Table 3 Examples of target operons regulation by multiple TFs
From: Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria
Combinations of TFs | Examples | |
|---|---|---|
| Â | Target operon | Genome(s) |
Quadruple regulation | ||
AdcR, CcpA, CodY, Rex | adhB1 | S. agalactiae, S. dysgalactiae |
Triple regulation | ||
AdcR, CodY, Rex | adhB1 | S. equi, S. mitis, S. pyogenes |
MtaR, CmbR, HomR | metEF | S. gallolyticus, S. gordonii, S. mutans, S. pneumoniae |
CcpA, MalR, MdxR | malXCDA | L. plantarum |
CcpA, MalR3, MdxR | nplT | L. plantarum |
CcpA, MalR, MdxR | malT-mapA-pgmB | L. mesenteroides |
Double regulation | ||
CcpA, Rex | adhE | S. mitis, S. sanguinis, L. acidophilus, L. brevis,L. johnsonii |
forT | S. dysgalactiae, S. equi, S. pyogenes, S. sanguinis, S. uberis | |
CcpA, MalR | ptsG-rgfB | S. agalactiae, S. equi, S. gordonii, S. mutans, S. uberis |
pulA | S. agalactiae, S. equi, S. gordonii, S. mutans, S. pyogenes | |
HrcA, CtsR | groSL | all Streptococcaceae, L. fermentum, L. reuteri, P. pentosaceus |
hrcA-grpE-dnaKJ | L. fermentum, L. plantarum, L. reuteri, L. sakei, P. pentosaceus | |
CcpA, ScrR | scrBR | S. gallolyticus, S. gordonii, L. acidophilus, L. johnsonii, |
CcpA, TreR | trePA | S. dysgalactiae, S. pneumoniae, L. mesenteroidesm, O. oeni |
CcpA, GalR | galKETRM | L. casei, L. rhamnosus |
lacLM | L. fermentum, L. plantarum, L. salivarius, P. pentosaceus | |
CcpA, CodY | livKHMGF | S. gordonii, S. mitis, S. sanguinis, S. suis, S. thermophilus |
CodY, GlnR | gluQHMP | S. agalactiae, S. gallolyticus, S. mutans |
CcpA, FruR | fruRBA | L. lactis, S. equi, S. suis, L. helveticus, L. sakei, P. pentosaceus |
PerR, MntR | mntABC | S. equi, S. pyogenes, S. mutans, S. sanguinis, S. uberis |
CcpA, RegR | hylD-ugl-hylEFG-ohl-regR | S. agalactiae, S. pyogenes |