Skip to main content

Table 2 RGKTCA direct repeats found in Alu elements.

From: Widespread Alu repeat-driven expansion of consensus DR2 retinoic acid response elements during primate evolution

DR sequence # in Alu % in DR1 % in DR2 % in DR3 % in DR4 % in DR5
AGGTCA AGGTCA 2888 0.90 49.90 0.73 47.64 0.83
AGGTCA AGTTCA 93067 0.19 99.59 0.11 0.06 0.05
AGGTCA GGGTCA 78 23.08 39.74 6.41 25.64 5.13
AGGTCA GGTTCA 2212 2.40 96.11 1.04 0.31 0.14
AGTTCA AGGTCA 524 0.95 46.95 1.72 49.62 0.76
AGTTCA AGTTCA 2389 1.21 95.10 1.80 0.63 1.26
AGTTCA GGGTCA 10 20.00 60.00 0.00 20.00 0.00
AGTTCA GGTTCA 137 12.41 78.10 3.65 2.19 3.65
GGGTCA AGGTCA 5244 0.08 29.67 0.27 69.68 0.30
GGGTCA AGTTCA 1285 0.70 91.91 0.47 6.69 0.23
GGGTCA GGGTCA 94 1.06 27.66 9.57 54.26 7.45
GGGTCA GGTTCA 44 11.36 68.18 2.27 13.64 4.55
GGTTCA AGGTCA 1096 0.18 42.43 0.27 55.84 1.28
GGTTCA AGTTCA 197 5.58 41.11 27.92 13.71 11.68
GGTTCA GGGTCA 21 9.52 61.91 0.00 19.05 9.52
GGTTCA GGTTCA 258 24.03 35.66 18.61 7.75 13.95
RGKTCA RGKTCA 109544 0.39 93.44 0.31 5.66 0.20