TY - JOUR AU - Arumuganathan, K. AU - Earle, E. D. PY - 1991 DA - 1991// TI - Nuclear DNA content of some important plant species JO - Plant Mol Biol Rep VL - 9 UR - https://doi.org/10.1007/BF02672069 DO - 10.1007/BF02672069 ID - Arumuganathan1991 ER - TY - JOUR AU - Jander, G. AU - Norris, S. R. AU - Rounsley, S. D. AU - Bush, D. F. AU - Levin, I. M. AU - Last, R. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Arabidopsis map-based cloning in the post-genome era JO - Plant Physiol VL - 129 UR - https://doi.org/10.1104/pp.003533 DO - 10.1104/pp.003533 ID - Jander2002 ER - TY - JOUR AU - Bus, A. AU - Körber, N. AU - Snowdon, R. J. AU - Stich, B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Patterns of molecular variation in a species-wide germplasm set of Brassica napus JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1676-7 DO - 10.1007/s00122-011-1676-7 ID - Bus2011 ER - TY - JOUR AU - Ecke, W. AU - Clemens, R. AU - Honsdorf, N. AU - Becker, H. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Extent and structure of linkage disequilibrium in canola quality winter rapeseed (Brassica napus L.) JO - Theor Appl Genet VL - 120 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-009-1221-0 DO - 10.1007/s00122-009-1221-0 ID - Ecke2010 ER - TY - JOUR AU - Trick, M. AU - Long, Y. AU - Meng, J. AU - Bancroft, I. PY - 2009 DA - 2009// TI - Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery in the polyploid Brassica napus using Solexa transcriptome sequencing JO - Plant Biotech J VL - 7 UR - https://doi.org/10.1111/j.1467-7652.2008.00396.x DO - 10.1111/j.1467-7652.2008.00396.x ID - Trick2009 ER - TY - JOUR AU - Westermeier, P. AU - Wenzel, G. AU - Mohler, V. PY - 2009 DA - 2009// TI - Development and evaluation of single-nucleotide polymorphism markers in allotetraploid rapeseed (Brassica napus L.) JO - Theor Appl Genet VL - 119 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-009-1135-x DO - 10.1007/s00122-009-1135-x ID - Westermeier2009 ER - TY - JOUR AU - Zhu, C. AU - Gore, M. AU - Buckler, E. S. AU - Yu, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Status and prospects of association mapping in plants JO - Plant Genome VL - 1 UR - https://doi.org/10.3835/plantgenome2008.02.0089 DO - 10.3835/plantgenome2008.02.0089 ID - Zhu2008 ER - TY - JOUR AU - Chutimanitsakun, Y. AU - Nipper, R. W. AU - Cuesta-Marcos, A. AU - Cistué, L. AU - Corey, A. AU - Filichkina, T. AU - Johnson, E. A. AU - Hayes, P. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Construction and application for QTL analysis of a restriction site associated DNA (RAD) linkage map in barley JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-4 DO - 10.1186/1471-2164-12-4 ID - Chutimanitsakun2011 ER - TY - JOUR AU - Pfender, W. F. AU - Saha, M. C. AU - Johnson, E. A. AU - Slabaugh, M. B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Mapping with RAD (restriction-site associated DNA) markers to rapidly identify QTL for stem rust resistance in Lolium perenne JO - Theor Appl Genet VL - 122 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1546-3 DO - 10.1007/s00122-011-1546-3 ID - Pfender2011 ER - TY - JOUR AU - Nipper, R. W. AU - Atwood, T. S. AU - Boone, J. Q. AU - Gribbin, J. M. AU - Johnson, E. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - SNP discovery in Zea mays using sequenced restriction-site associated DNA markers JO - Acta Hortic VL - 859 ID - Nipper2009 ER - TY - JOUR AU - Barchi, L. AU - Lanteri, S. AU - Portis, E. AU - Acquadro, A. AU - Vale, G. AU - Toppino, L. AU - Rotino, G. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Identification of SNP and SSR markers in eggplant using RAD tag sequencing JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-304 DO - 10.1186/1471-2164-12-304 ID - Barchi2011 ER - TY - JOUR AU - Scaglione, D. AU - Acquadro, A. AU - Portis, E. AU - Tirone, M. AU - Knapp, S. J. AU - Lanteri, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - RAD tag sequencing as a source of SNP markers in Cynara cardunculus L JO - BMC Genomics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-3 DO - 10.1186/1471-2164-13-3 ID - Scaglione2012 ER - TY - JOUR AU - Nelson, J. C. AU - Wang, S. AU - Wu, Y. AU - Li, X. AU - Antony, G. AU - White, F. F. AU - Yu, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Single-nucleotide polymorphism discovery by high-throughput sequencing in sorghum JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-352 DO - 10.1186/1471-2164-12-352 ID - Nelson2011 ER - TY - JOUR AU - Hohenlohe, P. A. AU - Bassham, S. AU - Currey, M. AU - Cresko, W. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Extensive linkage disequilibrium and parallel adaptive divergence across threespine stickleback genomes JO - Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci VL - 367 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.2011.0245 DO - 10.1098/rstb.2011.0245 ID - Hohenlohe2012 ER - TY - JOUR AU - Johnston, J. S. AU - Pepper, A. E. AU - Hall, A. E. AU - Chen, Z. J. AU - Hodnett, G. AU - Drabek, J. AU - Lopez, R. AU - Price, H. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Evolution of genome size in Brassicaceae JO - Ann Bot VL - 95 UR - https://doi.org/10.1093/aob/mci016 DO - 10.1093/aob/mci016 ID - Johnston2005 ER - TY - JOUR AU - Mun, J. H. AU - Kwon, S. J. AU - Yang, T. J. AU - Seol, Y. J. AU - Jin, M. AU - Kim, J. A. AU - Lim, M. H. AU - Kim, J. S. AU - Baek, S. AU - Choi, B. S. AU - Yu, H. J. AU - Kim, D. S. AU - Kim, N. AU - Lim, K. B. AU - Lee, S. I. AU - Hahn, J. H. AU - Lim, Y. P. AU - Bancroft, I. AU - Park, B. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genome-wide comparative analysis of the Brassica rapa gene space reveals genome shrinkage and differential loss of duplicated genes after whole genome triplication JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-10-r111 DO - 10.1186/gb-2009-10-10-r111 ID - Mun2009 ER - TY - JOUR AU - Trick, M. AU - Kwon, S. J. AU - Choi, S. R. AU - Fraser, F. AU - Soumpourou, E. AU - Drou, N. AU - Wang, Z. AU - Lee, S. Y. AU - Yang, T. J. AU - Mun, J. H. AU - Paterson, A. H. AU - Town, C. D. AU - Pires, J. C. AU - Lim, Y. P. AU - Park, B. S. AU - Bancroft, I. PY - 2009 DA - 2009// TI - Complexity of genome evolution by segmental rearrangement in Brassica rapa revealed by sequence-level analysis JO - BMC Genomics VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-10-539 DO - 10.1186/1471-2164-10-539 ID - Trick2009 ER - TY - JOUR AU - Town, C. D. AU - Cheung, F. AU - Maiti, R. AU - Crabtree, J. AU - Haas, B. J. AU - Wortman, J. R. AU - Hine, E. E. AU - Althoff, R. AU - Arbogast, T. S. AU - Tallon, L. J. AU - Vigouroux, M. AU - Trick, M. AU - Bancroft, I. PY - 2006 DA - 2006// TI - Comparative genomics of Brassica oleracea and Arabidopsis thaliana reveal gene loss, fragmentation, and dispersal after polyploidy JO - Plant Cell VL - 18 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.106.041665 DO - 10.1105/tpc.106.041665 ID - Town2006 ER - TY - JOUR AU - Cheng, F. AU - Liu, S. AU - Wu, J. AU - Fang, L. AU - Sun, S. AU - Liu, B. AU - Li, P. AU - Hua, W. AU - Wang, X. PY - 2011 DA - 2011// TI - BRAD, the genetics and genomics database for Brassica plants JO - BMC Plant Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-11-136 DO - 10.1186/1471-2229-11-136 ID - Cheng2011 ER - TY - JOUR AU - Batley, J. AU - Barker, G. AU - O’Sullivan, H. AU - Edwards, K. J. AU - Edwards, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Mining for single nucleotide polymorphisms and insertions/deletions in maize expressed sequence tag data JO - Plant Physiol VL - 132 UR - https://doi.org/10.1104/pp.102.019422 DO - 10.1104/pp.102.019422 ID - Batley2003 ER - TY - JOUR AU - Yang, Z. AU - Yoder, A. D. PY - 1999 DA - 1999// TI - Estimation of the transition/transversion rate bias and species sampling JO - J Mol Evol VL - 48 UR - https://doi.org/10.1007/PL00006470 DO - 10.1007/PL00006470 ID - Yang1999 ER - TY - JOUR AU - Park, S. AU - Yu, H. J. AU - Mun, J. H. AU - Lee, S. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome-wide discovery of DNA polymorphism in Brassica rapa JO - Mol Genet Genomics VL - 283 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-009-0504-0 DO - 10.1007/s00438-009-0504-0 ID - Park2010 ER - TY - JOUR AU - Baird, N. A. AU - Etter, P. D. AU - Atwood, T. S. AU - Currey, M. C. AU - Shiver, A. L. AU - Lewis, Z. A. AU - Selker, E. U. AU - Cresko, W. A. AU - Johnson, E. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rapid SNP discovery and genetic mapping using sequenced RAD markers JO - PLoS ONE VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0003376 DO - 10.1371/journal.pone.0003376 ID - Baird2008 ER - TY - JOUR AU - Baxter, S. W. AU - Davey, J. W. AU - Johnston, J. S. AU - Shelton, A. M. AU - Heckel, D. G. AU - Jiggins, C. D. AU - Blaxter, M. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Linkage mapping and comparative genomics using next-generation RAD sequencing of a non-model organism JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019315 DO - 10.1371/journal.pone.0019315 ID - Baxter2011 ER - TY - BOOK AU - Wright, S. PY - 1978 DA - 1978// TI - Evolution and Genetics of Populations. Volume IV PB - The University of Chicago Press CY - Chicago ID - Wright1978 ER - TY - JOUR PY - 2011 DA - 2011// TI - The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa JO - Nat Genet VL - 43 UR - https://doi.org/10.1038/ng.919 DO - 10.1038/ng.919 ID - ref26 ER - TY - JOUR AU - McCarthy, F. M. AU - Wang, N. AU - Magee, G. B. AU - Nanduri, B. AU - Lawrence, M. L. AU - Camon, E. B. AU - Barrell, D. G. AU - Hill, D. P. AU - Dolan, M. E. AU - Williams, W. P. AU - Luthe, D. S. AU - Bridges, S. M. AU - Burgess, S. C. PY - 2006 DA - 2006// TI - AgBase: a functional genomics resource for agriculture JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-229 DO - 10.1186/1471-2164-7-229 ID - McCarthy2006 ER - TY - BOOK PY - 2011 DA - 2011// TI - R: A Language and Environment for Statistical Computing PB - R Foundation for Statistical Computing CY - Vienna, Austria ID - ref28 ER -