Table 2 A. pleuropneumoniae S4074 genes of interest that were differentially expressed in biofilms
Locus tag | Gene | Conditions | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Â | 4 h-static biofilm | 6 h-static biofilm | 4 h vs 6 h static biofilms | Drip-flow biofilm | ||||
| Â | Â | Up | Down | Up | Down | Up | Down | Up | Down |
APL_0048 | arcA |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0049 |  |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0189 | dus |  | √ |  |  |  | √ | √ |  |
APL_0234 |  |  |  |  |  |  |  |  | √ |
APL_0236 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0330 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0331 | hlp |  |  |  |  |  |  |  | √ |
APL_0364 | ssa1 /aasP |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0379 | glpA |  | √ |  |  |  |  |  |  |
APL_0381 | glpC |  | √ |  |  |  |  |  |  |
APL_0382 | ribD |  |  | √ |  | √ |  | √ |  |
APL_0383 | ribE |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_0384 | ribA |  |  |  | √ |  |  |  |  |
APL_0391 | macA |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0394 | rpoE |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0395 | rseA |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0443 |  |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0449 |  |  |  |  |  | √ |  | √ |  |
APL_0626 | macB |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0627 | cpxA | √ |  |  |  |  |  |  |  |
APL_0629 | cpxR |  |  |  |  |  |  |  | √ |
APL_0840 | tolC |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_0891 | fdhD |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_0892 | fdxG |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_0893 | fdxG |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_0894 | fdxH |  | √ |  | √ | √ |  |  |  |
APL_0895 | fdnI |  | √ |  | √ | √ |  |  |  |
APL_0896 | fdhE |  | √ |  | √ |  |  |  |  |
APL_0936 |  |  |  |  |  |  |  | √ |  |
APL_0959 |  |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_1045 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_1110 |  |  |  |  |  |  |  | √ |  |
APL_1159 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_1387 |  |  |  | √ |  | √ |  | √ |  |
APL_1494 | ftpA |  |  |  |  |  |  |  | √ |
APL_1550 | wecD |  |  |  |  | √ |  |  |  |
APL_1552 | wecB |  |  |  |  | √ |  |  |  |
APL_1553 |  |  |  |  |  | √ |  |  |  |
APL_1554 | wecA |  |  | √ |  | √ |  |  |  |
APL_1674 | dmsA |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_1675 | dmsB |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_1676 | dmsC |  |  |  | √ | √ |  |  |  |
APL_1875 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_1921 | pgaA |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_1922 | pgaB |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_1923 | pgaC |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_1924 | pgaD |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_1957 |  |  |  |  |  |  | √ |  | √ |
APL_1965 | crp |  |  |  |  |  | √ |  |  |
APL_2012 |  |  |  |  |  |  |  | √ |  |
APL_2029 |  |  |  |  |  |  |  | √ |  |