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Table 5 SARAH1 Scale

From: A modular kernel approach for integrative analysis of protein domain boundaries

 

Amino acid

Binary code

 

Amino acid

Binary code

1

C

1,1,0,0,0

11

G

0,0,0,--1,--1

2

F

1,0,1,0,0

12

T

0,0, --1,0, --1

3

I

1,0,0,1,0

13

S

0,0, --1, --1,0

4

V

1,0,0,0,1

14

R

0, --1,0,0, --1

5

L

0,1,1,0,0

15

P

0, --1,0, --1,0

6

W

0,1,0,1,0

16

N

0, --1, --1,0,0

7

M

0,1,0,0,1

17

D

--1,0,0,0, --1

8

H

0,0,1,1,0

18

Q

--1,0,0, --1,0

9

Y

0,0,1,0,1

19

E

--1,0, --1,0,0

10

A

0,0,0,1,1

20

K

--1, --1,0,0,0