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Table 1 Probes and primers used in TaqMan® analysis

From: Comparing gene discovery from Affymetrix GeneChip microarrays and Clontech PCR-select cDNA subtraction: a case study

Accession Number

Gene

1) Probe

  

2) Forward primer

  

3) Reversed primer

AB017568

USF1

1) TCAACAACTGGATCGTGCAGCTCTCC

  

2) TCGCCGCCGAGACAAG

  

3) TCCATAGAGCAGTCTGGGATTATCT

AL050134

CDNA DKFZp586K011

1) ACCTGATTGCCAAAGACCGTTTC

  

2) CATGTGCTTCGGATCCATGTAT

  

3) GGGTCTGACTTGCCCTTCAC

AF177765

Toll-like receptor 4 (TLR4)

1) ATGATGCCTTTGTTATCTACTCAAGC

  

2) GCATAAAGTA TGGTAGAGGTGAAAACAT

  

3) TCATTCCTTACCCAGTCCTCATC

V00572

phosphoglycerate kinase

1) ATCTGCTTAGCCCGAGTGACAGCCTCA

  

2) GTGGTCCTGAAAGCAGCAAGA

  

3) CCCCACAGGACCATTCCA

NM_002046

GAPDH

1) CAAGCTTCCCGTTCTCAGCC

  

2) GAAGGTGAAGGTCGGAGTC

  

3) GAAGATGGTGATGGGATT TC