TY - JOUR AU - Bennett, M. D. AU - Leitch, I. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Nuclear DNA amounts in angiosperms: targets, trends and tomorrow JO - Ann Bot VL - 107 UR - https://doi.org/10.1093/aob/mcq258 DO - 10.1093/aob/mcq258 ID - Bennett2011 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. AU - Griffitts, J. AU - Starker, C. AU - Fedorova, E. AU - Limpens, E. AU - Ivanov, S. AU - Bisseling, T. AU - Long, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - A nodule-specific protein secretory pathway required for nitrogen-fixing symbiosis JO - Science VL - 327 UR - https://doi.org/10.1126/science.1184096 DO - 10.1126/science.1184096 ID - Wang2010 ER - TY - JOUR AU - Young, N. D. AU - Debelle, F. AU - Oldroyd, G. E. AU - Geurts, R. AU - Cannon, S. B. AU - Udvardi, M. K. AU - Benedito, V. A. AU - Mayer, K. F. AU - Gouzy, J. AU - Schoof, H. AU - Van de Peer, Y. AU - Proost, S. AU - Cook, D. R. AU - Meyers, B. C. AU - Spannagl, M. AU - Cheung, F. AU - De Mita, S. AU - Krishnakumar, V. AU - Gundlach, H. AU - Zhou, S. AU - Mudge, J. AU - Bharti, A. K. AU - Murray, J. D. AU - Naoumkina, M. A. AU - Rosen, B. AU - Silverstein, K. A. AU - Tang, H. AU - Rombauts, S. AU - Zhao, P. X. AU - Zhou, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses JO - Nature VL - 480 ID - Young2011 ER - TY - JOUR AU - Zhou, S. AU - Bechner, M. C. AU - Place, M. AU - Churas, C. P. AU - Pape, L. AU - Leong, S. A. AU - Runnheim, R. AU - Forrest, D. K. AU - Goldstein, S. AU - Livny, M. AU - Schwartz, D. C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Validation of rice genome sequence by optical mapping JO - BMC Genomics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-8-278 DO - 10.1186/1471-2164-8-278 ID - Zhou2007 ER - TY - JOUR AU - Kawahara, Y. AU - de la Bastide, M. AU - Hamilton, J. P. AU - Kanamori, H. AU - McCombie, W. R. AU - Ouyang, S. AU - Schwartz, D. C. AU - Tanaka, T. AU - Wu, J. AU - Zhou, S. AU - Childs, K. L. AU - Davidson, R. M. AU - Lin, H. AU - Quesada-Ocampo, L. AU - Vaillancourt, B. AU - Sakai, H. AU - Lee, S. S. AU - Kim, J. AU - Numa, H. AU - Itoh, T. AU - Buell, C. R. AU - Matsumoto, T. PY - 2013 DA - 2013// TI - Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next generation sequence and optical map data JO - Rice VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1939-8433-6-4 DO - 10.1186/1939-8433-6-4 ID - Kawahara2013 ER - TY - JOUR AU - Li, Z. AU - Zhang, Z. AU - Yan, P. AU - Huang, S. AU - Fei, Z. AU - Lin, K. PY - 2011 DA - 2011// TI - RNA-Seq improves annotation of protein-coding genes in the cucumber genome JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-540 DO - 10.1186/1471-2164-12-540 ID - Li2011 ER - TY - JOUR AU - Volkening, J. D. AU - Bailey, D. J. AU - Rose, C. M. AU - Grimsrud, P. A. AU - Howes-Podoll, M. AU - Venkateshwaran, M. AU - Westphall, M. S. AU - Ane, J. M. AU - Coon, J. J. AU - Sussman, M. R. PY - 2012 DA - 2012// TI - A proteogenomic survey of the Medicago truncatula genome JO - Mol Cell Proteomics: MCP VL - 11 UR - https://doi.org/10.1074/mcp.M112.019471 DO - 10.1074/mcp.M112.019471 ID - Volkening2012 ER - TY - JOUR AU - Haas, B. J. AU - Salzberg, S. L. AU - Zhu, W. AU - Pertea, M. AU - Allen, J. E. AU - Orvis, J. AU - White, O. AU - Buell, C. R. AU - Wortman, J. R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Automated eukaryotic gene structure annotation using EVidenceModeler and the Program to Assemble Spliced Alignments JO - Genome Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2008-9-1-r7 DO - 10.1186/gb-2008-9-1-r7 ID - Haas2008 ER - TY - JOUR AU - Cantarel, B. L. AU - Korf, I. AU - Robb, S. M. AU - Parra, G. AU - Ross, E. AU - Moore, B. AU - Holt, C. AU - Sanchez Alvarado, A. AU - Yandell, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - MAKER: an easy-to-use annotation pipeline designed for emerging model organism genomes JO - Genome Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.6743907 DO - 10.1101/gr.6743907 ID - Cantarel2008 ER - TY - JOUR AU - Gnerre, S. AU - Maccallum, I. AU - Przybylski, D. AU - Ribeiro, F. J. AU - Burton, J. N. AU - Walker, B. J. AU - Sharpe, T. AU - Hall, G. AU - Shea, T. P. AU - Sykes, S. AU - Berlin, A. M. AU - Aird, D. AU - Costello, M. AU - Daza, R. AU - Williams, L. AU - Nicol, R. AU - Gnirke, A. AU - Nusbaum, C. AU - Lander, E. S. AU - Jaffe, D. B. PY - 2011 DA - 2011// TI - High-quality draft assemblies of mammalian genomes from massively parallel sequence data JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 108 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1017351108 DO - 10.1073/pnas.1017351108 ID - Gnerre2011 ER - TY - JOUR AU - Luo, R. AU - Liu, B. AU - Xie, Y. AU - Li, Z. AU - Huang, W. AU - Yuan, J. AU - He, G. AU - Chen, Y. AU - Pan, Q. AU - Liu, Y. AU - Tang, J. AU - Wu, G. AU - Zhang, H. AU - Shi, Y. AU - Liu, Y. AU - Yu, C. AU - Wang, B. AU - Lu, Y. AU - Han, C. AU - Cheung, D. W. AU - Yiu, S. M. AU - Peng, S. AU - Xiaoqian, Z. AU - Liu, G. AU - Liao, X. AU - Li, Y. AU - Yang, H. AU - Wang, J. AU - Lam, T. W. AU - Wang, J. PY - 2012 DA - 2012// TI - SOAPdenovo2: an empirically improved memory-efficient short-read de novo assembler JO - GigaScience VL - 1 UR - https://doi.org/10.1186/2047-217X-1-18 DO - 10.1186/2047-217X-1-18 ID - Luo2012 ER - TY - JOUR AU - Pop, M. AU - Kosack, D. S. AU - Salzberg, S. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Hierarchical scaffolding with Bambus JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1536204 DO - 10.1101/gr.1536204 ID - Pop2004 ER - TY - JOUR AU - Ben, C. AU - Toueni, M. AU - Montanari, S. AU - Tardin, M. C. AU - Fervel, M. AU - Negahi, A. AU - Saint-Pierre, L. AU - Mathieu, G. AU - Gras, M. C. AU - Noel, D. AU - Prosperi, J. M. AU - Pilet-Nayel, M. L. AU - Baranger, A. AU - Huguet, T. AU - Julier, B. PY - 2013 DA - 2013// TI - Natural diversity in the model legume Medicago truncatula allows identifying distinct genetic mechanisms conferring partial resistance to Verticillium wilt JO - J Exp Bot VL - 64 UR - https://doi.org/10.1093/jxb/ers337 DO - 10.1093/jxb/ers337 ID - Ben2013 ER - TY - JOUR AU - Elshire, R. J. AU - Glaubitz, J. C. AU - Sun, Q. AU - Poland, J. A. AU - Kawamoto, K. AU - Buckler, E. S. AU - Mitchell, S. E. PY - 2011 DA - 2011// TI - A robust, simple genotyping-by-sequencing (GBS) approach for high diversity species JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019379 DO - 10.1371/journal.pone.0019379 ID - Elshire2011 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Durbin, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp324 DO - 10.1093/bioinformatics/btp324 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Li, H. PY - 2011 DA - 2011// TI - A statistical framework for SNP calling, mutation discovery, association mapping and population genetical parameter estimation from sequencing data JO - Bioinformatics VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr509 DO - 10.1093/bioinformatics/btr509 ID - Li2011 ER - TY - JOUR AU - Valouev, A. AU - Li, L. AU - Liu, Y. C. AU - Schwartz, D. C. AU - Yang, Y. AU - Zhang, Y. AU - Waterman, M. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Alignment of optical maps JO - J Comput Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1089/cmb.2006.13.442 DO - 10.1089/cmb.2006.13.442 ID - Valouev2006 ER - TY - JOUR AU - Zhou, S. AU - Wei, F. AU - Nguyen, J. AU - Bechner, M. AU - Potamousis, K. AU - Goldstein, S. AU - Pape, L. AU - Mehan, M. R. AU - Churas, C. AU - Pasternak, S. AU - Forrest, D. K. AU - Wise, R. AU - Ware, D. AU - Wing, R. A. AU - Waterman, M. S. AU - Livny, M. AU - Schwartz, D. C. PY - 2009 DA - 2009// TI - A single molecule scaffold for the maize genome JO - PLoS Genet VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000711 DO - 10.1371/journal.pgen.1000711 ID - Zhou2009 ER - TY - JOUR AU - Teague, B. AU - Waterman, M. S. AU - Goldstein, S. AU - Potamousis, K. AU - Zhou, S. AU - Reslewic, S. AU - Sarkar, D. AU - Valouev, A. AU - Churas, C. AU - Kidd, J. M. AU - Kohn, S. AU - Runnheim, R. AU - Lamers, C. AU - Forrest, D. AU - Newton, M. A. AU - Eichler, E. E. AU - Kent-First, M. AU - Surti, U. AU - Livny, M. AU - Schwartz, D. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - High-resolution human genome structure by single-molecule analysis JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0914638107 DO - 10.1073/pnas.0914638107 ID - Teague2010 ER - TY - JOUR AU - Zhou, P. AU - Silverstein, K. A. AU - Gao, L. AU - Walton, J. D. AU - Nallu, S. AU - Guhlin, J. AU - Young, N. D. PY - 2013 DA - 2013// TI - Detecting small plant peptides using SPADA (Small Peptide Alignment Discovery Application) JO - BMC Bioinformatics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-14-335 DO - 10.1186/1471-2105-14-335 ID - Zhou2013 ER - TY - JOUR AU - Min, X. J. AU - Butler, G. AU - Storms, R. AU - Tsang, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - TargetIdentifier: a webserver for identifying full-length cDNAs from EST sequences JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki436 DO - 10.1093/nar/gki436 ID - Min2005 ER - TY - JOUR AU - Skinner, M. E. AU - Uzilov, A. V. AU - Stein, L. D. AU - Mungall, C. J. AU - Holmes, I. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - JBrowse: a next-generation genome browser JO - Genome Res VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.094607.109 DO - 10.1101/gr.094607.109 ID - Skinner2009 ER - TY - JOUR AU - Lowe, T. M. AU - Eddy, S. R. PY - 1997 DA - 1997// TI - tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.5.0955 DO - 10.1093/nar/25.5.0955 ID - Lowe1997 ER - TY - JOUR AU - Rice, P. AU - Longden, I. AU - Bleasby, A. PY - 2000 DA - 2000// TI - EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite JO - Trends Genet VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-9525(00)02024-2 DO - 10.1016/S0168-9525(00)02024-2 ID - Rice2000 ER - TY - JOUR AU - Haas, B. J. AU - Delcher, A. L. AU - Mount, S. M. AU - Wortman, J. R. AU - Smith, R. K. AU - Hannick, L. I. AU - Maiti, R. AU - Ronning, C. M. AU - Rusch, D. B. AU - Town, C. D. AU - Salzberg, S. L. AU - White, O. PY - 2003 DA - 2003// TI - Improving the Arabidopsis genome annotation using maximal transcript alignment assemblies JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg770 DO - 10.1093/nar/gkg770 ID - Haas2003 ER - TY - JOUR AU - Grabherr, M. G. AU - Haas, B. J. AU - Yassour, M. AU - Levin, J. Z. AU - Thompson, D. A. AU - Amit, I. AU - Adiconis, X. AU - Fan, L. AU - Raychowdhury, R. AU - Zeng, Q. AU - Chen, Z. AU - Mauceli, E. AU - Hacohen, N. AU - Gnirke, A. AU - Rhind, N. AU - di Palma, F. AU - Birren, B. W. AU - Nusbaum, C. AU - Lindblad-Toh, K. AU - Friedman, N. AU - Regev, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome JO - Nat Biotechnol VL - 29 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.1883 DO - 10.1038/nbt.1883 ID - Grabherr2011 ER - TY - JOUR AU - Li, B. AU - Dewey, C. N. PY - 2011 DA - 2011// TI - RSEM: accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome JO - BMC Bioinformatics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-323 DO - 10.1186/1471-2105-12-323 ID - Li2011 ER - TY - JOUR AU - Kielbasa, S. M. AU - Wan, R. AU - Sato, K. AU - Horton, P. AU - Frith, M. C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Adaptive seeds tame genomic sequence comparison JO - Genome Res VL - 21 UR - https://doi.org/10.1101/gr.113985.110 DO - 10.1101/gr.113985.110 ID - Kielbasa2011 ER - TY - JOUR AU - Tang, H. AU - Lyons, E. AU - Pedersen, B. AU - Schnable, J. C. AU - Paterson, A. H. AU - Freeling, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Screening synteny blocks in pairwise genome comparisons through integer programming JO - BMC Bioinformatics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-102 DO - 10.1186/1471-2105-12-102 ID - Tang2011 ER - TY - JOUR AU - Parra, G. AU - Bradnam, K. AU - Korf, I. PY - 2007 DA - 2007// TI - CEGMA: a pipeline to accurately annotate core genes in eukaryotic genomes JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm071 DO - 10.1093/bioinformatics/btm071 ID - Parra2007 ER - TY - JOUR AU - Kamphuis, L. G. AU - Williams, A. H. AU - D’Souza, N. K. AU - Pfaff, T. AU - Ellwood, S. R. AU - Groves, E. J. AU - Singh, K. B. AU - Oliver, R. P. AU - Lichtenzveig, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The Medicago truncatula reference accession A17 has an aberrant chromosomal configuration JO - New Phytol VL - 174 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2007.02039.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2007.02039.x ID - Kamphuis2007 ER - TY - JOUR AU - Julier, B. AU - Huguet, T. AU - Chardon, F. AU - Ayadi, R. AU - Pierre, J. B. AU - Prosperi, J. M. AU - Barre, P. AU - Huyghe, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Identification of quantitative trait loci influencing aerial morphogenesis in the model legume Medicago truncatula JO - Theor Appl Genet VL - 114 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-007-0525-1 DO - 10.1007/s00122-007-0525-1 ID - Julier2007 ER - TY - JOUR AU - Jiang, N. AU - Bao, Z. AU - Zhang, X. AU - Eddy, S. R. AU - Wessler, S. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Pack-MULE transposable elements mediate gene evolution in plants JO - Nature VL - 431 UR - https://doi.org/10.1038/nature02953 DO - 10.1038/nature02953 ID - Jiang2004 ER - TY - JOUR AU - Lai, J. AU - Li, Y. AU - Messing, J. AU - Dooner, H. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene movement by Helitron transposons contributes to the haplotype variability of maize JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0502923102 DO - 10.1073/pnas.0502923102 ID - Lai2005 ER - TY - CHAP AU - Foissac, S. AU - Gouzy, J. AU - Rombauts, S. AU - Mathe, C. AU - Amselem, J. AU - Sterck, L. AU - Van de Peer, Y. AU - Rouze, P. AU - Schiex, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genome Annotation in Plants and Fungi: EuGene as a Model Platform BT - Current Bioinformatics, Volume 3 ID - Foissac2008 ER - TY - JOUR AU - Schmutz, J. AU - Cannon, S. B. AU - Schlueter, J. AU - Ma, J. AU - Mitros, T. AU - Nelson, W. AU - Hyten, D. L. AU - Song, Q. AU - Thelen, J. J. AU - Cheng, J. AU - Xu, D. AU - Hellsten, U. AU - May, G. D. AU - Yu, Y. AU - Sakurai, T. AU - Umezawa, T. AU - Bhattacharyya, M. K. AU - Sandhu, D. AU - Valliyodan, B. AU - Lindquist, E. AU - Peto, M. AU - Grant, D. AU - Shu, S. AU - Goodstein, D. AU - Barry, K. AU - Futrell-Griggs, M. AU - Abernathy, B. AU - Du, J. AU - Tian, Z. AU - Zhu, L. AU - Xu, D. AU - Hellsten, U. AU - May, G. D. AU - Yu, Y. AU - Sakurai, T. AU - Umezawa, T. AU - Bhattacharyya, M. K. AU - Sandhu, D. AU - Valliyodan, B. AU - Lindquist, E. AU - Peto, M. AU - Grant, D. AU - Shu, S. AU - Goodstein, D. AU - Barry, K. AU - Futrell-Griggs, M. AU - Abernathy, B. AU - Du, J. AU - Tian, Z. AU - Zhu, L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome sequence of the palaeopolyploid soybean JO - Nature VL - 463 UR - https://doi.org/10.1038/nature08670 DO - 10.1038/nature08670 ID - Schmutz2010 ER - TY - JOUR AU - Cannon, S. B. AU - Sterck, L. AU - Rombauts, S. AU - Sato, S. AU - Cheung, F. AU - Gouzy, J. AU - Wang, X. AU - Mudge, J. AU - Vasdewani, J. AU - Schiex, T. AU - Spannagl, M. AU - Monaghan, E. AU - Nicholson, C. AU - Humphray, S. J. AU - Schoof, H. AU - Mayer, K. F. AU - Rogers, J. AU - Quetier, F. AU - Oldroyd, G. E. AU - Debelle, F. AU - Cook, D. R. AU - Retzel, E. F. AU - Roe, B. A. AU - Town, C. D. AU - Tabata, S. AU - Van de Peer, Y. AU - Young, N. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Legume genome evolution viewed through the Medicago truncatula and Lotus japonicus genomes JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0603228103 DO - 10.1073/pnas.0603228103 ID - Cannon2006 ER - TY - JOUR AU - Varshney, R. K. AU - Chen, W. AU - Li, Y. AU - Bharti, A. K. AU - Saxena, R. K. AU - Schlueter, J. A. AU - Donoghue, M. T. AU - Azam, S. AU - Fan, G. AU - Whaley, A. M. AU - Farmer, A. D. AU - Sheridan, J. AU - Iwata, A. AU - Tuteja, R. AU - Penmetsa, R. V. AU - Wu, W. AU - Upadhyaya, H. D. AU - Yang, S. P. AU - Shah, T. AU - Saxena, K. B. AU - Michael, T. AU - McCombie, W. R. AU - Yang, B. AU - Zhang, G. AU - Yang, H. AU - Wang, J. AU - Spillane, C. AU - Cook, D. R. AU - May, G. D. AU - Xu, X. PY - 2012 DA - 2012// TI - Draft genome sequence of pigeonpea (Cajanus cajan), an orphan legume crop of resource-poor farmers JO - Nat Biotechnol VL - 30 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.2022 DO - 10.1038/nbt.2022 ID - Varshney2012 ER - TY - JOUR AU - Varshney, R. K. AU - Song, C. AU - Saxena, R. K. AU - Azam, S. AU - Yu, S. AU - Sharpe, A. G. AU - Cannon, S. AU - Baek, J. AU - Rosen, B. D. AU - Tar’an, B. AU - Millan, T. AU - Zhang, X. AU - Ramsay, L. D. AU - Iwata, A. AU - Wang, Y. AU - Nelson, W. AU - Farmer, A. D. AU - Gaur, P. M. AU - Soderlund, C. AU - Penmetsa, R. V. AU - Xu, C. AU - Bharti, A. K. AU - He, W. AU - Winter, P. AU - Zhao, S. AU - Hane, J. K. AU - Carrasquilla-Garcia, N. AU - Condie, J. A. AU - Upadhyaya, H. D. AU - Luo, M. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum) provides a resource for trait improvement JO - Nat Biotechnol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.2491 DO - 10.1038/nbt.2491 ID - Varshney2013 ER - TY - JOUR AU - Thibaud-Nissen, F. AU - Campbell, M. AU - Hamilton, J. P. AU - Zhu, W. AU - Buell, C. R. PY - 2007 DA - 2007// TI - EuCAP, a Eukaryotic Community Annotation Package, and its application to the rice genome JO - BMC Genomics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-8-388 DO - 10.1186/1471-2164-8-388 ID - Thibaud-Nissen2007 ER - TY - JOUR AU - VandenBosch, K. A. AU - Frugoli, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Guidelines for genetic nomenclature and community governance for the model legume Medicago truncatula JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 14 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.2001.14.12.1364 DO - 10.1094/MPMI.2001.14.12.1364 ID - VandenBosch2001 ER - TY - JOUR AU - Swain, M. T. AU - Tsai, I. J. AU - Assefa, S. A. AU - Newbold, C. AU - Berriman, M. AU - Otto, T. D. PY - 2012 DA - 2012// TI - A post-assembly genome-improvement toolkit (PAGIT) to obtain annotated genomes from contigs JO - Nat Protoc VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2012.068 DO - 10.1038/nprot.2012.068 ID - Swain2012 ER -