Table 2 Top candidate genes associated with Salmonella shedding

ENSSSCG00000022236

FOLR1

-0.56

0.29

0.06

0.41

0.18

0.93

ENSSSCG00000003259

OSCAR

-0.51

0.27

0.04

0.64

0.10

0.92

ENSSSCG00000029371

C5AR1

-0.49

0.27

0.07

0.49

0.16

0.92

ENSSSCG00000011361

(SLC26A6)

-0.57

0.26

0.06

0.74

0.14

0.92

ENSSSCG00000021259

CDA

-0.57

0.26

0.08

0.35

0.14

0.93

ENSSSCG00000011296

ANO10

-0.58

0.25

0.15

0.45

0.13

0.91

ENSSSCG00000021557

(SULT1A4)

-0.60

0.25

0.08

0.67

0.20

0.91

ENSSSCG00000002294

ARG2

-0.44

0.24

0.09

0.45

0.05

0.94

ENSSSCG00000009002

TLR2

-0.43

0.24

0.07

0.11

0.17

0.94

ENSSSCG00000000708

TNFRSF1A

-0.52

0.23

0.07

0.35

0.15

0.94

ENSSSCG00000003113

C5AR2

-0.61

0.23

0.12

0.70

0.09

0.93

ENSSSCG00000003236

SIGLEC5

-0.51

0.23

0.08

0.53

0.11

0.94

ENSSSCG00000009330

ALOX5AP

-0.47

0.23

0.07

0.57

0.06

0.94

ENSSSCG00000008701

LREAP1

-0.45

0.22

0.14

0.11

0.04

0.93

ENSSSCG00000021837

TMEM120A

-0.54

0.21

0.04

0.41

0.04

0.92

grey60 module

Ensembl ID

Gene symbol

GS

k _{d0_LS}

k _{d0_PS}

k _{d2_LS}

k _{d2_PS}

MM

ENSSSCG00000012137

BMX

-0.45

0.48

0.10

0.46

0.09

0.94

ENSSSCG00000010952

ZCCHC6

-0.44

0.45

0.17

0.16

0.21

0.94

ENSSSCG00000012440

PGK1

-0.50

0.45

0.05

0.21

0.22

0.95

ENSSSCG00000027967

IGSF6

-0.48

0.45

0.06

0.22

0.15

0.95

ENSSSCG00000011322

CCR1

-0.49

0.38

0.07

0.50

0.21

0.95

ENSSSCG00000009542

TNFSF13B

-0.46

0.35

0.04

0.34

0.21

0.95

ENSSSCG00000022178

(NUMB)

-0.49

0.35

0.07

0.37

0.24

0.96

ENSSSCG00000006237

SDCBP

-0.44

0.32

0.17

0.13

0.27

0.96

ENSSSCG00000023374

SRGN

-0.44

0.31

0.19

0.41

0.18

0.95

ENSSSCG00000005462

GNG10

-0.45

0.29

0.07

0.40

0.24

0.95

ENSSSCG00000027911

LTB4R

-0.52

0.27

0.07

0.54

0.06

0.92

ENSSSCG00000008168

RNF149

-0.46

0.26

0.07

0.24

0.21

0.92