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Table 1 Sets of microsatellite markers used for scanning the zebrafish genome

From: Large-scale mapping of mutations affecting zebrafish development

LG

Marker set G4

Marker set H2

1

Z4593, Z9394, Z5508, Z1705, Z1351, Z9704, Z11464, Z6802, Z1781

Z11913, Z6384, Z9977, Z6415, Z7287, Z9395, Z22319, Z10978, Z11618

2

Z7634, Z4662, Z3430, Z1406, Z6617, Z1703, Z20550

Z13620, Z7361, Z9361, Z13281, Z21490, Z7678, Z10302, Z22544

3

Z872, Z8208, Z15457, Z9964, Z11227, Z3725, Z20058, Z6019

Z8364, Z9843, Z7419, Z8681, Z9662

4

Z1525, Z9920, Z21636, Z7490, Z984

Z7629, Z10983, Z23058, Z9319, Z17278, Z6503, Z11566

5

Z15414, Z11496, Z6727, Z10456, Z1390, Z3804, Z14143, Z4299, Z1202

Z6916, Z9106, Z9109, Z9969, Z7313, Z7291, Z22523, Z21290, Z10484, Z7318, Z13304

6

Z740, Z13275, Z880, Z6624, Z10183, Z5294, Z13614, Z7666, Z4297, Z1680

Z15448, Z8447, Z22253, Z13328, Z8245, Z9254, Z6330, Z9652, Z17248, Z9230, Z21901

7

Z3273, Z10785, Z1206, Z4706, Z1182, Z1059, Z8156, Z1239, Z13880, Z13936, Z5563

Z7479, Z7555, Z7069, Z8975, Z8540, Z6273, Z10451, Z22628

8

Z1634, Z1068, Z4323, Z13412, Z21115, Z789, Z10929, Z3526

Z7962, Z11492, Z21483, Z10121, Z11946, Z23039, Z23009

9

Z1777, Z6268, Z4673, Z5080, Z1805, Z20031, Z10789, Z4577

Z22173, Z9923, Z6845, Z9439, Z6574, Z6336, Z9975

10

Z9199, Z6410, Z8146, Z13632, Z1145, Z9701, Z3260

Z6648, Z22661, Z8318, Z9574, Z8705, Z7558, Z15444

11

Z10919, Z3362, Z13411, Z1393, Z3527, Z1590

Z11865, Z7657, Z11067

12

Z1778, Z21911, Z1473, Z4188, Z1358

Z7409, Z8755, Z8460, Z10225, Z22666, Z6442, Z7834, Z20142, Z11903

13

Z1531, Z5643, Z6104, Z13611, Z5395, Z1627, Z7102, Z6657, Z1826, Z6007

Z10513, Z9049, Z11695, Z22022, Z20208, Z20379, Z9357, Z8617, Z11459

14

Z1523, Z5436, Z1536, Z5435, Z4203, Z22107, Z1226, Z3984, Z1801

Z6545, Z8471, Z11694, Z9720, Z4592, Z20663, Z20214, Z9789, Z11837

15

Z6312, Z6712, Z21982, Z4396, Z11320, Z13230, Z13822, Z7381, Z5223

Z20627, Z21452, Z22027, Z11323, Z7070, Z6024, Z13927

16

Z3741, Z21155, Z6365, Z10036, Z1215, Z4670

Z10217, Z10671, Z11452, Z20177, Z6329, Z6240, Z6293, Z7956, Z20704

17

Z4268, Z1490, Z22083, Z22674, Z9847, Z1408, Z4053

Z7625, Z9179, Z8862, Z9633, Z9830, Z13631, Z13643

18

Z1136, Z1144, Z13329, Z8488, Z10008, Z3558, Z9154, Z5321

Z14136, Z9484, Z8525, Z7142, Z13260, Z14011

19

Z4009, Z160, Z3782, Z3816, Z11403, Z6661, Z7926, Z1803

Z1544, Z22649, Z22818, Z13773, Z6079, Z13727, Z9050, Z7265, Z10273

20

Z9334, Z10056, Z11841, Z3964, Z7158, Z3954, Z22041, Z8554, Z4329

Z10177, Z17204, Z10901, Z10756, Z7568, Z6973

21

Z3476, Z1274, Z4492, Z10960, Z4425, Z1497, Z4074

Z6174, Z6243, Z8230, Z9728, Z9236, Z20446, Z6087

22

Z1148, Z10673, Z9402, Z230, Z10321, Z21243

Z6613, Z10028, Z10324, Z11262, Z20168, Z21507, Z21252, Z11679

23

Z8945, Z4003, Z15422, Z4421, Z3157, Z176, Z1773

Z8362, Z11495, Z20643, Z7550, Z11391, Z14008

24

Z5075, Z1584, Z5413, Z23011, Z3399, Z22375, Z5657, Z3901

Z7349, Z10961, Z10458, Z13695, Z10529, Z6438, Z21908, Z6296, Z7132, Z9673

25

GOF15, Z1378, Z3490, Z5669, Z1462

Z21929, Z21722, Z13232, Z15480, Z10010, Z10578, Z21181

  1. The G4 marker set [9] and the newly developed H2 marker set each consist of 192 microsatellite markers from the MGH map [5][6] which we selected for genome scanning in Tü × WIK crosses and electrophoresis on agarose gels. Up to two genome scans per mutation were performed with the G4 set (or its earlier versions). If no linkage could be confirmed and sufficient material was available, another two scans were subsequently performed with the H2 set. Additional markers from the MGH map were occasionally employed for scoring of mutant individuals. LG: linkage group.