

49.02

AcHB30/AcHB48

0.091

0.996

0.091

WGD

33.20

AcHB30/AcHB58

0.089

0.957

0.093

WGD

31.88

AcHB31/AcHB68

0.171

0.880

0.195

WGD

29.34

AcHB31/AcHB64

0.205

2.075

0.099

WGD

69.17

AcHB31/AcHB70

0.016

0.126

0.129

WGD

4.21

AcHB31/AcHB12

0.220

1.557

0.141

WGD

51.91

AcHB31/AcHB16

0.097

0.926

0.105

WGD

30.85

AcHB32/AcHB24

0.226

0.773

0.292

WGD

25.77

AcHB33/AcHB21

0.021

0.310

0.067

WGD

10.32

AcHB34/AcHB40

0.163

2.704

0.060

WGD

90.12

AcHB35/AcHB7

0.461

1.435

0.321

WGD

47.83

AcHB35/AcHB18

0.449

2.219

0.202

WGD

73.96

AcHB36/AcHB37

0.126

0.726

0.173

WGD

24.19

AcHB36/AcHB59

0.130

0.688

0.189

WGD

22.92

AcHB36/AcHB20

0.335

1.365

0.246

WGD

45.50

AcHB37/AcHB59

0.021

0.143

0.150

WGD

4.75

AcHB37/AcHB20

0.247

1.550

0.159

WGD

51.68

AcHB39/AcHB59

0.319

2.012

0.158

WGD

67.05

AcHB39/AcHB22

0.043

0.268

0.161

WGD

8.94

AcHB40/AcHB44

0.066

0.793

0.083

WGD

26.44

AcHB40/AcHB50

0.073

0.812

0.090

WGD

27.05

AcHB40/AcHB23

0.031

0.146

0.213

WGD

4.86

AcHB41/AcHB61

0.036

0.153

0.234

WGD

5.10

AcHB41/AcHB15

0.331

2.083

0.159

WGD

69.43

AcHB42/AcHB60

0.039

0.141

0.278

WGD

4.69

AcHB44/AcHB50

0.027

0.175

0.155

WGD

5.83

AcHB44/AcHB23

0.065

0.809

0.080

WGD

26.96

AcHB45/AcHB51

0.050

0.162

0.308

WGD

5.39

AcHB46/AcHB52

0.029

0.177

0.163

WGD

5.89

AcHB48/AcHB58

0.022

0.113

0.193

WGD

3.75

AcHB53/AcHB62

0.054

0.453

0.120

WGD

15.11

AcHB53/AcHB69

0.052

0.441

0.119

WGD

14.70

AcHB54/AcHB60

0.453

2.059

0.220

WGD

68.63

AcHB55/AcHB21

0.241

3.356

0.072

WGD

111.88

AcHB57/AcHB67

0.030

0.171

0.176

WGD

5.70

AcHB59/AcHB20

0.236

1.196

0.198

WGD

39.87

AcHB61/AcHB15

0.365

1.628

0.224

WGD

54.27

AcHB62/AcHB69

0.019

0.127

0.149

WGD

4.24

AcHB63/AcHB11

0.046

0.217

0.212

WGD

7.24

AcHB64/AcHB70

0.197

1.697

0.116

WGD

56.57

AcHB64/AcHB12

0.036

0.209

0.174

WGD

6.96

AcHB64/AcHB16

0.252

1.597

0.158

WGD

53.24

AcHB65/AcHB13

0.032

0.214

0.152

WGD

7.12

AcHB65/AcHB25

0.158

0.656

0.241

WGD

21.85

AcHB66/AcHB14

0.064

0.195

0.327

WGD

6.49

AcHB68/AcHB70

0.181

0.813

0.223

WGD

27.09

AcHB68/AcHB16

0.073

0.158

0.459

WGD

5.28

AcHB70/AcHB16

0.106

0.851

0.125

WGD

28.36

A. eriantha

AeHB3/AeHB14

0.155

0.845

0.184

WGD

28.17

AeHB3/AeHB22

0.034

0.211

0.163

WGD

7.04

AeHB3/AeHB51

0.141

0.700

0.202

WGD

23.34

AeHB4/AeHB27

0.216

0.813

0.266

WGD

27.10

AeHB5/AeHB15

0.139

0.955

0.146

WGD

31.85

AeHB5/AeHB52

0.184

0.931

0.197

WGD

31.03

AeHB6/AeHB8

0.070

0.211

0.332

WGD

7.04

AeHB7/AeHB41

0.152

0.288

0.527

WGD

9.61

AeHB8/AeHB17

0.368

1.484

0.248

WGD

49.48

AeHB8/AeHB31

0.422

1.225

0.344

WGD

40.83

AeHB9/AeHB13

0.149

0.701

0.213

WGD

23.37

AeHB14/AeHB22

0.148

0.769

0.193

WGD

25.62

AeHB14/AeHB51

0.042

0.237

0.178

WGD

7.91

AeHB15/AeHB52

0.126

0.276

0.459

WGD

9.19

AeHB16/AeHB35

0.326

1.388

0.235

WGD

46.27

AeHB16/AeHB48

0.316

1.249

0.253

WGD

41.63

AeHB16/AeHB50

0.542

2.289

0.237

WGD

76.30

AeHB17/AeHB31

0.420

1.877

0.224

WGD

62.56

AeHB21/AeHB24

0.267

2.158

0.124

WGD

71.94

AeHB21/AeHB33

0.057

0.229

0.248

WGD

7.64

AeHB22/AeHB51

0.148

0.577

0.257

WGD

19.23

AeHB23/AeHB34

0.034

0.152

0.226

WGD

5.07

AeHB24/AeHB28

0.176

0.939

0.188

WGD

31.29

AeHB24/AeHB33

0.217

2.306

0.094

WGD

76.86

AeHB25/AeHB50

0.203

2.236

0.091

WGD

74.54

AeHB25/AeHB55

0.018

0.120

0.148

WGD

4.00

AeHB29/AeHB33

0.251

3.008

0.084

WGD

100.26

AeHB32/AeHB46

0.138

0.639

0.216

WGD

21.29

AeHB35/AeHB48

0.042

0.156

0.271

WGD

5.20

AeHB37/AeHB42

0.055

0.246

0.224

WGD

8.21

AeHB43/AeHB49

0.067

0.436

0.154

WGD

14.53

AeHB45/AeHB53

0.040

0.254

0.157

WGD

8.46

AeHB50/AeHB54

0.279

1.315

0.212

WGD

43.84

AeHB50/AeHB55

0.190

1.561

0.121

WGD

52.02