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Table 2 Chromosomal changes in microdissected HPIN and CaP DNA samples.

From: The use of whole genome amplification to study chromosomal changes in prostate cancer: insights into genome-wide signature of preneoplasia associated with cancer progression

Tumour

Type

Loss

Gain

CaP 2-02

HPIN

3q13.33-q21.1; 6p24.1-pter; 8p11.1-p23.2; 13q14.3-q31.2

1p21.3-p31.1; 2q24.3-q31.1; 8q23.3-qter; 11p14.3-p15.1

CaP 5-02

HPIN

6q14.1-q16.3; 8p23.1-pter; 16q21-qter

1p22.3-p31.1; 7p15.1-p15.3; 8q13.3-qter

CaP 24-01

HPIN

2p23.1-p25.2; 4q22.1-q34.1; 8p11.23-pter

3q21.2-q24; 12q14.3-q21.33

CaP 37-02

HPIN

8p23.1-pter;

7p22.1-pter; 20q11.22-q13.11

CaP 70-01

HPIN

6q16.3-q22.1; 8p11.21-pter; 13q13.1-q14.3

7p21.3-p22.1; 8q21.11-qter; 16p12.3-pter; 20q11.23-q13.2

CaP 74-01

HPIN

8p21.1-pter; 10q21.3-q23.1; 18q21.32-q22.2; 21q21.3-qter

7q32.3-q36.1; 16p12.3-p13.13; 20p11.23-p12.1

CaP 36-02

HPIN

8p11.23-pter; 10q23.31-q25.1; 16q22.1-qter

16p12.2-pter; 17q24.2-qter

CaP 7-99

Cancer

2q14.2-q21.2; 5q14.1-q22.1; 6q16.1-q21; 8p21.3-p23.1; 10q22.1-q23.33; 13q14.11-q22.2

4q21.21-q21.23; 7p15.3-p21.3; 7q11.23

CaP 7-01

Cancer

1p21.1-p32.3; 2q33.1-q33.3; 5q14.1-q21.3; 6q16.1-q22.1; 8p11.23-pter; 10q23.31-qter; 13q12.13-q14.11

4p13-p15.1; 4q22.2-q24; 7q31.1-qter; 8q21.11-qter; 9p22.3-p24.1; 14q13.1-q21.3

CaP 7-02

Cancer

2q24.2-q31.1; 7q22.3-qter; 8p11.22-pter; 10q22.2-q23.33; 18q11.1-q22.3

 

CaP 11-01

Cancer

8p11.21-pter; 10q22.2-q23.33; 12p13.2; 13q13.3-q32.2; 16q24.1-qter; 22q11.21-qter

1q32.1; 5q14.2-q14.3; 8q13.3-q21.2

CaP 11-02

Cancer

1p13.1-p13.2; 1p22.3; 2p16.3; 6q12-q16.1; 8p21.1-pter; 10q25.3-q26.11

7p22.1-pter; 7q11.23; 8q22.3-qter; 16p12.2-pter; 19p; 19q13.33-qter

CaP 14-00

Cancer

6p24.1-pter; 8p11.21-pter; 10q23.31-q23.32; 15q22.33-q24.1

1p21.3-p32.1; 3q25.33-q27.3; 4p13-p15.1; 4q13.1-q13.3; 7p15.3-p22.1; 7q21.11-q21.3; 7q31.1-q31.33; 8q11.22-qter; 11q14.1-14.3

CaP 14-02

Cancer

1p13.1-p13.2; 1p22.3; 6q16.1-q16.3; 8p21.2-p23.1; 8q12-qter; 10q21.1-q21.2; 10q23.1-q23.32; 10q25.2-q26.11; 11q22.3-qter; 12p13.2; 13q12.3-q21.33; 15q13.1-q21.3; 16q12.2-qter

7p22.1-pter; 7q11.23; 8p23.2-pter; 18q21.1; 20q11.21-q13.12

CaP 32-02

Cancer

3q26.33-q27.3; 8p11.22-p23.2; 13q13.3-qter; 16q23.1-qter; 18q21.33-q22.1

1p35.2-p36.11; 7p22.1-p22.2; 7q11.23; 15q11.2-q22.32; 16p12.2-13.11; 19p13.11-pter