TY - JOUR AU - Blomhoff, R. AU - Blomhoff, H. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - Overview of retinoid metabolism and function JO - J Neurobiol VL - 66 UR - https://doi.org/10.1002/neu.20242 DO - 10.1002/neu.20242 ID - Blomhoff2006 ER - TY - JOUR AU - Bushue, N. AU - Wan, Y. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Retinoid pathway and cancer therapeutics JO - Adv Drug Deliv Rev VL - 62 UR - https://doi.org/10.1016/j.addr.2010.07.003 DO - 10.1016/j.addr.2010.07.003 ID - Bushue2010 ER - TY - JOUR AU - Mukherjee, R. AU - Strasser, J. AU - Jow, L. AU - Hoener, P. AU - Paterniti, J. R. AU - Heyman, R. A. PY - 1998 DA - 1998// TI - RXR agonists activate PPARalpha-inducible genes, lower triglycerides, and raise HDL levels in vivo JO - Arterioscler Thromb Vasc Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1161/01.ATV.18.2.272 DO - 10.1161/01.ATV.18.2.272 ID - Mukherjee1998 ER - TY - JOUR AU - Willy, P. J. AU - Umesono, K. AU - Ong, E. S. AU - Evans, R. M. AU - Heyman, R. A. AU - Mangelsdorf, D. J. PY - 1995 DA - 1995// TI - LXR, a nuclear receptor that defines a distinct retinoid response pathway JO - Genes Dev VL - 9 UR - https://doi.org/10.1101/gad.9.9.1033 DO - 10.1101/gad.9.9.1033 ID - Willy1995 ER - TY - JOUR AU - Urizar, N. L. AU - Dowhan, D. H. AU - Moore, D. D. PY - 2000 DA - 2000// TI - The farnesoid X-activated receptor mediates bile acid activation of phospholipid transfer protein gene expression JO - J Biol Chem VL - 275 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M007998200 DO - 10.1074/jbc.M007998200 ID - Urizar2000 ER - TY - JOUR AU - Lemay, D. G. AU - Hwang, D. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genome-wide identification of peroxisome proliferator response elements using integrated computational genomics JO - J Lipid Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1194/jlr.M500504-JLR200 DO - 10.1194/jlr.M500504-JLR200 ID - Lemay2006 ER - TY - JOUR AU - Wang, K. AU - Chen, S. AU - Xie, W. AU - Wan, Y. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Retinoids induce cytochrome P450 3A4 through RXR/VDR-mediated pathway JO - Biochem Pharmacol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1016/j.bcp.2008.02.030 DO - 10.1016/j.bcp.2008.02.030 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Chen, S. AU - Wang, K. AU - Wan, Y. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Retinoids activate RXR/CAR-mediated pathway and induce CYP3A JO - Biochem Pharmacol VL - 79 UR - https://doi.org/10.1016/j.bcp.2009.08.012 DO - 10.1016/j.bcp.2009.08.012 ID - Chen2010 ER - TY - JOUR AU - Wan, Y. J. PY - 1993 DA - 1993// TI - Retinoic acid and its receptors JO - Am J Surg VL - 166 UR - https://doi.org/10.1016/S0002-9610(05)80581-1 DO - 10.1016/S0002-9610(05)80581-1 ID - Wan1993 ER - TY - JOUR AU - Wan, Y. J. AU - An, D. AU - Cai, Y. AU - Repa, J. J. AU - Hung-Po Chen, T. AU - Flores, M. AU - Postic, C. AU - Magnuson, M. A. AU - Chen, J. AU - Chien, K. R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Hepatocyte-specific mutation establishes retinoid X receptor alpha as a heterodimeric integrator of multiple physiological processes in the liver JO - Mol Cell Biol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.20.12.4436-4444.2000 DO - 10.1128/MCB.20.12.4436-4444.2000 ID - Wan2000 ER - TY - JOUR AU - Wan, Y. J. AU - Cai, Y. AU - Lungo, W. AU - Fu, P. AU - Locker, J. AU - French, S. AU - Sucov, H. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Peroxisome proliferator-activated receptor alpha-mediated pathways are altered in hepatocyte-specific retinoid X receptor alpha-deficient mice JO - J Biol Chem VL - 275 ID - Wan2000 ER - TY - JOUR AU - Gyamfi, M. A. AU - He, L. AU - French, S. W. AU - Damjanov, I. AU - Wan, Y. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Hepatocyte retinoid X receptor alpha-dependent regulation of lipid homeostasis and inflammatory cytokine expression contributes to alcohol-induced liver injury JO - J Pharmacol Exp Ther VL - 324 UR - https://doi.org/10.1124/jpet.107.132258 DO - 10.1124/jpet.107.132258 ID - Gyamfi2008 ER - TY - JOUR AU - Gyamfi, M. A. AU - Tanaka, Y. AU - He, L. AU - Klaassen, C. D. AU - Wan, Y. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Hepatic effects of a methionine-choline-deficient diet in hepatocyte RXRalpha-null mice JO - Toxicol Appl Pharmacol VL - 234 UR - https://doi.org/10.1016/j.taap.2008.09.022 DO - 10.1016/j.taap.2008.09.022 ID - Gyamfi2009 ER - TY - JOUR AU - Cai, Y. AU - Konishi, T. AU - Han, G. AU - Campwala, K. H. AU - French, S. W. AU - Wan, Y. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - The role of hepatocyte RXR alpha in xenobiotic-sensing nuclear receptor-mediated pathways JO - Eur J Pharm Sci VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/S0928-0987(01)00211-1 DO - 10.1016/S0928-0987(01)00211-1 ID - Cai2002 ER - TY - JOUR AU - Dai, G. AU - Chou, N. AU - He, L. AU - Gyamfi, M. A. AU - Mendy, A. J. AU - Slitt, A. L. AU - Klaassen, C. D. AU - Wan, Y. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Retinoid X receptor alpha Regulates the expression of glutathione s-transferase genes and modulates acetaminophen-glutathione conjugation in mouse liver JO - Mol Pharmacol VL - 68 ID - Dai2005 ER - TY - JOUR AU - Gyamfi, M. A. AU - Kocsis, M. G. AU - He, L. AU - Dai, G. AU - Mendy, A. J. AU - Wan, Y. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - The role of retinoid X receptor alpha in regulating alcohol metabolism JO - J Pharmacol Exp Ther VL - 319 UR - https://doi.org/10.1124/jpet.106.108175 DO - 10.1124/jpet.106.108175 ID - Gyamfi2006 ER - TY - JOUR AU - Wan, Y. J. AU - Han, G. AU - Cai, Y. AU - Dai, T. AU - Konishi, T. AU - Leng, A. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Hepatocyte retinoid X receptor-alpha-deficient mice have reduced food intake, increased body weight, and improved glucose tolerance JO - Endocrinology VL - 144 UR - https://doi.org/10.1210/en.2002-221003 DO - 10.1210/en.2002-221003 ID - Wan2003 ER - TY - JOUR AU - Cui, J. Y. AU - Gunewardena, S. S. AU - Rockwell, C. E. AU - Klaassen, C. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - ChIPing the cistrome of PXR in mouse liver JO - Nucleic Acids Res VL - 38 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq654 DO - 10.1093/nar/gkq654 ID - Cui2010 ER - TY - JOUR AU - Boergesen, M. AU - Pedersen, T. A. AU - Gross, B. AU - Van Heeringen, S. J. AU - Hagenbeek, D. AU - Bindesboll, C. AU - Caron, S. AU - Lalloyer, F. AU - Steffensen, K. R. AU - Nebb, H. I. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genome-Wide Profiling of Liver X Receptor, Retinoid X Receptor, and Peroxisome Proliferator-Activated Receptor alpha in Mouse Liver Reveals Extensive Sharing of Binding Sites JO - Mol Cell Biol VL - 32 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.06175-11 DO - 10.1128/MCB.06175-11 ID - Boergesen2012 ER - TY - JOUR AU - Thomas, A. M. AU - Hart, S. N. AU - Kong, B. AU - Fang, J. AU - Zhong, X. B. AU - Guo, G. L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome-wide tissue-specific farnesoid X receptor binding in mouse liver and intestine JO - Hepatology VL - 51 UR - https://doi.org/10.1002/hep.23450 DO - 10.1002/hep.23450 ID - Thomas2010 ER - TY - JOUR AU - Wan, Y. J. AU - An, D. AU - Cai, Y. AU - Repa, J. J. AU - Hung-Po Chen, T. AU - Flores, M. AU - Postic, C. AU - Magnuson, M. A. AU - Chen, J. AU - Chien, K. R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Hepatocyte-specific mutation establishes retinoid X receptor alpha as a heterodimeric integrator of multiple physiological processes in the liver JO - Mol Cell Biol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.20.12.4436-4444.2000 DO - 10.1128/MCB.20.12.4436-4444.2000 ID - Wan2000 ER - TY - JOUR AU - Mader, S. AU - Chen, J. Y. AU - Chen, Z. AU - White, J. AU - Chambon, P. AU - Gronemeyer, H. PY - 1993 DA - 1993// TI - The patterns of binding of RAR, RXR and TR homo- and heterodimers to direct repeats are dictated by the binding specificites of the DNA binding domains JO - EMBO J VL - 12 ID - Mader1993 ER - TY - JOUR AU - Repa, J. J. AU - Liang, G. AU - Ou, J. AU - Bashmakov, Y. AU - Lobaccaro, J. M. AU - Shimomura, I. AU - Shan, B. AU - Brown, M. S. AU - Goldstein, J. L. AU - Mangelsdorf, D. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Regulation of mouse sterol regulatory element-binding protein-1c gene (SREBP-1c) by oxysterol receptors, LXRalpha and LXRbeta JO - Genes Dev VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gad.844900 DO - 10.1101/gad.844900 ID - Repa2000 ER - TY - JOUR AU - Duran-Sandoval, D. AU - Mautino, G. AU - Martin, G. AU - Percevault, F. AU - Barbier, O. AU - Fruchart, J. C. AU - Kuipers, F. AU - Staels, B. PY - 2004 DA - 2004// TI - Glucose regulates the expression of the farnesoid X receptor in liver JO - Diabetes VL - 53 UR - https://doi.org/10.2337/diabetes.53.4.890 DO - 10.2337/diabetes.53.4.890 ID - Duran-Sandoval2004 ER - TY - JOUR AU - Theken, K. N. AU - Deng, Y. AU - Kannon, M. A. AU - Miller, T. M. AU - Poloyac, S. M. AU - Lee, C. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Activation of the acute inflammatory response alters cytochrome P450 expression and eicosanoid metabolism JO - Drug Metab Dispos VL - 39 UR - https://doi.org/10.1124/dmd.110.035287 DO - 10.1124/dmd.110.035287 ID - Theken2011 ER - TY - JOUR AU - Node, K. AU - Huo, Y. AU - Ruan, X. AU - Yang, B. AU - Spiecker, M. AU - Ley, K. AU - Zeldin, D. C. AU - Liao, J. K. PY - 1999 DA - 1999// TI - Anti-inflammatory properties of cytochrome P450 epoxygenase-derived eicosanoids JO - Science VL - 285 UR - https://doi.org/10.1126/science.285.5431.1276 DO - 10.1126/science.285.5431.1276 ID - Node1999 ER - TY - CHAP AU - Henkel, J. AU - Frede, K. AU - Schanze, N. AU - Vogel, H. AU - Schurmann, A. AU - Spruss, A. AU - Bergheim, I. AU - Puschel, G. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Stimulation of fat accumulation in hepatocytes by PGE(2)-dependent repression of hepatic lipolysis, beta-oxidation and VLDL-synthesis BT - Lab Invest ID - Henkel2012 ER - TY - JOUR AU - Zeisel, S. H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Choline: needed for normal development of memory JO - J Am Coll Nutr VL - 19 UR - https://doi.org/10.1080/07315724.2000.10718976 DO - 10.1080/07315724.2000.10718976 ID - Zeisel2000 ER - TY - JOUR AU - Li, Z. AU - Agellon, L. B. AU - Allen, T. M. AU - Umeda, M. AU - Jewell, L. AU - Mason, A. AU - Vance, D. E. PY - 2006 DA - 2006// TI - The ratio of phosphatidylcholine to phosphatidylethanolamine influences membrane integrity and steatohepatitis JO - Cell Metab VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/j.cmet.2006.03.007 DO - 10.1016/j.cmet.2006.03.007 ID - Li2006 ER - TY - JOUR AU - Imaizumi, K. AU - Mawatari, K. AU - Murata, M. AU - Ikeda, I. AU - Sugano, M. PY - 1983 DA - 1983// TI - The contrasting effect of dietary phosphatidylethanolamine and phosphatidylcholine on serum lipoproteins and liver lipids in rats JO - J Nutr VL - 113 ID - Imaizumi1983 ER - TY - JOUR AU - Zhan, Q. AU - Fang, Y. AU - He, Y. AU - Liu, H. -. X. AU - Fang, J. AU - Wan, Y. -. J. Y. PY - 2012 DA - 2012// TI - Function annotation of hepatic retinoid x receptor a based on genome-wide DNA binding and transcriptome profiling JO - PLOS one VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0050013 DO - 10.1371/journal.pone.0050013 ID - Zhan2012 ER - TY - JOUR AU - Langmead, B. AU - Trapnell, C. AU - Pop, M. AU - Salzberg, S. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-3-r25 DO - 10.1186/gb-2009-10-3-r25 ID - Langmead2009 ER - TY - JOUR AU - Zhang, Y. AU - Liu, T. AU - Meyer, C. A. AU - Eeckhoute, J. AU - Johnson, D. S. AU - Bernstein, B. E. AU - Nusbaum, C. AU - Myers, R. M. AU - Brown, M. AU - Li, W. AU - Liu, X. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Model-based analysis of ChIP-Seq (MACS) JO - Genome Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2008-9-9-r137 DO - 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ID - Zhang2008 ER - TY - JOUR AU - Salmon-Divon, M. AU - Dvinge, H. AU - Tammoja, K. AU - Bertone, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - PeakAnalyzer: genome-wide annotation of chromatin binding and modification loci JO - BMC Bioinforma VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-415 DO - 10.1186/1471-2105-11-415 ID - Salmon-Divon2010 ER - TY - JOUR AU - Da Huang, W. AU - Sherman, B. T. AU - Lempicki, R. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources JO - Nat Protoc VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2008.211 DO - 10.1038/nprot.2008.211 ID - Da Huang2009 ER -