TY - JOUR AU - Hu, H. AU - Xu, Y. AU - Chen, F. AU - Zhang, X. AU - Hur, B. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Isolation and characterization of a new fluorescent Pseudomonas strain that produces both phenazine 1-carboxylic acid and pyoluteorin JO - J Microbiol Biotechnol VL - 15 ID - Hu2005 ER - TY - JOUR AU - Ge, Y. AU - Huang, X. AU - Wang, S. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Phenazine-1-carboxylic acid is negatively regulated and pyoluteorin positively regulated by gacA in Pseudomonas sp. M18 JO - FEMS Microbiol Lett VL - 237 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2004.tb09676.x DO - 10.1111/j.1574-6968.2004.tb09676.x ID - Ge2004 ER - TY - JOUR AU - Ge, Y. AU - Pei, D. AU - Feng, P. AU - Huang, X. AU - Xu, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - Autoinduction of RpoS biosynthesis in the biocontrol strain Pseudomonas sp. M18 JO - Curr Microbiol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1007/s00284-006-0072-z DO - 10.1007/s00284-006-0072-z ID - Ge2007 ER - TY - JOUR AU - Wang, Y. AU - Huang, X. AU - Hu, H. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - QscR acts as an intermediate in gacA-dependent regulation of PCA biosynthesis in Pseudomonas sp. M18 JO - Curr Microbiol VL - 56 UR - https://doi.org/10.1007/s00284-007-9087-3 DO - 10.1007/s00284-007-9087-3 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Yan, A. AU - Huang, X. AU - Liu, H. AU - Dong, D. AU - Zhang, D. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - An rhl-like quorum-sensing system negatively regulates pyoluteorin production in Pseudomonas sp. M18 JO - Microbiology VL - 153 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.29211-0 DO - 10.1099/mic.0.29211-0 ID - Yan2007 ER - TY - JOUR AU - Chen, Y. AU - Wang, X. AU - Huang, X. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - Las-like quorum-sensing system negatively regulates both pyoluteorin and phenazine-1-carboxylic acid production in Pseudomonas sp. M18 JO - Sci China C Life Sci VL - 51 UR - https://doi.org/10.1007/s11427-008-0026-8 DO - 10.1007/s11427-008-0026-8 ID - Chen2008 ER - TY - JOUR AU - Zhang, X. AU - Wang, S. AU - Geng, H. AU - Ge, Y. AU - Huang, X. AU - Hu, H. AU - Xu, Y. PY - 2005 DA - 2005// TI - Differential regulation of rsmA gene on biosynthesis of pyoluteorin and phenazine-1-carboxylic acid in Pseudomonas sp. M18 JO - World J Microbiol Biotechnol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1007/s11274-004-6358-z DO - 10.1007/s11274-004-6358-z ID - Zhang2005 ER - TY - JOUR AU - Gurusiddaiah, S. AU - Weller, D. M. AU - Sarkar, A. AU - Cook, R. J. PY - 1986 DA - 1986// TI - Characterization of an antibiotic produced by a strain of Pseudomonas fluorescens inhibitory to Gaeumannomyces graminis var. tritici and Pythium spp JO - Antimicrob Agents Chemother VL - 29 UR - https://doi.org/10.1128/AAC.29.3.488 DO - 10.1128/AAC.29.3.488 ID - Gurusiddaiah1986 ER - TY - JOUR AU - Howell, C. R. AU - Stipanovic, R. D. PY - 1980 DA - 1980// TI - Suppression of Pythium ultimum-induced damping-off of cotton seedlings by Pseudomonas fluorescens and its antibiotic, pyoluteorin JO - Phytopathology VL - 70 UR - https://doi.org/10.1094/Phyto-70-712 DO - 10.1094/Phyto-70-712 ID - Howell1980 ER - TY - JOUR AU - Chin-A-Woeng, T. F. C. AU - Bloemberg, G. V. AU - van der Bij, A. J. AU - van der Drift, K. AU - Schripsema, J. AU - Kroon, B. AU - Scheffer, R. J. AU - Keel, C. AU - Bakker, P. AU - Tichy, H. V. PY - 1998 DA - 1998// TI - Biocontrol by phenazine-1-carboxamide-producing Pseudomonas chlororaphis PCL1391 of tomato root rot caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici JO - Molecular Plant-Microbe Interactions VL - 11 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.1998.11.11.1069 DO - 10.1094/MPMI.1998.11.11.1069 ID - Chin-A-Woeng1998 ER - TY - JOUR AU - Huang, J. AU - Xu, Y. AU - Zhang, H. AU - Li, Y. AU - Huang, X. AU - Ren, B. AU - Zhang, X. PY - 2009 DA - 2009// TI - Temperature-dependent expression of phzM and its regulatory genes lasI and ptsP in rhizosphere isolate Pseudomonas sp. strain M18 JO - Appl Environ Microbiol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01148-09 DO - 10.1128/AEM.01148-09 ID - Huang2009 ER - TY - JOUR AU - Mavrodi, D. V. AU - Blankenfeldt, W. AU - Thomashow, L. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Phenazine compounds in fluorescent Pseudomonas spp. biosynthesis and regulation JO - Annu Rev Phytopathol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.phyto.44.013106.145710 DO - 10.1146/annurev.phyto.44.013106.145710 ID - Mavrodi2006 ER - TY - JOUR AU - Gibson, J. AU - Sood, A. AU - Hogan, D. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Pseudomonas aeruginosa-Candida albicans interactions: localization and fungal toxicity of a phenazine derivative JO - Appl Environ Microbiol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01037-08 DO - 10.1128/AEM.01037-08 ID - Gibson2009 ER - TY - JOUR AU - Winstanley, C. AU - Langille, M. G. AU - Fothergill, J. L. AU - Kukavica-Ibrulj, I. AU - Paradis-Bleau, C. AU - Sanschagrin, F. AU - Thomson, N. R. AU - Winsor, G. L. AU - Quail, M. A. AU - Lennard, N. PY - 2009 DA - 2009// TI - Newly introduced genomic prophage islands are critical determinants of in vivo competitiveness in the Liverpool Epidemic Strain of Pseudomonas aeruginosa JO - Genome Res VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.086082.108 DO - 10.1101/gr.086082.108 ID - Winstanley2009 ER - TY - JOUR AU - Lu, J. AU - Huang, X. AU - Zhang, M. AU - Li, S. AU - Jiang, H. AU - Xu, Y. PY - 2009 DA - 2009// TI - The distinct quorum sensing hierarchy of las and rhl in Pseudomonas sp. M18 JO - Curr Microbiol VL - 59 UR - https://doi.org/10.1007/s00284-009-9483-y DO - 10.1007/s00284-009-9483-y ID - Lu2009 ER - TY - JOUR AU - Buysens, S. AU - Heungens, K. AU - Poppe, J. AU - Hofte, M. PY - 1996 DA - 1996// TI - Involvement of pyochelin and pyoverdin in suppression of Pythium-Induced damping-off of tomato by Pseudomonas aeruginosa 7NSK2 JO - Appl Environ Microbiol VL - 62 ID - Buysens1996 ER - TY - JOUR AU - Anjaiah, V. AU - Cornelis, P. AU - Koedam, N. PY - 2003 DA - 2003// TI - Effect of genotype and root colonization in biological control of fusarium wilts in pigeonpea and chickpea by Pseudomonas aeruginosa PNA1 JO - Can J Microbiol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1139/w03-011 DO - 10.1139/w03-011 ID - Anjaiah2003 ER - TY - JOUR AU - Bano, N. AU - Musarrat, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Characterization of a new Pseudomonas aeruginosa strain NJ-15 as a potential biocontrol agent JO - Curr Microbiol VL - 46 UR - https://doi.org/10.1007/s00284-002-3857-8 DO - 10.1007/s00284-002-3857-8 ID - Bano2003 ER - TY - JOUR AU - Kumar, R. S. AU - Ayyadurai, N. AU - Pandiaraja, P. AU - Reddy, A. V. AU - Venkateswarlu, Y. AU - Prakash, O. AU - Sakthivel, N. PY - 2005 DA - 2005// TI - Characterization of antifungal metabolite produced by a new strain Pseudomonas aeruginosa PUPa3 that exhibits broad-spectrum antifungal activity and biofertilizing traits JO - J Appl Microbiol VL - 98 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2004.02435.x DO - 10.1111/j.1365-2672.2004.02435.x ID - Kumar2005 ER - TY - JOUR AU - Li, Y. AU - Jiang, H. AU - Du, X. AU - Huang, X. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Enhancement of phenazine-1-carboxylic acid production using batch and fed-batch culture of gacA inactivated Pseudomonas sp. M18G JO - Bioresour Technol VL - 101 UR - https://doi.org/10.1016/j.biortech.2009.12.120 DO - 10.1016/j.biortech.2009.12.120 ID - Li2010 ER - TY - JOUR AU - Su, J. AU - Zhou, Q. AU - Zhang, H. AU - Li, Y. AU - Huang, X. AU - Xu, Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Medium optimization for phenazine-1-carboxylic acid production by a gacAqscR double mutant of Pseudomonas sp. M18 using response surface methodology JO - Bioresour Technol VL - 101 UR - https://doi.org/10.1016/j.biortech.2009.12.143 DO - 10.1016/j.biortech.2009.12.143 ID - Su2010 ER - TY - JOUR AU - Zhou, Q. AU - Su, J. AU - Jiang, H. AU - Huang, X. AU - Xu, Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Optimization of phenazine-1-carboxylic acid production by a gacA/qscR-inactivated Pseudomonas sp. M18GQ harboring pME6032Phz using response surface methodology JO - Appl Microbiol Biotechnol VL - 86 UR - https://doi.org/10.1007/s00253-010-2464-z DO - 10.1007/s00253-010-2464-z ID - Zhou2010 ER - TY - JOUR AU - Stover, C. K. AU - Pham, X. Q. AU - Erwin, A. L. AU - Mizoguchi, S. D. AU - Warrener, P. AU - Hickey, M. J. AU - Brinkman, F. S. AU - Hufnagle, W. O. AU - Kowalik, D. J. AU - Lagrou, M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen JO - Nature VL - 406 UR - https://doi.org/10.1038/35023079 DO - 10.1038/35023079 ID - Stover2000 ER - TY - JOUR AU - Lee, D. G. AU - Urbach, J. M. AU - Wu, G. AU - Liberati, N. T. AU - Feinbaum, R. L. AU - Miyata, S. AU - Diggins, L. T. AU - He, J. AU - Saucier, M. AU - Deziel, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genomic analysis reveals that Pseudomonas aeruginosa virulence is combinatorial JO - Genome Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2006-7-10-r90 DO - 10.1186/gb-2006-7-10-r90 ID - Lee2006 ER - TY - JOUR AU - Roy, P. H. AU - Tetu, S. G. AU - Larouche, A. AU - Elbourne, L. AU - Tremblay, S. AU - Ren, Q. AU - Dodson, R. AU - Harkins, D. AU - Shay, R. AU - Watkins, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Complete genome sequence of the multiresistant taxonomic outlier Pseudomonas aeruginosa PA7 JO - PLoS ONE VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0008842 DO - 10.1371/journal.pone.0008842 ID - Roy2010 ER - TY - JOUR AU - Wolfgang, M. C. AU - Kulasekara, B. R. AU - Liang, X. AU - Boyd, D. AU - Wu, K. AU - Yang, Q. AU - Miyada, C. G. AU - Lory, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Conservation of genome content and virulence determinants among clinical and environmental isolates of Pseudomonas aeruginosa JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 100 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0832438100 DO - 10.1073/pnas.0832438100 ID - Wolfgang2003 ER - TY - JOUR AU - Mathee, K. AU - Narasimhan, G. AU - Valdes, C. AU - Qiu, X. AU - Matewish, J. M. AU - Koehrsen, M. AU - Rokas, A. AU - Yandava, C. N. AU - Engels, R. AU - Zeng, E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Dynamics of Pseudomonas aeruginosa genome evolution JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 105 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0711982105 DO - 10.1073/pnas.0711982105 ID - Mathee2008 ER - TY - JOUR AU - Shao, Y. AU - He, X. AU - Harrison, E. M. AU - Tai, C. AU - Ou, H. Y. AU - Rajakumar, K. AU - Deng, Z. PY - 2010 DA - 2010// TI - mGenomeSubtractor: a web-based tool for parallel in silico subtractive hybridization analysis of multiple bacterial genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 38 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq326 DO - 10.1093/nar/gkq326 ID - Shao2010 ER - TY - JOUR AU - Delcher, A. L. AU - Phillippy, A. AU - Carlton, J. AU - Salzberg, S. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Fast algorithms for large-scale genome alignment and comparison JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.11.2478 DO - 10.1093/nar/30.11.2478 ID - Delcher2002 ER - TY - JOUR AU - Klockgether, J. AU - Munder, A. AU - Neugebauer, J. AU - Davenport, C. F. AU - Stanke, F. AU - Larbig, K. D. AU - Heeb, S. AU - Schock, U. AU - Pohl, T. M. AU - Wiehlmann, L. AU - Tummler, B. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome diversity of Pseudomonas aeruginosa PAO1 laboratory strains JO - J Bacteriol VL - 192 UR - https://doi.org/10.1128/JB.01515-09 DO - 10.1128/JB.01515-09 ID - Klockgether2010 ER - TY - JOUR AU - Winsor, G. L. AU - Van Rossum, T. AU - Lo, R. AU - Khaira, B. AU - Whiteside, M. D. AU - Hancock, R. E. AU - Brinkman, F. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Pseudomonas Genome Database: facilitating user-friendly, comprehensive comparisons of microbial genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn861 DO - 10.1093/nar/gkn861 ID - Winsor2009 ER - TY - JOUR AU - Raymond, C. K. AU - Sims, E. H. AU - Kas, A. AU - Spencer, D. H. AU - Kutyavin, T. V. AU - Ivey, R. G. AU - Zhou, Y. AU - Kaul, R. AU - Clendenning, J. B. AU - Olson, M. V. PY - 2002 DA - 2002// TI - Genetic variation at the O-antigen biosynthetic locus in Pseudomonas aeruginosa JO - J Bacteriol VL - 184 UR - https://doi.org/10.1128/JB.184.13.3614-3622.2002 DO - 10.1128/JB.184.13.3614-3622.2002 ID - Raymond2002 ER - TY - JOUR AU - He, J. AU - Baldini, R. L. AU - Deziel, E. AU - Saucier, M. AU - Zhang, Q. AU - Liberati, N. T. AU - Lee, D. AU - Urbach, J. AU - Goodman, H. M. AU - Rahme, L. G. PY - 2004 DA - 2004// TI - The broad host range pathogen Pseudomonas aeruginosa strain PA14 carries two pathogenicity islands harboring plant and animal virulence genes JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0304622101 DO - 10.1073/pnas.0304622101 ID - He2004 ER - TY - JOUR AU - Harrison, E. M. AU - Carter, M. E. AU - Luck, S. AU - Ou, H. Y. AU - He, X. AU - Deng, Z. AU - O'Callaghan, C. AU - Kadioglu, A. AU - Rajakumar, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Pathogenicity islands PAPI-1 and PAPI-2 contribute individually and synergistically to the virulence of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 JO - Infect Immun VL - 78 UR - https://doi.org/10.1128/IAI.00621-09 DO - 10.1128/IAI.00621-09 ID - Harrison2010 ER - TY - JOUR AU - Battle, S. E. AU - Meyer, F. AU - Rello, J. AU - Kung, V. L. AU - Hauser, A. R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Hybrid pathogenicity island PAGI-5 contributes to the highly virulent phenotype of a Pseudomonas aeruginosa isolate in mammals JO - J Bacteriol VL - 190 UR - https://doi.org/10.1128/JB.00785-08 DO - 10.1128/JB.00785-08 ID - Battle2008 ER - TY - JOUR AU - Kobayashi, I. PY - 2001 DA - 2001// TI - Behavior of restriction-modification systems as selfish mobile elements and their impact on genome evolution JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.18.3742 DO - 10.1093/nar/29.18.3742 ID - Kobayashi2001 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Yan, A. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identification and characterization of a putative ABC transporter PltHIJKN required for pyoluteorin production in Pseudomonas sp. M18 JO - Gene VL - 376 UR - https://doi.org/10.1016/j.gene.2006.02.009 DO - 10.1016/j.gene.2006.02.009 ID - Huang2006 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Zhu, D. AU - Ge, Y. AU - Hu, H. AU - Zhang, X. AU - Xu, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Identification and characterization of pltZ, a gene involved in the repression of pyoluteorin biosynthesis in Pseudomonas sp. M18 JO - FEMS Microbiol Lett VL - 232 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1097(04)00074-6 DO - 10.1016/S0378-1097(04)00074-6 ID - Huang2004 ER - TY - JOUR AU - Nowak-Thompson, B. AU - Chaney, N. AU - Wing, J. S. AU - Gould, S. J. AU - Loper, J. E. PY - 1999 DA - 1999// TI - Characterization of the pyoluteorin biosynthetic gene cluster of Pseudomonas fluorescens Pf-5 JO - J Bacteriol VL - 181 ID - Nowak-Thompson1999 ER - TY - JOUR AU - Arora, S. K. AU - Bangera, M. AU - Lory, S. AU - Ramphal, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - A genomic island in Pseudomonas aeruginosa carries the determinants of flagellin glycosylation JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.161249198 DO - 10.1073/pnas.161249198 ID - Arora2001 ER - TY - JOUR AU - Werck-Reichhart, D. AU - Feyereisen, R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Cytochromes P450: a success story JO - Genome Biol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2000-1-6-reviews3003 DO - 10.1186/gb-2000-1-6-reviews3003 ID - Werck-Reichhart2000 ER - TY - JOUR AU - Bhattacharya, D. AU - Nagpure, A. AU - Gupta, R. K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Bacterial chitinases: properties and potential JO - Crit Rev Biotechnol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1080/07388550601168223 DO - 10.1080/07388550601168223 ID - Bhattacharya2007 ER - TY - JOUR AU - Schindelin, H. AU - Jiang, W. AU - Inouye, M. AU - Heinemann, U. PY - 1994 DA - 1994// TI - Crystal structure of CspA, the major cold shock protein of Escherichia coli JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 91 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.91.11.5119 DO - 10.1073/pnas.91.11.5119 ID - Schindelin1994 ER - TY - JOUR AU - Monteiro-Vitorello, C. B. AU - de Oliveira, M. C. AU - Zerillo, M. M. AU - Varani, A. M. AU - Civerolo, E. AU - Van Sluys, M. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Xylella and Xanthomonas Mobil'omics JO - OMICS VL - 9 UR - https://doi.org/10.1089/omi.2005.9.146 DO - 10.1089/omi.2005.9.146 ID - Monteiro-Vitorello2005 ER - TY - JOUR AU - Grissa, I. AU - Vergnaud, G. AU - Pourcel, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - CRISPRFinder: a web tool to identify clustered regularly interspaced short palindromic repeats JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm360 DO - 10.1093/nar/gkm360 ID - Grissa2007 ER - TY - JOUR AU - Brouns, S. J. AU - Jore, M. M. AU - Lundgren, M. AU - Westra, E. R. AU - Slijkhuis, R. J. AU - Snijders, A. P. AU - Dickman, M. J. AU - Makarova, K. S. AU - Koonin, E. V. AU - van der Oost, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes JO - Science VL - 321 UR - https://doi.org/10.1126/science.1159689 DO - 10.1126/science.1159689 ID - Brouns2008 ER - TY - JOUR AU - Marraffini, L. A. AU - Sontheimer, E. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - CRISPR interference limits horizontal gene transfer in staphylococci by targeting DNA JO - Science VL - 322 UR - https://doi.org/10.1126/science.1165771 DO - 10.1126/science.1165771 ID - Marraffini2008 ER - TY - JOUR AU - Briat, J. F. PY - 1992 DA - 1992// TI - Iron assimilation and storage in prokaryotes JO - J Gen Microbiol VL - 138 UR - https://doi.org/10.1099/00221287-138-12-2475 DO - 10.1099/00221287-138-12-2475 ID - Briat1992 ER - TY - JOUR AU - Li, Y. AU - Du, X. AU - Lu, Z. J. AU - Wu, D. AU - Zhao, Y. AU - Ren, B. AU - Huang, J. AU - Huang, X. AU - Xu, Y. PY - 2011 DA - 2011// TI - Regulatory feedback loop of two phz gene clusters through 5'-untranslated regions in Pseudomonas sp. M18 JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019413 DO - 10.1371/journal.pone.0019413 ID - Li2011 ER - TY - BOOK AU - Miller, S. H. AU - Mark, G. L. AU - Franks, A. AU - O'Gara, F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Pseudomonas-Plant Interactions PB - Co. CY - KGaA UR - https://doi.org/10.1002/9783527622009.ch13 DO - 10.1002/9783527622009.ch13 ID - Miller2008 ER - TY - JOUR AU - Yang, J. AU - Chen, L. AU - Sun, L. AU - Yu, J. AU - Jin, Q. PY - 2008 DA - 2008// TI - VFDB 2008 release: an enhanced web-based resource for comparative pathogenomics JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm951 DO - 10.1093/nar/gkm951 ID - Yang2008 ER - TY - JOUR AU - Meyer, J. M. AU - Neely, A. AU - Stintzi, A. AU - Georges, C. AU - Holder, I. A. PY - 1996 DA - 1996// TI - Pyoverdin is essential for virulence of Pseudomonas aeruginosa JO - Infect Immun VL - 64 ID - Meyer1996 ER - TY - JOUR AU - Mougous, J. D. AU - Gifford, C. A. AU - Ramsdell, T. L. AU - Mekalanos, J. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Threonine phosphorylation post-translationally regulates protein secretion in Pseudomonas aeruginosa JO - Nat Cell Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1605 DO - 10.1038/ncb1605 ID - Mougous2007 ER - TY - JOUR AU - Diggle, S. P. AU - Stacey, R. E. AU - Dodd, C. AU - Camara, M. AU - Williams, P. AU - Winzer, K. PY - 2006 DA - 2006// TI - The galactophilic lectin, LecA, contributes to biofilm development in Pseudomonas aeruginosa JO - Environ Microbiol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2006.001001.x DO - 10.1111/j.1462-2920.2006.001001.x ID - Diggle2006 ER - TY - JOUR AU - Zavascki, A. P. AU - Carvalhaes, C. G. AU - Picao, R. C. AU - Gales, A. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii: resistance mechanisms and implications for therapy JO - Expert Rev Anti Infect Ther VL - 8 UR - https://doi.org/10.1586/eri.09.108 DO - 10.1586/eri.09.108 ID - Zavascki2010 ER - TY - JOUR AU - Jacoby, G. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - AmpC beta-lactamases JO - Clin Microbiol Rev VL - 22 UR - https://doi.org/10.1128/CMR.00036-08 DO - 10.1128/CMR.00036-08 ID - Jacoby2009 ER - TY - JOUR AU - Livermore, D. M. AU - Woodford, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - The beta-lactamase threat in Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter JO - Trends Microbiol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.tim.2006.07.008 DO - 10.1016/j.tim.2006.07.008 ID - Livermore2006 ER - TY - JOUR AU - Li, X. Z. AU - Nikaido, H. AU - Poole, K. PY - 1995 DA - 1995// TI - Role of mexA-mexB-oprM in antibiotic efflux in Pseudomonas aeruginosa JO - Antimicrob Agents Chemother VL - 39 UR - https://doi.org/10.1128/AAC.39.9.1948 DO - 10.1128/AAC.39.9.1948 ID - Li1995 ER - TY - JOUR AU - Poole, K. AU - Gotoh, N. AU - Tsujimoto, H. AU - Zhao, Q. AU - Wada, A. AU - Yamasaki, T. AU - Neshat, S. AU - Yamagishi, J. AU - Li, X. Z. AU - Nishino, T. PY - 1996 DA - 1996// TI - Overexpression of the mexC-mexD-oprJ efflux operon in nfxB-type multidrug-resistant strains of Pseudomonas aeruginosa JO - Mol Microbiol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1996.281397.x DO - 10.1046/j.1365-2958.1996.281397.x ID - Poole1996 ER - TY - JOUR AU - Kohler, T. AU - Michea-Hamzehpour, M. AU - Henze, U. AU - Gotoh, N. AU - Curty, L. K. AU - Pechere, J. C. PY - 1997 DA - 1997// TI - Characterization of MexE-MexF-OprN, a positively regulated multidrug efflux system of Pseudomonas aeruginosa JO - Mol Microbiol VL - 23 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1997.2281594.x DO - 10.1046/j.1365-2958.1997.2281594.x ID - Kohler1997 ER - TY - JOUR AU - Jalal, S. AU - Wretlind, B. PY - 1998 DA - 1998// TI - Mechanisms of quinolone resistance in clinical strains of Pseudomonas aeruginosa JO - Microb Drug Resist VL - 4 UR - https://doi.org/10.1089/mdr.1998.4.257 DO - 10.1089/mdr.1998.4.257 ID - Jalal1998 ER - TY - JOUR AU - Silby, M. W. AU - Cerdeno-Tarraga, A. M. AU - Vernikos, G. S. AU - Giddens, S. R. AU - Jackson, R. W. AU - Preston, G. M. AU - Zhang, X. X. AU - Moon, C. D. AU - Gehrig, S. M. AU - Godfrey, S. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genomic and genetic analyses of diversity and plant interactions of Pseudomonas fluorescens JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-5-r51 DO - 10.1186/gb-2009-10-5-r51 ID - Silby2009 ER - TY - JOUR AU - Cheng, K. AU - Smyth, R. L. AU - Govan, J. R. AU - Doherty, C. AU - Winstanley, C. AU - Denning, N. AU - Heaf, D. P. AU - van Saene, H. AU - Hart, C. A. PY - 1996 DA - 1996// TI - Spread of beta-lactam-resistant Pseudomonas aeruginosa in a cystic fibrosis clinic JO - Lancet VL - 348 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(96)05169-0 DO - 10.1016/S0140-6736(96)05169-0 ID - Cheng1996 ER - TY - JOUR AU - Zhang, Z. Y. AU - Liu, C. AU - Zhu, Y. Z. AU - Zhong, Y. AU - Zhu, Y. Q. AU - Zheng, H. J. AU - Zhao, G. P. AU - Wang, S. Y. AU - Guo, X. K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum JDM1 JO - J Bacteriol VL - 191 UR - https://doi.org/10.1128/JB.00587-09 DO - 10.1128/JB.00587-09 ID - Zhang2009 ER - TY - JOUR AU - Delcher, A. L. AU - Harmon, D. AU - Kasif, S. AU - White, O. AU - Salzberg, S. L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Improved microbial gene identification with GLIMMER JO - Nucleic Acids Res VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/nar/27.23.4636 DO - 10.1093/nar/27.23.4636 ID - Delcher1999 ER - TY - JOUR AU - Marchler-Bauer, A. AU - Panchenko, A. R. AU - Shoemaker, B. A. AU - Thiessen, P. A. AU - Geer, L. Y. AU - Bryant, S. H. PY - 2002 DA - 2002// TI - CDD: a database of conserved domain alignments with links to domain three-dimensional structure JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.1.281 DO - 10.1093/nar/30.1.281 ID - Marchler-Bauer2002 ER - TY - JOUR AU - Gardy, J. L. AU - Laird, M. R. AU - Chen, F. AU - Rey, S. AU - Walsh, C. J. AU - Ester, M. AU - Brinkman, F. S. PY - 2005 DA - 2005// TI - PSORTb v.2.0: expanded prediction of bacterial protein subcellular localization and insights gained from comparative proteome analysis JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti057 DO - 10.1093/bioinformatics/bti057 ID - Gardy2005 ER - TY - JOUR AU - Juncker, A. S. AU - Willenbrock, H. AU - Von Heijne, G. AU - Brunak, S. AU - Nielsen, H. AU - Krogh, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Prediction of lipoprotein signal peptides in Gram-negative bacteria JO - Protein Sci VL - 12 UR - https://doi.org/10.1110/ps.0303703 DO - 10.1110/ps.0303703 ID - Juncker2003 ER - TY - JOUR AU - Lowe, T. M. AU - Eddy, S. R. PY - 1997 DA - 1997// TI - tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.5.0955 DO - 10.1093/nar/25.5.0955 ID - Lowe1997 ER - TY - JOUR AU - Tamura, K. AU - Dudley, J. AU - Nei, M. AU - Kumar, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 JO - Mol Biol Evol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msm092 DO - 10.1093/molbev/msm092 ID - Tamura2007 ER - TY - JOUR AU - Ou, H. Y. AU - He, X. AU - Harrison, E. M. AU - Kulasekara, B. R. AU - Thani, A. B. AU - Kadioglu, A. AU - Lory, S. AU - Hinton, J. C. AU - Barer, M. R. AU - Deng, Z. AU - Rajakumar, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - MobilomeFINDER: web-based tools for in silico and experimental discovery of bacterial genomic islands JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm380 DO - 10.1093/nar/gkm380 ID - Ou2007 ER - TY - JOUR AU - Thomashow, L. S. AU - Weller, D. M. PY - 1988 DA - 1988// TI - Role of a phenazine antibiotic from Pseudomonas fluorescens in biological control of Gaeumannomyces graminis var. tritici JO - J Bacteriol VL - 170 ID - Thomashow1988 ER - TY - JOUR AU - Kukavica-Ibrulj, I. AU - Bragonzi, A. AU - Paroni, M. AU - Winstanley, C. AU - Sanschagrin, F. AU - O'Toole, G. A. AU - Levesque, R. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - In vivo growth of Pseudomonas aeruginosa strains PAO1 and PA14 and the hypervirulent strain LESB58 in a rat model of chronic lung infection JO - J Bacteriol VL - 190 UR - https://doi.org/10.1128/JB.01572-07 DO - 10.1128/JB.01572-07 ID - Kukavica-Ibrulj2008 ER - TY - JOUR AU - Ihaka, R. AU - Gentleman, R. PY - 1996 DA - 1996// TI - R: a language for data analysis and graphics JO - J Comput Graph Stat VL - 5 ID - Ihaka1996 ER - TY - JOUR AU - Ghai, R. AU - Hain, T. AU - Chakraborty, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - GenomeViz: visualizing microbial genomes JO - BMC Bioinformatics VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-198 DO - 10.1186/1471-2105-5-198 ID - Ghai2004 ER - TY - JOUR AU - Larkin, M. A. AU - Blackshields, G. AU - Brown, N. P. AU - Chenna, R. AU - McGettigan, P. A. AU - McWilliam, H. AU - Valentin, F. AU - Wallace, I. M. AU - Wilm, A. AU - Lopez, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Clustal W and Clustal × version 2.0 JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm404 DO - 10.1093/bioinformatics/btm404 ID - Larkin2007 ER -