Skip to main content

Table 5 Specific genes expressed in the brain

From: Housekeeping and tissue-specific genes in mouse tissues

                 Tissues from GEO and accession number    
Tag Testis Prostate Ovary Mammary gland Uterus Vagina Skin Liver Adipose tissue Lung Bone Skeletal muscle Cerebral cortex Hypothalamus Pituitary gland Mouse embryonic fibroblasts GSM7759 Heart normal GSM106587 Thymus normal GSM106596 Bladder normal GSM106599 Kidney normal GSM56242 Spleen normal GSM106591 Pancreas Normal GSM106592 Intestine UniGene and EST expression (%) Description [UniGene cluster, GenBank Accession No] General function
   Cerebral cortex                          
GTCGTCCTCTA 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 47 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0 solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7 [Mm.255631, NM_182993] Transport
TGACCTTGGCC 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 41 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 gene model 748, (NCBI) [Mm.102203, AK122363] Protein binding and heme Binding
GTACTTGGCTG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 24 1a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 synaptic vesicle glycoprotein 2 b [Mm.273082, NM_153579] Transporter activity
   Hypothalamus                          
TTGGCAAGTCT 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 198 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 RIKEN cDNA A230109K 23 gene [Mm.200361, BC048534] neurotransmitter or neuromodulator
TGTGACGCTGG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 1a 37 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 cocaine and amphetamine regulated transcript [Mm.75498, NM_013732] Cell signaling
AGTTCCTTCGC 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 34 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 calbindin 2 [Mm.2755, NM_007586] Calciunion binding
GGCCGCCGCGC 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 33 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 hypocretin [Mm.10096, NM_010410] Cell signaling
   Pituitary gland                          
AAGTGTCGCCG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 14963 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 growth horm one [Mm.343934, NM_008117] Cell signaling
GGCGAGCTGAT 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1496 0a 1a 0a 0a 2a 0a 0a 0 Pro-opiomelanocortin-alpha [Mm.277996, NM_008895] Cell signaling
GCGGGAAAAGC 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 1383 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
CTTGGGTGCAA 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1307 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   prolactin [Mm.1270, NM_011164] Cell signaling
AAGTGTCGCCT 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 601 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
TTGGCGTCAAA 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 436 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
AAGTGTCGCCA 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 408 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
TCGGTTCTCTG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 329 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
ACGTACTTCCG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 222 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
CGCAGCGACGA 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 218 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
GCTGGGGCCCG 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 194 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
ACCCGCAGGTA 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 114 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
GTCCGAGTACT 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 75 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 luteinizing hormone beta [Mm.57061, NM_008497] Cell signaling
TTACTCCTTAT 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 49 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 thyroid stimulating hormone, beta subunit [Mm.110730, NM_009432] Thyroid structure and metabolism
  1. a Significant difference vs. no. of tags shown in bold (p < 0,05)