TY - JOUR AU - Akbari, M. AU - Wenzl, P. AU - Caig, V. AU - Carling, J. AU - Xia, L. AU - Yang, S. AU - Uszynski, G. AU - Mohler, V. AU - Lehmensiek, A. AU - Kuchel, H. AU - Hayden, M. J. AU - Howes, N. AU - Sharp, P. AU - Vaughan, P. AU - Rathmell, B. AU - Huttner, E. AU - Kilian, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Diversity arrays technology (DArT) for high-throughput profiling of the hexaploid wheat genome JO - Theor Appl Genet VL - 113 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0365-4 DO - 10.1007/s00122-006-0365-4 ID - Akbari2006 ER - TY - JOUR AU - Cho, R. J. AU - Mindrinos, M. AU - Richards, D. R. AU - Sapolsky, R. J. AU - Anderson, M. AU - Drenkard, E. AU - Dewdney, J. AU - Reuber, T. L. AU - Stammers, M. AU - Federspiel, N. AU - Theologis, A. AU - Yang, W. H. AU - Hubbell, E. AU - Au, M. AU - Chung, E. Y. AU - Lashkari, D. AU - Lemieux, B. AU - Dean, C. AU - Lipshutz, R. J. AU - Ausubel, F. M. AU - Davis, R. W. AU - Oefner, P. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Genome-wide mapping with biallelic markers in Arabidopsis thaliana JO - Nat Genet VL - 23 UR - https://doi.org/10.1038/13833 DO - 10.1038/13833 ID - Cho1999 ER - TY - JOUR AU - Sargent, D. J. AU - Clarke, J. AU - Simpson, D. AU - Tobutt, K. AU - Arus, P. AU - Monfort, A. AU - Vilanova, S. AU - Denoyes-Rothan, B. AU - Rousseau, M. AU - Folta, K. PY - 2006 DA - 2006// TI - An enhanced microsatellite map of diploid Fragaria JO - Theor Appl Genet VL - 112 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0237-y DO - 10.1007/s00122-006-0237-y ID - Sargent2006 ER - TY - JOUR AU - Sargent, D. J. AU - Fernández-Fernández, F. AU - Rys, A. AU - Knight, V. H. AU - Simpson, D. W. AU - Tobutt, K. R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mapping of A1 conferring resistance to the aphid Amphorophora idaei and dw (dwarfing habit) in red raspberry (Rubus idaeus L.) using AFLP and microsatellite markers JO - BMC Plant Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-7-15 DO - 10.1186/1471-2229-7-15 ID - Sargent2007 ER - TY - JOUR AU - Tanksley, S. AU - Ganal, M. AU - Prince, J. AU - De-Vicente, M. AU - Bonierbale, M. AU - Broun, P. AU - Fulton, T. AU - Giovannoni, J. AU - Grandillo, S. AU - Martin, G. PY - 1992 DA - 1992// TI - High density molecular linkage maps of the tomato and potato genomes JO - Genetics VL - 132 ID - Tanksley1992 ER - TY - JOUR AU - Velasco, R. AU - Zharkikh, A. AU - Affourtit, J. AU - Dhingra, A. AU - Cestaro, A. AU - Kalyanaraman, A. AU - Fontana, P. AU - Bhatnagar, S. K. AU - Troggio, M. AU - Pruss, D. AU - Salvi, S. AU - Pindo, M. AU - Baldi, P. AU - Castelletti, S. AU - Cavaiuolo, M. AU - Coppola, G. AU - Costa, F. AU - Cova, V. AU - Dal Ri, A. AU - Goremykin, V. AU - Komjanc, M. AU - Longhi, S. AU - Magnago, P. AU - Malacarne, G. AU - Malnoy, M. AU - Micheletti, D. AU - Moretto, M. AU - Perazzolli, M. AU - Si-Ammour, A. AU - Vezzulli, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - The genome of the domesticated apple (Malus × domestica Borkh.) JO - Nat Genet VL - 42 UR - https://doi.org/10.1038/ng.654 DO - 10.1038/ng.654 ID - Velasco2010 ER - TY - JOUR AU - Vezzulli, S. AU - Troggio, M. AU - Coppola, G. AU - Jermakow, A. AU - Cartwright, D. AU - Zharkikh, A. AU - Stefanini, M. AU - Grando, M. S. AU - Viola, R. AU - Adam-Blondon, A. -. F. AU - Thomas, M. AU - This, P. AU - Velasco, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - A reference integrated map for cultivated grapevine (Vitis vinifera L.) from three crosses, based on 283 SSR and 501 SNP-based markers JO - Theor Appl Genet VL - 117 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-008-0794-3 DO - 10.1007/s00122-008-0794-3 ID - Vezzulli2008 ER - TY - JOUR AU - Fernández-Fernández, F. AU - Antanaviciute, L. AU - Govan, C. AU - Sargent, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Development of a multiplexed microsatellite set for fingerprinting red raspberry (Rubus idaeus) germplasm and its transferability to other Rubus species JO - J Berry Res VL - 1 ID - Fernández-Fernández2011 ER - TY - JOUR AU - Illa, E. AU - Lambert, P. AU - Quilot, B. AU - Audergon, J. AU - Dirlewanger, E. AU - Howad, W. AU - Dondini, L. AU - Tartarini, S. AU - Lain, O. AU - Testolin, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Linkage map saturation, construction, and comparison in four populations of Prunus JO - J Horticultural Sci Biotechnol ISAFRUIT Spec Issue VL - 84 ID - Illa2009 ER - TY - JOUR AU - Eshed, Y. AU - Zamir, D. PY - 1995 DA - 1995// TI - An introgression line population of Lycopersicon pennellii in the cultivated tomato enables the identification and fine mapping of yield-associated QTL JO - Genetics VL - 141 ID - Eshed1995 ER - TY - JOUR AU - Sargent, D. J. AU - Passey, T. AU - Surbanovski, N. AU - Lopez Girona, E. AU - Kuchta, P. AU - Davik, J. AU - Harrison, R. AU - Passey, A. AU - Whitehouse, A. B. AU - Simpson, D. W. PY - 2012 DA - 2012// TI - A microsatellite linkage map for the cultivated strawberry (Fragaria × ananassa) suggests extensive regions of homozygosity in the genome that may have resulted from breeding and selection JO - Theor Appl Genet VL - 124 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1782-6 DO - 10.1007/s00122-011-1782-6 ID - Sargent2012 ER - TY - JOUR AU - Silfverberg-Dilworth, E. AU - Matasci, C. AU - de Weg, W. AU - Van Kaauwen, M. P. W. AU - Walser, M. AU - Kodde, L. AU - Soglio, V. AU - Gianfranceschi, L. AU - Durel, C. AU - Costa, F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Microsatellite markers spanning the apple (Malus x domestica Borkh.) genome JO - Tree Genet Genomes VL - 2 UR - https://doi.org/10.1007/s11295-006-0045-1 DO - 10.1007/s11295-006-0045-1 ID - Silfverberg-Dilworth2006 ER - TY - JOUR PY - 2005 DA - 2005// TI - The map-based sequence of the rice genome JO - Nature VL - 436 UR - https://doi.org/10.1038/nature03895 DO - 10.1038/nature03895 ID - ref13 ER - TY - JOUR AU - Shulaev, V. AU - Sargent, D. J. AU - Crowhurst, R. N. AU - Mockler, T. AU - Folkerts, O. AU - Delcher, A. L. AU - Jaiswal, P. AU - Mockaitis, K. AU - Liston, A. AU - Mane, S. AU - Burns, P. AU - Davis, T. M. AU - Slovin, J. P. AU - Bassil, N. V. AU - Hellens, R. P. AU - Evans, C. AU - Harkins, T. AU - Kodira, C. AU - Desany, B. AU - Crasta, O. R. AU - Jensen, R. V. AU - Allan, A. C. AU - Michael, T. P. AU - Setubal, J. C. AU - Celton, J. -. M. AU - Rees, D. J. G. AU - Williams, K. P. AU - Holt, S. H. AU - Ruiz Rojas, J. J. AU - Chatterjee, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - The genome of woodland strawberry (Fragaria vesca) JO - Nat Genet VL - 43 UR - https://doi.org/10.1038/ng.740 DO - 10.1038/ng.740 ID - Shulaev2011 ER - TY - JOUR AU - Velasco, R. AU - Zharkikh, A. AU - Troggio, M. AU - Cartwright, D. A. AU - Cestaro, A. AU - Pruss, D. AU - Pindo, M. AU - Fitzgerald, L. M. AU - Vezzulli, S. AU - Reid, J. AU - Malacarne, G. AU - Iliev, D. AU - Coppola, G. AU - Wardell, B. AU - Micheletti, D. AU - Macalma, T. AU - Facci, M. AU - Mitchell, J. T. AU - Perazzolli, M. AU - Eldredge, G. AU - Gatto, P. AU - Oyzerski, R. AU - Moretto, M. AU - Gutin, N. AU - Stefanini, M. AU - Chen, Y. -. J. AU - Segala, C. AU - Davenport, C. AU - Demattè, L. AU - Mraz, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - A High Quality Draft Consensus Sequence of the Genome of a Heterozygous Grapevine Variety JO - PLoS One VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0001326 DO - 10.1371/journal.pone.0001326 ID - Velasco2007 ER - TY - JOUR AU - Zhebentyayeva, T. N. AU - Swire-Clark, G. AU - Georgi, L. L. AU - Garay, L. AU - Jung, S. AU - Forrest, S. AU - Blenda, A. V. AU - Blackmon, B. AU - Mook, J. AU - Horn, R. AU - Howad, W. AU - Arus, P. AU - Main, D. S. AU - Tomkins, J. P. AU - Sosinski, B. AU - Baird, W. V. AU - Reighard, G. L. AU - Abbott, A. G. PY - 2008 DA - 2008// TI - A framework physical map for peach, a model Rosaceae species JO - Tree Genet Genomes VL - 4 UR - https://doi.org/10.1007/s11295-008-0147-z DO - 10.1007/s11295-008-0147-z ID - Zhebentyayeva2008 ER - TY - JOUR AU - Velasco, R. AU - Zharkikh, A. AU - Affourtit, J. AU - Dhingra, A. AU - Cestaro, A. AU - Kalyanaraman, A. AU - Fontana, P. AU - Bhatnagar, S. K. AU - Troggio, M. AU - Pruss, D. AU - Salvi, S. AU - Pindo, M. AU - Baldi, P. AU - Castelletti, S. AU - Cavaiuolo, M. AU - Coppola, G. AU - Costa, F. AU - Cova, V. AU - Ri, A. D. AU - Goremykin, V. AU - Komjanc, M. AU - Longhi, S. AU - Magnago, P. AU - Malacarne, G. AU - Malnoy, M. AU - Micheletti, D. AU - Moretto, M. AU - Perazzolli, M. AU - Si-Ammour, A. AU - Vezzulli, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - The genome of the domesticated apple (Malus × domestica Borkh.) JO - Nat Genet VL - 42 UR - https://doi.org/10.1038/ng.654 DO - 10.1038/ng.654 ID - Velasco2010 ER - TY - JOUR AU - Argout, X. AU - Salse, J. AU - Aury, J. -. M. AU - Guiltinan, M. J. AU - Droc, G. AU - Gouzy, J. AU - Allegre, M. AU - Chaparro, C. AU - Legavre, T. AU - Maximova, S. N. AU - Abrouk, M. AU - Murat, F. AU - Fouet, O. AU - Poulain, J. AU - Ruiz, M. AU - Roguet, Y. AU - Rodier-Goud, M. AU - Barbosa-Neto, J. F. AU - Sabot, F. AU - Kudrna, D. AU - Ammiraju, J. S. S. AU - Schuster, S. C. AU - Carlson, J. E. AU - Sallet, E. AU - Schiex, T. AU - Dievart, A. AU - Kramer, M. AU - Gelley, L. AU - Shi, Z. AU - Bérard, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - The genome of Theobroma cacao JO - Nat Genet VL - 43 UR - https://doi.org/10.1038/ng.736 DO - 10.1038/ng.736 ID - Argout2010 ER - TY - JOUR AU - Huang, S. AU - Li, R. AU - Zhang, Z. AU - Li, L. AU - Gu, X. AU - Fan, W. AU - Lucas, W. J. AU - Wang, X. AU - Xie, B. AU - Ni, P. AU - Ren, Y. AU - Zhu, H. AU - Li, J. AU - Lin, K. AU - Jin, W. AU - Fei, Z. AU - Li, G. AU - Staub, J. AU - Kilian, A. AU - van der Vossen, E. AU - Wu, Y. AU - Guo, J. AU - He, J. AU - Jia, Z. AU - Ren, Y. AU - Tian, G. AU - Lu, Y. AU - Ruan, J. AU - Qian, W. AU - Wang, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - The genome of the cucumber, Cucumis sativus L JO - Nat Genet VL - 41 UR - https://doi.org/10.1038/ng.475 DO - 10.1038/ng.475 ID - Huang2009 ER - TY - JOUR AU - Varshney, R. K. AU - Chen, W. AU - Li, Y. AU - Bharti, A. K. AU - Saxena, R. K. AU - Schlueter, J. A. AU - Donoghue, M. T. A. AU - Azam, S. AU - Fan, G. AU - Whaley, A. M. AU - Farmer, A. D. AU - Sheridan, J. AU - Iwata, A. AU - Tuteja, R. AU - Penmetsa, R. V. AU - Wu, W. AU - Upadhyaya, H. D. AU - Yang, S. -. P. AU - Shah, T. AU - Saxena, K. B. AU - Michael, T. AU - McCombie, W. R. AU - Yang, B. AU - Zhang, G. AU - Yang, H. AU - Wang, J. AU - Spillane, C. AU - Cook, D. R. AU - May, G. D. AU - Xu, X. PY - 2012 DA - 2012// TI - Draft genome sequence of pigeonpea (Cajanus cajan), an orphan legume crop of resource-poor farmers JO - Nat Biotechnol VL - 30 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.2022 DO - 10.1038/nbt.2022 ID - Varshney2012 ER - TY - JOUR AU - Celton, J. -. M. AU - Christoffels, A. AU - Sargent, D. J. AU - Xu, X. AU - Rees, D. J. G. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome-wide SNP identification by high-throughput sequencing and selective mapping allows sequence assembly positioning using a framework genetic linkage map JO - BMC Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1741-7007-8-155 DO - 10.1186/1741-7007-8-155 ID - Celton2010 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Crowhurst, R. N. AU - Troggio, M. AU - Davey, M. W. AU - Gilmore, B. AU - Lawley, C. AU - Vanderzande, S. AU - Hellens, R. P. AU - Kumar, S. AU - Cestaro, A. AU - Velasco, R. AU - Main, D. S. AU - Rees, J. D. AU - Iezzoni, A. AU - Mockler, T. AU - Wilhelm, L. AU - Van de Weg, E. AU - Gardiner, S. E. AU - Bassil, N. V. AU - Peace, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genome-Wide SNP Detection, Validation, and Development of an 8K SNP Array for Apple JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0031745 DO - 10.1371/journal.pone.0031745 ID - Chagné2012 ER - TY - JOUR AU - Myles, S. AU - Chia, J. -. M. AU - Hurwitz, B. AU - Simon, C. AU - Zhong, G. Y. AU - Buckler, E. AU - Ware, D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Rapid genomic characterization of the genus vitis JO - PLoS One VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0008219 DO - 10.1371/journal.pone.0008219 ID - Myles2010 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Gasic, K. AU - Crowhurst, R. N. AU - Han, Y. AU - Bassett, H. C. AU - Bowatte, D. R. AU - Lawrence, T. J. AU - Rikkerink, E. H. A. AU - Gardiner, S. E. AU - Korban, S. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Development of a set of SNP markers present in expressed genes of the apple JO - Genomics VL - 92 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2008.07.008 DO - 10.1016/j.ygeno.2008.07.008 ID - Chagné2008 ER - TY - JOUR AU - Konieczny, A. AU - Ausubel, F. M. PY - 1993 DA - 1993// TI - A procedure for mapping Arabidopsis mutations using co-dominant ecotype-specific PCR-based markers JO - Plant J VL - 4 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1993.04020403.x DO - 10.1046/j.1365-313X.1993.04020403.x ID - Konieczny1993 ER - TY - JOUR AU - Antanaviciute, L. AU - Fernández-Fernández, F. AU - Jansen, J. AU - Banchi, E. AU - Evans, K. M. AU - Viola, R. AU - Velasco, R. AU - Dunwell, J. M. AU - Troggio, M. AU - Sargent, D. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Development of a dense SNP-based linkage map of an apple rootstock progeny using the Malus Infinium whole genome genotyping array JO - BMC Genomics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-203 DO - 10.1186/1471-2164-13-203 ID - Antanaviciute2012 ER - TY - JOUR AU - Huo, N. AU - Garvin, D. F. AU - You, F. M. AU - McMahon, S. AU - Luo, M. -. C. AU - Gu, Y. Q. AU - Lazo, G. R. AU - Vogel, J. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Comparison of a high-density genetic linkage map to genome features in the model grass Brachypodium distachyon JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1598-4 DO - 10.1007/s00122-011-1598-4 ID - Huo2011 ER - TY - JOUR AU - Pindo, M. AU - Vezzulli, S. AU - Coppola, G. AU - Cartwright, D. A. AU - Zharkikh, A. AU - Velasco, R. AU - Troggio, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - SNP high-throughput screening in grapevine using the SNPlex™ genotyping system JO - BMC Plant Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-8-12 DO - 10.1186/1471-2229-8-12 ID - Pindo2008 ER - TY - JOUR AU - Verde, I. AU - Bassil, N. V. AU - Scalabrin, S. AU - Gilmore, B. AU - Lawley, C. T. AU - Gasic, K. AU - Micheletti, D. AU - Rosyara, U. R. AU - Cattonaro, F. AU - Vendramin, E. AU - Main, D. S. AU - Aramini, V. AU - Blas, A. L. AU - Mockler, T. AU - Bryant, D. W. AU - Wilhelm, L. AU - Troggio, M. AU - Sosinski, B. AU - Aranzana, M. J. AU - Arus, P. AU - Iezzoni, A. AU - Morgante, M. AU - Peace, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Development and Evaluation of a 9K SNP Array for Peach by Internationally Coordinated SNP Detection and Validation in Breeding Germplasm JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0035668 DO - 10.1371/journal.pone.0035668 ID - Verde2012 ER - TY - JOUR AU - Micheletti, D. AU - Troggio, M. AU - Zharkikh, A. AU - Costa, F. AU - Malnoy, M. AU - Velasco, R. AU - Salvi, S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genetic diversity of the genus Malus and implications for linkage mapping with SNPs JO - Tree Genetics & Genomes VL - 7 UR - https://doi.org/10.1007/s11295-011-0380-8 DO - 10.1007/s11295-011-0380-8 ID - Micheletti2011 ER - TY - JOUR AU - Miller, M. R. AU - Dunham, J. P. AU - Amores, A. AU - Cresko, W. A. AU - Johnson, E. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Rapid and cost-effective polymorphism identification and genotyping using restriction site associated DNA (RAD) markers JO - Genome Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.1101/gr.5681207 DO - 10.1101/gr.5681207 ID - Miller2007 ER - TY - JOUR AU - Baird, N. A. AU - Etter, P. D. AU - Atwood, T. S. AU - Currey, M. C. AU - Shiver, A. L. AU - Lewis, Z. A. AU - Selker, E. U. AU - Cresko, W. A. AU - Johnson, E. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rapid SNP Discovery and Genetic Mapping Using Sequenced RAD Markers JO - PLoS One VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0003376 DO - 10.1371/journal.pone.0003376 ID - Baird2008 ER - TY - JOUR AU - Barchi, L. AU - Lanteri, S. AU - Portis, E. AU - Acquadro, A. AU - Valè, G. AU - Toppino, L. AU - Rotino, G. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Identification of SNP and SSR markers in eggplant using RAD tag sequencing JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-304 DO - 10.1186/1471-2164-12-304 ID - Barchi2011 ER - TY - JOUR AU - Chutimanitsakun, Y. AU - Nipper, R. W. AU - Cuesta-Marcos, A. AU - Cistué, L. AU - Corey, A. AU - Filichkina, T. AU - Johnson, E. A. AU - Hayes, P. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Construction and application for QTL analysis of a Restriction Site Associated DNA (RAD) linkage map in barley JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-4 DO - 10.1186/1471-2164-12-4 ID - Chutimanitsakun2011 ER - TY - JOUR AU - Scaglione, D. AU - Acquadro, A. AU - Portis, E. AU - Tirone, M. AU - Knapp, S. J. AU - Lanteri, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - RAD tag sequencing as a source of SNP markers in Cynara cardunculus L JO - BMC Genomics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-3 DO - 10.1186/1471-2164-13-3 ID - Scaglione2012 ER - TY - JOUR AU - Pfender, W. F. AU - Saha, M. C. AU - Johnson, E. A. AU - Slabaugh, M. B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Mapping with RAD (restriction-site associated DNA) markers to rapidly identify QTL for stem rust resistance in Lolium perenne JO - Theor Appl Genet VL - 122 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1546-3 DO - 10.1007/s00122-011-1546-3 ID - Pfender2011 ER - TY - JOUR AU - Elshire, R. J. AU - Glaubitz, J. C. AU - Sun, Q. AU - Poland, J. AU - Kawamoto, K. AU - Buckler, E. S. AU - Mitchell, S. E. PY - 2011 DA - 2011// TI - A Robust, Simple Genotyping-by-Sequencing (GBS) Approach for High Diversity Species JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019379 DO - 10.1371/journal.pone.0019379 ID - Elshire2011 ER - TY - JOUR AU - Heslot, N. AU - Yang, H. -. P. AU - Sorrells, M. E. AU - Jannink, J. -. L. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genomic Selection in Plant Breeding: A Comparison of Models JO - Crop Sci VL - 52 UR - https://doi.org/10.2135/cropsci2011.06.0297 DO - 10.2135/cropsci2011.06.0297 ID - Heslot2012 ER - TY - JOUR AU - Castillo, N. R. F. AU - Reed, B. M. AU - Graham, J. AU - Fernández-Fernández, F. AU - Bassil, N. V. PY - 2010 DA - 2010// TI - Microsatellite markers for raspberry and blackberry JO - J Am Soc Hortic Sci VL - 135 ID - Castillo2010 ER - TY - JOUR AU - Graham, J. AU - Smith, K. AU - Woodhead, M. AU - Russell, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Development and use of simple sequence repeat SSR markers in Rubus species JO - Mol Ecol Notes VL - 2 UR - https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2002.00203.x DO - 10.1046/j.1471-8286.2002.00203.x ID - Graham2002 ER - TY - JOUR AU - Graham, J. AU - Smith, K. AU - Mackenzie, K. AU - Jorgenson, L. AU - Hackett, C. AU - Powell, W. PY - 2004 DA - 2004// TI - The construction of a genetic linkage map of red raspberry (Rubus idaeus subsp. idaeus) based on AFLPs, genomic-SSR and EST-SSR markers JO - Theor Appl Genet VL - 109 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-004-1687-8 DO - 10.1007/s00122-004-1687-8 ID - Graham2004 ER - TY - JOUR AU - Graham, J. AU - Smith, K. AU - Tierney, I. AU - Mackenzie, K. AU - Hackett, C. PY - 2006 DA - 2006// TI - Mapping gene H controlling cane pubescence in raspberry and its association with resistance to cane botrytis and spur blight, rust and cane spot JO - Theor Appl Genet VL - 112 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-005-0184-z DO - 10.1007/s00122-005-0184-z ID - Graham2006 ER - TY - JOUR AU - Woodhead, M. AU - McCallum, S. AU - Smith, K. AU - Cardle, L. AU - Mazzitelli, L. AU - Graham, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Identification, characterisation and mapping of simple sequence repeat (SSR) markers from raspberry root and bud ESTs JO - Mol Breed VL - 22 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-008-9198-y DO - 10.1007/s11032-008-9198-y ID - Woodhead2008 ER - TY - JOUR AU - Bushakra, J. M. AU - Stephens, M. J. AU - Atmadjaja, A. N. AU - Lewers, K. AU - Symonds, V. V. AU - Udall, J. A. AU - Chagné, D. AU - Buck, E. J. AU - Gardiner, S. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Construction of black (Rubus occidentalis) and red (R. idaeus) raspberry linkage maps and their comparison to the genomes of strawberry, apple, and peach JO - Theor Appl Genet VL - 125 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-012-1835-5 DO - 10.1007/s00122-012-1835-5 ID - Bushakra2012 ER - TY - JOUR AU - Graham, J. AU - Hackett, C. AU - Smith, K. AU - Woodhead, M. AU - Mackenzie, K. AU - Tierney, I. AU - Cooke, D. AU - Bayer, M. AU - Jennings, N. PY - 2011 DA - 2011// TI - Towards an understanding of the nature of resistance to Phytophthora root rot in red raspberry JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1609-5 DO - 10.1007/s00122-011-1609-5 ID - Graham2011 ER - TY - JOUR AU - Catchen, J. M. AU - Amores, A. AU - Hohenlohe, P. AU - Cresko, W. AU - Postlethwait, J. H. PY - 2011 DA - 2011// TI - Stacks: building and genotyping Loci de novo from short-read sequences JO - G3 (Bethesda) VL - 1 UR - https://doi.org/10.1534/g3.111.000240 DO - 10.1534/g3.111.000240 ID - Catchen2011 ER - TY - JOUR AU - Pattison, J. A. AU - Samuelian, S. K. AU - Weber, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Inheritance of Phytophthora root rot resistance in red raspberry determined by generation means and molecular linkage analysis JO - Theor Appl Genet VL - 115 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-007-0558-5 DO - 10.1007/s00122-007-0558-5 ID - Pattison2007 ER - TY - JOUR AU - Spiller, M. AU - Linde, M. AU - Hibrand-Saint Oyant, L. AU - Tsai, C. -. J. AU - Byrne, D. H. AU - Smulders, M. J. M. AU - Foucher, F. AU - Debener, T. PY - 2010 DA - 2010// TI - Towards a unified genetic map for diploid roses JO - Theor Appl Genet VL - 122 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-010-1463-x DO - 10.1007/s00122-010-1463-x ID - Spiller2010 ER - TY - JOUR AU - Dale, A. AU - Moore, P. P. AU - McNicol, R. J. AU - Sjulin, T. M. AU - Burmistrov, L. A. PY - 1993 DA - 1993// TI - Genetic Diversity of Red Raspberry Varieties throughout the-World JO - J Am Soc Hortic Sci VL - 118 ID - Dale1993 ER - TY - STD TI - Ward J, Price J, Clement MJ, Schatz MC, Weber C, Swanson J, Bodily P, Lewers K, Fernández-Fernández F, Burns P, Velasco R, Sargent DJ, Udall J: Plant and Animal Genome XX. A Draft Assembly AndAnalysis Of The Highly Heterozygous Diploid Red Raspberry Genome. https://pag.confex.com/pag/xx/webprogram/Paper1359.html ID - ref50 ER - TY - JOUR AU - Jennings, D. PY - 1967 DA - 1967// TI - Balanced lethals and polymorphism in Rubus idaeus JO - Heredity VL - 22 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.1967.64 DO - 10.1038/hdy.1967.64 ID - Jennings1967 ER - TY - JOUR AU - Jennings, D. PY - 1972 DA - 1972// TI - Aberrant segregation of a gene in the raspberry and its association with effects on seed development JO - Heredity VL - 29 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.1972.66 DO - 10.1038/hdy.1972.66 ID - Jennings1972 ER - TY - JOUR AU - Keep, E. PY - 1968 DA - 1968// TI - Incompatibility in Rubus with Special Reference to R. Idaeus L JO - Can J Genet Cytol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1139/g68-037 DO - 10.1139/g68-037 ID - Keep1968 ER - TY - BOOK PY - 2012 DA - 2012// TI - GBS barcode splitter ID - ref54 ER - TY - JOUR AU - Langmead, B. AU - Trapnell, C. AU - Pop, M. AU - Salzberg, S. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-3-r25 DO - 10.1186/gb-2009-10-3-r25 ID - Langmead2009 ER - TY - JOUR AU - Voorrips, R. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - MapChart: software for the graphical presentation of linkage maps and QTLs JO - J Hered VL - 93 UR - https://doi.org/10.1093/jhered/93.1.77 DO - 10.1093/jhered/93.1.77 ID - Voorrips2002 ER -