TY - JOUR AU - Revenu, C. AU - Athman, R. AU - Robine, S. AU - Louvard, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - The co-workers of actin filaments: from cell structures to signals JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nrm1437 DO - 10.1038/nrm1437 ID - Revenu2004 ER - TY - JOUR AU - Blessing, C. A. AU - Ugrinova, G. T. AU - Goodson, H. V. PY - 2004 DA - 2004// TI - Actin and ARPs: action in the nucleus JO - Trends Cell Biol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.tcb.2004.07.009 DO - 10.1016/j.tcb.2004.07.009 ID - Blessing2004 ER - TY - JOUR AU - Miralles, F. AU - Visa, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Actin in transcription and transcription regulation JO - Curr Opin Cell Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.ceb.2006.04.009 DO - 10.1016/j.ceb.2006.04.009 ID - Miralles2006 ER - TY - JOUR AU - Disanza, A. AU - Steffen, A. AU - Hertzog, M. AU - Frittoli, E. AU - Rottner, K. AU - Scita, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - Actin polymerization machinery: the finish line of signaling networks, the starting point of cellular movement JO - Cell Mol Life Sci VL - 62 UR - https://doi.org/10.1007/s00018-004-4472-6 DO - 10.1007/s00018-004-4472-6 ID - Disanza2005 ER - TY - JOUR AU - Janmey, P. A. AU - Chaponnier, C. PY - 1995 DA - 1995// TI - Medical aspects of the actin cytoskeleton JO - Curr Opin Cell Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/0955-0674(95)80052-2 DO - 10.1016/0955-0674(95)80052-2 ID - Janmey1995 ER - TY - JOUR AU - Lambrechts, A. AU - Van Troys, M. AU - Ampe, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - The actin cytoskeleton in normal and pathological cell motility JO - Int J Biochem Cell Biol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1016/j.biocel.2004.01.024 DO - 10.1016/j.biocel.2004.01.024 ID - Lambrechts2004 ER - TY - JOUR AU - Condeelis, J. AU - Singer, R. H. AU - Segall, J. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - The great escape: when cancer cells hijack the genes for chemotaxis and motility JO - Annu Rev Cell Dev Biol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.cellbio.21.122303.120306 DO - 10.1146/annurev.cellbio.21.122303.120306 ID - Condeelis2005 ER - TY - JOUR AU - Jechlinger, M. AU - Grunert, S. AU - Tamir, I. H. AU - Janda, E. AU - Ludemann, S. AU - Waerner, T. AU - Seither, P. AU - Weith, A. AU - Beug, H. AU - Kraut, N. PY - 2003 DA - 2003// TI - Expression profiling of epithelial plasticity in tumor progression JO - Oncogene VL - 22 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1206887 DO - 10.1038/sj.onc.1206887 ID - Jechlinger2003 ER - TY - JOUR AU - Steenman, M. AU - Lamirault, G. AU - Le Meur, N. AU - Leger, J. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene expression profiling in human cardiovascular disease JO - Clin Chem Lab Med VL - 43 UR - https://doi.org/10.1515/CCLM.2005.118 DO - 10.1515/CCLM.2005.118 ID - Steenman2005 ER - TY - JOUR AU - Giganti, A. AU - Friederich, E. PY - 2003 DA - 2003// TI - The actin cytoskeleton as a therapeutic target: state of the art and future directions JO - Prog Cell Cycle Res VL - 5 ID - Giganti2003 ER - TY - JOUR AU - Benson, D. A. AU - Karsch-Mizrachi, I. AU - Lipman, D. J. AU - Ostell, J. AU - Wheeler, D. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - GenBank JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj157 DO - 10.1093/nar/gkj157 ID - Benson2006 ER - TY - JOUR AU - Ashburner, M. AU - Ball, C. A. AU - Blake, J. A. AU - Botstein, D. AU - Butler, H. AU - Cherry, J. M. AU - Davis, A. P. AU - Dolinski, K. AU - Dwight, S. S. AU - Eppig, J. T. AU - Harris, M. A. AU - Hill, D. P. AU - Issel-Tarver, L. AU - Kasarskis, A. AU - Lewis, S. AU - Matese, J. C. AU - Richardson, J. E. AU - Ringwald, M. AU - Rubin, G. M. AU - Sherlock, G. PY - 2000 DA - 2000// TI - Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium JO - Nat Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/75556 DO - 10.1038/75556 ID - Ashburner2000 ER - TY - STD TI - Actinome. [http://alnitak.u-strasbg.fr/] UR - http://alnitak.u-strasbg.fr/ ID - ref13 ER - TY - JOUR AU - Kane, M. D. AU - Jatkoe, T. A. AU - Stumpf, C. R. AU - Lu, J. AU - Thomas, J. D. AU - Madore, S. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Assessment of the sensitivity and specificity of oligonucleotide (50mer) microarrays JO - Nucleic Acids Res VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.22.4552 DO - 10.1093/nar/28.22.4552 ID - Kane2000 ER - TY - JOUR AU - Mecham, B. H. AU - Wetmore, D. Z. AU - Szallasi, Z. AU - Sadovsky, Y. AU - Kohane, I. AU - Mariani, T. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Increased measurement accuracy for sequence-verified microarray probes JO - Physiol Genomics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1152/physiolgenomics.00066.2004 DO - 10.1152/physiolgenomics.00066.2004 ID - Mecham2004 ER - TY - JOUR AU - Barczak, A. AU - Rodriguez, M. W. AU - Hanspers, K. AU - Koth, L. L. AU - Tai, Y. C. AU - Bolstad, B. M. AU - Speed, T. P. AU - Erle, D. J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Spotted long oligonucleotide arrays for human gene expression analysis JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1048803 DO - 10.1101/gr.1048803 ID - Barczak2003 ER - TY - JOUR AU - Li, F. AU - Stormo, G. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Selection of optimal DNA oligos for gene expression arrays JO - Bioinformatics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.11.1067 DO - 10.1093/bioinformatics/17.11.1067 ID - Li2001 ER - TY - JOUR AU - Rouillard, J. M. AU - Zuker, M. AU - Gulari, E. PY - 2003 DA - 2003// TI - OligoArray 2.0: design of oligonucleotide probes for DNA microarrays using a thermodynamic approach JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg426 DO - 10.1093/nar/gkg426 ID - Rouillard2003 ER - TY - JOUR AU - Nielsen, H. B. AU - Wernersson, R. AU - Knudsen, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Design of oligonucleotides for microarrays and perspectives for design of multi-transcriptome arrays JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg622 DO - 10.1093/nar/gkg622 ID - Nielsen2003 ER - TY - JOUR AU - Chou, H. H. AU - Hsia, A. P. AU - Mooney, D. L. AU - Schnable, P. S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Picky: oligo microarray design for large genomes JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth347 DO - 10.1093/bioinformatics/bth347 ID - Chou2004 ER - TY - JOUR AU - Reymond, N. AU - Charles, H. AU - Duret, L. AU - Calevro, F. AU - Beslon, G. AU - Fayard, J. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - ROSO: optimizing oligonucleotide probes for microarrays JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg401 DO - 10.1093/bioinformatics/btg401 ID - Reymond2004 ER - TY - JOUR AU - Nordberg, E. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - YODA: selecting signature oligonucleotides JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti182 DO - 10.1093/bioinformatics/bti182 ID - Nordberg2005 ER - TY - JOUR AU - Rimour, S. AU - Hill, D. AU - Militon, C. AU - Peyret, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - GoArrays: highly dynamic and efficient microarray probe design JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti112 DO - 10.1093/bioinformatics/bti112 ID - Rimour2005 ER - TY - STD TI - CADO4MI. [http://bips.u-strasbg.fr/CADO4MI] UR - http://bips.u-strasbg.fr/CADO4MI ID - ref24 ER - TY - JOUR AU - Perrodou, E. AU - Deshayes, C. AU - Muller, J. AU - Schaeffer, C. AU - Van Dorsselaer, A. AU - Ripp, R. AU - Poch, O. AU - Reyrat, J. M. AU - Lecompte, O. PY - 2006 DA - 2006// TI - ICDS database: interrupted CoDing sequences in prokaryotic genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj060 DO - 10.1093/nar/gkj060 ID - Perrodou2006 ER - TY - JOUR AU - Pruitt, K. D. AU - Tatusova, T. AU - Maglott, D. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - NCBI Reference Sequence (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki025 DO - 10.1093/nar/gki025 ID - Pruitt2005 ER - TY - JOUR AU - Wheeler, D. L. AU - Barrett, T. AU - Benson, D. A. AU - Bryant, S. H. AU - Canese, K. AU - Chetvernin, V. AU - Church, D. M. AU - DiCuccio, M. AU - Edgar, R. AU - Federhen, S. AU - Geer, L. Y. AU - Helmberg, W. AU - Kapustin, Y. AU - Kenton, D. L. AU - Khovayko, O. AU - Lipman, D. J. AU - Madden, T. L. AU - Maglott, D. R. AU - Ostell, J. AU - Pruitt, K. D. AU - Schuler, G. D. AU - Schriml, L. M. AU - Sequeira, E. AU - Sherry, S. T. AU - Sirotkin, K. AU - Souvorov, A. AU - Starchenko, G. AU - Suzek, T. O. AU - Tatusov, R. AU - Tatusova, T. A. AU - Wagner, L. AU - Yaschenko, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Database resources of the National Center for Biotechnology Information JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj158 DO - 10.1093/nar/gkj158 ID - Wheeler2006 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. AU - Coscoy, L. AU - Zylberberg, M. AU - Avila, P. C. AU - Boushey, H. A. AU - Ganem, D. AU - DeRisi, J. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Microarray-based detection and genotyping of viral pathogens JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.242579699 DO - 10.1073/pnas.242579699 ID - Wang2002 ER - TY - JOUR AU - Lee, P. D. AU - Sladek, R. AU - Greenwood, C. M. AU - Hudson, T. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Control genes and variability: absence of ubiquitous reference transcripts in diverse mammalian expression studies JO - Genome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1101/gr.217802 DO - 10.1101/gr.217802 ID - Lee2002 ER - TY - JOUR AU - Wang, H. Y. AU - Malek, R. L. AU - Kwitek, A. E. AU - Greene, A. S. AU - Luu, T. V. AU - Behbahani, B. AU - Frank, B. AU - Quackenbush, J. AU - Lee, N. H. PY - 2003 DA - 2003// TI - Assessing unmodified 70-mer oligonucleotide probe performance on glass-slide microarrays JO - Genome Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2003-4-1-r5 DO - 10.1186/gb-2003-4-1-r5 ID - Wang2003 ER - TY - JOUR AU - Tusher, V. G. AU - Tibshirani, R. AU - Chu, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.091062498 DO - 10.1073/pnas.091062498 ID - Tusher2001 ER - TY - JOUR AU - Muller, J. AU - Oma, Y. AU - Vallar, L. AU - Friederich, E. AU - Poch, O. AU - Winsor, B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Sequence and comparative genomic analysis of actin-related proteins JO - Mol Biol Cell VL - 16 UR - https://doi.org/10.1091/mbc.E05-06-0508 DO - 10.1091/mbc.E05-06-0508 ID - Muller2005 ER - TY - JOUR AU - Kothapalli, R. AU - Yoder, S. J. AU - Mane, S. AU - Loughran, T. P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Microarray results: how accurate are they? JO - BMC Bioinformatics VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-3-22 DO - 10.1186/1471-2105-3-22 ID - Kothapalli2002 ER - TY - JOUR AU - Khaitlina, S. Y. PY - 2001 DA - 2001// TI - Functional specificity of actin isoforms JO - Int Rev Cytol VL - 202 UR - https://doi.org/10.1016/S0074-7696(01)02003-4 DO - 10.1016/S0074-7696(01)02003-4 ID - Khaitlina2001 ER - TY - JOUR AU - Hoheisel, J. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Microarray technology: beyond transcript profiling and genotype analysis JO - Nat Rev Genet VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrg1809 DO - 10.1038/nrg1809 ID - Hoheisel2006 ER - TY - JOUR AU - Brazma, A. AU - Hingamp, P. AU - Quackenbush, J. AU - Sherlock, G. AU - Spellman, P. AU - Stoeckert, C. AU - Aach, J. AU - Ansorge, W. AU - Ball, C. A. AU - Causton, H. C. AU - Gaasterland, T. AU - Glenisson, P. AU - Holstege, F. C. AU - Kim, I. F. AU - Markowitz, V. AU - Matese, J. C. AU - Parkinson, H. AU - Robinson, A. AU - Sarkans, U. AU - Schulze-Kremer, S. AU - Stewart, J. AU - Taylor, R. AU - Vilo, J. AU - Vingron, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Minimum information about a microarray experiment (MIAME)-toward standards for microarray data JO - Nat Genet VL - 29 UR - https://doi.org/10.1038/ng1201-365 DO - 10.1038/ng1201-365 ID - Brazma2001 ER - TY - JOUR AU - Bammler, T. AU - Beyer, R. P. AU - Bhattacharya, S. AU - Boorman, G. A. AU - Boyles, A. AU - Bradford, B. U. AU - Bumgarner, R. E. AU - Bushel, P. R. AU - Chaturvedi, K. AU - Choi, D. AU - Cunningham, M. L. AU - Deng, S. AU - Dressman, H. K. AU - Fannin, R. D. AU - Farin, F. M. AU - Freedman, J. H. AU - Fry, R. C. AU - Harper, A. AU - Humble, M. C. AU - Hurban, P. AU - Kavanagh, T. J. AU - Kaufmann, W. K. AU - Kerr, K. F. AU - Jing, L. AU - Lapidus, J. A. AU - Lasarev, M. R. AU - Li, J. AU - Li, Y. J. AU - Lobenhofer, E. K. AU - Lu, X. AU - Malek, R. L. AU - Milton, S. AU - Nagalla, S. R. AU - O'Malley J, P. AU - Palmer, V. S. AU - Pattee, P. AU - Paules, R. S. AU - Perou, C. M. AU - Phillips, K. AU - Qin, L. X. AU - Qiu, Y. AU - Quigley, S. D. AU - Rodland, M. AU - Rusyn, I. AU - Samson, L. D. AU - Schwartz, D. A. AU - Shi, Y. AU - Shin, J. L. AU - Sieber, S. O. AU - Slifer, S. AU - Speer, M. C. AU - Spencer, P. S. AU - Sproles, D. I. AU - Swenberg, J. A. AU - Suk, W. A. AU - Sullivan, R. C. AU - Tian, R. AU - Tennant, R. W. AU - Todd, S. A. AU - Tucker, C. J. AU - Van Houten, B. AU - Weis, B. K. AU - Xuan, S. AU - Zarbl, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Standardizing global gene expression analysis between laboratories and across platforms JO - Nat Methods VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth0605-477a DO - 10.1038/nmeth0605-477a ID - Bammler2005 ER - TY - JOUR AU - Irizarry, R. A. AU - Warren, D. AU - Spencer, F. AU - Kim, I. F. AU - Biswal, S. AU - Frank, B. C. AU - Gabrielson, E. AU - Garcia, J. G. AU - Geoghegan, J. AU - Germino, G. AU - Griffin, C. AU - Hilmer, S. C. AU - Hoffman, E. AU - Jedlicka, A. E. AU - Kawasaki, E. AU - Martinez-Murillo, F. AU - Morsberger, L. AU - Lee, H. AU - Petersen, D. AU - Quackenbush, J. AU - Scott, A. AU - Wilson, M. AU - Yang, Y. AU - Ye, S. Q. AU - Yu, W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Multiple-laboratory comparison of microarray platforms JO - Nat Methods VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth756 DO - 10.1038/nmeth756 ID - Irizarry2005 ER - TY - JOUR AU - Larkin, J. E. AU - Frank, B. C. AU - Gavras, H. AU - Sultana, R. AU - Quackenbush, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Independence and reproducibility across microarray platforms JO - Nat Methods VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth757 DO - 10.1038/nmeth757 ID - Larkin2005 ER - TY - JOUR AU - Kuo, W. P. AU - Liu, F. AU - Trimarchi, J. AU - Punzo, C. AU - Lombardi, M. AU - Sarang, J. AU - Whipple, M. E. AU - Maysuria, M. AU - Serikawa, K. AU - Lee, S. Y. AU - McCrann, D. AU - Kang, J. AU - Shearstone, J. R. AU - Burke, J. AU - Park, D. J. AU - Wang, X. AU - Rector, T. L. AU - Ricciardi-Castagnoli, P. AU - Perrin, S. AU - Choi, S. AU - Bumgarner, R. AU - Kim, J. H. AU - Short, G. F. AU - Freeman, M. W. AU - Seed, B. AU - Jensen, R. AU - Church, G. M. AU - Hovig, E. AU - Cepko, C. L. AU - Park, P. AU - Ohno-Machado, L. AU - Jenssen, T. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - A sequence-oriented comparison of gene expression measurements across different hybridization-based technologies JO - Nat Biotechnol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1038/nbt1217 DO - 10.1038/nbt1217 ID - Kuo2006 ER - TY - JOUR AU - Allemeersch, J. AU - Durinck, S. AU - Vanderhaeghen, R. AU - Alard, P. AU - Maes, R. AU - Seeuws, K. AU - Bogaert, T. AU - Coddens, K. AU - Deschouwer, K. AU - Van Hummelen, P. AU - Vuylsteke, M. AU - Moreau, Y. AU - Kwekkeboom, J. AU - Wijfjes, A. H. AU - May, S. AU - Beynon, J. AU - Hilson, P. AU - Kuiper, M. T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Benchmarking the CATMA microarray. A novel tool for Arabidopsis transcriptome analysis JO - Plant Physiol VL - 137 UR - https://doi.org/10.1104/pp.104.051300 DO - 10.1104/pp.104.051300 ID - Allemeersch2005 ER - TY - JOUR AU - Snijders, A. M. AU - Meijer, G. A. AU - Brakenhoff, R. H. AU - van den Brule, A. J. AU - van Diest, P. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Microarray techniques in pathology: tool or toy? JO - Mol Pathol VL - 53 UR - https://doi.org/10.1136/mp.53.6.289 DO - 10.1136/mp.53.6.289 ID - Snijders2000 ER - TY - JOUR AU - Shippy, R. AU - Sendera, T. J. AU - Lockner, R. AU - Palaniappan, C. AU - Kaysser-Kranich, T. AU - Watts, G. AU - Alsobrook, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Performance evaluation of commercial short-oligonucleotide microarrays and the impact of noise in making cross-platform correlations JO - BMC Genomics VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-5-61 DO - 10.1186/1471-2164-5-61 ID - Shippy2004 ER - TY - JOUR AU - Schlingemann, J. AU - Habtemichael, N. AU - Ittrich, C. AU - Toedt, G. AU - Kramer, H. AU - Hambek, M. AU - Knecht, R. AU - Lichter, P. AU - Stauber, R. AU - Hahn, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Patient-based cross-platform comparison of oligonucleotide microarray expression profiles JO - Lab Invest VL - 85 UR - https://doi.org/10.1038/labinvest.3700293 DO - 10.1038/labinvest.3700293 ID - Schlingemann2005 ER - TY - JOUR AU - Magnusson, N. E. AU - Cardozo, A. K. AU - Kruhoffer, M. AU - Eizirik, D. L. AU - Orntoft, T. F. AU - Jensen, J. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Construction and validation of the APOCHIP, a spotted oligo-microarray for the study of beta-cell apoptosis JO - BMC Bioinformatics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-6-311 DO - 10.1186/1471-2105-6-311 ID - Magnusson2005 ER - TY - JOUR AU - Yauk, C. L. AU - Berndt, M. L. AU - Williams, A. AU - Douglas, G. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Comprehensive comparison of six microarray technologies JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gnh123 DO - 10.1093/nar/gnh123 ID - Yauk2004 ER - TY - JOUR AU - Kuo, W. P. AU - Jenssen, T. K. AU - Butte, A. J. AU - Ohno-Machado, L. AU - Kohane, I. S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Analysis of matched mRNA measurements from two different microarray technologies JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.3.405 DO - 10.1093/bioinformatics/18.3.405 ID - Kuo2002 ER - TY - JOUR AU - Tan, P. K. AU - Downey, T. J. AU - Spitznagel, E. L. AU - Xu, P. AU - Fu, D. AU - Dimitrov, D. S. AU - Lempicki, R. A. AU - Raaka, B. M. AU - Cam, M. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Evaluation of gene expression measurements from commercial microarray platforms JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg763 DO - 10.1093/nar/gkg763 ID - Tan2003 ER - TY - JOUR AU - Rogojina, A. T. AU - Orr, W. E. AU - Song, B. K. AU - Geisert, E. E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Comparing the use of Affymetrix to spotted oligonucleotide microarrays using two retinal pigment epithelium cell lines JO - Mol Vis VL - 9 ID - Rogojina2003 ER - TY - JOUR AU - Mah, N. AU - Thelin, A. AU - Lu, T. AU - Nikolaus, S. AU - Kuhbacher, T. AU - Gurbuz, Y. AU - Eickhoff, H. AU - Kloppel, G. AU - Lehrach, H. AU - Mellgard, B. AU - Costello, C. M. AU - Schreiber, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - A comparison of oligonucleotide and cDNA-based microarray systems JO - Physiol Genomics VL - 16 UR - https://doi.org/10.1152/physiolgenomics.00080.2003 DO - 10.1152/physiolgenomics.00080.2003 ID - Mah2004 ER - TY - JOUR AU - Jensen, K. AU - Talbot, R. AU - Paxton, E. AU - Waddington, D. AU - Glass, E. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Development and validation of a bovine macrophage specific cDNA microarray JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-224 DO - 10.1186/1471-2164-7-224 ID - Jensen2006 ER - TY - JOUR AU - Glas, A. M. AU - Floore, A. AU - Delahaye, L. J. AU - Witteveen, A. T. AU - Pover, R. C. AU - Bakx, N. AU - Lahti-Domenici, J. S. AU - Bruinsma, T. J. AU - Warmoes, M. O. AU - Bernards, R. AU - Wessels, L. F. AU - Van't Veer, L. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Converting a breast cancer microarray signature into a high-throughput diagnostic test JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-278 DO - 10.1186/1471-2164-7-278 ID - Glas2006 ER - TY - JOUR AU - Kapur, K. AU - Xing, Y. AU - Ouyang, Z. AU - Wong, W. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Exon array assessment of gene expression JO - Genome Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2007-8-5-r82 DO - 10.1186/gb-2007-8-5-r82 ID - Kapur2007 ER - TY - JOUR AU - Okoniewski, M. J. AU - Hey, Y. AU - Pepper, S. D. AU - Miller, C. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - High correspondence between Affymetrix exon and standard expression arrays JO - Biotechniques VL - 42 UR - https://doi.org/10.2144/000112315 DO - 10.2144/000112315 ID - Okoniewski2007 ER - TY - JOUR AU - Xing, Y. AU - Kapur, K. AU - Wong, W. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Probe selection and expression index computation of affymetrix exon arrays JO - PLoS ONE VL - 1 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000088 DO - 10.1371/journal.pone.0000088 ID - Xing2006 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schaffer, A. A. AU - Zhang, J. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - JOUR AU - Wu, C. H. AU - Apweiler, R. AU - Bairoch, A. AU - Natale, D. A. AU - Barker, W. C. AU - Boeckmann, B. AU - Ferro, S. AU - Gasteiger, E. AU - Huang, H. AU - Lopez, R. AU - Magrane, M. AU - Martin, M. J. AU - Mazumder, R. AU - O'Donovan, C. AU - Redaschi, N. AU - Suzek, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - The Universal Protein Resource (UniProt): an expanding universe of protein information JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj161 DO - 10.1093/nar/gkj161 ID - Wu2006 ER - TY - JOUR AU - Lander, E. S. AU - Linton, L. M. AU - Birren, B. AU - Nusbaum, C. AU - Zody, M. C. AU - Baldwin, J. AU - Devon, K. AU - Dewar, K. AU - Doyle, M. AU - FitzHugh, W. AU - Funke, R. AU - Gage, D. AU - Harris, K. AU - Heaford, A. AU - Howland, J. AU - Kann, L. AU - Lehoczky, J. AU - LeVine, R. AU - McEwan, P. AU - McKernan, K. AU - Meldrim, J. AU - Mesirov, J. P. AU - Miranda, C. AU - Morris, W. AU - Naylor, J. AU - Raymond, C. AU - Rosetti, M. AU - Santos, R. AU - Sheridan, A. AU - Sougnez, C. AU - Stange-Thomann, N. AU - Stojanovic, N. AU - Subramanian, A. AU - Wyman, D. AU - Rogers, J. AU - Sulston, J. AU - Ainscough, R. AU - Beck, S. AU - Bentley, D. AU - Burton, J. AU - Clee, C. AU - Carter, N. AU - Coulson, A. AU - Deadman, R. AU - Deloukas, P. AU - Dunham, A. AU - Dunham, I. AU - Durbin, R. AU - French, L. AU - Grafham, D. AU - Gregory, S. AU - Hubbard, T. AU - Humphray, S. AU - Hunt, A. AU - Jones, M. AU - Lloyd, C. AU - McMurray, A. AU - Matthews, L. AU - Mercer, S. AU - Milne, S. AU - Mullikin, J. C. AU - Mungall, A. AU - Plumb, R. AU - Ross, M. AU - Shownkeen, R. AU - Sims, S. AU - Waterston, R. H. AU - Wilson, R. K. AU - Hillier, L. W. AU - McPherson, J. D. AU - Marra, M. A. AU - Mardis, E. R. AU - Fulton, L. A. AU - Chinwalla, A. T. AU - Pepin, K. H. AU - Gish, W. R. AU - Chissoe, S. L. AU - Wendl, M. C. AU - Delehaunty, K. D. AU - Miner, T. L. AU - Delehaunty, A. AU - Kramer, J. B. AU - Cook, L. L. AU - Fulton, R. S. AU - Johnson, D. L. AU - Minx, P. J. AU - Clifton, S. W. AU - Hawkins, T. AU - Branscomb, E. AU - Predki, P. AU - Richardson, P. AU - Wenning, S. AU - Slezak, T. AU - Doggett, N. AU - Cheng, J. F. AU - Olsen, A. AU - Lucas, S. AU - Elkin, C. AU - Uberbacher, E. AU - Frazier, M. AU - Gibbs, R. A. AU - Muzny, D. M. AU - Scherer, S. E. AU - Bouck, J. B. AU - Sodergren, E. J. AU - Worley, K. C. AU - Rives, C. M. AU - Gorrell, J. H. AU - Metzker, M. L. AU - Naylor, S. L. AU - Kucherlapati, R. S. AU - Nelson, D. L. AU - Weinstock, G. M. AU - Sakaki, Y. AU - Fujiyama, A. AU - Hattori, M. AU - Yada, T. AU - Toyoda, A. AU - Itoh, T. AU - Kawagoe, C. AU - Watanabe, H. AU - Totoki, Y. AU - Taylor, T. AU - Weissenbach, J. AU - Heilig, R. AU - Saurin, W. AU - Artiguenave, F. AU - Brottier, P. AU - Bruls, T. AU - Pelletier, E. AU - Robert, C. AU - Wincker, P. AU - Smith, D. R. AU - Doucette-Stamm, L. AU - Rubenfield, M. AU - Weinstock, K. AU - Lee, H. M. AU - Dubois, J. AU - Rosenthal, A. AU - Platzer, M. AU - Nyakatura, G. AU - Taudien, S. AU - Rump, A. AU - Yang, H. AU - Yu, J. AU - Wang, J. AU - Huang, G. AU - Gu, J. AU - Hood, L. AU - Rowen, L. AU - Madan, A. AU - Qin, S. AU - Davis, R. W. AU - Federspiel, N. A. AU - Abola, A. P. AU - Proctor, M. J. AU - Myers, R. M. AU - Schmutz, J. AU - Dickson, M. AU - Grimwood, J. AU - Cox, D. R. AU - Olson, M. V. AU - Kaul, R. AU - Shimizu, N. AU - Kawasaki, K. AU - Minoshima, S. AU - Evans, G. A. AU - Athanasiou, M. AU - Schultz, R. AU - Roe, B. A. AU - Chen, F. AU - Pan, H. AU - Ramser, J. AU - Lehrach, H. AU - Reinhardt, R. AU - McCombie, W. R. AU - de la Bastide, M. AU - Dedhia, N. AU - Blocker, H. AU - Hornischer, K. AU - Nordsiek, G. AU - Agarwala, R. AU - Aravind, L. AU - Bailey, J. A. AU - Bateman, A. AU - Batzoglou, S. AU - Birney, E. AU - Bork, P. AU - Brown, D. G. AU - Burge, C. B. AU - Cerutti, L. AU - Chen, H. C. AU - Church, D. AU - Clamp, M. AU - Copley, R. R. AU - Doerks, T. AU - Eddy, S. R. AU - Eichler, E. E. AU - Furey, T. S. AU - Galagan, J. AU - Gilbert, J. G. AU - Harmon, C. AU - Hayashizaki, Y. AU - Haussler, D. AU - Hermjakob, H. AU - Hokamp, K. AU - Jang, W. AU - Johnson, L. S. AU - Jones, T. A. AU - Kasif, S. AU - Kaspryzk, A. AU - Kennedy, S. AU - Kent, W. J. AU - Kitts, P. AU - Koonin, E. V. AU - Korf, I. AU - Kulp, D. AU - Lancet, D. AU - Lowe, T. M. AU - McLysaght, A. AU - Mikkelsen, T. AU - Moran, J. V. AU - Mulder, N. AU - Pollara, V. J. AU - Ponting, C. P. AU - Schuler, G. AU - Schultz, J. AU - Slater, G. AU - Smit, A. F. AU - Stupka, E. AU - Szustakowski, J. AU - Thierry-Mieg, D. AU - Thierry-Mieg, J. AU - Wagner, L. AU - Wallis, J. AU - Wheeler, R. AU - Williams, A. AU - Wolf, Y. I. AU - Wolfe, K. H. AU - Yang, S. P. AU - Yeh, R. F. AU - Collins, F. AU - Guyer, M. S. AU - Peterson, J. AU - Felsenfeld, A. AU - Wetterstrand, K. A. AU - Patrinos, A. AU - Morgan, M. J. AU - de Jong, P. AU - Catanese, J. J. AU - Osoegawa, K. AU - Shizuya, H. AU - Choi, S. AU - Chen, Y. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Initial sequencing and analysis of the human genome JO - Nature VL - 409 UR - https://doi.org/10.1038/35057062 DO - 10.1038/35057062 ID - Lander2001 ER - TY - JOUR AU - Chalmel, F. AU - Lardenois, A. AU - Thompson, J. D. AU - Muller, J. AU - Sahel, J. A. AU - Leveillard, T. AU - Poch, O. PY - 2005 DA - 2005// TI - GOAnno: GO annotation based on multiple alignment JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti252 DO - 10.1093/bioinformatics/bti252 ID - Chalmel2005 ER - TY - JOUR AU - SantaLucia, J. PY - 1998 DA - 1998// TI - A unified view of polymer, dumbbell, and oligonucleotide DNA nearest-neighbor thermodynamics JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 95 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.95.4.1460 DO - 10.1073/pnas.95.4.1460 ID - SantaLucia1998 ER - TY - STD TI - Actichip. [http://www.microarray.lu/en/MICROARRAY.shtml] UR - http://www.microarray.lu/en/MICROARRAY.shtml ID - ref61 ER - TY - STD TI - MGED. [http://www.mged.org] UR - http://www.mged.org ID - ref62 ER - TY - STD TI - ArrayExpress. [http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress] UR - http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress ID - ref63 ER - TY - JOUR AU - Tibshirani, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - A simple method for assessing sample sizes in microarray experiments JO - BMC Bioinformatics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-106 DO - 10.1186/1471-2105-7-106 ID - Tibshirani2006 ER -