Top piRNA clusters Brennecke et al. (2007) | Â | piRNA clusters from present study | Â | ||||||
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Cluster id 1 | Chr. | start | stop | Cluster Unique piRNAs 2 | Cluster id 1 | Chr. | start | stop | Cluster Unique piRNAs 2 |
1 | 2R | 2144349 | 2386719 | 1686 | 1 | 2R | 2110440 | 2217150 | 2350 |
 |  |  |  |  | 2 | 2R | 2304581 | 2394124 | 1975 |
2 | X | 21392175 | 21431907 | 986 | 24 | X | 21390160 | 21406447 | 231 |
 |  |  |  |  | 37 | X | 21424709 | 21429775 | 194 |
3 | 4 | 1258473 | 1348320 | 684 | 27 | 4 | 1250143 | 1289828 | 217 |
5 | 2L | 20148259 | 20227581 | 482 | 22 | 2L | 20136345 | 20153079 | 235 |
 |  |  |  |  | 14 | 2L | 20164387 | 20176739 | 333 |
 |  |  |  |  | 12 | 2L | 20198129 | 20230518 | 392 |
6 | 3L | 23273964 | 23314199 | 228 | 9 | 3L | 23251131 | 23313773 | 520 |
7 | U | 4015849 | 4029971 | 176 | 7 | U | 4022887 | 4029272 | 834 |
8 | X | 21505666 | 21684449 | 170 | 4 | X | 21496075 | 21510974 | 1046 |
 |  |  |  |  | 8 | X | 21526569 | 21543427 | 520 |
 |  |  |  |  | 33 | X | 21631078 | 21672693 | 206 |
 |  |  |  |  | 69 | X | 21604048 | 21622362 | 123 |
9 | X | 21759393 | 21844063 | 155 | 53 | X | 21786358 | 21878191 | 150 |
10 | U | 5766708 | 5772171 | 133 | 1246 | U | 5760625 | 5774759 | 6 |
11 | 3R | 27895169 | 27905030 | 107 | N/A 3 | 3R | N/A | N/A | N/A |
12 | 3LHet | 1402377 | 1557939 | 102 | 148 | 3LHet | 1438260 | 1446518 | 55 |
 |  |  |  |  | 99 | 3LHet | 1485097 | 1535498 | 84 |
 |  |  |  |  | 163 | 3LHet | 1557765 | 1579687 | 50 |
13 | 3LHet | 2011004 | 2180268 | 86 | 75 | 3LHet | 2068714 | 2118742 | 110 |
 |  |  |  |  | 133 | 3LHet | 2126549 | 2158540 | 62 |
 |  |  |  |  | 3480 | 3LHet | 2167493 | 2167493 | 1 |
14 | U | 7542733 | 7545114 | 84 | 236 | U | 7532042 | 7545038 | 33 |
15 | 3LHet | 238123 | 332969 | 71 | N/A | 3LHet | N/A | N/A | N/A |