Skip to main content

Table 3 Examples of target operons regulation by multiple TFs

From: Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria

Combinations of TFs Examples
  Target operon Genome(s)
Quadruple regulation
AdcR, CcpA, CodY, Rex adhB1 S. agalactiae, S. dysgalactiae
Triple regulation
AdcR, CodY, Rex adhB1 S. equi, S. mitis, S. pyogenes
MtaR, CmbR, HomR metEF S. gallolyticus, S. gordonii, S. mutans, S. pneumoniae
CcpA, MalR, MdxR malXCDA L. plantarum
CcpA, MalR3, MdxR nplT L. plantarum
CcpA, MalR, MdxR malT-mapA-pgmB L. mesenteroides
Double regulation
CcpA, Rex adhE S. mitis, S. sanguinis, L. acidophilus, L. brevis,L. johnsonii
forT S. dysgalactiae, S. equi, S. pyogenes, S. sanguinis, S. uberis
CcpA, MalR ptsG-rgfB S. agalactiae, S. equi, S. gordonii, S. mutans, S. uberis
pulA S. agalactiae, S. equi, S. gordonii, S. mutans, S. pyogenes
HrcA, CtsR groSL all Streptococcaceae, L. fermentum, L. reuteri, P. pentosaceus
hrcA-grpE-dnaKJ L. fermentum, L. plantarum, L. reuteri, L. sakei, P. pentosaceus
CcpA, ScrR scrBR S. gallolyticus, S. gordonii, L. acidophilus, L. johnsonii,
CcpA, TreR trePA S. dysgalactiae, S. pneumoniae, L. mesenteroidesm, O. oeni
CcpA, GalR galKETRM L. casei, L. rhamnosus
lacLM L. fermentum, L. plantarum, L. salivarius, P. pentosaceus
CcpA, CodY livKHMGF S. gordonii, S. mitis, S. sanguinis, S. suis, S. thermophilus
CodY, GlnR gluQHMP S. agalactiae, S. gallolyticus, S. mutans
CcpA, FruR fruRBA L. lactis, S. equi, S. suis, L. helveticus, L. sakei, P. pentosaceus
PerR, MntR mntABC S. equi, S. pyogenes, S. mutans, S. sanguinis, S. uberis
CcpA, RegR hylD-ugl-hylEFG-ohl-regR S. agalactiae, S. pyogenes