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Table 1 Cross-species amplification. Cross-species amplification allele size range information (bp) for microsatellite markers generated from rainbow trout ESTs

From: Comparative mapping of expressed sequence tags containing microsatellites in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Locus Artic Char Brook Trout Atlantic Salmon Brown Trout Chinook Salmon Coho Salmon Sockeye Salmon Cutthroat Trout
OMM5000 253–255 260–294 256 239–254 250–260 256 251–263 240–252
OMM5001 87 89 87 85 97 89 97–109 123–151
OMM5002 142–155 - 165–265 336–346 274–282 139–151 139–151 277
OMM5003 177 176–179 173 179–183 179 168–184 173–186 176–181
OMM5004 187 189 185–187 187 187 150–164 193 189–193
OMM5005 201–203 195–202 219 196–207 186–187 189 191 200–204
OMM5006 - 225–231 - 205–245 203 207–209 201 211–236
OMM5007 162–167 182–187 181–192 166 170–176 180–199 156–170 147–163
OMM5008 259 247 223–255 253–261 246–95 227–252 232 236–254
OMM5009 247 335–363 - 266 279–283 410 - 303–331
OMM5010 288–334 - 346–370 350–358 305–332 341–346 294–297 362
OMM5011 214–248 217–248 213–248 214–233 224–244 227–247 228–249 224–246
OMM5012 170–188 202–208 186 199–201 174–184 175–190 196–223 169–187
OMM5013 - 107 98 98–111 111–135 96–220 126 102–187
OMM5014 - - - 201–208 185–202 181–198 - 230–262
OMM5015 228 228 228 228 228 228 228 228
OMM5016 239 - 239 239 198 249–311 189 231–236
OMM5017 203–234 195–200 188–200 208–256 217–237 190–201 193 184–209
OMM5018 192 215–231 182–199 198 184–192 - - 186–215
OMM5019 298 256–268 269–335 298–321 269–279 272–275 - 272–282
OMM5020 262 262 262–275 262 256–259 255–258 256–261 261–263
OMM5023 131 131 122 122 130–136 122 122 126–142
OMM5024 198 202 170 194–195 209–230 - - 212–214
OMM5025 154 152 160 160 186–188 158 164 160
OMM5029 210–214 209–227 192–211 193–215 208 207–213 210 203–228
OMM5030 135–187 135–137 140–187 137–139 129–141 150–164 129–141 141–155
OMM5031 145 143 102–144 129–144 142–155 136 142–144 140
OMM5032 198 - 178 216–218 191–201 159 175–179 179–187
OMM5033 284 - 274–280 225 - 243 254–279 260–295
OMM5034 239–287 264 238–240 238–263 239–275 236–269 236–267 246–269
OMM5037 - 266 262–268 260–293 251 254–281 264–272 260–285
OMM5039 284 280 274–280 268 248–286 243–308 282–286 260
OMM5041 168 185–187 172 170 170–173 183–187 132 132–189
OMM5042 133 140 - 127–137 122 - - -
OMM5043 122 122 126 114–128 112–114 112–122 112–131
OMM5044 206 199 - 230 242 - - 199–217
OMM5047 - - 317–328 245–251 257–258 261 190 257–263
OMM5050 242 247–249 251 240 243 245–247 246–248 251–261
OMM5051 174–192 190 179 201–218 212–214 190–191 - 195–206
OMM5053 134–198 - - - 122 248 202 228–237
OMM5054 172–240 171–265 161–240 172–241 171–240 171–265 172–241 162–278
OMM5055 217–219 190–220 190–212 190–212 221 225–243 221 219
OMM5056 254–280 268–299 - 196 186 282–319 - 218–253
OMM5058 - - 216–219 239–244 198–204 192 231–235 194–209
OMM5059 151 - 157 145–172 134 124–135 121–127 126–136
OMM5060 105–164 165 - 160 164 164 164 105–164
OMM5061 400 354–358 291–293 274–282 275 274 262 274–278
OMM5062 229 225 200 192–212 223–233 212–231 221–241 222–240
OMM5063 - 148–195 207–243 203–237 150–154 237–282 154–182 178–220
OMM5064 272–274 92–110 276–283 274 290–319 283–285 279 95–286
OMM5067 153–186 153–164 185–187 171–185 153–186 153–164 171–192 153–187
OMM5072 160–164 161–167 171 170–187 146–158 158–164 158–167 164–170
OMM5074 306–344 247–260 242 238–244 245–253 232 228–233 241–244
OMM5075 214 206–208 - 189–191 186 192–198 194 208–229
OMM5077 368 372 377 383 373 377–380 365 334–354
OMM5088 174 168 - 153 159–161 153 168 159–174
OMM5089 - - 134–167 - 154–161 132–140 134–146 -
OMM5090 153 152–255 153 249–255 153–269 249–255 153–255 239–248
OMM5091 276 201–210 178 201–205 221–262 368 223–244 265–283
OMM5092 161 161 186 186 202–208 192–217 - -
OMM5093 285 285 285 285 285 285 285 285
OMM5099 244 243 228 219–234 278–296 260–268 214–254 213–260
OMM5100 137–185 - 182 138–143 173 - 160–173 167–201
OMM5106 358–388 328–353 260–271 261 306–322 361–395 257–274 273–318
OMM5107 258–264 255 250–254 264 - 254 255 -
OMM5108 265 251 265–271 256 263–292 260–262 251–271 256–267
OMM5109 256 254–256 256–271 260–263 256 254–256 260–262 262–271
OMM5112 194 198 194–218 196 193–202 189–196 189 193–206
OMM5113 - 320–368 - 274–320 - 286–304 - 243–288
OMM5117 135–142 138 142 125–140 138 125–140 138 137–154
OMM5121 230 228–230 156–173 166–176 166–267 178–230 173–175 197–222
OMM5124 271–281 271–277 - 272–273 258 266 269 280
OMM5125 256 262–264 254 250–252 256–277 250–260 256–260 256–260
OMM5126 295–299 286 295–299 286–290 286 286–291 286 286–307
% Amp. 87 83 83 97 94 93 85 94