TY - JOUR AU - Shapiro, J. A. AU - von Sternberg, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Why repetitive DNA is essential to genome function JO - Biol Rev VL - 80 UR - https://doi.org/10.1017/S1464793104006657 DO - 10.1017/S1464793104006657 ID - Shapiro2005 ER - TY - JOUR AU - Bennetzen, J. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Patterns in grass genome evolution JO - Curr Opin Plant Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/j.pbi.2007.01.010 DO - 10.1016/j.pbi.2007.01.010 ID - Bennetzen2007 ER - TY - JOUR AU - Morgante, M. AU - De Paoli, E. AU - Radovic, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Transposable elements and the plant pan-genomes JO - Curr Opin Plant Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/j.pbi.2007.02.001 DO - 10.1016/j.pbi.2007.02.001 ID - Morgante2007 ER - TY - JOUR AU - Slotkin, R. K. AU - Martienssen, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Transposable elements and the epigenetic regulation of the genome JO - Nat Rev Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2072 DO - 10.1038/nrg2072 ID - Slotkin2007 ER - TY - JOUR AU - Flavell, R. B. AU - Bennett, M. D. AU - Smith, J. B. AU - Smith, D. B. PY - 1974 DA - 1974// TI - Genome size and proportion of repeated nucleotide-sequence dna in plants JO - Biochem Genet VL - 12 UR - https://doi.org/10.1007/BF00485947 DO - 10.1007/BF00485947 ID - Flavell1974 ER - TY - JOUR AU - Murray, M. G. AU - Peters, D. L. AU - Thompson, W. F. PY - 1981 DA - 1981// TI - Ancient repeated sequences in the pea and mung bean genomes and implications for genome evolution JO - J Mol Evol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1007/BF01792422 DO - 10.1007/BF01792422 ID - Murray1981 ER - TY - JOUR AU - Piegu, B. AU - Guyot, R. AU - Picault, N. AU - Roulin, A. AU - Saniyal, A. AU - Kim, H. AU - Collura, K. AU - Brar, D. S. AU - Jackson, S. AU - Wing, R. A. AU - Panaud, O. PY - 2006 DA - 2006// TI - Doubling genome size without polyploidization: Dynamics of retrotransposition-driven genomic expansions in Oryza australiensis, a wild relative of rice JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.5290206 DO - 10.1101/gr.5290206 ID - Piegu2006 ER - TY - JOUR AU - Neumann, P. AU - Koblizkova, A. AU - Navratilova, A. AU - Macas, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Significant expansion of Vicia pannonica genome size mediated by amplification of a single type of giant retroelement JO - Genetics VL - 173 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.106.056259 DO - 10.1534/genetics.106.056259 ID - Neumann2006 ER - TY - JOUR AU - Hawkins, J. S. AU - Kim, H. AU - Nason, J. D. AU - Wing, R. A. AU - Wendel, J. F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Differential lineage-specific amplification of transposable elements is responsible for genome size variation in Gossypium JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.5282906 DO - 10.1101/gr.5282906 ID - Hawkins2006 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Pozarkova, D. AU - Navratilova, A. AU - Nouzova, M. AU - Neumann, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Two new families of tandem repeats isolated from genus Vicia using genomic self-priming PCR JO - Mol Gen Genet VL - 263 UR - https://doi.org/10.1007/s004380000245 DO - 10.1007/s004380000245 ID - Macas2000 ER - TY - JOUR AU - Dechyeva, D. AU - Schmidt, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Molecular organization of terminal repetitive DNA in Beta species JO - Chromosome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-006-1096-8 DO - 10.1007/s10577-006-1096-8 ID - Dechyeva2006 ER - TY - CHAP AU - Manetti, M. E. AU - Rossi, M. AU - Costa, A. P. P. AU - Clausen, A. M. AU - Van Sluys, M. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Radiation of the Tnt1 retrotransposon superfamily in three Solanaceae genera BT - BMC Evol Biol ID - Manetti2007 ER - TY - JOUR AU - Nouzova, M. AU - Neumann, P. AU - Navratilova, A. AU - Galbraith, D. W. AU - Macas, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Microarray-based survey of repetitive genomic sequences in Vicia spp JO - Plant Mol Biol VL - 45 UR - https://doi.org/10.1023/A:1006408119740 DO - 10.1023/A:1006408119740 ID - Nouzova2001 ER - TY - JOUR AU - Margulies, M. AU - Egholm, M. AU - Altman, W. E. AU - Attiya, S. AU - Bader, J. S. AU - Bemben, L. A. AU - Berka, J. AU - Braverman, M. S. AU - Chen, Y. J. AU - Chen, Z. T. AU - Dewell, S. B. AU - Du, L. AU - Fierro, J. M. AU - Gomes, X. V. AU - Godwin, B. C. AU - He, W. AU - Helgesen, S. AU - Ho, C. H. AU - Irzyk, G. P. AU - Jando, S. C. AU - Alenquer, M. L. I. AU - Jarvie, T. P. AU - Jirage, K. B. AU - Kim, J. B. AU - Knight, J. R. AU - Lanza, J. R. AU - Leamon, J. H. AU - Lefkowitz, S. M. AU - Lei, M. AU - Li, J. AU - Lohman, K. L. AU - Lu, H. AU - Makhijani, V. B. AU - McDade, K. E. AU - McKenna, M. P. AU - Myers, E. W. AU - Nickerson, E. AU - Nobile, J. R. AU - Plant, R. AU - Puc, B. P. AU - Ronan, M. T. AU - Roth, G. T. AU - Sarkis, G. J. AU - Simons, J. F. AU - Simpson, J. W. AU - Srinivasan, M. AU - Tartaro, K. R. AU - Tomasz, A. AU - Vogt, K. A. AU - Volkmer, G. A. AU - Wang, S. H. AU - Wang, Y. AU - Weiner, M. P. AU - Yu, P. G. AU - Begley, R. F. AU - Rothberg, J. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors JO - Nature VL - 437 ID - Margulies2005 ER - TY - JOUR AU - Smith, M. G. AU - Gianoulis, T. A. AU - Pukatzki, S. AU - Mekalanos, J. J. AU - Ornston, L. N. AU - Gerstein, M. AU - Snyder, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - New insights into Acinetobacter baumannii pathogenesis revealed by high-density pyrosequencing and transposon mutagenesis JO - Genes Dev VL - 21 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1510307 DO - 10.1101/gad.1510307 ID - Smith2007 ER - TY - JOUR AU - Noonan, J. P. AU - Coop, G. AU - Kudaravalli, S. AU - Smith, D. AU - Krause, J. AU - Alessi, J. AU - Chen, F. AU - Platt, D. AU - Paabo, S. AU - Pritchard, J. K. AU - Rubin, E. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sequencing and analysis of Neanderthal genomic DNA JO - Science VL - 314 UR - https://doi.org/10.1126/science.1131412 DO - 10.1126/science.1131412 ID - Noonan2006 ER - TY - JOUR AU - Cheung, F. AU - Haas, B. J. AU - Goldberg, S. M. AU - May, G. D. AU - Xiao, Y. AU - Town, C. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sequencing Medicago truncatula expressed sequenced tags using 454 Life Sciences technology JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-272 DO - 10.1186/1471-2164-7-272 ID - Cheung2006 ER - TY - STD TI - Plant DNA C-values database. [http://www.kew.org/cval/] UR - http://www.kew.org/cval/ ID - ref18 ER - TY - CHAP AU - Swaminathan, K. AU - Varala, K. AU - Hudson, M. E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Global repeat discovery and estimation of genomic copy number in a large, complex genome using a high-throughput 454 sequence survey BT - BMC Genomics ID - Swaminathan2007 ER - TY - JOUR AU - Neumann, P. AU - Nouzova, M. AU - Macas, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular and cytogenetic analysis of repetitive DNA in pea (Pisum sativum L.) JO - Genome VL - 44 UR - https://doi.org/10.1139/gen-44-4-716 DO - 10.1139/gen-44-4-716 ID - Neumann2001 ER - TY - JOUR AU - Neumann, P. AU - Pozarkova, D. AU - Macas, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced JO - Plant Mol Biol VL - 53 UR - https://doi.org/10.1023/B:PLAN.0000006945.77043.ce DO - 10.1023/B:PLAN.0000006945.77043.ce ID - Neumann2003 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Neumann, P. AU - Pozarkova, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Zaba: a novel miniature transposable element present in genomes of legume plants JO - Mol Genet Genomics VL - 269 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-003-0869-4 DO - 10.1007/s00438-003-0869-4 ID - Macas2003 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Koblizkova, A. AU - Neumann, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Characterization of Stowaway MITEs in pea (Pisum sativum L.) and identification of their potential master elements JO - Genome VL - 48 UR - https://doi.org/10.1139/g05-047 DO - 10.1139/g05-047 ID - Macas2005 ER - TY - JOUR AU - Neumann, P. AU - Pozarkova, D. AU - Koblizkova, A. AU - Macas, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - PIGY, a new plant envelope-class LTR retrotransposon JO - Mol Genet Genomics VL - 273 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-004-1092-7 DO - 10.1007/s00438-004-1092-7 ID - Neumann2005 ER - TY - JOUR AU - Pertea, G. AU - Huang, X. Q. AU - Liang, F. AU - Antonescu, V. AU - Sultana, R. AU - Karamycheva, S. AU - Lee, Y. AU - White, J. AU - Cheung, F. AU - Parvizi, B. AU - Tsai, J. AU - Quackenbush, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - TIGR Gene Indices clustering tools (TGICL): a software system for fast clustering of large EST datasets JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg034 DO - 10.1093/bioinformatics/btg034 ID - Pertea2003 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Neumann, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Ogre elements – A distinct group of plant Ty3/gypsy-like retrotransposons JO - Gene VL - 390 UR - https://doi.org/10.1016/j.gene.2006.08.007 DO - 10.1016/j.gene.2006.08.007 ID - Macas2007 ER - TY - JOUR AU - Chavanne, F. AU - Zhang, D. X. AU - Liaud, M. F. AU - Cerff, R. PY - 1998 DA - 1998// TI - Structure and evolution of Cyclops: a novel giant retrotransposon of the Ty3/Gypsy family highly amplified in pea and other legume species JO - Plant Mol Biol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1023/A:1005969626142 DO - 10.1023/A:1005969626142 ID - Chavanne1998 ER - TY - JOUR AU - Lee, D. AU - Ellis, T. H. N. AU - Turner, L. AU - Hellens, R. P. AU - Cleary, W. G. PY - 1990 DA - 1990// TI - A copia-like element in Pisum demonstrates the uses of dispersed repeated sequences in genetic-analysis JO - Plant Mol Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1007/BF00016121 DO - 10.1007/BF00016121 ID - Lee1990 ER - TY - JOUR AU - Laten, H. M. AU - Havecker, E. R. AU - Farmer, L. M. AU - Voytas, D. F. PY - 2003 DA - 2003// TI - SIRE1, an endogenous retrovirus family from Glycine max, is highly homogenous and evolutionarily young JO - Mol Biol Evol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msg142 DO - 10.1093/molbev/msg142 ID - Laten2003 ER - TY - JOUR AU - Xiong, Y. AU - Eickbush, T. H. PY - 1990 DA - 1990// TI - Origin and evolution of retroelements based upon their reverse-transcriptase sequences JO - EMBO J VL - 9 ID - Xiong1990 ER - TY - JOUR AU - Richards, E. J. AU - Ausubel, F. M. PY - 1988 DA - 1988// TI - Isolation of a higher eukaryotic telomere from Arabidopsis thaliana JO - Cell VL - 53 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(88)90494-1 DO - 10.1016/0092-8674(88)90494-1 ID - Richards1988 ER - TY - JOUR AU - Li, R. Q. AU - Ye, J. AU - Li, S. G. AU - Wang, J. AU - Han, Y. J. AU - Ye, C. AU - Wang, J. AU - Yang, H. M. AU - Yu, J. AU - Wong, G. K. S. AU - Wang, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - ReAS: Recovery of ancestral sequences for transposable elements from the unassembled reads of a whole genome shotgun JO - PLoS Comput Biol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.0010043 DO - 10.1371/journal.pcbi.0010043 ID - Li2005 ER - TY - JOUR AU - Elsik, C. G. AU - Williams, C. G. PY - 2000 DA - 2000// TI - Retroelements contribute to the excess low-copy-number DNA in pine JO - Mol Gen Genet VL - 264 UR - https://doi.org/10.1007/s004380000279 DO - 10.1007/s004380000279 ID - Elsik2000 ER - TY - JOUR AU - Rabinowicz, P. D. AU - Bennetzen, J. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - The maize genome as a model for efficient sequence analysis of large plant genomes JO - Curr Opin Plant Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/j.pbi.2006.01.015 DO - 10.1016/j.pbi.2006.01.015 ID - Rabinowicz2006 ER - TY - JOUR AU - Feschotte, C. AU - Jiang, N. AU - Wessler, S. R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Plant transposable elements: Where genetics meets genomics JO - Nat Rev Genet VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/nrg793 DO - 10.1038/nrg793 ID - Feschotte2002 ER - TY - JOUR AU - Bennetzen, J. L. AU - Ma, J. X. AU - Devos, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Mechanisms of recent genome size variation in flowering plants JO - Ann Bot VL - 95 UR - https://doi.org/10.1093/aob/mci008 DO - 10.1093/aob/mci008 ID - Bennetzen2005 ER - TY - CHAP AU - Gao, L. H. AU - McCarthy, E. M. AU - Ganko, E. W. AU - McDonald, J. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Evolutionary history of Oryza sativa LTR retrotransposons: a preliminary survey of the rice genome sequences BT - BMC Genomics ID - Gao2004 ER - TY - JOUR AU - Hill, P. AU - Burford, D. AU - Martin, D. M. A. AU - Flavell, A. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Retrotransposon populations of Vicia species with varying genome size JO - Mol Genet Genomics VL - 273 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-005-1141-x DO - 10.1007/s00438-005-1141-x ID - Hill2005 ER - TY - JOUR AU - Flavell AU - Smith AU - Kumar PY - 1992 DA - 1992// TI - Extreme heterogeneity of Ty1-copia group retrotransposons in plants JO - Mol Gen Genet VL - 231 ID - Flavell1992 ER - TY - JOUR AU - Wicker, T. AU - Keller, B. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome-wide comparative analysis of copia retrotransposons in Triticeae, rice, and Arabidopsis reveals conserved ancient evolutionary lineages and distinct dynamics of individual copia families JO - Genome Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.1101/gr.6214107 DO - 10.1101/gr.6214107 ID - Wicker2007 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Meszaros, T. AU - Nouzova, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - PlantSat: a specialized database for plant satellite repeats JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.1.28 DO - 10.1093/bioinformatics/18.1.28 ID - Macas2002 ER - TY - JOUR AU - Navratilova, A. AU - Neumann, P. AU - Macas, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Long-range organization of plant satellite repeats investigated using strand-specific FISH JO - Cytogenet Genome Res VL - 109 UR - https://doi.org/10.1159/000082382 DO - 10.1159/000082382 ID - Navratilova2005 ER - TY - JOUR AU - Macas, J. AU - Navratilova, A. AU - Koblizkova, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sequence homogenization and chromosomal localization of VicTR-B satellites differ between closely related Vicia species JO - Chromosoma VL - 115 UR - https://doi.org/10.1007/s00412-006-0070-8 DO - 10.1007/s00412-006-0070-8 ID - Macas2006 ER - TY - JOUR AU - Kulikova, O. AU - Geurts, R. AU - Lamine, M. AU - Kim, D. J. AU - Cook, D. R. AU - Leunissen, J. AU - de Jong, H. AU - Roe, B. A. AU - Bisseling, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Satellite repeats in the functional centromere and pericentromeric heterochromatin of Medicago truncatula JO - Chromosoma VL - 113 UR - https://doi.org/10.1007/s00412-004-0315-3 DO - 10.1007/s00412-004-0315-3 ID - Kulikova2004 ER - TY - JOUR AU - Jiang, J. M. AU - Birchler, J. A. AU - Parrott, W. A. AU - Dawe, R. K. PY - 2003 DA - 2003// TI - A molecular view of plant centromeres JO - Trends Plant Sci VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.tplants.2003.10.011 DO - 10.1016/j.tplants.2003.10.011 ID - Jiang2003 ER - TY - JOUR AU - Fajkus, J. AU - Sykorova, E. AU - Leitch, A. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Telomeres in evolution and evolution of telomeres JO - Chromosome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-005-0997-2 DO - 10.1007/s10577-005-0997-2 ID - Fajkus2005 ER - TY - JOUR AU - Vershinin, A. V. AU - Heslop-Harrison, J. S. PY - 1998 DA - 1998// TI - Comparative analysis of the nucleosomal structure of rye, wheat and their relatives JO - Plant Mol Biol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1023/A:1005912822671 DO - 10.1023/A:1005912822671 ID - Vershinin1998 ER - TY - STD TI - The NCBI Trace Archive. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/] UR - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/ ID - ref48 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schaffer, A. A. AU - Zhang, J. H. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - STD TI - [http://www.bioperl.org/] UR - http://www.bioperl.org/ ID - ref50 ER - TY - STD TI - [http://w3lamc.umbr.cas.cz/pisum_454/] UR - http://w3lamc.umbr.cas.cz/pisum_454/ ID - ref51 ER - TY - JOUR AU - Marchler-Bauer, A. AU - Anderson, J. B. AU - DeWeese-Scott, C. AU - Fedorova, N. D. AU - Geer, L. Y. AU - He, S. Q. AU - Hurwitz, D. I. AU - Jackson, J. D. AU - Jacobs, A. R. AU - Lanczycki, C. J. AU - Liebert, C. A. AU - Liu, C. L. AU - Madej, T. AU - Marchler, G. H. AU - Mazumder, R. AU - Nikolskaya, A. N. AU - Panchenko, A. R. AU - Rao, B. S. AU - Shoemaker, B. A. AU - Simonyan, V. AU - Song, J. S. AU - Thiessen, P. A. AU - Vasudevan, S. AU - Wang, Y. L. AU - Yamashita, R. A. AU - Yin, J. J. AU - Bryant, S. H. PY - 2003 DA - 2003// TI - CDD: a curated Entrez database of conserved domain alignments JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg087 DO - 10.1093/nar/gkg087 ID - Marchler-Bauer2003 ER - TY - JOUR AU - Sonnhammer, E. L. L. AU - Durbin, R. PY - 1995 DA - 1995// TI - A dot-matrix program with dynamic threshold control suited for genomic DNA and protein sequence analysis JO - Gene VL - 167 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(95)00714-8 DO - 10.1016/0378-1119(95)00714-8 ID - Sonnhammer1995 ER - TY - JOUR AU - Thompson, J. D. AU - Gibson, T. J. AU - Plewniak, F. AU - Jeanmougin, F. AU - Higgins, D. G. PY - 1997 DA - 1997// TI - The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.24.4876 DO - 10.1093/nar/25.24.4876 ID - Thompson1997 ER - TY - JOUR AU - Jurka, J. AU - Kapitonov, V. V. AU - Pavlicek, A. AU - Klonowski, P. AU - Kohany, O. AU - Walichiewicz, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Repbase update, a database of eukaryotic repetitive elements JO - Cytogenet Genome Res VL - 110 UR - https://doi.org/10.1159/000084979 DO - 10.1159/000084979 ID - Jurka2005 ER - TY - JOUR AU - Jurka, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Repbase Update – a database and an electronic journal of repetitive elements JO - Trends Genet VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-9525(00)02093-X DO - 10.1016/S0168-9525(00)02093-X ID - Jurka2000 ER - TY - JOUR AU - Zmasek, C. M. AU - Eddy, S. R. PY - 2001 DA - 2001// TI - ATV: display and manipulation of annotated phylogenetic trees JO - Bioinformatics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.4.383 DO - 10.1093/bioinformatics/17.4.383 ID - Zmasek2001 ER - TY - STD TI - Rambaut A, Charleston M: TreeEdit – Phylogeny Editor and Manipulator. [http://evolve.zoo.ox.ac.uk/software/TreeEdit/main.html] UR - http://evolve.zoo.ox.ac.uk/software/TreeEdit/main.html ID - ref58 ER - TY - JOUR AU - Clamp, M. AU - Cuff, J. AU - Searle, S. M. AU - Barton, G. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - The Jalview Java alignment editor JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg430 DO - 10.1093/bioinformatics/btg430 ID - Clamp2004 ER - TY - JOUR AU - Benson, G. PY - 1999 DA - 1999// TI - Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences JO - Nucleic Acids Res VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/nar/27.2.573 DO - 10.1093/nar/27.2.573 ID - Benson1999 ER - TY - JOUR AU - Sobreira, T. J. P. AU - Durham, A. M. AU - Gruber, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - TRAP: automated classification, quantification and annotation of tandemly repeated sequences JO - Bioinformatics VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti809 DO - 10.1093/bioinformatics/bti809 ID - Sobreira2006 ER - TY - STD TI - [ftp://ftp.tigr.org/pub/data/m_truncatula/all_bac_ends.Z] UR - ftp://ftp.tigr.org/pub/data/m_truncatula/all_bac_ends.Z ID - ref62 ER - TY - STD TI - [http://www-loa.univ-lille1.fr/Mgraph/] UR - http://www-loa.univ-lille1.fr/Mgraph/ ID - ref63 ER - TY - BOOK AU - Leitch, A. AU - Schwarzacher, T. AU - Jackson, D. AU - Leitch, I. PY - 1994 DA - 1994// TI - In Situ Hybridization: a practical guide PB - BIOS Scientific Publishers Ltd CY - Oxford ID - Leitch1994 ER - TY - JOUR AU - Neumann, P. AU - Pozarkova, D. AU - Vrana, J. AU - Dolezel, J. AU - Macas, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Chromosome sorting and PCR-based physical mapping in pea (Pisum sativum L.) JO - Chromosome Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1023/A:1014274328269 DO - 10.1023/A:1014274328269 ID - Neumann2002 ER - TY - STD TI - [http://lna-tm.com] UR - http://lna-tm.com ID - ref66 ER -