TY - JOUR AU - Casas, E. AU - Shackelford, S. D. AU - Keele, J. W. AU - Koohmaraie, M. AU - Smith, T. P. AU - Stone, R. T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Detection of quantitative trait loci for growth and carcass composition in cattle JO - J Anim Sci VL - 81 ID - Casas2003 ER - TY - JOUR AU - Ashwell, M. S. AU - Heyen, D. W. AU - Sonstegard, T. S. AU - Van Tassell, C. P. AU - Da, Y. AU - VanRaden, P. M. AU - Ron, M. AU - Weller, J. I. AU - Lewin, H. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Detection of quantitative trait loci affecting milk production, health, and reproductive traits in Holstein cattle JO - J Dairy Sci VL - 87 UR - https://doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(04)73186-0 DO - 10.3168/jds.S0022-0302(04)73186-0 ID - Ashwell2004 ER - TY - JOUR AU - Barendse, W. AU - Vaiman, D. AU - Kemp, S. J. AU - Sugimoto, Y. AU - Armitage, S. M. AU - Williams, J. L. AU - Sun, H. S. AU - Eggen, A. AU - Agaba, M. AU - Aleyasin, S. A. AU - Band, M. AU - Bishop, M. D. AU - Buitkamp, J. AU - Byrne, K. AU - Collins, F. AU - Cooper, L. AU - Coppettiers, W. AU - Denys, B. AU - Drinkwater, R. D. AU - Easterday, K. AU - Elduque, C. AU - Ennis, S. AU - Erhardt, G. AU - Ferretti, L. AU - Flavin, N. AU - Gao, Q. AU - Georges, M. AU - Gurung, R. AU - Harlizius, B. AU - Hawkins, G. AU - Hetzel, J. AU - Hirano, T. AU - Hulme, D. AU - Jorgensen, C. AU - Kessler, M. AU - Kirkpatrick, B. W. AU - Konfortov, B. AU - Kostia, S. AU - Kuhn, C. AU - Lenstra, J. A. AU - Leveziel, H. AU - Lewin, H. A. AU - Leyhe, B. AU - Li, L. AU - Martin Burriel, I. AU - McGraw, R. A. AU - Miller, J. R. AU - Moody, D. E. AU - Moore, S. S. AU - Nakane, S. AU - Nijman, I. J. AU - Olsaker, I. AU - Pomp, D. AU - Rando, A. AU - Ron, M. AU - Shalom, A. AU - Teale, A. J. AU - Thieven, U. AU - Urquhart, B. G. D. AU - Vage, D. I. AU - Van de Weghe, A. AU - Varvio, S. AU - Velmala, R. AU - Vilkki, J. AU - Weikard, R. AU - Woodside, C. AU - Womack, J. E. PY - 1997 DA - 1997// TI - A medium-density genetic linkage map of the bovine genome JO - Mamm Genome VL - 8 UR - https://doi.org/10.1007/s003359900340 DO - 10.1007/s003359900340 ID - Barendse1997 ER - TY - JOUR AU - Kappes, S. M. AU - Keele, J. W. AU - Stone, R. T. AU - McGraw, R. A. AU - Sonstegard, T. S. AU - Smith, T. P. AU - Lopez-Corrales, N. L. AU - Beattie, C. W. PY - 1997 DA - 1997// TI - A second-generation linkage map of the bovine genome JO - Genome Res VL - 7 UR - https://doi.org/10.1101/gr.7.3.235 DO - 10.1101/gr.7.3.235 ID - Kappes1997 ER - TY - JOUR AU - Ihara, N. AU - Takasuga, A. AU - Mizoshita, K. AU - Takeda, H. AU - Sugimoto, M. AU - Mizoguchi, Y. AU - Hirano, T. AU - Itoh, T. AU - Watanabe, T. AU - Reed, K. M. AU - Snelling, W. M. AU - Kappes, S. M. AU - Beattie, C. W. AU - Bennett, G. L. AU - Sugimoto, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - A comprehensive genetic map of the cattle genome based on 3802 microsatellites JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2741704 DO - 10.1101/gr.2741704 ID - Ihara2004 ER - TY - JOUR AU - Everts-van der Wind, A. AU - Kata, S. R. AU - Band, M. R. AU - Rebeiz, M. AU - Larkin, D. M. AU - Everts, R. E. AU - Green, C. A. AU - Liu, L. AU - Natarajan, S. AU - Goldammer, T. AU - Lee, J. H. AU - McKay, S. AU - Womack, J. E. AU - Lewin, H. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - A 1463 gene cattle-human comparative map with anchor points defined by human genome sequence coordinates JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2554404 DO - 10.1101/gr.2554404 ID - Everts-van der Wind2004 ER - TY - JOUR AU - Clawson, M. L. AU - Heaton, M. P. AU - Chitko-McKown, C. G. AU - Fox, J. M. AU - Smith, T. P. AU - Snelling, W. M. AU - Keele, J. W. AU - Laegreid, W. W. PY - 2004 DA - 2004// TI - Beta-2-microglobulin haplotypes in U.S. beef cattle and association with failure of passive transfer in newborn calves JO - Mamm Genome VL - 15 UR - https://doi.org/10.1007/s00335-003-2320-x DO - 10.1007/s00335-003-2320-x ID - Clawson2004 ER - TY - JOUR AU - Thue, T. D. AU - Buchanan, F. C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Linkage mapping of NPY to bovine chromosome 4 JO - Anim Genet VL - 35 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2004.01116.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2004.01116.x ID - Thue2004 ER - TY - JOUR AU - Connor, E. E. AU - Sonstegard, T. S. AU - Ashwell, M. S. AU - Bennett, G. L. AU - Williams, J. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - An expanded comparative map of bovine chromosome 27 targeting dairy form QTL regions JO - Anim Genet VL - 35 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2004.01151.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2004.01151.x ID - Connor2004 ER - TY - JOUR AU - Smith, T. P. AU - Casas, E. AU - Rexroad, C. E. AU - Kappes, S. M. AU - Keele, J. W. PY - 2000 DA - 2000// TI - Bovine CAPN1 maps to a region of BTA29 containing a quantitative trait locus for meat tenderness JO - J Anim Sci VL - 78 ID - Smith2000 ER - TY - JOUR AU - Stone, R. T. AU - Grosse, W. M. AU - Casas, E. AU - Smith, T. P. AU - Keele, J. W. AU - Bennett, G. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Use of bovine EST data and human genomic sequences to map 100 gene-specific bovine markers JO - Mamm Genome VL - 13 UR - https://doi.org/10.1007/s00335-001-2124-9 DO - 10.1007/s00335-001-2124-9 ID - Stone2002 ER - TY - JOUR AU - Bishop, M. D. AU - Kappes, S. M. AU - Keele, J. W. AU - Stone, R. T. AU - Sunden, S. L. AU - Hawkins, G. A. AU - Toldo, S. S. AU - Fries, R. AU - Grosz, M. D. AU - Yoo, J. AU - Beattie, C. W. PY - 1994 DA - 1994// TI - A genetic linkage map for cattle JO - Genetics VL - 136 ID - Bishop1994 ER - TY - CHAP AU - Stone, R. T. AU - Casas, E. AU - Smith, T. P. AU - Keele, J. W. AU - Harhay, G. AU - Bennett, G. L. AU - Koohmaraie, M. AU - Wheeler, T. L. AU - Shackelford, S. D. AU - Snelling, W. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Identification of genetic markers for fat deposition and meat tenderness on bovine chromosome 5: Development of a low density SNP map BT - J Anim Sci ID - Stone2005 ER - TY - CHAP AU - Green, P. AU - Falls, K. AU - Crooks, S. PY - 1990 DA - 1990// TI - Documentation for CRIMAP, version 2.4 BT - Washington University School of Medicine, St. Louis, Missouri ID - Green1990 ER - TY - JOUR AU - Li, C. AU - Basarab, J. AU - Snelling, W. M. AU - Benkel, B. AU - Murdoch, B. AU - Moore, S. S. PY - 2002 DA - 2002// TI - The identification of common haplotypes on bovine chromosome 5 within commercial lines of Bos taurus and their association with growth traits JO - J Anim Sci VL - 80 ID - Li2002 ER - TY - STD TI - Human Genome Sequencing Center at Baylor College of Medicine Bovine Genome Project. [http://www.hgsc.bcm.tmc.edu/projects/bovine/] UR - http://www.hgsc.bcm.tmc.edu/projects/bovine/ ID - ref16 ER - TY - JOUR AU - Rowe, L. B. AU - Barter, M. E. AU - Kelmenson, J. A. AU - Eppig, J. T. PY - 2003 DA - 2003// TI - The comprehensive mouse radiation hybrid map densely cross-referenced to the recombination map: a tool to support the sequence assemblies JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.858103 DO - 10.1101/gr.858103 ID - Rowe2003 ER - TY - JOUR AU - Williams, J. L. AU - Eggen, A. AU - Ferretti, L. AU - Farr, C. J. AU - Gautier, M. AU - Amati, G. AU - Ball, G. AU - Caramorr, T. AU - Critcher, R. AU - Costa, S. AU - Hextall, P. AU - Hills, D. AU - Jeulin, A. AU - Kiguwa, S. L. AU - Ross, O. AU - Smith, A. L. AU - Saunier, K. AU - Urquhart, B. AU - Waddington, D. PY - 2002 DA - 2002// TI - A bovine whole-genome radiation hybrid panel and outline map JO - Mamm Genome VL - 13 UR - https://doi.org/10.1007/s00335-002-3001-x DO - 10.1007/s00335-002-3001-x ID - Williams2002 ER - TY - STD TI - Genome Sciences Centre Bovine BAC Fingerprint Map. [http://www.bcgsc.ca/lab/mapping/bovine/] UR - http://www.bcgsc.ca/lab/mapping/bovine/ ID - ref19 ER - TY - CHAP AU - Schiex, T. AU - Chabrier, P. AU - Bouchez, M. AU - Milan, D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Boosting EM for Radiation Hybrid and Genetic Mapping BT - WABI'2001 (Workshop on Algorithms in Bioinformatics) LNCS ID - Schiex2001 ER - TY - JOUR AU - Snelling, W. M. AU - Gautier, M. AU - Keele, J. W. AU - Smith, T. P. AU - Stone, R. T. AU - Harhay, G. P. AU - Bennett, G. L. AU - Ihara, N. AU - Takasuga, A. AU - Takeda, H. AU - Sugimoto, Y. AU - Eggen, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Integrating linkage and radiation hybrid mapping data for bovine chromosome 15 JO - BMC Genomics VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-5-77 DO - 10.1186/1471-2164-5-77 ID - Snelling2004 ER - TY - JOUR AU - Havlak, P. AU - Chen, R. AU - Durbin, K. J. AU - Egan, A. AU - Ren, Y. AU - Song, X. Z. AU - Weinstock, G. M. AU - Gibbs, R. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - The Atlas genome assembly system JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2264004 DO - 10.1101/gr.2264004 ID - Havlak2004 ER - TY - JOUR AU - Wilder, S. P. AU - Bihoreau, M. T. AU - Argoud, K. AU - Watanabe, T. K. AU - Lathrop, M. AU - Gauguier, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Integration of the rat recombination and EST maps in the rat genomic sequence and comparative mapping analysis with the mouse genome JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2001604 DO - 10.1101/gr.2001604 ID - Wilder2004 ER - TY - STD TI - TIGR Cattle Gene Index. [http://www.tigr.org/tigr-scripts/tgi/T_index.cgi?species=cattle] UR - http://www.tigr.org/tigr-scripts/tgi/T_index.cgi?species=cattle ID - ref24 ER - TY - STD TI - RepeatMasker Home Page. [http://www.repeatmasker.org] UR - http://www.repeatmasker.org ID - ref25 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schaffer, A. A. AU - Zhang, J. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - JOUR AU - Page, B. T. AU - Casas, E. AU - Heaton, M. P. AU - Cullen, N. G. AU - Hyndman, D. L. AU - Morris, C. A. AU - Crawford, A. M. AU - Wheeler, T. L. AU - Koohmaraie, M. AU - Keele, J. W. AU - Smith, T. P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Evaluation of single-nucleotide polymorphisms in CAPN1 for association with meat tenderness in cattle JO - J Anim Sci VL - 80 ID - Page2002 ER - TY - STD TI - Genome Sciences Department, University of Washington, Laboratory of Phil Green. [http://www.phrap.org/] UR - http://www.phrap.org/ ID - ref28 ER - TY - JOUR AU - Braun, A. AU - Little, D. P. AU - Reuter, D. AU - Muller-Mysok, B. AU - Koster, H. PY - 1997 DA - 1997// TI - Improved analysis of microsatellites using mass spectrometry JO - Genomics VL - 46 UR - https://doi.org/10.1006/geno.1997.5011 DO - 10.1006/geno.1997.5011 ID - Braun1997 ER - TY - JOUR AU - Schuler, G. D. PY - 1997 DA - 1997// TI - Sequence mapping by electronic PCR JO - Genome Res VL - 7 ID - Schuler1997 ER - TY - JOUR AU - Kent, W. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - BLAT – the BLAST-like alignment tool JO - Genome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1101/gr.229202. Article published online before March 2002 DO - 10.1101/gr.229202. Article published online before March 2002 ID - Kent2002 ER - TY - STD TI - UCSC Genome Browser: Downloads. [http://hgdownload.cse.ucsc.edu/downloads.html#human] UR - http://hgdownload.cse.ucsc.edu/downloads.html#human ID - ref32 ER -