TY - JOUR AU - Gubler, D. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Vector-borne diseases JO - Rev Sci Tech VL - 28 ID - Gubler2009 ER - TY - JOUR AU - Gubler, D. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - Resurgent vector-borne diseases as a global health problem JO - Emerg Infect Dis VL - 4 UR - https://doi.org/10.3201/eid0403.980326 DO - 10.3201/eid0403.980326 ID - Gubler1998 ER - TY - JOUR AU - Adams, T. S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Hematophagy and Hormone Release JO - Ann Entomol Soc Am VL - 92 UR - https://doi.org/10.1093/aesa/92.1.1 DO - 10.1093/aesa/92.1.1 ID - Adams1999 ER - TY - JOUR AU - Ribeiro, J. M. PY - 1995 DA - 1995// TI - Blood-feeding arthropods: live syringes or invertebrate pharmacologists? JO - Infect Agents Dis VL - 4 ID - Ribeiro1995 ER - TY - JOUR AU - Yuval, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - Mating systems of blood-feeding flies JO - Annu Rev Entomol VL - 51 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.ento.51.110104.151058 DO - 10.1146/annurev.ento.51.110104.151058 ID - Yuval2006 ER - TY - JOUR AU - Dana, A. N. AU - Hong, Y. S. AU - Kern, M. K. AU - Hillenmeyer, M. E. AU - Harker, B. W. AU - Lobo, N. F. AU - Hogan, J. R. AU - Romans, P. AU - Collins, F. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene expression patterns associated with blood-feeding in the malaria mosquito Anopheles gambiae JO - BMC Genomics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-5 DO - 10.1186/1471-2164-6-5 ID - Dana2005 ER - TY - JOUR AU - Marinotti, O. AU - Calvo, E. AU - Nguyen, Q. K. AU - Dissanayake, S. AU - Ribeiro, J. M. C. AU - James, A. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genome-wide analyses of gene expression in adult Anopheles gambiae JO - Insect Mol Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2583.2006.00610.x DO - 10.1111/j.1365-2583.2006.00610.x ID - Marinotti2006 ER - TY - JOUR AU - Krywinski, J. AU - Grushko, O. G. AU - Besansky, N. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Analyses of the complete mitochondrial DNA from Anopheles funestus: an improved dipteran mitochondrial genome annotation and a temporal dimension of mosquito evolution JO - Mol Phylogenet Evol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.01.006 DO - 10.1016/j.ympev.2006.01.006 ID - Krywinski2006 ER - TY - JOUR AU - San Martín, J. L. AU - Brathwaite, O. AU - Zambrano, B. AU - Solórzano, J. O. AU - Bouckenooghe, A. AU - Dayan, G. H. AU - Guzmán, M. G. PY - 2010 DA - 2010// TI - The epidemiology of dengue in the americas over the last three decades: a worrisome reality JO - Am J Trop Med Hyg VL - 82 UR - https://doi.org/10.4269/ajtmh.2010.09-0346 DO - 10.4269/ajtmh.2010.09-0346 ID - San Martín2010 ER - TY - JOUR AU - Franco, L. AU - Di Caro, A. AU - Carletti, F. AU - Vapalahti, O. AU - Renaudat, C. AU - Zeller, H. AU - Tenorio, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Recent expansion of dengue virus serotype 3 in West Africa JO - Euro Surveill VL - 15 ID - Franco2010 ER - TY - JOUR AU - Monath, T. P. PY - 1994 DA - 1994// TI - Dengue: the risk to developed and developing countries JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 91 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.91.7.2395 DO - 10.1073/pnas.91.7.2395 ID - Monath1994 ER - TY - JOUR AU - Monath, T. P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dengue and yellow fever-challenges for the development and use of vaccines JO - N Engl J Med VL - 357 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMp0707161 DO - 10.1056/NEJMp0707161 ID - Monath2007 ER - TY - JOUR AU - Hombach, J. AU - Barrett, A. D. AU - Cardosa, M. J. AU - Deubel, V. AU - Guzman, M. AU - Kurane, I. AU - Roehrig, J. T. AU - Sabchareon, A. AU - Kieny, M. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Review on flavivirus vaccine development. Proceedings of a meeting jointly organised by the World Health Organization and the Thai Ministry of Public Health, 26-27 April 2004, Bangkok, Thailand JO - Vaccine VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2004.11.040 DO - 10.1016/j.vaccine.2004.11.040 ID - Hombach2005 ER - TY - JOUR AU - Sanders, H. AU - Evans, A. M. AU - Ross, L. S. AU - Gill, S. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Blood meal induces global changes in midgut gene expression in the disease vector, Aedes aegypti JO - Insect Biochem Mol Biol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1016/S0965-1748(03)00124-3 DO - 10.1016/S0965-1748(03)00124-3 ID - Sanders2003 ER - TY - JOUR AU - Goncalves, R. L. S. AU - Machafo, A. C. L. AU - Paiva-Silva, G. O. AU - Sorgine, M. H. F. AU - Oliveira, J. H. M. AU - Vanniet-Santos, M. A. AU - Galina, A. AU - Oluveira, P. L. AU - Oliveira, M. F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Blood-feeding induces reversible functional changes in flight muscle mitochondria of Aedes aegypti mosquitoes JO - PLoS ONE VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0007854 DO - 10.1371/journal.pone.0007854 ID - Goncalves2009 ER - TY - JOUR AU - Evans, A. M. AU - Aimanova, K. G. AU - Gill, S. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Characterization of a blood-meal-responsive proton-dependent amino acid transporter in the disease vector, Aedes aegypti JO - J Exp Biol VL - 212 UR - https://doi.org/10.1242/jeb.029553 DO - 10.1242/jeb.029553 ID - Evans2009 ER - TY - JOUR AU - Brackney, D. E. AU - Isoe, J. AU - Black, W. C. I. V. AU - Zamora, J. AU - Foy, B. D. AU - Miesfeld, R. L. AU - Olson, K. E. PY - 2010 DA - 2010// TI - Expression profiling and comparative analyses of seven midgut serine proteases from the yellow fever, Aedes aegypti JO - J Insect Physiol VL - 56 UR - https://doi.org/10.1016/j.jinsphys.2010.01.003 DO - 10.1016/j.jinsphys.2010.01.003 ID - Brackney2010 ER - TY - JOUR AU - Ozsolak, F. AU - Platt, A. R. AU - Jones, D. R. AU - Reifenberger, J. G. AU - Sass, L. E. AU - McInerney, P. AU - Thompson, J. F. AU - Bowers, J. AU - Jarosz, M. AU - Milos, P. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Direct RNA sequencing JO - Nature VL - 461 UR - https://doi.org/10.1038/nature08390 DO - 10.1038/nature08390 ID - Ozsolak2009 ER - TY - CHAP AU - Nagalakshmi, U. AU - Waern, K. AU - Snyder, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - RNA-Seq: a method for comprehensive transcriptome analysis BT - Curr Protoc Mol Biol ID - Nagalakshmi2010 ER - TY - JOUR AU - Diguistini, S. AU - Liao, N. Y. AU - Platt, D. AU - Robertson, G. AU - Seidel, M. AU - Chan, S. K. AU - Docking, T. R. AU - Birol, I. AU - Holt, R. A. AU - Hirst, M. AU - Mardis, E. AU - Marra, M. A. AU - Hamelin, R. C. AU - Bohlmann, J. AU - Breuil, C. AU - Jones, S. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - De novo genome sequence assembly of a filamentous fungus using Sanger, 454 and Illumina sequence data JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-9-r94 DO - 10.1186/gb-2009-10-9-r94 ID - Diguistini2009 ER - TY - JOUR AU - Mardis, E. R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Next-generation DNA sequencing methods JO - Annu Rev Genomics Hum Genet VL - 9 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.genom.9.081307.164359 DO - 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359 ID - Mardis2008 ER - TY - JOUR AU - Morozova, O. AU - Marra, M. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Applications of next-generation sequencing technologies in functional genomics JO - Genomics VL - 92 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2008.07.001 DO - 10.1016/j.ygeno.2008.07.001 ID - Morozova2008 ER - TY - JOUR AU - Harris, T. D. AU - Buzby, P. R. AU - Babcock, H. AU - Beer, E. AU - Bowers, J. AU - Braslavsky, I. AU - Causey, M. AU - Colonell, J. AU - Dimeo, J. AU - Efcavitch, J. W. AU - Giladi, E. AU - Gill, J. AU - Healy, J. AU - Jarosz, M. AU - Lapen, D. AU - Moulton, K. AU - Quake, S. R. AU - Steinmann, K. AU - Thayer, E. AU - Tyurina, A. AU - Ward, R. AU - Weiss, H. AU - Xie, Z. PY - 2008 DA - 2008// TI - Single-molecule DNA sequencing of a viral genome JO - Science VL - 320 UR - https://doi.org/10.1126/science.1150427 DO - 10.1126/science.1150427 ID - Harris2008 ER - TY - JOUR AU - Marioni, J. C. AU - Mason, C. E. AU - Mane, S. M. AU - Stephens, M. AU - Gilad, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - RNA-seq: an assessment of technical reproducibility and comparison with gene expression arrays JO - Genome Research VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.079558.108 DO - 10.1101/gr.079558.108 ID - Marioni2008 ER - TY - JOUR AU - Wilhelm, B. T. AU - Landry, J. R. PY - 2009 DA - 2009// TI - RNA-Seq-quantitative measurement of expression through massively parallel RNA-sequencing JO - Methods VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2009.03.016 DO - 10.1016/j.ymeth.2009.03.016 ID - Wilhelm2009 ER - TY - JOUR AU - Cloonan, N. AU - Grimmond, S. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transcriptome content and dynamics at single-nucleotide resolution JO - Genome Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2008-9-9-234 DO - 10.1186/gb-2008-9-9-234 ID - Cloonan2008 ER - TY - STD TI - AegyXcel: an Aedes aegypti protein database. [http://exon.niaid.nih.gov/transcriptome.html#aegyxcel] UR - http://exon.niaid.nih.gov/transcriptome.html#aegyxcel ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - Finn, R. D. AU - Tate, J. AU - Mistry, J. AU - Coggill, P. C. AU - Sammut, S. J. AU - Hotz, H. R. AU - Ceric, G. AU - Forslund, K. AU - Eddy, S. R. AU - Sonnhammer, E. L. AU - Bateman, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - The Pfam protein families database JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm960 DO - 10.1093/nar/gkm960 ID - Finn2008 ER - TY - JOUR AU - Shao, L. AU - Devenport, M. AU - Fujioka, H. AU - Ghosh, A. AU - Jacobs-Lorena, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Identification and characterization of a novel peritrophic matrix protein, Ae-Aper50, and the microvillar membrane protein, AEG12, from the mosquito, Aedes aegypti JO - Insect Biochem Mol Biol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2005.03.012 DO - 10.1016/j.ibmb.2005.03.012 ID - Shao2005 ER - TY - JOUR AU - Morlais, I. AU - Mori, A. AU - Schneider, J. R. AU - Severson, D. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - A targeted approach to the identification of candidate genes determining susceptibility to Plasmodium gallinaceum in Aedes aegypti JO - Mol Genet Genomics VL - 269 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-003-0882-7 DO - 10.1007/s00438-003-0882-7 ID - Morlais2003 ER - TY - JOUR AU - Fischer, H. M. AU - Wheat, C. W. AU - Heckel, D. G. AU - Vogel, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Evolutionary origins of a novel host plant detoxification gene in butterflies JO - Mol Biol Evol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msn014 DO - 10.1093/molbev/msn014 ID - Fischer2008 ER - TY - JOUR AU - Pane, A. AU - Wehr, K. AU - Schupbach, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - zucchini and squash encode two putative nucleases required for rasiRNA production in the Drosophila germline JO - Dev Cell VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/j.devcel.2007.03.022 DO - 10.1016/j.devcel.2007.03.022 ID - Pane2007 ER - TY - STD TI - Lawson D, Arensburger P, Atkinson P, Besansky NJ, Bruggner RV, Butler R, Campbell KS, Christophides GK, Christley S, Dialynas E, Hammond M, Hill CA, Konopinski N, Lobo NF, MacCallum RM, Madey G, Megy K, Meyer J, Redmond S, Severson DW, Stinson EO, Topalis P, Birney E, Gelbart WM, Kafatos FC, Louis C, Collins FH: VectorBase: a data resource for invertebrate vector genomics. Nucleic Acids Res. 2009, D583-7. 10.1093/nar/gkn857. 37 Database ID - ref33 ER - TY - JOUR AU - Hu, X. AU - Yagi, Y. AU - Tanji, T. AU - Zhou, S. AU - Ip, T. Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Multimerization and interaction of Toll and Spätzle in Drosophila JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0307062101 DO - 10.1073/pnas.0307062101 ID - Hu2004 ER - TY - JOUR AU - Shia, A. K. H. AU - Glittenberg, M. AU - Thomson, G. AU - Weber, A. N. AU - Reichhart, J. M. AU - Ligoxygakis, P. PY - 2009 DA - 2009// TI - Toll-dependent antimicrobial responses in Drosophila larval fat body require Spätzle secreted by haemocytes JO - J Cell Science VL - 122 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.049155 DO - 10.1242/jcs.049155 ID - Shia2009 ER - TY - JOUR AU - Bize, P. AU - Jeannert, C. AU - Klopfenstein, A. AU - Roulin, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - What makes a host profitable? Parasite balance host nutritive resources against immunity JO - Am Nat VL - 171 UR - https://doi.org/10.1086/523943 DO - 10.1086/523943 ID - Bize2008 ER - TY - JOUR AU - Sánchez-Vargas, I. AU - Scott, J. C. AU - Poole-Smith, K. B. AU - Franz, A. W. E. AU - Barbosa-Solomieu, V. AU - Wilusz, J. AU - Olson, K. E. AU - Blair, C. D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Dengue Virus Type 2 Infections of Aedes aegypti are modulated by the mosquito's RNA interference pathway JO - PLOS Pathogens VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000299 DO - 10.1371/journal.ppat.1000299 ID - Sánchez-Vargas2009 ER - TY - JOUR AU - Campbell, C. AU - Black, I. V. W. C. AU - Hess, A. M. AU - Foy, B. D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Comparative genomics of small RNA regulatory pathway components in vector mosquitoes JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-425 DO - 10.1186/1471-2164-9-425 ID - Campbell2008 ER - TY - JOUR AU - Lowenberger, C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Innate immune response of Aedes aegypti JO - Insect Biochem Mol Biol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1016/S0965-1748(00)00141-7 DO - 10.1016/S0965-1748(00)00141-7 ID - Lowenberger2001 ER - TY - JOUR AU - Ramirez, J. L. AU - Dimopoulos, G. PY - 2010 DA - 2010// TI - The Toll immune signaling pathway control conserved anti-dengue defenses across diverse Ae. aegypti strains and against multiple dengue virus serotypes JO - Dev Comp Immunol VL - 34 UR - https://doi.org/10.1016/j.dci.2010.01.006 DO - 10.1016/j.dci.2010.01.006 ID - Ramirez2010 ER - TY - JOUR AU - Zou, Z. AU - Shin, S. W. AU - Alvarez, K. S. AU - Kokoza, V. AU - Raikhel, A. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Distinct melanization pathways in the mosquito Aedes aegypti JO - Immunity VL - 32 UR - https://doi.org/10.1016/j.immuni.2009.11.011 DO - 10.1016/j.immuni.2009.11.011 ID - Zou2010 ER - TY - JOUR AU - Bartholomay, L. C. AU - Fuchs, J. F. AU - Cheng, L. L. AU - Beck, E. T. AU - Vizioli, J. AU - Lowenberger, C. AU - Christensen, B. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Reassessing the role of defensin in the innate immune response of the mosquito, Aedes aegypti JO - Insect Mol Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1111/j.0962-1075.2004.00467.x DO - 10.1111/j.0962-1075.2004.00467.x ID - Bartholomay2004 ER - TY - CHAP AU - Erickson, S. M. AU - Xi, Z. AU - Mayhew, G. F. AU - Ramirez, J. L. AU - Aliota, M. T. AU - Christensen, B. M. AU - Dimopoulos, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Mosquito infection responses to developing filarial worms BT - Plos Negl Trop Dis ID - Erickson2009 ER - TY - JOUR AU - Xi, Z. AU - Ramirez, J. L. AU - Dimopoulos, G. PY - 2008 DA - 2008// TI - The Aedes aegypti Toll Pathway Controls Dengue Virus Infection JO - PLOS Pathogens VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000098 DO - 10.1371/journal.ppat.1000098 ID - Xi2008 ER - TY - JOUR AU - Khoo, C. C. AU - Piper, J. AU - Sanchez-Vargas, I. AU - Olson, K. E. AU - Franz, A. W. PY - 2010 DA - 2010// TI - The RNA interference pathway affects midgut infection- and escape barriers for Sindbis virus in Aedes aegypti JO - BMC Microbiology VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-10-130 DO - 10.1186/1471-2180-10-130 ID - Khoo2010 ER - TY - JOUR AU - Bartholomay, L. C. AU - Waterhouse, R. M. AU - Mayhew, G. F. AU - Campbell, C. L. AU - Michel, K. AU - Zou, Z. AU - Ramirez, J. L. AU - Das, S. AU - Alvarez, K. AU - Arensburger, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Pathogenomics of Culex quiquefasciatus and meta-analysis of infection responses to diverse pathogens JO - Science VL - 330 UR - https://doi.org/10.1126/science.1193162 DO - 10.1126/science.1193162 ID - Bartholomay2010 ER - TY - JOUR AU - Campbell, C. L. AU - Keene, K. M. AU - Brackney, D. E. AU - Olson, K. E. AU - Blair, C. D. AU - Wilusz, J. AU - Foy, B. D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Aedes aegypti uses RNA interference in defense against Sindbis virus infection JO - BMC Microbiology VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-8-47 DO - 10.1186/1471-2180-8-47 ID - Campbell2008 ER - TY - JOUR AU - Dong, Y. AU - Manfredini, F. AU - Dimopoulos, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Implication of the mosquito midgut microbiota in the defense against malaria parasite JO - Plos Pathogens VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000423 DO - 10.1371/journal.ppat.1000423 ID - Dong2009 ER - TY - JOUR AU - Molina-Cruz, A. AU - DeJong, R. J. AU - Charles, B. AU - Gupta, L. AU - Kumar, S. AU - Jaramillo-Gutlerrez, G. AU - Barillas-Mury, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Reactive oxygen species modulate Anopehels gambiae immunity against Bacteria and Plasmodium JO - J Biol Chem VL - 283 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M705873200 DO - 10.1074/jbc.M705873200 ID - Molina-Cruz2008 ER - TY - JOUR AU - Salazar, M. I. AU - Richardson, J. H. AU - Sánchez-Vargas, I. AU - Olson, K. E. AU - Beaty, B. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dengue virus type 2: replication and tropisms in orally infected Aedes aegypti mosquitoes JO - BMC Microbiol VL - 30 ID - Salazar2007 ER - TY - JOUR AU - Waterhouse, R. M. AU - Kriventseva, E. V. AU - Meister, S. AU - Xi, Z. AU - Alvarez, K. S. AU - Bartholomay, L. C. AU - Barillas-Mury, C. AU - Bian, G. AU - Blandin, S. AU - Christensen, B. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Evolutionary dynamics of immune-related genes and pathways in disease-vector mosquitoes JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1139862 DO - 10.1126/science.1139862 ID - Waterhouse2007 ER - TY - STD TI - Insect Immune-Related Genes and Gene Famillies. [http://cegg.unige.ch/Insecta/immunodb] UR - http://cegg.unige.ch/Insecta/immunodb ID - ref52 ER - TY - JOUR AU - Chang, Y. Y. AU - Neufeld, T. P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Autophagy takes flight in Drosophila JO - FEBS Lett VL - 584 UR - https://doi.org/10.1016/j.febslet.2010.01.006 DO - 10.1016/j.febslet.2010.01.006 ID - Chang2010 ER - TY - JOUR AU - Marelli, M. T. AU - Moreira, C. K. AU - Kelly, D. AU - Alphey, L. AU - Jacobs-Lorena, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Mosquito transgenesis: what fitness cost? JO - Trends Parasitol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2006.03.004 DO - 10.1016/j.pt.2006.03.004 ID - Marelli2006 ER - TY - JOUR AU - Amenya, D. A. AU - Bonizzoni, M. AU - Isaacs, A. T. AU - Jasinskiene, N. AU - Chen, H. AU - Marinotti, O. AU - Yan, G. AU - James, A. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Comparative fitness assessment of Anopheles stephensi transgenic lines receptive to site-specific integration JO - Insect Mol Biol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2583.2009.00986.x DO - 10.1111/j.1365-2583.2009.00986.x ID - Amenya2010 ER - TY - JOUR AU - Carlson, J. M. AU - Chakravarty, A. AU - DeZiel, C. AU - Gross, R. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - SCOPE: a web server for practical de novo motif discovery JO - Nucl Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm310 DO - 10.1093/nar/gkm310 ID - Carlson2007 ER - TY - STD TI - Kriventseva EV, Rahman N, Espinosa O, Zdobnov EM: OrthoDB: the hierarchical catalog of eukaryotic orthologs. Nucleic Acids Research. 2008, D271-5. 36 Database ID - ref57 ER - TY - JOUR AU - Sieglaff, D. H. AU - Dunn, W. A. AU - Xie, X. S. AU - Megy, K. AU - Marinotti, O. AU - James, A. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparative genomics allows the discovery of cis-regulatory elements in mosquitoes JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0813264106 DO - 10.1073/pnas.0813264106 ID - Sieglaff2009 ER - TY - JOUR AU - Dimon, M. T. AU - Sorber, K. AU - DeRisi, J. L. PY - 2010 DA - 2010// TI - HMMSplicer: a tool for efficient and sensitive discovery of known and novel splice junctions in RNA-seq data JO - PLoS ONE VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0013875 DO - 10.1371/journal.pone.0013875 ID - Dimon2010 ER - TY - JOUR AU - Hubbard, T. AU - Barker, D. AU - Birney, E. AU - Cameron, G. AU - Chen, Y. AU - Clark, L. AU - Cox, T. AU - Cuff, J. AU - Curwen, V. AU - Down, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - The Ensembl genome database project JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.1.38 DO - 10.1093/nar/30.1.38 ID - Hubbard2002 ER - TY - STD TI - VectorBase Aedes aegypti Liverpool annotation, AaegL1.2. [http://www.vectorbase.org] UR - http://www.vectorbase.org ID - ref61 ER - TY - JOUR AU - Bennet, K. E. AU - Olson, K. E. AU - Munoz, M. L. AU - Fernandez-Salas, I. AU - Farfan-Ale, J. A. AU - Higgs, S. AU - Black, W. C. AU - Beaty, B. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Variation in vector competence for dengue 2 virus among 24 collections of Ae. aegypti from Mexico and the United States JO - Am J Trop Med Hyg VL - 67 ID - Bennet2002 ER - TY - JOUR AU - Black, W. C. AU - Bennett, K. E. AU - Gorrochotegui-Escalante, N. AU - Barillas-Mury, C. V. AU - Fernandez-Salas, I. AU - Munoz, M. L. AU - Farfan-Ale, J. A. AU - Olson, K. E. AU - Beaty, B. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Flavivirus susceptibility in Ae. aegypti JO - Arch Med Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1016/S0188-4409(02)00373-9 DO - 10.1016/S0188-4409(02)00373-9 ID - Black2002 ER - TY - JOUR AU - Terenius, O. AU - Marinotti, O. AU - Sieglaff, D. AU - James, A. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Molecular genetic manipulation of vector mosquitoes JO - Cell Host Microbe VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.chom.2008.09.002 DO - 10.1016/j.chom.2008.09.002 ID - Terenius2008 ER - TY - JOUR AU - Macdonald, W. W. PY - 1963 DA - 1963// TI - Further studies on a strain of Aedes aegypti susceptible to infection with sub-periodic Brugia malayi JO - Ann Trop Med Parasitol VL - 57 UR - https://doi.org/10.1080/00034983.1963.11686200 DO - 10.1080/00034983.1963.11686200 ID - Macdonald1963 ER - TY - JOUR AU - Nene, V. AU - Wortman, J. R. AU - Lawson, D. AU - Haas, B. AU - Kodira, C. AU - Tu, Z. J. AU - Loftus, B. AU - Xi, Z. AU - Megy, K. AU - Grabherr, M. AU - Ren, Q. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1138878 DO - 10.1126/science.1138878 ID - Nene2007 ER - TY - STD TI - mRNA Sequencing Sample Preparation Guide. [http://www.illumina.com/support/documentation.ilmn] UR - http://www.illumina.com/support/documentation.ilmn ID - ref67 ER - TY - STD TI - UC Davis Genome Center- Expression Analysis Core. [http://genomecenter.ucdavis.edu/expression_analysis/] UR - http://genomecenter.ucdavis.edu/expression_analysis/ ID - ref68 ER - TY - JOUR AU - Langmead, B. AU - Trapnell, C. AU - Pop, M. AU - Salzberg, S. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome JO - Genome Biology VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-3-r25 DO - 10.1186/gb-2009-10-3-r25 ID - Langmead2009 ER - TY - JOUR AU - Quinlan, A. R. AU - Hall, I. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - BEDTools: A flexible suite of utilities for comparing genomic features JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq033 DO - 10.1093/bioinformatics/btq033 ID - Quinlan2010 ER - TY - JOUR AU - Wang, L. AU - Feng, Z. AU - Wang, X. AU - Wang, X. AU - Zhang, X. PY - 2010 DA - 2010// TI - DEGseq: an R package for identifying differentially expressed genes from RNA-seq data JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp612 DO - 10.1093/bioinformatics/btp612 ID - Wang2010 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Hochberg, Y. PY - 1995 DA - 1995// TI - Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing JO - J R Stat Soc Ser B VL - 57 ID - Benjamini1995 ER - TY - JOUR AU - Schmittgen, T. D. AU - Livak, K. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Analyzing real-time PCR data by the comparative C(T) method JO - Nat Protoc VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2008.73 DO - 10.1038/nprot.2008.73 ID - Schmittgen2008 ER -