TY - JOUR AU - López-Guerrero, M. G. AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Velázquez, E. AU - Rogel, M. A. AU - Acosta, J. L. AU - Gónzalez, V. AU - Martínez, J. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Rhizobium etli taxonomy revised with novel genomic data and analyses JO - Syst Appl Microbiol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2012.06.009 DO - 10.1016/j.syapm.2012.06.009 ID - López-Guerrero2012 ER - TY - JOUR AU - Rogel, M. A. AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Martinez Romero, E. PY - 2011 DA - 2011// TI - Symbiovars in rhizobia reflect bacterial adaptation to legumes JO - Syst Appl Microbiol VL - 34 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2010.11.015 DO - 10.1016/j.syapm.2010.11.015 ID - Rogel2011 ER - TY - JOUR AU - Cobo-Díaz, J. F. AU - Martínez-Hidalgo, P. AU - Fernández-González, A. J. AU - Martínez-Molina, E. AU - Toro, N. AU - Velázquez, E. AU - Fernández-López, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - The endemic Genista versicolor from Sierra Nevada National Park in Spain is nodulated by putative new Bradyrhizobium species and a novel symbiovar (sierranevadense) JO - Syst Appl Microbiol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2013.09.008 DO - 10.1016/j.syapm.2013.09.008 ID - Cobo-Díaz2013 ER - TY - JOUR AU - Gubry-Rangin, C. AU - Béna, G. AU - Cleyet-Marel, J. C. AU - Brunel, B. PY - 2013 DA - 2013// TI - Definition and evolution of a new symbiovar, sv. rigiduloides, among Ensifer meliloti efficiently nodulating Medicago species JO - Syst Appl Microbiol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2013.06.004 DO - 10.1016/j.syapm.2013.06.004 ID - Gubry-Rangin2013 ER - TY - JOUR AU - Ramírez-Bahena, M. H. AU - Chahboune, R. AU - Velázquez, E. AU - Gómez-Moriano, A. AU - Mora, E. AU - Peix, A. AU - Toro, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Centrosema is a promiscuous legume nodulated by several new putative species and symbiovars of Bradyrhizobium in various American countries JO - Syst Appl Microbiol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2013.03.007 DO - 10.1016/j.syapm.2013.03.007 ID - Ramírez-Bahena2013 ER - TY - JOUR AU - Laranjo, M. AU - Young, J. P. AU - Oliveira, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Multilocus sequence analysis reveals multiple symbiovars within Mesorhizobium species JO - Syst Appl Microbiol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2012.06.002 DO - 10.1016/j.syapm.2012.06.002 ID - Laranjo2012 ER - TY - JOUR AU - Ramírez-Bahena, M. H. AU - Hernández, M. AU - Peix, A. AU - Velázquez, E. AU - León-Barrios, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mesorhizobial strains nodulating Anagyris latifolia and Lotus berthelotii in Tamadaya ravine (Tenerife, Canary Islands) are two symbiovars of the same species, Mesorhizobium tamadayense sp. nov JO - Syst Appl Microbiol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2012.05.003 DO - 10.1016/j.syapm.2012.05.003 ID - Ramírez-Bahena2012 ER - TY - JOUR AU - Crossman, L. C. AU - Castillo-Ramírez, S. AU - McAnnula, C. AU - Lozano, L. AU - Vernikos, G. S. AU - Acosta, J. L. AU - Ghazoui, Z. F. AU - Hernández-González, I. AU - Meakin, G. AU - Walker, A. W. AU - Hynes, M. F. AU - Young, J. P. AU - Downie, J. A. AU - Romero, D. AU - Johnston, A. W. AU - Dávila, G. AU - Parkhill, J. AU - González, V. PY - 2008 DA - 2008// TI - A common genomic framework for a diverse assembly of plasmids in the symbiotic nitrogen fixing bacteria JO - PLoS One VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002567 DO - 10.1371/journal.pone.0002567 ID - Crossman2008 ER - TY - JOUR AU - Wang, E. T. AU - Rogel, M. A. AU - García-de los Santos, A. AU - Martínez-Romero, J. AU - Cevallos, M. A. AU - Martínez-Romero, E. PY - 1999 DA - 1999// TI - Rhizobium etli bv. mimosae, a novel biovar isolated from Mimosa affinis JO - Int J Syst Bacteriol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1099/00207713-49-4-1479 DO - 10.1099/00207713-49-4-1479 ID - Wang1999 ER - TY - JOUR AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Rogel-Hernández, M. A. AU - Lloret, L. AU - López-López, A. AU - Martínez, J. AU - Barois, I. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Change in land use alters the diversity and composition of Bradyrhizobium communities and led to the introduction of Rhizobium etli into the tropical rain forest of Los Tuxtlas (Mexico) JO - Microb Ecol VL - 63 UR - https://doi.org/10.1007/s00248-011-9974-9 DO - 10.1007/s00248-011-9974-9 ID - Ormeño-Orrillo2012 ER - TY - JOUR AU - Vázquez, M. AU - Dávalos, A. AU - de las Peñas, A. AU - Sánchez, F. AU - Quinto, C. PY - 1991 DA - 1991// TI - Novel organization of the common nodulation genes in Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli strains JO - J Bacteriol VL - 173 ID - Vázquez1991 ER - TY - JOUR AU - Silva, C. AU - Vinuesa, P. AU - Eguiarte, L. E. AU - Souza, V. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Evolutionary genetics and biogeographic structure of Rhizobium gallicum sensu lato, a widely distributed bacterial symbiont of diverse legumes JO - Mol Ecol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02721.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2005.02721.x ID - Silva2005 ER - TY - JOUR AU - Martínez-Romero, E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Coevolution in Rhizobium-legume symbiosis? JO - DNA Cell Biol VL - 28 UR - https://doi.org/10.1089/dna.2009.0863 DO - 10.1089/dna.2009.0863 ID - Martínez-Romero2009 ER - TY - JOUR AU - Delgado-Salinas, A. AU - Bibler, R. AU - Lavin, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Phylogeny of the genus Phaseolus (Leguminosae): a recent diversification in an ancient landscape JO - Syst Bot VL - 31 UR - https://doi.org/10.1600/036364406779695960 DO - 10.1600/036364406779695960 ID - Delgado-Salinas2006 ER - TY - JOUR AU - Dos Reis, F. B. J. AU - Simon, M. F. AU - Gross, E. AU - Boddey, R. M. AU - Elliott, G. N. AU - Neto, N. E. AU - Loureiro, M. F. AU - de Queiroz, L. P. AU - Scotti, M. R. AU - Chen, W. M. AU - Norén, A. AU - Rubio, M. C. AU - de Faria, S. M. AU - Bontemps, C. AU - Goi, S. R. AU - Young, J. P. AU - Sprent, J. I. AU - James, E. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the Cerrado and Caatinga biomes of Brazil JO - New Phytol VL - 186 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2010.03267.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2010.03267.x ID - Dos Reis2010 ER - TY - JOUR AU - Chen, W. M. AU - de Faria, S. M. AU - James, E. K. AU - Elliott, G. N. AU - Lin, K. Y. AU - Chou, J. H. AU - Sheu, S. Y. AU - Cnockaert, M. AU - Sprent, J. I. AU - Vandamme, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Burkholderia nodosa sp. nov., isolated from root nodules of the woody Brazilian legumes Mimosa bimucronata and Mimosa scabrella JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 57 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.64873-0 DO - 10.1099/ijs.0.64873-0 ID - Chen2007 ER - TY - JOUR AU - Chen, W. M. AU - de Faria, S. M. AU - Chou, J. H. AU - James, E. K. AU - Elliott, G. N. AU - Sprent, J. I. AU - Bontemps, C. AU - Young, J. P. AU - Vandamme, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Burkholderia sabiae sp. nov., isolated from root nodules of Mimosa caesalpiniifolia JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 58 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.65816-0 DO - 10.1099/ijs.0.65816-0 ID - Chen2008 ER - TY - JOUR AU - Sheu, S. Y. AU - Chou, J. H. AU - Bontemps, C. AU - Elliott, G. N. AU - Gross, E. AU - James, E. K. AU - Sprent, J. I. AU - Young, J. P. AU - Chen, W. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Burkholderia symbiotica sp. nov., isolated from root nodules of Mimosa spp. native to north-east Brazil JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 62 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.037408-0 DO - 10.1099/ijs.0.037408-0 ID - Sheu2012 ER - TY - JOUR AU - Taulé, C. AU - Zabaleta, M. AU - Mareque, C. AU - Platero, R. AU - Sanjurjo, L. AU - Sicardi, M. AU - Frioni, L. AU - Battistoni, F. AU - Fabiano, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - New Betaproteobacterial Rhizobium strains able to efficiently nodulate Parapiptadenia rigida (Benth.) Brenan JO - Appl Environ Microbiol VL - 78 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.06215-11 DO - 10.1128/AEM.06215-11 ID - Taulé2012 ER - TY - JOUR AU - Simon, M. F. AU - Grether, R. AU - de Queiroz, L. P. AU - Särkinen, T. E. AU - Dutra, V. F. AU - Hughes, C. E. PY - 2011 DA - 2011// TI - The evolutionary history of Mimosa (Leguminosae): toward a phylogeny of the sensitive plants JO - Am J Bot VL - 98 UR - https://doi.org/10.3732/ajb.1000520 DO - 10.3732/ajb.1000520 ID - Simon2011 ER - TY - JOUR AU - Elliott, G. N. AU - Chou, J. H. AU - Chen, W. M. AU - Bloemberg, G. V. AU - Bontemps, C. AU - Martínez-Romero, E. AU - Velázquez, E. AU - Young, J. P. AU - Sprent, J. I. AU - James, E. K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Burkholderia spp. are the most competitive symbionts of Mimosa, particularly under N-limited conditions JO - Environ Microbiol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2008.01799.x DO - 10.1111/j.1462-2920.2008.01799.x ID - Elliott2009 ER - TY - CHAP AU - Gehlot, H. S. AU - Tak, N. AU - Kaushik, M. AU - Mitra, S. AU - Chen, W. -. M. AU - Poweleit, N. AU - Panwar, D. AU - Poonar, N. AU - Parihar, R. AU - Tak, A. AU - Sankhla, I. S. AU - Ojha, A. AU - Rao, S. R. AU - Simon, M. F. AU - Dos Reis, F. B. AU - Perigolo, N. AU - Tripathi, A. AU - Sprent, J. I. AU - Young, J. P. W. AU - James, E. K. AU - Gyaneshwar, P. PY - 2013 DA - 2013// TI - An invasive Mimosa in India does not adopt the symbionts of its native relatives BT - Ann Bot ID - Gehlot2013 ER - TY - JOUR AU - Robledo, M. AU - Velázquez, E. AU - Ramírez-Bahena, M. H. AU - García-Fraile, P. AU - Pérez-Alonso, A. AU - Rivas, R. AU - Martínez-Molina, E. AU - Mateos, P. F. PY - 2011 DA - 2011// TI - The celC gene, a new phylogenetic marker useful for taxonomic studies in Rhizobium JO - Syst Appl Microbiol VL - 34 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.01.010 DO - 10.1016/j.syapm.2011.01.010 ID - Robledo2011 ER - TY - JOUR AU - Toledo, I. AU - Lloret, L. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Sinorhizobium americanum sp. nov., a new Sinorhizobium species nodulating native Acacia spp. in Mexico JO - Syst Appl Microbiol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1078/072320203322337317 DO - 10.1078/072320203322337317 ID - Toledo2003 ER - TY - JOUR AU - Hynes, M. F. AU - McGregor, N. F. PY - 1990 DA - 1990// TI - Two plasmids other than the nodulation plasmid are necessary for formation of nitrogen-fixing nodules by Rhizobium leguminosarum JO - Mol Microbiol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.1990.tb00625.x DO - 10.1111/j.1365-2958.1990.tb00625.x ID - Hynes1990 ER - TY - JOUR AU - Martinez-Romero, E. AU - Rosenblueth, M. PY - 1990 DA - 1990// TI - Increased bean (Phaseolus vulgaris L.) nodulation competitiveness of genetically modified Rhizobium strains JO - Appl Environ Microbiol VL - 56 ID - Martinez-Romero1990 ER - TY - JOUR AU - Zerbino, D. R. AU - Birney, E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs JO - Genome Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.074492.107 DO - 10.1101/gr.074492.107 ID - Zerbino2008 ER - TY - JOUR AU - Boetzer, M. AU - Henkel, C. V. AU - Jansen, H. J. AU - Butler, D. AU - Pirovano, W. PY - 2011 DA - 2011// TI - Scaffolding pre-assembled contigs using SSPACE JO - Bioinformatics VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq683 DO - 10.1093/bioinformatics/btq683 ID - Boetzer2011 ER - TY - JOUR AU - Gordon, D. AU - Abajian, C. AU - Green, P. PY - 1998 DA - 1998// TI - Consed: a graphical tool for sequence finishing JO - Genome Res VL - 8 UR - https://doi.org/10.1101/gr.8.3.195 DO - 10.1101/gr.8.3.195 ID - Gordon1998 ER - TY - JOUR AU - Delcher, A. L. AU - Harmon, D. AU - Kasif, S. AU - White, O. AU - Salzberg, S. L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Improved microbial gene identification with GLIMMER JO - Nucleic Acids Res VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/nar/27.23.4636 DO - 10.1093/nar/27.23.4636 ID - Delcher1999 ER - TY - JOUR AU - Rutherford, K. AU - Parkhill, J. AU - Crook, J. AU - Horsnell, T. AU - Rice, P. AU - Rajandream, M. -. A. AU - Barrell, B. PY - 2000 DA - 2000// TI - Artemis: sequence visualization and annotation JO - Bioinformatics VL - 16 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/16.10.944 DO - 10.1093/bioinformatics/16.10.944 ID - Rutherford2000 ER - TY - JOUR AU - González, V. AU - Santamaría, R. I. AU - Bustos, P. AU - Hernández-González, I. AU - Medrano-Soto, A. AU - Moreno-Hagelsieb, G. AU - Janga, S. C. AU - Ramírez, M. A. AU - Jiménez-Jacinto, V. AU - Collado-Vides, J. AU - Dávila, G. PY - 2006 DA - 2006// TI - The partitioned Rhizobium etli genome: genetic and metabolic redundancy in seven interacting replicons JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0508502103 DO - 10.1073/pnas.0508502103 ID - González2006 ER - TY - JOUR AU - Benson, D. A. AU - Karsch-Mizrachi, I. AU - Lipman, D. J. AU - Ostell, J. AU - Wheeler, D. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - GenBank JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm929 DO - 10.1093/nar/gkm929 ID - Benson2008 ER - TY - JOUR AU - Apweiler, R. AU - Attwood, T. K. AU - Bairoch, A. AU - Bateman, A. AU - Birney, E. AU - Biswas, M. AU - Bucher, P. AU - Cerutti, L. AU - Corpet, F. AU - Croning, M. D. R. AU - Durbin, R. AU - Falquet, L. AU - Fleischmann, W. AU - Gouzy, J. AU - Hermjakob, H. AU - Hulo, N. AU - Jonassen, I. AU - Kahn, D. AU - Kanapin, A. AU - Karavidopoulou, Y. AU - Lopez, R. AU - Marx, B. AU - Mulder, N. J. AU - Oinn, T. M. AU - Pagni, M. AU - Servant, F. AU - Sigrist, C. J. A. AU - Zdobnov, E. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - The InterPro database, an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.1.37 DO - 10.1093/nar/29.1.37 ID - Apweiler2001 ER - TY - JOUR AU - Richter, M. AU - Rossello-Mora, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Shifting the genomic gold standard for the prokaryotic species definition JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0906412106 DO - 10.1073/pnas.0906412106 ID - Richter2009 ER - TY - JOUR AU - Kurtz, S. AU - Phillippy, A. AU - Delcher, A. L. AU - Smoot, M. AU - Shumway, M. AU - Antonescu, C. AU - Salzberg, S. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Versatile and open software for comparing large genomes JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-2-r12 DO - 10.1186/gb-2004-5-2-r12 ID - Kurtz2004 ER - TY - JOUR AU - Enright, A. J. AU - Van Dongen, S. AU - Ouzounis, C. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - An efficient algorithm for large-scale detection of protein families JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.7.1575 DO - 10.1093/nar/30.7.1575 ID - Enright2002 ER - TY - JOUR AU - Vernikos, G. S. AU - Parkhill, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Interpolated variable order motifs for detection of horizontally acquired DNA: revisiting the Salmonella pathogenicity islands JO - Bioinformatics VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl369 DO - 10.1093/bioinformatics/btl369 ID - Vernikos2006 ER - TY - JOUR AU - Edgar, R. C. PY - 2004 DA - 2004// TI - MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh340 DO - 10.1093/nar/gkh340 ID - Edgar2004 ER - TY - JOUR AU - Guindon, S. AU - Dufayard, J. -. F. AU - Lefort, V. AU - Anisimova, M. AU - Hordijk, W. AU - Gascuel, O. PY - 2010 DA - 2010// TI - New algorithms and methods to estimate Maximum-Likelihood phylogenies: assessing the performance of PhyML 3.0 JO - Syst Biol VL - 59 UR - https://doi.org/10.1093/sysbio/syq010 DO - 10.1093/sysbio/syq010 ID - Guindon2010 ER - TY - JOUR AU - Ronquist, F. AU - Huelsenbeck, J. P. PY - 2003 DA - 2003// TI - MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg180 DO - 10.1093/bioinformatics/btg180 ID - Ronquist2003 ER - TY - JOUR AU - Harrison, P. W. AU - Lower, R. P. AU - Kim, N. K. AU - Young, J. P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Introducing the bacterial ‘chromid’: not a chromosome, not a plasmid JO - Trends Microbiol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.tim.2009.12.010 DO - 10.1016/j.tim.2009.12.010 ID - Harrison2010 ER - TY - JOUR AU - Cevallos, M. A. AU - Cervantes-Rivera, R. AU - Gutiérrez-Ríos, R. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - The repABC plasmid family JO - Plasmid VL - 60 UR - https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2008.03.001 DO - 10.1016/j.plasmid.2008.03.001 ID - Cevallos2008 ER - TY - CHAP AU - Ribeiro, R. A. AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Fuzinatto Dall’Agnol, R. AU - Graham, P. H. AU - Martínez-Romero, E. AU - Hungria, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Novel Rhizobium lineages isolated from root nodules of common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Andean and Mesoamerican areas BT - Res Microbiol ID - Ribeiro2013 ER - TY - JOUR AU - Pardo, M. A. AU - Lagunez, J. AU - Miranda, J. AU - Martínez, E. PY - 1994 DA - 1994// TI - Nodulating ability of Rhizobium tropici is conditioned by a plasmid-encoded citrate synthase JO - Mol Microbiol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.1994.tb00311.x DO - 10.1111/j.1365-2958.1994.tb00311.x ID - Pardo1994 ER - TY - JOUR AU - Hernández-Lucas, I. AU - Pardo, M. A. AU - Segovia, L. AU - Miranda, J. AU - Martínez-Romero, E. PY - 1995 DA - 1995// TI - Rhizobium tropici chromosomal citrate synthase gene JO - Appl Environ Microbiol VL - 61 ID - Hernández-Lucas1995 ER - TY - JOUR AU - Rosemeyer, V. AU - Michiels, J. AU - Verreth, C. AU - Vanderleyden, J. PY - 1998 DA - 1998// TI - luxI- and luxR-homologous genes of Rhizobium etli CNPAF512 contribute to synthesis of autoinducer molecules and nodulation of Phaseolus vulgaris JO - J Bacteriol VL - 180 ID - Rosemeyer1998 ER - TY - JOUR AU - Daniels, R. AU - De Vos, D. E. AU - Desair, J. AU - Raedschelders, G. AU - Luyten, E. AU - Rosemeyer, V. AU - Verreth, C. AU - Schoeters, E. AU - Vanderleyden, J. AU - Michiels, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - The cin quorum sensing locus of Rhizobium etli CNPAF512 affects growth and symbiotic nitrogen fixation JO - J Biol Chem VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M106655200 DO - 10.1074/jbc.M106655200 ID - Daniels2002 ER - TY - JOUR AU - López-Guerrero, M. G. AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Acosta, J. L. AU - Mendoza-Vargas, A. AU - Rogel, M. A. AU - Ramírez, M. A. AU - Rosenblueth, M. AU - Martínez-Romero, J. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Rhizobial extrachromosomal replicon variability, stability and expression in natural niches JO - Plasmid VL - 68 UR - https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2012.07.002 DO - 10.1016/j.plasmid.2012.07.002 ID - López-Guerrero2012 ER - TY - JOUR AU - Poupot, R. AU - Martinez-Romero, E. AU - Gautier, N. AU - Promé, J. C. PY - 1995 DA - 1995// TI - Wild type Rhizobium etli, a bean symbiont, produces acetyl-fucosylated, N-methylated, and carbamoylated nodulation factors JO - J Biol Chem VL - 270 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.270.11.6050 DO - 10.1074/jbc.270.11.6050 ID - Poupot1995 ER - TY - JOUR AU - Laeremans, T. AU - Snoeck, C. AU - Mariën, J. AU - Verreth, C. AU - Martínez-Romero, E. AU - Promé, J. C. AU - Vanderleyden, J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Phaseolus vulgaris recognizes Azorhizobium caulinodans Nod factors with a variety of chemical substituents JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 12 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.1999.12.9.820 DO - 10.1094/MPMI.1999.12.9.820 ID - Laeremans1999 ER - TY - JOUR AU - Waelkens, F. AU - Voets, T. AU - Vlassak, K. AU - Vanderleyden, J. AU - van Rhijn, P. PY - 1995 DA - 1995// TI - The nodS gene of Rhizobium tropici strain CIAT899 is necessary for nodulation on Phaseolus vulgaris and on Leucaena leucocephala JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 8 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI-8-0147 DO - 10.1094/MPMI-8-0147 ID - Waelkens1995 ER - TY - JOUR AU - Perret, X. AU - Staehelin, C. AU - Broughton, W. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Molecular basis of symbiotic promiscuity JO - Microbiol Mol Biol Rev VL - 64 UR - https://doi.org/10.1128/MMBR.64.1.180-201.2000 DO - 10.1128/MMBR.64.1.180-201.2000 ID - Perret2000 ER - TY - JOUR AU - van Rhijn, P. AU - Luyten, E. AU - Vlassak, K. AU - Vanderleyden, J. PY - 1996 DA - 1996// TI - Isolation and characterization of a pSym locus of Rhizobium sp. BR816 that extends nodulation ability of narrow host range Phaseolus vulgaris symbionts to Leucaena leucocephala JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 9 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI-9-0074 DO - 10.1094/MPMI-9-0074 ID - van Rhijn1996 ER - TY - JOUR AU - Vlassak, K. M. AU - Luyten, E. AU - Verreth, C. AU - van Rhijn, P. AU - Bisseling, T. AU - Vanderleyden, J. PY - 1998 DA - 1998// TI - The Rhizobium sp. BR816 nodO gene can function as a determinant for nodulation of Leucaena leucocephala, Phaseolus vulgaris, and Trifolium repens by a diversity of Rhizobium spp JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 11 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.1998.11.5.383 DO - 10.1094/MPMI.1998.11.5.383 ID - Vlassak1998 ER - TY - JOUR AU - Tittabutr, P. AU - Awaya, J. D. AU - Li, Q. X. AU - Borthakur, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - The cloned 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase gene from Sinorhizobium sp. strain BL3 in Rhizobium sp. strain TAL1145 promotes nodulation and growth of Leucaena leucocephala JO - Syst Appl Microbiol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2008.03.001 DO - 10.1016/j.syapm.2008.03.001 ID - Tittabutr2008 ER - TY - JOUR AU - González, V. AU - Bustos, P. AU - Ramírez-Romero, M. A. AU - Medrano-Soto, A. AU - Salgado, H. AU - Hernández-González, I. AU - Hernández-Celis, J. C. AU - Quintero, V. AU - Moreno-Hagelsieb, G. AU - Girard, L. AU - Rodríguez, O. AU - Flores, M. AU - Cevallos, M. A. AU - Collado-Vides, J. AU - Romero, D. AU - Dávila, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - The mosaic structure of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 and its relation to other symbiotic genome compartments JO - Genome Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2003-4-6-r36 DO - 10.1186/gb-2003-4-6-r36 ID - González2003 ER - TY - JOUR AU - Girard, L. AU - Brom, S. AU - Dávalos, A. AU - López, O. AU - Soberón, M. AU - Romero, D. PY - 2000 DA - 2000// TI - Differential regulation of fixN-reiterated genes in Rhizobium etli by a novel fixL–fixK cascade JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 12 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.2000.13.12.1283 DO - 10.1094/MPMI.2000.13.12.1283 ID - Girard2000 ER - TY - JOUR AU - Zamorano-Sánchez, D. AU - Reyes-González, A. AU - Gómez-Hernández, N. AU - Rivera, P. AU - Georgellis, D. AU - Girard, L. PY - 2012 DA - 2012// TI - FxkR provides the missing link in the fixL-fixK signal transduction cascade in Rhizobium etli CFN42 JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 25 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI-05-12-0136-R DO - 10.1094/MPMI-05-12-0136-R ID - Zamorano-Sánchez2012 ER - TY - JOUR AU - Rosenblueth, M. AU - Hynes, M. F. AU - Martínez-Romero, E. PY - 1998 DA - 1998// TI - Rhizobium tropici teu genes involved in specific uptake of Phaseolus vulgaris bean-exudate compounds JO - Mol Gen Genet VL - 258 UR - https://doi.org/10.1007/s004380050772 DO - 10.1007/s004380050772 ID - Rosenblueth1998 ER - TY - JOUR AU - Fauvart, M. AU - Michiels, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rhizobial secreted proteins as determinants of host specificity in the rhizobium-legume symbiosis JO - FEMS Microbiol Lett VL - 285 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2008.01254.x DO - 10.1111/j.1574-6968.2008.01254.x ID - Fauvart2008 ER - TY - JOUR AU - Baginsky, C. AU - Brito, B. AU - Imperial, J. AU - Palacios, J. -. M. AU - Ruiz-Argüeso, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Diversity and evolution of hydrogenase systems in rhizobia JO - Appl Environ Microbiol VL - 68 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.68.10.4915-4924.2002 DO - 10.1128/AEM.68.10.4915-4924.2002 ID - Baginsky2002 ER - TY - JOUR AU - Brito, B. AU - Prieto, R. I. AU - Cabrera, E. AU - Mandrand-Berthelot, M. A. AU - Imperial, J. AU - Ruiz-Argueso, T. AU - Palacios, J. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Rhizobium leguminosarum hupE encodes a nickel transporter required for hydrogenase activity JO - J Bacteriol VL - 192 UR - https://doi.org/10.1128/JB.01045-09 DO - 10.1128/JB.01045-09 ID - Brito2010 ER - TY - JOUR AU - López-López, A. AU - Rogel, M. A. AU - Ormeño-Orrillo, E. AU - Martínez-Romero, J. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2010 DA - 2010// TI - Phaseolus vulgaris seed-borne endophytic community with novel bacterial species such as Rhizobium endophyticum sp. nov JO - Syst Appl Microbiol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1016/j.syapm.2010.07.005 DO - 10.1016/j.syapm.2010.07.005 ID - López-López2010 ER - TY - JOUR AU - Lozano, L. AU - Hernández-González, I. AU - Bustos, P. AU - Santamaría, R. I. AU - Souza, V. AU - Young, J. P. AU - Dávila, G. AU - González, V. PY - 2010 DA - 2010// TI - Evolutionary dynamics of insertion sequences in relation to the evolutionary histories of the chromosome and symbiotic plasmid genes of Rhizobium etli populations JO - Appl Environ Microbiol VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01001-10 DO - 10.1128/AEM.01001-10 ID - Lozano2010 ER - TY - JOUR AU - González, V. AU - Acosta, J. L. AU - Santamaría, R. I. AU - Bustos, P. AU - Fernández, J. L. AU - Hernández González, I. L. AU - Díaz, R. AU - Flores, M. AU - Palacios, R. AU - Mora, J. AU - Dávila, G. PY - 2010 DA - 2010// TI - Conserved symbiotic plasmid DNA sequences in the multireplicon pangenomic structure of Rhizobium etli JO - Appl Environ Microbiol VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02039-09 DO - 10.1128/AEM.02039-09 ID - González2010 ER - TY - JOUR AU - Brom, S. AU - Girard, L. AU - Tun-Garrido, C. AU - García-de los Santos, A. AU - Bustos, P. AU - González, V. AU - Romero, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Transfer of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 requires cointegration with p42a, which may be mediated by site-specific recombination JO - J Bacteriol VL - 186 UR - https://doi.org/10.1128/JB.186.22.7538-7548.2004 DO - 10.1128/JB.186.22.7538-7548.2004 ID - Brom2004 ER - TY - JOUR AU - González-Pasayo, R. AU - Martínez-Romero, E. PY - 2000 DA - 2000// TI - Multiresistance genes of Rhizobium etli CFN42 JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 13 UR - https://doi.org/10.1094/MPMI.2000.13.5.572 DO - 10.1094/MPMI.2000.13.5.572 ID - González-Pasayo2000 ER - TY - JOUR AU - Ramachandran, V. K. AU - East, A. K. AU - Karunakaran, R. AU - Downie, J. A. AU - Poole, P. S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Adaptation of Rhizobium leguminosarum to pea, alfalfa and sugar beet rhizospheres investigated by comparative transcriptomics JO - Genome Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2011-12-10-r106 DO - 10.1186/gb-2011-12-10-r106 ID - Ramachandran2011 ER - TY - CHAP AU - Borthakur, D. AU - Soedarjo, M. ED - Martinez, E. ED - Hernandez, G. PY - 1999 DA - 1999// TI - Isolation and Characterization of a DNA Fragment Containing Genes for Mimosine Degradation from Rhizobium sp. Strain TAL1145 BT - Highlights of Nitrogen Fixation Research PB - Kluwer/Plenum CY - New York UR - https://doi.org/10.1007/978-1-4615-4795-2_17 DO - 10.1007/978-1-4615-4795-2_17 ID - Borthakur1999 ER - TY - JOUR AU - Soedarjo, M. AU - Borthakur, D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Mimosine, a toxin produced by the tree-legume Leucaena provides a nodulation competition advantage to mimosine-degrading Rhizobium strains JO - Soil Biol Biochem VL - 30 UR - https://doi.org/10.1016/S0038-0717(97)00180-6 DO - 10.1016/S0038-0717(97)00180-6 ID - Soedarjo1998 ER -