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Table 1 Compositional comparison of Core Islands e1-e5 (with relative dissimilarities of 10%) of Escherichia coli O157H7 with each other (underlined), and Genomic Islands with each other (bold)

From: A quantitative account of genomic island acquisitions in prokaryotes

    

Genomic dissimilarity values (δ*)

 

Start coordinate

End coordinate

size (bp)

E. coli

e1

e2

e3

e4

e5

GI8

GI24

GI25

E. coli

0

5498450

5498450

0

18,6

18,5

18,5

18,7

18,9

47,2

58,1

49,0

e1

4770000

4785000

15001

18,6

0

22,3

24,7

29,2

30,2

59,8

72,7

65,8

e2

2445000

2460000

15001

18,5

22,3

0

16,2

22,5

28,0

58,3

68,6

63,2

e3

1695000

1710000

15001

18,5

24,7

16,2

0

12,2

21,6

53,0

60,8

57,7

e4

135000

150000

15001

18,7

29,2

22,5

12,2

0

29,7

59,4

67,2

61,5

e5

1455000

1470000

15001

18,9

30,2

28,0

21,6

29,7

0

49,8

54,7

47,0

GI8

892240

903808

11568

47,2

59,8

58,3

53,0

59,4

49,8

0

24,4

24,9

GI24

2924490

2936721

12231

58,1

72,7

68,6

60,8

67,2

54,7

24,4

0

22,0

GI25

3193144

3204209

11065

49,0

65,8

63,2

57,7

61,5

47,0

24,9

22,0

0