TY - JOUR AU - Greaves, L. C. AU - Reeve, A. K. AU - Taylor, R. W. AU - Turnbull, D. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Mitochondrial DNA and disease JO - J Pathol VL - 226 UR - https://doi.org/10.1002/path.3028 DO - 10.1002/path.3028 ID - Greaves2011 ER - TY - JOUR AU - Schon, E. A. AU - DiMauro, S. AU - Hirano, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Human mitochondrial DNA: roles of inherited and somatic mutations JO - Nat Rev Genet VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/nrg3275 DO - 10.1038/nrg3275 ID - Schon2012 ER - TY - JOUR AU - Schaefer, A. M. AU - McFarland, R. AU - Blakely, E. L. AU - He, L. AU - Whittaker, R. G. AU - Taylor, R. W. AU - Chinnery, P. F. AU - Turnbull, D. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Prevalence of mitochondrial DNA disease in adults JO - Ann Neurol VL - 63 UR - https://doi.org/10.1002/ana.21217 DO - 10.1002/ana.21217 ID - Schaefer2008 ER - TY - JOUR AU - Schaefer, A. M. AU - Taylor, R. W. AU - Turnbull, D. M. AU - Chinnery, P. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - The epidemiology of mitochondrial disorders–past, present and future JO - Biochim Biophys Acta VL - 1659 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2004.09.005 DO - 10.1016/j.bbabio.2004.09.005 ID - Schaefer2004 ER - TY - JOUR AU - Chinnery, P. F. AU - Johnson, M. A. AU - Wardell, T. M. AU - Singh-Kler, R. AU - Hayes, C. AU - Brown, D. T. AU - Taylor, R. W. AU - Bindoff, L. A. AU - Turnbull, D. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - The epidemiology of pathogenic mitochondrial DNA mutations JO - Ann Neurol VL - 48 UR - https://doi.org/3.0.CO;2-P DO - 3.0.CO;2-P ID - Chinnery2000 ER - TY - JOUR AU - Hudson, G. AU - Deschauer, M. AU - Taylor, R. W. AU - Hanna, M. G. AU - Fialho, D. AU - Schaefer, A. M. AU - He, L. -. P. AU - Blakely, E. AU - Turnbull, D. M. AU - Chinnery, P. F. PY - 2006 DA - 2006// TI - POLG1, C10ORF2, and ANT1 mutations are uncommon in sporadic progressive external ophthalmoplegia with multiple mitochondrial DNA deletions JO - Neurology VL - 66 UR - https://doi.org/10.1212/01.wnl.0000210486.32196.24 DO - 10.1212/01.wnl.0000210486.32196.24 ID - Hudson2006 ER - TY - JOUR AU - Spinazzola, A. AU - Zeviani, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Disorders from perturbations of nuclear-mitochondrial intergenomic cross-talk JO - J Intern Med VL - 265 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2796.2008.02059.x DO - 10.1111/j.1365-2796.2008.02059.x ID - Spinazzola2009 ER - TY - JOUR AU - Bender, A. AU - Krishnan, K. J. AU - Morris, C. M. AU - Taylor, G. A. AU - Reeve, A. K. AU - Perry, R. H. AU - Jaros, E. AU - Hersheson, J. S. AU - Betts, J. AU - Klopstock, T. AU - Taylor, R. W. AU - Turnbull, D. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - High levels of mitochondrial DNA deletions in substantia nigra neurons in aging and Parkinson disease JO - Nat Genet VL - 38 UR - https://doi.org/10.1038/ng1769 DO - 10.1038/ng1769 ID - Bender2006 ER - TY - JOUR AU - Linnane, A. W. AU - Marzuki, S. AU - Ozawa, T. AU - Tanaka, M. PY - 1989 DA - 1989// TI - Mitochondrial DNA mutations as an important contributor to ageing and degenerative diseases JO - Lancet VL - 1 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(89)92145-4 DO - 10.1016/S0140-6736(89)92145-4 ID - Linnane1989 ER - TY - JOUR AU - Herbst, A. AU - Pak, J. W. AU - McKenzie, D. AU - Bua, E. AU - Bassiouni, M. AU - Aiken, J. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Accumulation of mitochondrial DNA deletion mutations in aged muscle fibers: evidence for a causal role in muscle fiber loss JO - J Gerontol A Biol Sci Med Sci VL - 62 UR - https://doi.org/10.1093/gerona/62.3.235 DO - 10.1093/gerona/62.3.235 ID - Herbst2007 ER - TY - JOUR AU - Kraytsberg, Y. AU - Simon, D. K. AU - Turnbull, D. M. AU - Khrapko, K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Do mtDNA deletions drive premature aging in mtDNA mutator mice? JO - Aging Cell VL - 8 UR - https://doi.org/10.1111/j.1474-9726.2009.00484.x DO - 10.1111/j.1474-9726.2009.00484.x ID - Kraytsberg2009 ER - TY - JOUR AU - Schon, E. A. AU - Rizzuto, R. AU - Moraes, C. T. AU - Nakase, H. AU - Zeviani, M. AU - DiMauro, S. PY - 1989 DA - 1989// TI - A direct repeat is a hotspot for large-scale deletion of human mitochondrial DNA JO - Science VL - 244 UR - https://doi.org/10.1126/science.2711184 DO - 10.1126/science.2711184 ID - Schon1989 ER - TY - JOUR AU - Mita, S. AU - Rizzuto, R. AU - Moraes, C. T. AU - Shanske, S. AU - Arnaudo, E. AU - Fabrizi, G. M. AU - Koga, Y. AU - DiMauro, S. AU - Schon, E. A. PY - 1990 DA - 1990// TI - Recombination via flanking direct repeats is a major cause of large-scale deletions of human mitochondrial DNA JO - Nucleic Acids Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/nar/18.3.561 DO - 10.1093/nar/18.3.561 ID - Mita1990 ER - TY - JOUR AU - Samuels, D. C. AU - Schon, E. A. AU - Chinnery, P. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Two direct repeats cause most human mtDNA deletions JO - Trends Genet VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.tig.2004.07.003 DO - 10.1016/j.tig.2004.07.003 ID - Samuels2004 ER - TY - JOUR AU - Lakshmanan, L. N. AU - Gruber, J. AU - Halliwell, B. AU - Gunawan, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - Role of direct repeat and stem-loop motifs in mtDNA deletions: cause or coincidence? JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0035271 DO - 10.1371/journal.pone.0035271 ID - Lakshmanan2012 ER - TY - JOUR AU - Hou, J. H. AU - Wei, Y. H. PY - 1996 DA - 1996// TI - The unusual structures of the hot-regions flanking large-scale deletions in human mitochondrial DNA JO - Biochem J VL - 318 UR - https://doi.org/10.1042/bj3181065 DO - 10.1042/bj3181065 ID - Hou1996 ER - TY - JOUR AU - Zeviani, M. AU - Servidei, S. AU - Gellera, C. AU - Bertini, E. AU - DiMauro, S. AU - DiDonato, S. PY - 1989 DA - 1989// TI - An autosomal dominant disorder with multiple deletions of mitochondrial DNA starting at the D-loop region JO - Nature VL - 339 UR - https://doi.org/10.1038/339309a0 DO - 10.1038/339309a0 ID - Zeviani1989 ER - TY - JOUR AU - Damas, J. AU - Carneiro, J. AU - Gonçalves, J. AU - Stewart, J. B. AU - Samuels, D. C. AU - Amorim, A. AU - Pereira, F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mitochondrial DNA deletions are associated with non-B DNA conformations JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks500 DO - 10.1093/nar/gks500 ID - Damas2012 ER - TY - JOUR AU - Bochman, M. L. AU - Paeschke, K. AU - Zakian, V. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - DNA secondary structures:stability and function ofG-quadruplex structures JO - Nat Rev Genet VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/nrg3296 DO - 10.1038/nrg3296 ID - Bochman2012 ER - TY - JOUR AU - Cao, K. AU - Ryvkin, P. AU - Johnson, F. B. PY - 2012 DA - 2012// TI - Computational detection and analysis of sequences with duplex-derived interstrand G-quadruplex forming potential JO - Methods VL - 57 UR - https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2012.05.002 DO - 10.1016/j.ymeth.2012.05.002 ID - Cao2012 ER - TY - JOUR AU - Lopes, J. AU - Piazza, A. AU - Bermejo, R. AU - Kriegsman, B. AU - Colosio, A. AU - Teulade-Fichou, M. -. P. AU - Foiani, M. AU - Nicolas, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - G-quadruplex-induced instability during leading-strand replication JO - EMBO J VL - 30 UR - https://doi.org/10.1038/emboj.2011.316 DO - 10.1038/emboj.2011.316 ID - Lopes2011 ER - TY - JOUR AU - Ribeyre, C. AU - Lopes, J. AU - Boulé, J. -. B. AU - Piazza, A. AU - Guédin, A. AU - Zakian, V. A. AU - Mergny, J. -. L. AU - Nicolas, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - The yeast Pif1 helicase prevents genomic instability caused by G-quadruplex-forming CEB1 sequences in vivo JO - PLoS Genet VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000475 DO - 10.1371/journal.pgen.1000475 ID - Ribeyre2009 ER - TY - JOUR AU - De, S. AU - Michor, F. PY - 2011 DA - 2011// TI - DNA secondary structures and epigenetic determinants of cancer genome evolution JO - Nat Struct Mol Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/nsmb.2089 DO - 10.1038/nsmb.2089 ID - De2011 ER - TY - JOUR AU - Capra, J. A. AU - Paeschke, K. AU - Singh, M. AU - Zakian, V. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - G-quadruplex DNA sequences are evolutionarily conserved and associated with distinct genomic features in Saccharomyces cerevisiae JO - PLoS Comput Biol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000861 DO - 10.1371/journal.pcbi.1000861 ID - Capra2010 ER - TY - JOUR AU - Rawal, P. AU - Kummarasetti, V. B. R. AU - Ravindran, J. AU - Kumar, N. AU - Halder, K. AU - Sharma, R. AU - Mukerji, M. AU - Das, S. K. AU - Chowdhury, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genome-wide prediction of G4 DNA as regulatory motifs: role in Escherichia coli global regulation JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.4508806 DO - 10.1101/gr.4508806 ID - Rawal2006 ER - TY - JOUR AU - Wanrooij, P. H. AU - Uhler, J. P. AU - Simonsson, T. AU - Falkenberg, M. AU - Gustafsson, C. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - G-quadruplex structures in RNA stimulate mitochondrial transcription termination and primer formation JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1006026107 DO - 10.1073/pnas.1006026107 ID - Wanrooij2010 ER - TY - JOUR AU - Lee, D. Y. AU - Clayton, D. A. PY - 1996 DA - 1996// TI - Properties of a primer RNA-DNA hybrid at the mouse mitochondrial DNA leading-strand origin of replication JO - J Biol Chem VL - 271 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.271.39.24262 DO - 10.1074/jbc.271.39.24262 ID - Lee1996 ER - TY - JOUR AU - Wanrooij, P. H. AU - Uhler, J. P. AU - Shi, Y. AU - Westerlund, F. AU - Falkenberg, M. AU - Gustafsson, C. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - A hybrid G-quadruplex structure formed between RNA and DNA explains the extraordinary stability of the mitochondrial R-loop JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks802 DO - 10.1093/nar/gks802 ID - Wanrooij2012 ER - TY - JOUR AU - Albring, M. AU - Attardi, G. PY - 1977 DA - 1977// TI - Association of a protein structure of probable membrane derivation with HeLa cell mitochondrial DNA near its origin of replication JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 74 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.74.4.1348 DO - 10.1073/pnas.74.4.1348 ID - Albring1977 ER - TY - JOUR AU - Kopek, B. G. AU - Shtengel, G. AU - Xu, C. S. AU - Clayton, D. A. AU - Hess, H. F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Correlative 3D superresolution fluorescence and electron microscopy reveal the relationship of mitochondrial nucleoids to membranes JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1121558109 DO - 10.1073/pnas.1121558109 ID - Kopek2012 ER - TY - JOUR AU - Chang, D. D. AU - Clayton, D. A. PY - 1985 DA - 1985// TI - Priming of human mitochondrial DNA replication occurs at the light-strand promoter JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 82 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.82.2.351 DO - 10.1073/pnas.82.2.351 ID - Chang1985 ER - TY - JOUR AU - Oliveira, P. H. AU - da Silva, C. L. AU - Cabral, J. M. S. PY - 2013 DA - 2013// TI - An appraisal of human mitochondrial DNA instability: new insights into the role of non-canonical DNA structures and sequence motifs JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0059907 DO - 10.1371/journal.pone.0059907 ID - Oliveira2013 ER - TY - JOUR AU - Hazel, P. AU - Huppert, J. AU - Balasubramanian, S. AU - Neidle, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Loop-length-dependent folding of G-quadruplexes JO - J Am Chem Soc VL - 126 UR - https://doi.org/10.1021/ja045154j DO - 10.1021/ja045154j ID - Hazel2004 ER - TY - JOUR AU - Petraccone, L. AU - Erra, E. AU - Duro, I. AU - Esposito, V. AU - Randazzo, A. AU - Mayol, L. AU - Mattia, C. A. AU - Barone, G. AU - Giancola, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Relative stability of quadruplexes containing different number of G-tetrads JO - Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids VL - 24 UR - https://doi.org/10.1081/NCN-200060080 DO - 10.1081/NCN-200060080 ID - Petraccone2005 ER - TY - JOUR AU - Risitano, A. AU - Fox, K. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Influence of loop size on the stability of intramolecular DNA quadruplexes JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh598 DO - 10.1093/nar/gkh598 ID - Risitano2004 ER - TY - JOUR AU - Kikin, O. AU - D’antonio, L. AU - Bagga, P. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - QGRS Mapper: a web-based server for predicting G-quadruplexes in nucleotide sequences JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkl253 DO - 10.1093/nar/gkl253 ID - Kikin2006 ER - TY - JOUR AU - Markham, N. R. AU - Zuker, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - UNAFold: software for nucleic acid folding and hybridization JO - Methods Mol Biol VL - 453 UR - https://doi.org/10.1007/978-1-60327-429-6_1 DO - 10.1007/978-1-60327-429-6_1 ID - Markham2008 ER - TY - JOUR AU - Krzywinski, M. AU - Schein, J. AU - Birol, I. AU - Connors, J. AU - Gascoyne, R. AU - Horsman, D. AU - Jones, S. J. AU - Marra, M. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Circos: an information aesthetic for comparative genomics JO - Genome Res VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.092759.109 DO - 10.1101/gr.092759.109 ID - Krzywinski2009 ER - TY - JOUR AU - Bhattacharjee, A. J. AU - Ahluwalia, K. AU - Taylor, S. AU - Jin, O. AU - Nicoludis, J. M. AU - Buscaglia, R. AU - Brad Chaires, J. AU - Kornfilt, D. J. P. AU - Marquardt, D. G. S. AU - Yatsunyk, L. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Induction of G-quadruplex DNA structure by Zn(II) 5,10,15,20-tetrakis(N-methyl-4-pyridyl)porphyrin JO - Biochimie VL - 93 UR - https://doi.org/10.1016/j.biochi.2011.05.038 DO - 10.1016/j.biochi.2011.05.038 ID - Bhattacharjee2011 ER - TY - JOUR AU - Smith, J. S. AU - Chen, Q. AU - Yatsunyk, L. A. AU - Nicoludis, J. M. AU - Garcia, M. S. AU - Kranaster, R. AU - Balasubramanian, S. AU - Monchaud, D. AU - Teulade-Fichou, M. -. P. AU - Abramowitz, L. AU - Schultz, D. C. AU - Johnson, F. B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Rudimentary G-quadruplex-based telomere capping in Saccharomyces cerevisiae JO - Nat Struct Mol Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/nsmb.2033 DO - 10.1038/nsmb.2033 ID - Smith2011 ER - TY - JOUR AU - Huppert, J. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Hunting G-quadruplexes JO - Biochimie VL - 90 UR - https://doi.org/10.1016/j.biochi.2008.01.014 DO - 10.1016/j.biochi.2008.01.014 ID - Huppert2008 ER - TY - JOUR AU - Yang, J. -. N. AU - Seluanov, A. AU - Gorbunova, V. PY - 2013 DA - 2013// TI - Mitochondrial inverted repeats strongly correlate with lifespan: mtDNA inversions and aging JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0073318 DO - 10.1371/journal.pone.0073318 ID - Yang2013 ER - TY - JOUR AU - Moraes, C. T. AU - DiMauro, S. AU - Zeviani, M. AU - Lombes, A. AU - Shanske, S. AU - Miranda, A. F. AU - Nakase, H. AU - Bonilla, E. AU - Werneck, L. C. AU - Servidei, S. PY - 1989 DA - 1989// TI - Mitochondrial DNA deletions in progressive external ophthalmoplegia and Kearns-Sayre syndrome JO - N Engl J Medi VL - 320 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM198905183202001 DO - 10.1056/NEJM198905183202001 ID - Moraes1989 ER - TY - JOUR AU - Guo, X. AU - Popadin, K. Y. AU - Markuzon, N. AU - Orlov, Y. L. AU - Kraytsberg, Y. AU - Krishnan, K. J. AU - Zsurka, G. AU - Turnbull, D. M. AU - Kunz, W. S. AU - Khrapko, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Repeats, longevity and the sources of mtDNA deletions: evidence from ‘deletional spectra’ JO - Trends Genet VL - 26 UR - https://doi.org/10.1016/j.tig.2010.05.006 DO - 10.1016/j.tig.2010.05.006 ID - Guo2010 ER - TY - JOUR AU - Damas, J. AU - Samuels, D. C. AU - Carneiro, J. AU - Amorim, A. AU - Pereira, F. PY - 2014 DA - 2014// TI - Mitochondrial DNA rearrangements in health and disease–a comprehensive study JO - Hum Mutat VL - 35 UR - https://doi.org/10.1002/humu.22452 DO - 10.1002/humu.22452 ID - Damas2014 ER - TY - JOUR AU - Myers, S. AU - Freeman, C. AU - Auton, A. AU - Donnelly, P. AU - McVean, G. PY - 2008 DA - 2008// TI - A common sequence motif associated with recombination hot spots and genome instability in humans JO - Nat Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng.213 DO - 10.1038/ng.213 ID - Myers2008 ER - TY - JOUR AU - Mergny, J. -. L. AU - Li, J. AU - Lacroix, L. AU - Amrane, S. AU - Chaires, J. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Thermal difference spectra: a specific signature for nucleic acid structures JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gni134 DO - 10.1093/nar/gni134 ID - Mergny2005 ER - TY - JOUR AU - Paeschke, K. AU - Capra, J. A. AU - Zakian, V. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - DNA replication through G-quadruplex motifs is promoted by the Saccharomyces cerevisiae Pif1 DNA helicase JO - Cell VL - 145 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.04.015 DO - 10.1016/j.cell.2011.04.015 ID - Paeschke2011 ER - TY - JOUR AU - Paeschke, K. AU - Bochman, M. L. AU - Garcia, P. D. AU - Cejka, P. AU - Friedman, K. L. AU - Kowalczykowski, S. C. AU - Zakian, V. A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Pif1 family helicases suppress genome instability at G-quadruplex motifs JO - Nature VL - 497 UR - https://doi.org/10.1038/nature12149 DO - 10.1038/nature12149 ID - Paeschke2013 ER - TY - JOUR AU - Kolesar, J. E. AU - Wang, C. Y. AU - Taguchi, Y. V. AU - Chou, S. -. H. AU - Kaufman, B. A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Two-dimensional intact mitochondrial DNA agarose electrophoresis reveals the structural complexity of the mammalian mitochondrial genome JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks1324 DO - 10.1093/nar/gks1324 ID - Kolesar2013 ER - TY - JOUR AU - Pohjoismäki, J. L. O. AU - Holmes, J. B. AU - Wood, S. R. AU - Yang, M. -. Y. AU - Yasukawa, T. AU - Reyes, A. AU - Bailey, L. J. AU - Cluett, T. J. AU - Goffart, S. AU - Rigby, R. E. AU - Jackson, A. P. AU - Spelbrink, J. N. AU - Griffith, J. D. AU - Crouch, R. J. AU - Jacobs, H. T. AU - Holt, I. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Mammalian mitochondrial DNA replication intermediates are essentially duplex but contain extensive tracts of RNA/DNA hybrid JO - J Mol Biol VL - 397 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2010.02.029 DO - 10.1016/j.jmb.2010.02.029 ID - Pohjoismäki2010 ER - TY - JOUR AU - Van Tuyle, G. C. AU - Pavco, P. A. PY - 1985 DA - 1985// TI - The rat liver mitochondrial DNA-protein complex: displaced single strands of replicative intermediates are protein coated JO - J Cell Biol VL - 100 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.100.1.251 DO - 10.1083/jcb.100.1.251 ID - Van Tuyle1985 ER - TY - JOUR AU - Kim, N. AU - Jinks-Robertson, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Transcription as a source of genome instability JO - Nat Rev Genet VL - 13 ID - Kim2012 ER - TY - JOUR AU - Krishnan, K. J. AU - Reeve, A. K. AU - Samuels, D. C. AU - Chinnery, P. F. AU - Blackwood, J. K. AU - Taylor, R. W. AU - Wanrooij, S. AU - Spelbrink, J. N. AU - Lightowlers, R. N. AU - Turnbull, D. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - What causes mitochondrial DNA deletions in human cells? JO - Nat Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng.f.94 DO - 10.1038/ng.f.94 ID - Krishnan2008 ER - TY - JOUR AU - Srivastava, S. AU - Moraes, C. T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Double-strand breaks of mouse muscle mtDNA promote large deletions similar to multiple mtDNA deletions in humans JO - Hum Mol Genet VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddi082 DO - 10.1093/hmg/ddi082 ID - Srivastava2005 ER - TY - JOUR AU - Fukui, H. AU - Moraes, C. T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Mechanisms of formation and accumulation of mitochondrial DNA deletions in aging neurons JO - Hum Mol Genet VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddn437 DO - 10.1093/hmg/ddn437 ID - Fukui2009 ER - TY - JOUR AU - Garone, C. AU - Rubio, J. C. AU - Calvo, S. E. AU - Naini, A. AU - Tanji, K. AU - DiMauro, S. AU - Mootha, V. K. AU - Hirano, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - MPV17 mutations causing adult-onset multisystemic disorder with multiple mitochondrial DNA DeletionsMPV17 mutations JO - Arch Neurol VL - 69 UR - https://doi.org/10.1001/archneurol.2012.405 DO - 10.1001/archneurol.2012.405 ID - Garone2012 ER - TY - JOUR AU - Copeland, W. C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Defects in mitochondrial DNA replication and human disease JO - Crit Rev Biochem Mol Biol VL - 47 UR - https://doi.org/10.3109/10409238.2011.632763 DO - 10.3109/10409238.2011.632763 ID - Copeland2012 ER - TY - JOUR AU - Copeland, W. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Inherited mitochondrial diseases of DNA replication JO - Annu Rev Med VL - 59 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.med.59.053006.104646 DO - 10.1146/annurev.med.59.053006.104646 ID - Copeland2008 ER - TY - JOUR AU - Douarre, C. AU - Mergui, X. AU - Sidibe, A. AU - Gomez, D. AU - Alberti, P. AU - Mailliet, P. AU - Trentesaux, C. AU - Riou, J. -. F. PY - 2013 DA - 2013// TI - DNA damage signaling induced by the G-quadruplex ligand 12459 is modulated by PPM1D/WIP1 phosphatase JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt073 DO - 10.1093/nar/gkt073 ID - Douarre2013 ER - TY - JOUR AU - Schwab, R. A. AU - Nieminuszczy, J. AU - Shin-ya, K. AU - Niedzwiedz, W. PY - 2013 DA - 2013// TI - FANCJ couples replication past natural fork barriers with maintenance of chromatin structure JO - J Cell Biol VL - 201 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.201208009 DO - 10.1083/jcb.201208009 ID - Schwab2013 ER - TY - JOUR AU - Spelbrink, J. N. AU - Li, F. Y. AU - Tiranti, V. AU - Nikali, K. AU - Yuan, Q. P. AU - Tariq, M. AU - Wanrooij, S. AU - Garrido, N. AU - Comi, G. AU - Morandi, L. AU - Santoro, L. AU - Toscano, A. AU - Fabrizi, G. M. AU - Somer, H. AU - Croxen, R. AU - Beeson, D. AU - Poulton, J. AU - Suomalainen, A. AU - Jacobs, H. T. AU - Zeviani, M. AU - Larsson, C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Human mitochondrial DNA deletions associated with mutations in the gene encoding Twinkle, a phage T7 gene 4-like protein localized in mitochondria JO - Nat Genet VL - 28 UR - https://doi.org/10.1038/90058 DO - 10.1038/90058 ID - Spelbrink2001 ER - TY - JOUR AU - Jemt, E. AU - Farge, G. AU - Backstrom, S. AU - Holmlund, T. AU - Gustafsson, C. M. AU - Falkenberg, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - The mitochondrial DNA helicase TWINKLE can assemble on a closed circular template and support initiation of DNA synthesis JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr653 DO - 10.1093/nar/gkr653 ID - Jemt2011 ER - TY - JOUR AU - Croteau, D. L. AU - Rossi, M. L. AU - Canugovi, C. AU - Tian, J. AU - Sykora, P. AU - Ramamoorthy, M. AU - Wang, Z. M. AU - Singh, D. K. AU - Akbari, M. AU - Kasiviswanathan, R. AU - Copeland, W. C. AU - Bohr, V. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - RECQL4 localizes to mitochondria and preserves mitochondrial DNA integrity JO - Aging Cell VL - 11 UR - https://doi.org/10.1111/j.1474-9726.2012.00803.x DO - 10.1111/j.1474-9726.2012.00803.x ID - Croteau2012 ER - TY - JOUR AU - Kazak, L. AU - Reyes, A. AU - Duncan, A. L. AU - Rorbach, J. AU - Wood, S. R. AU - Brea-Calvo, G. AU - Gammage, P. A. AU - Robinson, A. J. AU - Minczuk, M. AU - Holt, I. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Alternative translation initiation augments the human mitochondrial proteome JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks1347 DO - 10.1093/nar/gks1347 ID - Kazak2013 ER - TY - JOUR AU - George, T. AU - Wen, Q. AU - Griffiths, R. AU - Ganesh, A. AU - Meuth, M. AU - Sanders, C. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Human Pif1 helicase unwinds synthetic DNA structures resembling stalled DNA replication forks JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkp671 DO - 10.1093/nar/gkp671 ID - George2009 ER - TY - JOUR AU - Sanders, C. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Human Pif1 helicase is a G-quadruplex DNA-binding protein with G-quadruplex DNA-unwinding activity JO - Biochem J VL - 430 UR - https://doi.org/10.1042/BJ20100612 DO - 10.1042/BJ20100612 ID - Sanders2010 ER -