Table 5 Output data from sequencing experiment using non-duplicate reads

Lane 1 1% non bis-converted DNA

B02

33 064 288

2 855 963

2 010 850

6.08

2 567 012

349 168

40 326

2.63

D07

22 138 393

1 819 725

1 255 728

5.67

2 062 303

121 179

6 308

1.98

E08

27 604 275

3 277 855

2 323 092

8.41

2 566 936

527 206

109 576

3.27

G12

34 606 411

3 331 718

2 318 284

6.69

2 714 010

422 645

47 241

2.81

Lane 2 10% non bis-converted DNA

B02

35 305 177

2 951 835

2 078 732

5.89

2 567 438

380 661

48 125

2.73

D07

13 678 215

1 406 910

999 858

7.31

1 870 722

63 063

2 673

1.77

E08

29 182 244

3 343 563

2 371 936

8.13

2 564 006

549 654

119 076

3.35

G12

35 675 527

3 377 167

2 352 532

6.59

2 706 283

443 966

50 919

2.87

Lane 3 20% non bis-converted DNA

B02

29 189 642

2 680 090

1 903 402

6.52

2 506 260

315 769

33 092

2.55

D07

11 434 385

1 281 232

1 281 232

11.2

1 798 599

47 005

1 960

1.69

E08

29 178 605

3 315 119

2 354 427

8.07

2 555 851

543 668

117 267

3.33

G12

32 077 566

3 190 847

2 234 841

6.97

2 672 851

396 964

41 721

2.75

Lane 4 30% non bis-converted DNA

B02

26 075 222

2 601 566

1 853 844

7.11

2 471 169

302 050

30 356

2.52

D07

15 915 092

1 563 145

1 101 459

6.92

1 923 817

86 567

3 720

1.87

E08

22 095 982

2 896 518

2 075 605

9.39

2 456 950

446 280

80 977

3.04

G12

27 526 678

3 034 738

2 139 571

7.77

2 629 556

363 919

35 701

2.68

Lane 5 50% non bis-converted DNA

B02

20 542 906

2 606 323

1 841 922

8.97

2 368 596

321 222

32 684

2.62

D07

9 506 379

1 299 321

925 451

9.74

1 716 465

57 531

2 107

1.78

E08

18 652 337

2 828 208

2 007 876

10.76

2 359 943

440 954

81 427

3.07

G12

23 046 688

3 069 911

2 146 208

9.31

2 559 434

391 118

36 982

2.77

Lanes 6 20% non bis-converted DNA

B02

-

D07

-

E08

-

G12

147 537 115

6 665 204

4 381 541

2.97

2 988 624

1 086 692

383 384

4.93

Lane 7 20% non bis-converted DNA

B02

20 450 646

2 241 773

1 614 966

7.9

2 395 119

213 017

15 790

2.26

D07

8 334 712

1 087 639

791 533

9.5

1 671 805

27 718

1 338

1.57

E08

19 548 711

2 663 849

1 915 409

9.8

2 415 658

385 375

62 823

2.85

G12

21 853 857

2 654 189

1 886 840

8.63

2 562 616

267 113

20 703

2.42

Lane 8 20% non bis-converted DNA

B02

10 420 846

1 644 906

1 213 820

11.65

2 156 458

95 891

4 665

1.89

D07

4 061 039

774 145

578 180

14.24

1 394 239

8 729

914

1.39

E08

6 950 628

1 494 036

1 105 554

15.91

1 994 770

113 007

9 195

1.98

G12

11 162 134

1 928 010

1 405 997

12.6

2 334 809

120 111

6 110

1.98