Table 2 Compositional comparison of Core Islands r1-r5 (with relative dissimilarities of 10%) of Rhodobacter sphaeroides with each other (underlined), and Genomic Islands with each other (bold)
From: A quantitative account of genomic island acquisitions in prokaryotes
|  |  |  |  | Genomic dissimilarity values (δ*) | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Start coordinate | End coordinate | size (bp) | R. sphaeroides | r1 | r2 | r3 | r4 | r5 | GI1 | GI3 | GI4 |
R. sphaeroides | 0 | 3217726 | 3217726 | 0 | 16,3 | 16,9 | 16,8 | 16,8 | 16,9 | 42,1 | 40,6 | 44,0 |
r1 | 2400000 | 2415000 | 15001 | 16,3 | 0 | 25,9 | 26,2 | 22,1 | 29,9 | 41,7 | 43,7 | 45,9 |
r2 | 990000 | 1005000 | 15001 | 16,9 | 25,9 | 0 | 31,0 | 31,1 | 23,8 | 48,1 | 46,2 | 47,1 |
r3 | 1620000 | 1635000 | 15001 | 16,8 | 26,2 | 31,0 | 0 | 25,8 | 20,3 | 41,8 | 46,4 | 51,1 |
r4 | 2910000 | 2925000 | 15001 | 16,8 | 22,1 | 31,1 | 25,8 | 0 | 21,0 | 29,6 | 33,1 | 33,5 |
r5 | 2310000 | 2325000 | 15001 | 16,9 | 29,9 | 23,8 | 20,3 | 21,0 | 0 | 43,8 | 40,2 | 40,0 |
GI1 | 2883355 | 2905795 | 22440 | 42,1 | 41,7 | 48,1 | 41,8 | 29,6 | 43,8 | 0 | 16,9 | 18,9 |
GI3 | 2085503 | 2112636 | 27133 | 40,6 | 43,7 | 46,2 | 46,4 | 33,1 | 40,2 | 16,9 | 0 | 12,8 |
GI4 | 1575936 | 1597159 | 21223 | 44,0 | 45,9 | 47,1 | 51,1 | 33,5 | 40,0 | 18,9 | 12,8 | 0 |