Skip to main content

Table 4 Average Ka/Ks value of all the orthologous genes belonging to the core genome

From: Contrasted evolutionary constraints on secreted and non-secreted proteomes of selected Actinobacteria

Strain vs.Strain   Ka/Ks Ka Ks
Frankia ACN      
  Frankia CcI   0.047 0.092 6.458
  Frankia EAN   0.037 0.15 24.059
  Frankia FD   0.034 0.187 31.731
  Frankia Eul   0.034 0.18 33.03
   Average 0.038 0.152 23.82
Frankia CcI      
  Frankia ACN   0.047 0.092 6.458
  Frankia EAN   0.033 0.153 24.232
  Frankia FD   0.034 0.191 28
  Frankia Eul   0.029 0.186 33.82
   Average 0.036 0.156 23.128
Frankia FD      
  Frankia CcI   0.034 0.191 28
  Frankia ACN   0.034 0.187 31.731
  Frankia Eul   0.028 0.205 39.126
  Frankia EAN   0.029 0.191 36.336
   Average 0.031 0.194 33.798
Frankia EAN      
  Frankia CcI   0.033 0.153 24.232
  Frankia ACN   0.037 0.15 24.059
  Frankia Eul   0.031 0.184 39.412
  Frankia FD   0.029 0.191 36.336
   Average 0.033 0.169 31.01
Frankia Eul      
  Frankia CcI   0.029 0.186 33.82
  Frankia ACN   0.034 0.18 33.03
  Frankia EAN   0.031 0.184 39.412
  Frankia FD   0.028 0.205 39.126
   Average 0.031 0.189 36.347
M. tuberculosis      
  M. leprae   0.089 0.123 2.155
  M. ulcerans   0.066 0.097 2.582
  M. smegmatis   0.03 0.165 28.61
  M. vanbaalenii   0.032 0.166 26.201
   Average 0.054 0.138 14.887
M. leprae      
  M. tuberculosis   0.089 0.123 2.155
  M. ulcerans   0.071 0.134 2.962
  M. smegmatis   0.026 0.191 28.417
  M. vanbaalenii   0.03 0.196 25.624
   Average 0.054 0.161 14.789
M. ulcerans      
  M. leprae   0.071 0.134 2.962
  M. tuberculosis   0.066 0.097 2.582
  M. smegmatis   0.03 0.167 28.253
  M. vanbaalenii   0.031 0.169 27.778
   Average 0.05 0.142 15.394
M. smegmatis      
  M. tuberculosis   0.03 0.165 28.61
  M. leprae   0.026 0.191 28.417
  M. ulcerans   0.03 0.167 28.253
  M. vanbaalenii   0.042 0.128 16.365
   Average 0.032 0.163 25.411
M. vanbaalenii      
  M. tuberculosis   0.032 0.166 26.201
  M. leprae   0.03 0.196 25.624
  M. ulcerans   0.031 0.169 27.778
  M. smegmatis   0.042 0.128 16.365
   Average 0.034 0.165 23.992
S. coelicolor      
  S. avermitilis   0.054 0.101 8.594
  S. griseus   0.044 0.152 24.613
  S. somaliensis   0.041 0.156 27.083
  S. scabiei   0.051 0.106 10.949
   Average 0.047 0.135 19.053
S. avermitilis      
  S. coelicolor   0.054 0.101 8.594
  S. somaliensis   0.036 0.152 28.933
  S. scabiei   0.057 0.098 7.197
  S. griseus   0.041 0.147 25
   Average 0.046 0.132 18.875
S. griseus      
  S. coelicolor   0.044 0.152 24.613
  S. avermitilis   0.041 0.147 25
  S. somaliensis   0.041 0.143 21.745
  S. scabiei   0.041 0.152 24.843
   Average 0.042 0.149 24.050
S. somaliensis      
  S. coelicolor   0.041 0.156 27.083
  S. avermitilis   0.036 0.152 28.933
  S. griseus   0.041 0.143 21.745
  S. scabiei   0.035 0.155 28.346
   Average 0.039 0.153 25.597
S. scabiei      
  S. coelicolor   0.051 0.106 10.949
  S. avermitilis   0.057 0.098 7.197
  S. griseus   0.041 0.152 24.843
  S. somaliensis   0.035 0.155 28.346
   Average 0.045 0.136 19.266