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Table 1 Sets of microsatellite markers used for scanning the zebrafish genome

From: Large-scale mapping of mutations affecting zebrafish development

LG Marker set G4 Marker set H2
1 Z4593, Z9394, Z5508, Z1705, Z1351, Z9704, Z11464, Z6802, Z1781 Z11913, Z6384, Z9977, Z6415, Z7287, Z9395, Z22319, Z10978, Z11618
2 Z7634, Z4662, Z3430, Z1406, Z6617, Z1703, Z20550 Z13620, Z7361, Z9361, Z13281, Z21490, Z7678, Z10302, Z22544
3 Z872, Z8208, Z15457, Z9964, Z11227, Z3725, Z20058, Z6019 Z8364, Z9843, Z7419, Z8681, Z9662
4 Z1525, Z9920, Z21636, Z7490, Z984 Z7629, Z10983, Z23058, Z9319, Z17278, Z6503, Z11566
5 Z15414, Z11496, Z6727, Z10456, Z1390, Z3804, Z14143, Z4299, Z1202 Z6916, Z9106, Z9109, Z9969, Z7313, Z7291, Z22523, Z21290, Z10484, Z7318, Z13304
6 Z740, Z13275, Z880, Z6624, Z10183, Z5294, Z13614, Z7666, Z4297, Z1680 Z15448, Z8447, Z22253, Z13328, Z8245, Z9254, Z6330, Z9652, Z17248, Z9230, Z21901
7 Z3273, Z10785, Z1206, Z4706, Z1182, Z1059, Z8156, Z1239, Z13880, Z13936, Z5563 Z7479, Z7555, Z7069, Z8975, Z8540, Z6273, Z10451, Z22628
8 Z1634, Z1068, Z4323, Z13412, Z21115, Z789, Z10929, Z3526 Z7962, Z11492, Z21483, Z10121, Z11946, Z23039, Z23009
9 Z1777, Z6268, Z4673, Z5080, Z1805, Z20031, Z10789, Z4577 Z22173, Z9923, Z6845, Z9439, Z6574, Z6336, Z9975
10 Z9199, Z6410, Z8146, Z13632, Z1145, Z9701, Z3260 Z6648, Z22661, Z8318, Z9574, Z8705, Z7558, Z15444
11 Z10919, Z3362, Z13411, Z1393, Z3527, Z1590 Z11865, Z7657, Z11067
12 Z1778, Z21911, Z1473, Z4188, Z1358 Z7409, Z8755, Z8460, Z10225, Z22666, Z6442, Z7834, Z20142, Z11903
13 Z1531, Z5643, Z6104, Z13611, Z5395, Z1627, Z7102, Z6657, Z1826, Z6007 Z10513, Z9049, Z11695, Z22022, Z20208, Z20379, Z9357, Z8617, Z11459
14 Z1523, Z5436, Z1536, Z5435, Z4203, Z22107, Z1226, Z3984, Z1801 Z6545, Z8471, Z11694, Z9720, Z4592, Z20663, Z20214, Z9789, Z11837
15 Z6312, Z6712, Z21982, Z4396, Z11320, Z13230, Z13822, Z7381, Z5223 Z20627, Z21452, Z22027, Z11323, Z7070, Z6024, Z13927
16 Z3741, Z21155, Z6365, Z10036, Z1215, Z4670 Z10217, Z10671, Z11452, Z20177, Z6329, Z6240, Z6293, Z7956, Z20704
17 Z4268, Z1490, Z22083, Z22674, Z9847, Z1408, Z4053 Z7625, Z9179, Z8862, Z9633, Z9830, Z13631, Z13643
18 Z1136, Z1144, Z13329, Z8488, Z10008, Z3558, Z9154, Z5321 Z14136, Z9484, Z8525, Z7142, Z13260, Z14011
19 Z4009, Z160, Z3782, Z3816, Z11403, Z6661, Z7926, Z1803 Z1544, Z22649, Z22818, Z13773, Z6079, Z13727, Z9050, Z7265, Z10273
20 Z9334, Z10056, Z11841, Z3964, Z7158, Z3954, Z22041, Z8554, Z4329 Z10177, Z17204, Z10901, Z10756, Z7568, Z6973
21 Z3476, Z1274, Z4492, Z10960, Z4425, Z1497, Z4074 Z6174, Z6243, Z8230, Z9728, Z9236, Z20446, Z6087
22 Z1148, Z10673, Z9402, Z230, Z10321, Z21243 Z6613, Z10028, Z10324, Z11262, Z20168, Z21507, Z21252, Z11679
23 Z8945, Z4003, Z15422, Z4421, Z3157, Z176, Z1773 Z8362, Z11495, Z20643, Z7550, Z11391, Z14008
24 Z5075, Z1584, Z5413, Z23011, Z3399, Z22375, Z5657, Z3901 Z7349, Z10961, Z10458, Z13695, Z10529, Z6438, Z21908, Z6296, Z7132, Z9673
25 GOF15, Z1378, Z3490, Z5669, Z1462 Z21929, Z21722, Z13232, Z15480, Z10010, Z10578, Z21181
  1. The G4 marker set [9] and the newly developed H2 marker set each consist of 192 microsatellite markers from the MGH map [5][6] which we selected for genome scanning in Tü × WIK crosses and electrophoresis on agarose gels. Up to two genome scans per mutation were performed with the G4 set (or its earlier versions). If no linkage could be confirmed and sufficient material was available, another two scans were subsequently performed with the H2 set. Additional markers from the MGH map were occasionally employed for scoring of mutant individuals. LG: linkage group.
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