Skip to main content

Table 1 Read Statistics

From: Bos taurus genome assembly

 

Btau 1.0

Btau 2.0

Btau 3.1

Btau 4.0

InsertSize(kb)

2 to 4

4 to 6

2 to 4

4 to 6

2 to 6

200

2 to 6

200

Source/Vector

Plasmid

Plasmid

Plasmid

Plasmid

Plasmid

BAC

Plasmid

BAC

Reads (million)

        

WGS

        

All WGS

14.09

1.41

NA

NA

26.98

0.21

26.98

0.21

   Total

15.51

27.2

27.19

27.19

Trimmed

11.72

1.15

19

4

23.09

0.17

23.09

0.17

   Total

12.88

23

23.26

23.26

Paired

11.01

1.07

5

5.2

NA

NA

NA

NA

   Total

12.08

10.2

NA

NA

Assembled

8.98

0.89

14.9

3.2

18.74

0.11

18.74

0.11

   Total

9.87

18.1

18.86

18.86

Unassembled

0.39

0.04

0.31

0.06

NA

NA

NA

NA

   Total

0.43

0.37

NA

NA

Single BACs

        

All

NA

NA

NA

NA

6.42

NA

6.42

NA

   Total

NA

NA

6.42

6.42

Trimmed

NA

NA

NA

NA

5.11

NA

5.11

NA

   Total

NA

NA

5.11

5.11

Assembled

NA

NA

NA

NA

4.28

NA

4.28

NA

   Total

NA

NA

4.28

4.28

Pooled BACs

        

All

NA

NA

NA

NA

5.38

NA

5.38

NA

   Total

NA

NA

5.38

5.38

Trimmed

NA

NA

NA

NA

5.12

NA

5.12

NA

   Total

NA

NA

5.12

5.12

Assembled

NA

NA

NA

NA

2.92

NA

2.92

NA

   Total

NA

NA

2.92

2.92