Disease | Chr. | Flanking DNA marker | Size of locus (Mb) | No. of SGPs (n = 43,109) | No. of retinome transcripts a) (n = 13,307) | No. of "retinome-enriched" transcripts (n = 5,051) | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
AA | 11 | D11S1323 | D11S902 | 11.21 | 213 | 65 | 13 |
AIED | X | DXS7 | DXS72 | 37.33 | 479 | 129 | 49 |
AXPC1 | 1 | D1S2692 | D1S414 | 3.00 | 43 | 7 | 3 |
BBS3 | 3 | D3S1603 | D3S1271 | 2.28 | 28 | 10 | 1 |
BBS5 | 2 | D2S142 | D2S326 | 16.81 | 353 | 50 | 24 |
BCD | 4 | D4S3051 | D4S1652 | 2.06 | 17 | 2 | 1 |
CACD | 17 | D17S1810 | CHLC.GAT7B03 | 3.17 | 118 | 76 | 36 |
COD2 | X | DXS292 | DXS1113 | 6.1 | 37 | 5 | 3 |
COD4 | X | DXS10042 | DXS8060 | 32.44 | 436 | 117 | 45 |
CORD1 | 18 | marker position not available | - | - | - | - | |
CORD4 | 17 | marker position not available | - | - | - | - | |
CORD8 | 1 | D1S442 | D1S2681 | 19.86 | 485 | 222 | 74 |
CORD9 | 8 | D8S1820 | D8S532 | 12.79 | 179 | 43 | 16 |
CRV | 3 | D3S3564 | D3S1578 | 11.2 | 271 | 157 | 72 |
CYMD | 7 | D7S435 | D7S526 | 1.56 | 25 | 13 | 7 |
EVR3 | 11 | GATA34E08 | D11S4102 | 14.00 | 192 | 35 | 13 |
LCA3 | 14 | D14S606 | D14S610 | 5.95 | 178 | 36 | 15 |
LCA5 | 6 | D6S1551 | D6S1694 | 36.08 | 541 | 263 | 93 |
LCA9 | 1 | D1S1612 | D1S228 | 5.52 | 130 | 51 | 22 |
MCDR1 | 6 | D6S249 | D6S1671 | 2.44 | 45 | 2 | 0 |
MCDR2 | 4 | D4S3023 | D4S3022 | 21.00 | 253 | 57 | 20 |
MCDR3 | 5 | D5S1981 | D5S2031 | 19.94 | 184 | 36 | 14 |
MCDR4 | 14 | D14S261 | - | 10.00 b) | 58 | 11 | 4 |
MRST | 15 | D15S211 | D15S152 | 4.70 | 106 | 24 | 11 |
OPA2 | X | DXS993 | DXS991 | 14.31 | 245 | 69 | 24 |
OPA4 | 18 | D18S34 | D18S548 | 2.55 | 23 | 3 | 1 |
PRD | X | MAOB | DXS426 | 3.92 | 67 | 18 | 6 |
RCD1 | 6 | marker position not available | - | - | - | - | |
RNANC | 10 | D10S1225 | D10S1418 | 5.76 | 58 | 9 | 2 |
ROA1 | 8 | D8S1702 | D8S1794 | 11.87 | 150 | 30 | 13 |
RP6 | X | DXS28 | DXS164 | 4.92 | 60 | 4 | 2 |
RP17 | 17 | D17S1607 | D17S948 | 7.18 | 130 | 44 | 17 |
RP22 | 16 | D16S287 | D16S420 | 6.33 | 92 | 40 | 14 |
RP23 | X | DXS1223 | DXS7161 | 10.51 | 140 | 30 | 15 |
RP24 | X | DXS8094 | DXS8043 | 7.75 | 74 | 6 | 3 |
RP28 | 2 | D1S1337 | D2S286 | 45.78 | 674 | 194 | 68 |
RP29 | 4 | D4S3035 | D4S2417 | 3.66 | 28 | 5 | 2 |
STGD4 | 4 | D4S1582 | D4S2397 | 16.56 | 187 | 33 | 10 |
USH1A | 14 | D14S99E | D14S292 | 6.98 | 134 | 44 | 18 |
USH1E | 21 | D21S1905 | D21S1913 | 11.48 | 77 | 19 | 10 |
USH2B | 3 | D3S1578 | D3S3658 | 12.80 | 287 | 161 | 74 |
USH2C | 5 | D5S428 | D5S433 | 18.54 | 269 | 34 | 13 |
VRNI | 11 | INT2 | D11S873 | 22.41 | 311 | 89 | 37 |
WFS2 | 4 | D4S2366 | D4S3023 | 2.18 | 26 | 10 | 5 |
WGN1 | 5 | D5S626 | D5S2103 | 7.11 | 84 | 9 | 4 |