TY - JOUR AU - Goodwin, G. H. AU - Johns, E. W. PY - 1973 DA - 1973// TI - Isolation and characterisation of two calf-thymus chromatin non-histone proteins with high contents of acidic and basic amino acids JO - Eur J Biochem VL - 40 UR - https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1973.tb03188.x DO - 10.1111/j.1432-1033.1973.tb03188.x ID - Goodwin1973 ER - TY - JOUR AU - Bustin, M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Regulation of DNA-dependent activities by the functional motifs of the high-mobility-group chromosomal proteins JO - Mol Cell Biol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.19.8.5237 DO - 10.1128/MCB.19.8.5237 ID - Bustin1999 ER - TY - JOUR AU - Thomas, J. O. AU - Travers, A. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - HMG1 and 2, and related 'architectural' DNA-binding proteins JO - Trends Biochem Sci VL - 26 UR - https://doi.org/10.1016/S0968-0004(01)01801-1 DO - 10.1016/S0968-0004(01)01801-1 ID - Thomas2001 ER - TY - JOUR AU - Bustin, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Revised nomenclature for high mobility group (HMG) chromosomal proteins JO - Trends Biochem Sci VL - 26 UR - https://doi.org/10.1016/S0968-0004(00)01777-1 DO - 10.1016/S0968-0004(00)01777-1 ID - Bustin2001 ER - TY - JOUR AU - Baxevanis, A. D. AU - Landsman, D. PY - 1995 DA - 1995// TI - The HMG-1 box protein family: classification and functional relationships JO - Nucleic Acids Res VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/nar/23.9.1604 DO - 10.1093/nar/23.9.1604 ID - Baxevanis1995 ER - TY - JOUR AU - Aidinis, V. AU - Bonaldi, T. AU - Beltrame, M. AU - Santagata, S. AU - Bianchi, M. E. AU - Spanopoulou, E. PY - 1999 DA - 1999// TI - The RAG1 homeodomain recruits HMG1 and HMG2 to facilitate recombination signal sequence binding and to enhance the intrinsic DNA-bending activity of RAG1-RAG2 JO - Mol Cell Biol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.19.10.6532 DO - 10.1128/MCB.19.10.6532 ID - Aidinis1999 ER - TY - JOUR AU - Allain, F. H. AU - Yen, Y. M. AU - Masse, J. E. AU - Schultze, P. AU - Dieckmann, T. AU - Johnson, R. C. AU - Feigon, J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Solution structure of the HMG protein NHP6A and its interaction with DNA reveals the structural determinants for non-sequence-specific binding JO - EMBO J VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/18.9.2563 DO - 10.1093/emboj/18.9.2563 ID - Allain1999 ER - TY - JOUR AU - Read, C. M. AU - Cary, P. D. AU - Crane-Robinson, C. AU - Driscoll, P. C. AU - Norman, D. G. PY - 1993 DA - 1993// TI - Solution structure of a DNA-binding domain from HMG1 JO - Nucleic Acids Res VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/nar/21.15.3427 DO - 10.1093/nar/21.15.3427 ID - Read1993 ER - TY - JOUR AU - Bewley, C. A. AU - Gronenborn, A. M. AU - Clore, G. M. PY - 1998 DA - 1998// TI - Minor groove-binding architectural proteins: structure, function, and DNA recognition JO - Annu Rev Biophys Biomol Struct VL - 27 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.biophys.27.1.105 DO - 10.1146/annurev.biophys.27.1.105 ID - Bewley1998 ER - TY - JOUR AU - Soullier, S. AU - Jay, P. AU - Poulat, F. AU - Vanacker, J. M. AU - Berta, P. AU - Laudet, V. PY - 1999 DA - 1999// TI - Diversification pattern of the HMG and SOX family members during evolution JO - J Mol Evol VL - 48 UR - https://doi.org/10.1007/PL00006495 DO - 10.1007/PL00006495 ID - Soullier1999 ER - TY - JOUR AU - Pöhler, J. R. G. AU - Norman, D. G. AU - Bramham, J. AU - Bianchi, M. E. AU - Lilley, D. M. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - HMG box proteins bind to four-way DNA junctions in their open conformations JO - EMBO J VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/17.3.817 DO - 10.1093/emboj/17.3.817 ID - Pöhler1998 ER - TY - JOUR AU - Webb, M. AU - Thomas, J. O. PY - 1999 DA - 1999// TI - Structure-specific binding of the two tandem HMG boxes of HMG1 to four-way junction DNA is mediated by the A domain JO - J Mol Biol VL - 294 UR - https://doi.org/10.1006/jmbi.1999.3150 DO - 10.1006/jmbi.1999.3150 ID - Webb1999 ER - TY - JOUR AU - Zlatanova, J. AU - van Holde, K. PY - 1998 DA - 1998// TI - Binding to four-way junction DNA: a common property of architectural proteins? JO - FASEB J VL - 12 ID - Zlatanova1998 ER - TY - JOUR AU - Pil, P. M. AU - Lippard, S. J. PY - 1992 DA - 1992// TI - Specific binding of chromosomal protein HMG1 to DNA damaged by the anticancer drug cisplatin JO - Science VL - 256 UR - https://doi.org/10.1126/science.1566071 DO - 10.1126/science.1566071 ID - Pil1992 ER - TY - JOUR AU - Wilkinson, B. AU - Chen, J. Y. AU - Han, P. AU - Rufner, K. M. AU - Goularte, O. D. AU - Kaye, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - TOX: an HMG box protein implicated in the regulation of thymocyte selection JO - Nat Immunol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/ni767 DO - 10.1038/ni767 ID - Wilkinson2002 ER - TY - JOUR AU - Alizadeh, A. A. AU - Eisen, M. B. AU - Davis, R. E. AU - Ma, C. AU - Lossos, I. S. AU - Rosenwald, A. AU - Boldrick, J. C. AU - Sabet, H. AU - Tran, T. AU - Yu, X. AU - Powell, J. I. AU - Yang, L. AU - Marti, G. E. AU - Moore, T. AU - Hudson, J. ,. J. r. AU - Lu, L. AU - Lewis, D. B. AU - Tibshirani, R. AU - Sherlock, G. AU - Chan, W. C. AU - Greiner, T. C. AU - Weisenburger, D. D. AU - Armitage, J. O. AU - Warnke, R. AU - Staudt, L. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling JO - Nature VL - 403 UR - https://doi.org/10.1038/35000501 DO - 10.1038/35000501 ID - Alizadeh2000 ER - TY - JOUR AU - Kuo, C. T. AU - Leiden, J. M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Transcriptional regulation of T lymphocyte development and function JO - Annu Rev Immunol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.immunol.17.1.149 DO - 10.1146/annurev.immunol.17.1.149 ID - Kuo1999 ER - TY - JOUR AU - Schilham, M. W. AU - Clevers, H. PY - 1998 DA - 1998// TI - HMG box containing transcription factors in lymphocyte differentiation JO - Semin Immunol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1006/smim.1998.0114 DO - 10.1006/smim.1998.0114 ID - Schilham1998 ER - TY - JOUR AU - Staal, F. J. AU - Clevers, H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Tcf/Lef transcription factors during T-cell development: unique and overlapping functions JO - Hematol J VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/sj.thj.6200001 DO - 10.1038/sj.thj.6200001 ID - Staal2000 ER - TY - JOUR AU - Schilham, M. W. AU - Oosterwegel, M. A. AU - Moerer, P. AU - Ya, J. AU - de Boer, P. A. AU - van de Wetering, M. AU - Verbeek, S. AU - Lamers, W. H. AU - Kruisbeek, A. M. AU - Cumano, A. AU - Clevers, H. PY - 1996 DA - 1996// TI - Defects in cardiac outflow tract formation and pro-B-lymphocyte expansion in mice lacking Sox-4 JO - Nature VL - 380 UR - https://doi.org/10.1038/380711a0 DO - 10.1038/380711a0 ID - Schilham1996 ER - TY - JOUR AU - Masse, J. E. AU - Wong, B. AU - Yen, Y. M. AU - Allain, F. H. AU - Johnson, R. C. AU - Feigon, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - The S. cerevisiae architectural HMGB protein NHP6A complexed with DNA: DNA and protein conformational changes upon binding JO - J Mol Biol VL - 323 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(02)00938-5 DO - 10.1016/S0022-2836(02)00938-5 ID - Masse2002 ER - TY - JOUR AU - Learned, R. M. AU - Learned, T. K. AU - Haltiner, M. M. AU - Tjian, R. T. PY - 1986 DA - 1986// TI - Human rRNA transcription is modulated by the coordinate binding of two factors to an upstream control element JO - Cell VL - 45 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(86)90559-3 DO - 10.1016/0092-8674(86)90559-3 ID - Learned1986 ER - TY - JOUR AU - Read, C. M. AU - Cary, P. D. AU - Preston, N. S. AU - Lnenicek-Allen, M. AU - Crane-Robinson, C. PY - 1994 DA - 1994// TI - The DNA sequence specificity of HMG boxes lies in the minor wing of the structure JO - EMBO J VL - 13 ID - Read1994 ER - TY - JOUR AU - Werner, M. H. AU - Huth, J. R. AU - Gronenborn, A. M. AU - Clore, G. M. PY - 1995 DA - 1995// TI - Molecular basis of human 46X,Y sex reversal revealed from the three-dimensional solution structure of the human SRY-DNA complex JO - Cell VL - 81 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(95)90532-4 DO - 10.1016/0092-8674(95)90532-4 ID - Werner1995 ER - TY - JOUR AU - Murphy, F. V. t. h. AU - Sweet, R. M. AU - Churchill, M. E. PY - 1999 DA - 1999// TI - The structure of a chromosomal high mobility group protein-DNA complex reveals sequence-neutral mechanisms important for non-sequence-specific DNA recognition JO - EMBO J VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/18.23.6610 DO - 10.1093/emboj/18.23.6610 ID - Murphy1999 ER - TY - JOUR AU - Ohndorf, U. M. AU - Rould, M. A. AU - He, Q. AU - Pabo, C. O. AU - Lippard, S. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Basis for recognition of cisplatin-modified DNA by high-mobility-group proteins JO - Nature VL - 399 UR - https://doi.org/10.1038/21460 DO - 10.1038/21460 ID - Ohndorf1999 ER - TY - JOUR AU - Ner, S. S. PY - 1992 DA - 1992// TI - HMGs everywhere JO - Curr. Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/0960-9822(92)90541-H DO - 10.1016/0960-9822(92)90541-H ID - Ner1992 ER - TY - JOUR AU - Love, J. J. AU - Li, X. AU - Case, D. A. AU - Giese, K. AU - Grosschedl, R. AU - Wright, P. E. PY - 1995 DA - 1995// TI - Structural basis for DNA bending by the architectural transcription factor LEF-1 JO - Nature VL - 376 UR - https://doi.org/10.1038/376791a0 DO - 10.1038/376791a0 ID - Love1995 ER - TY - JOUR AU - Nagase, T. AU - Ishikawa, K. AU - Suyama, M. AU - Kikuno, R. AU - Miyajima, N. AU - Tanaka, A. AU - Kotani, H. AU - Nomura, N. AU - Ohara, O. PY - 1998 DA - 1998// TI - Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro JO - DNA Res VL - 5 UR - https://doi.org/10.1093/dnares/5.5.277 DO - 10.1093/dnares/5.5.277 ID - Nagase1998 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Gish, W. AU - Miller, W. AU - Myers, E. W. AU - Lipman, D. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Basic local alignment search tool JO - J Mol Biol VL - 215 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2 DO - 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 ID - Altschul1990 ER - TY - JOUR AU - Madden, T. L. AU - Tatusov, R. L. AU - Zhang, J. PY - 1996 DA - 1996// TI - Applications of network BLAST server JO - Methods Enzymol VL - 266 UR - https://doi.org/10.1016/S0076-6879(96)66011-X DO - 10.1016/S0076-6879(96)66011-X ID - Madden1996 ER - TY - JOUR AU - Margolis, R. L. AU - Abraham, M. R. AU - Gatchell, S. B. AU - Li, S. H. AU - Kidwai, A. S. AU - Breschel, T. S. AU - Stine, O. C. AU - Callahan, C. AU - McInnis, M. G. AU - Ross, C. A. PY - 1997 DA - 1997// TI - cDNAs with long CAG trinucleotide repeats from human brain JO - Hum Genet VL - 100 UR - https://doi.org/10.1007/s004390050476 DO - 10.1007/s004390050476 ID - Margolis1997 ER - TY - JOUR AU - Bowles, J. AU - Schepers, G. AU - Koopman, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Phylogeny of the SOX family of developmental transcription factors based on sequence and structural indicators JO - Dev Biol VL - 227 UR - https://doi.org/10.1006/dbio.2000.9883 DO - 10.1006/dbio.2000.9883 ID - Bowles2000 ER - TY - JOUR AU - Hosking, B. M. AU - Wyeth, J. R. AU - Pennisi, D. J. AU - Wang, S. C. AU - Koopman, P. AU - Muscat, G. E. PY - 2001 DA - 2001// TI - Cloning and functional analysis of the Sry-related HMG box gene, Sox18 JO - Gene VL - 262 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1119(00)00525-4 DO - 10.1016/S0378-1119(00)00525-4 ID - Hosking2001 ER - TY - JOUR AU - Gilbert, W. AU - de Souza, S. J. AU - Long, M. PY - 1997 DA - 1997// TI - Origin of genes JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 94 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.94.15.7698 DO - 10.1073/pnas.94.15.7698 ID - Gilbert1997 ER - TY - JOUR AU - Robbins, J. AU - Dilworth, S. M. AU - Laskey, R. A. AU - Dingwall, C. PY - 1991 DA - 1991// TI - Two interdependent basic domains in nucleoplasmin nuclear targeting sequence: identification of a class of bipartite nuclear targeting sequence JO - Cell VL - 64 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(91)90245-T DO - 10.1016/0092-8674(91)90245-T ID - Robbins1991 ER - TY - JOUR AU - Poulat, F. AU - Girard, F. AU - Chevron, M. P. AU - Goze, C. AU - Rebillard, X. AU - Calas, B. AU - Lamb, N. AU - Berta, P. PY - 1995 DA - 1995// TI - Nuclear localization of the testis determining gene product SRY JO - J Cell Biol VL - 128 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.128.5.737 DO - 10.1083/jcb.128.5.737 ID - Poulat1995 ER - TY - JOUR AU - Yen, Y. M. AU - Wong, B. AU - Johnson, R. C. PY - 1998 DA - 1998// TI - Determinants of DNA binding and bending by the Saccharomyces cerevisiae high mobility group protein NHP6A that are important for its biological activities. Role of the unique N terminus and putative intercalating methionine JO - J Biol Chem VL - 273 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.273.8.4424 DO - 10.1074/jbc.273.8.4424 ID - Yen1998 ER - TY - JOUR AU - Gerber, H. P. AU - Seipel, K. AU - Georgiev, O. AU - Hofferer, M. AU - Hug, M. AU - Rusconi, S. AU - Schaffner, W. PY - 1994 DA - 1994// TI - Transcriptional activation modulated by homopolymeric glutamine and proline stretches JO - Science VL - 263 UR - https://doi.org/10.1126/science.8303297 DO - 10.1126/science.8303297 ID - Gerber1994 ER - TY - JOUR AU - Bowles, J. AU - Cooper, L. AU - Berkman, J. AU - Koopman, P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Sry requires a CAG repeat domain for male sex determination in Mus musculus JO - Nat Genet VL - 22 UR - https://doi.org/10.1038/11981 DO - 10.1038/11981 ID - Bowles1999 ER - TY - JOUR AU - Ross, C. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Polyglutamine pathogenesis: emergence of unifying mechanisms for Huntington's disease and related disorders JO - Neuron VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/S0896-6273(02)00872-3 DO - 10.1016/S0896-6273(02)00872-3 ID - Ross2002 ER - TY - JOUR AU - Masino, L. AU - Pastore, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Glutamine repeats: structural hypotheses and neurodegeneration JO - Biochem Soc Trans VL - 30 UR - https://doi.org/10.1042/bst0300548 DO - 10.1042/bst0300548 ID - Masino2002 ER - TY - JOUR AU - Brenner, S. AU - Elgar, G. AU - Sandford, R. AU - Macrae, A. AU - Venkatesh, B. AU - Aparicio, S. PY - 1993 DA - 1993// TI - Characterization of the pufferfish (Fugu) genome as a compact model vertebrate genome JO - Nature VL - 366 UR - https://doi.org/10.1038/366265a0 DO - 10.1038/366265a0 ID - Brenner1993 ER - TY - JOUR AU - Coutelle, O. AU - Nyakatura, G. AU - Taudien, S. AU - Elgar, G. AU - Brenner, S. AU - Platzer, M. AU - Drescher, B. AU - Jouet, M. AU - Kenwrick, S. AU - Rosenthal, A. PY - 1998 DA - 1998// TI - The neural cell adhesion molecule L1: genomic organisation and differential splicing is conserved between man and the pufferfish Fugu JO - Gene VL - 208 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1119(97)00614-8 DO - 10.1016/S0378-1119(97)00614-8 ID - Coutelle1998 ER - TY - JOUR AU - De Gregorio, E. AU - Lemaitre, B. PY - 2002 DA - 2002// TI - The mosquito genome: the post-genomic era opens JO - Nature VL - 419 UR - https://doi.org/10.1038/419496a DO - 10.1038/419496a ID - De Gregorio2002 ER - TY - JOUR AU - Zdobnov, E. M. AU - von Mering, C. AU - Letunic, I. AU - Torrents, D. AU - Suyama, M. AU - Copley, R. R. AU - Christophides, G. K. AU - Thomasova, D. AU - Holt, R. A. AU - Subramanian, G. M. AU - Mueller, H. M. AU - Dimopoulos, G. AU - Law, J. H. AU - Wells, M. A. AU - Birney, E. AU - Charlab, R. AU - Halpern, A. L. AU - Kokoza, E. AU - Kraft, C. L. AU - Lai, Z. AU - Lewis, S. AU - Louis, C. AU - Barillas-Mury, C. AU - Nusskern, D. AU - Rubin, G. M. AU - Salzberg, S. L. AU - Sutton, G. G. AU - Topalis, P. AU - Wides, R. AU - Wincker, P. AU - Yandell, M. AU - Collins, F. H. AU - Ribeiro, J. AU - Gelbart, W. M. AU - Kafatos, F. C. AU - Bork, P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Comparative genome and proteome analysis of Anopheles gambiae and Drosophila melanogaster JO - Science VL - 298 UR - https://doi.org/10.1126/science.1077061 DO - 10.1126/science.1077061 ID - Zdobnov2002 ER - TY - JOUR AU - Aparicio, S. AU - Chapman, J. AU - Stupka, E. AU - Putnam, N. AU - Chia, J. M. AU - Dehal, P. AU - Christoffels, A. AU - Rash, S. AU - Hoon, S. AU - Smit, A. AU - Gelpke, M. D. AU - Roach, J. AU - Oh, T. AU - Ho, I. Y. AU - Wong, M. AU - Detter, C. AU - Verhoef, F. AU - Predki, P. AU - Tay, A. AU - Lucas, S. AU - Richardson, P. AU - Smith, S. F. AU - Clark, M. S. AU - Edwards, Y. J. AU - Doggett, N. AU - Zharkikh, A. AU - Tavtigian, S. V. AU - Pruss, D. AU - Barnstead, M. AU - Evans, C. AU - Baden, H. AU - Powell, J. AU - Glusman, G. AU - Rowen, L. AU - Hood, L. AU - Tan, Y. H. AU - Elgar, G. AU - Hawkins, T. AU - Venkatesh, B. AU - Rokhsar, D. AU - Brenner, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Whole-genome shotgun assembly and analysis of the genome of Fugu rubripes JO - Science VL - 297 UR - https://doi.org/10.1126/science.1072104 DO - 10.1126/science.1072104 ID - Aparicio2002 ER - TY - JOUR PY - 2002 DA - 2002// TI - The FlyBase database of the Drosophila genome projects and community literature JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.1.106 DO - 10.1093/nar/30.1.106 ID - ref48 ER - TY - JOUR AU - Garcia-Meunier, P. AU - Etienne-Julan, M. AU - Fort, P. AU - Piechaczyk, M. AU - Bonhomme, F. PY - 1993 DA - 1993// TI - Concerted evolution in the GAPDH family of retrotransposed pseudogenes JO - Mamm Genome VL - 4 UR - https://doi.org/10.1007/BF00357792 DO - 10.1007/BF00357792 ID - Garcia-Meunier1993 ER -