Table 1 Base changes, additions and deletions in C. stercorarium DSM8532 ^T genome sequence suggested by RNA-seq transcriptome

Clst_0020/21

21928

G

-

−1

Y

Clst_0024

25417

A

G

NA

Y

Clst_0030/1

31758

T

-

−1

Y

Clst_0035/6

37728

-

A

1

Y

Clst_0081

88853

A

T

NA

Y

Clst_0081

88886

C

A

NA

Y

Clst_0130*

149305

-

A

1

Y

Clst_0131/2

150526

-

A

1

Y

Clst_0269

313700

A

G

0

Y

Clst_0746*

820762

-

A

1

Y

Clst_0755/6

828349

-

T

1

Y

Clst_0791/2

868841

C

A

0

Y

Clst_0847

937715

-

C

1

Y

Clst_0897/8

995753

-

A

1

Y

Clst_0899/900

998883

C

A

NA

Y

Clst_0972/3

1090847

-

A

1

Y

Clst_0992*

1116366

-

A

1

Y

Clst_1060*

1201128

-

A

1

Y

Clst_1117*

1271246

AT

-

−2

Y

Clst_1187

1342072

T

A

NA

Y

Clst_1286/7

1442396

-

T

1

Y

CLst_1298/9

1457047

-

T

1

Y

Clst_1339/40

1499569

A

-

−1

Y

Clst_1341

1502214

A

T

0

Y

Clst_1420/1

1596278

A

T

0

Y

Clst_1435

1606866

-

A

1

Y

Clst_1435

1606893

T

-

−1

Y

Clst_1474/5

1649400

-

T

1

Y

Clst_1511/2

1694436

A

T

0

N

Clst_1524/5

1707519

T

-

−1

N

Clst_1542/3

1724606

C

T

0

N

Clst_1543

1725709

T

C

0

Y

Clst_1605/6

1809359

-

T

1

Y

Clst_1771/3

2005558

A

T

0

N

Clst_1893

2151838

AA

GG

0

Y

Clst_2041/2

2322549

T

A

0

N

Clst_2046

2314413

-

C

1

N

Clst_2051

2322540

-

C

1

N

Clst_2090/1

2365983

G

T

0

N

Clst_2360

2656461

-

CTC

NA

N

Clst_2564/5

2854567

-

T

1

Y