Skip to main content

Table 3 A typical probe-level data generated from GeneChip® gene expression analysis array

From: A class of models for analyzing GeneChip® gene expression analysis array data

Sample ID

Probe

PM (1)

1

2

...

k

...

K

Covariate

ID

MM(0)

x 1

x 2

...

x k

...

x K

ORF1

1

1

y 1111

y 1112

 

y 111k

...

y 111K

 

1

0

y 1101

y 1102

 

y 110k

...

y 110K

 

2

1

y 1211

y 1212

 

y 121k

...

y 121K

 

2

0

y 1201

y 1202

 

y 120k

...

y 120K

 

...

       
 

N

1

y 1N 11

y 1N 12

 

y 1N 1k

...

y 1N 1K

 

N

0

y 1N 01

y 1N 02

 

y 1N 0k

...

y 1N 0K

...

        

ORF j

1

1

y j 111

y j 112

 

y j 11k

...

y j 11K

 

1

0

y j 101

y j 102

 

y j 10k

...

y j 10K

 

2

1

y j 211

y j 212

 

y j 21k

...

y j 21K

 

2

0

y j 201

y j 202

 

y j 20k

...

y j 20K

 

...

       
 

i

1

y ji 11

y ji 12

 

y ji 1k

...

y ji 1K

 

i

0

y ji 01

y ji 02

 

y ji 0k

...

y ji 0K

 

...

       
 

N

1

y jN 11

y jN 12

 

y jN 1k

...

y jN 1K

 

N

0

y jN 01

y jN 02

 

y jN 0k

...

y jN 0K

...

        

ORF J

1

1

y J 111

y J 112

 

y J 11k

...

y J 11K

 

1

0

y J 101

y J 102

 

y J 10k

...

y J 10K

 

2

1

y J 211

y J 212

 

y J 21k

...

y J 21K

 

2

0

y J 201

y J 202

 

y J 20k

...

y J 20K

 

...

       
 

N

1

y JN 11

y JN 12

 

y JN 1k

...

y JN 1K

 

N

0

y JN 01

y JN 02

 

y JN 0k

...

y JN 0K