Table 3 Average nucleodite identity and characteristics of Mycobacterium abscessus genomes
From: Genome analysis reveals three genomospecies in Mycobacterium abscessus
Clusters | Strains | Genome lenght Mb | Genome GC% | AAI Vs M. abscessusT | AAI Vs M. bolletiiT | AAI Vs massilienseT | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
M. abscessus | C1 | M. abscessus T | 5,09 | 62,7 | 100,00 | 95,56 | 94,74 |
M93 | 5,08 | 64,2 | 97,30 | 95,35 | 94,76 | ||
M94 | 5,1 | 64,2 | 97,56 | 95,67 | 94,79 | ||
M152 | 4,91 | 64,1 | 98,59 | 96,33 | 95,73 | ||
strain GO 06 | 5,07 | 64,2 | 98,35 | 95,23 | 95,64 | ||
M. massiliense | C2A | M. massiliense T | 5,2 | 64,2 | 95,56 | 96,13 | 100,00 |
M18 | 4,89 | 64,2 | 96,66 | 96,09 | 97,57 | ||
M154 | 4,8 | 64,1 | 96,14 | 95,81 | 97,26 | ||
C2B | M115 | 4,98 | 64,1 | 96,16 | 95,36 | 96,92 | |
M172 | 5,2 | 64,2 | 95,30 | 94,93 | 96,17 | ||
M47 J26 | 4,87 | 64,1 | 96,23 | 95,74 | 96,93 | ||
M139 | 5,05 | 64,1 | 95,94 | 95,64 | 96,88 | ||
M. bolletii | C3A | M. bolletii T | 5,05 | 64,2 | 94,51 | 100,00 | 95,33 |
C3B | M24 | 5,51 | 64,2 | 94,91 | 96,47 | 94,20 | |