Skip to main content

Table 2 Signal pathways that may be active in hESCs

From: A large-scale proteomic analysis of human embryonic stem cells

 

Name

Protein

mRNA

TGF β

Stat1

++++

++

 

PAI-1/SERPINE1

+++

-

 

Smad2/3

++

++

 

Jun

++

+

 

Smad4/DPC4

+

++

 

Endoglin

+

-

Wnt

CtBP2

++++

+++

 

PP2A Catalytic alpha/PPP2CA

++++

+++

 

EBP50/SLC9A3R1

++++

++

 

beta-Catenin/Ctnnb1

+++

+

 

Cyclin D3/CCND3

++

++

 

GSK-3 beta

++

++

 

Jun

++

+

 

Casein Kinase II alpha/CSNK2A1

++

++

Jak-Stat

Stat1

++++

++

 

Crk

+++

+

 

Stat3/2

+++

++

 

Stat6

+++

++

 

PTP1B

+++

++

 

JAK1

++

-

 

Glucocorticoid R/NR3C1

++

-

 

Thrombin Receptor/PAR1/F2R

++

+

 

SHPS-1/PTPNS1

++

++

 

MCM5

++

+++

 

Smad2/3

++

++

 

Tyk2

++

++

 

Jun

++

+

 

Bcl-x/BCL2L1

++

++

 

Smad4/DPC4

+

++

 

Stat5A

+

+

GPCR

B2 Bradykinin Receptor/BDKRB2

++++

-

 

Neurotensin Receptor 3/SORT1

+++

-

 

Endopeptidase 3.4.24.16/NLN

++

++

 

IP3R-3

++

++

 

SHC

+

+++

Gap Junction

Cdk1/Cdc2

++++

++

 

GRB2

++++

++

 

MEK1/MAP2K1

++++

++

 

PKA C

++

-

 

PKA RI alpha

++

-

 

PKC alpha

++

-

 

C-Raf/RAF1

++

++

 

ZO-1/TJP1

++

+++

 

Connexin-43/GJA1

++

++

IGF

PKC iota

++++

++

 

MEK1/MAP2K1

++++

++

 

Rsk/RPS6KA1

++++

+

 

GRB2

++++

++

 

MEK2/MAP2K2

+++

+++

 

PI3Kinase/PIK3R1

+++

++

 

pan ERK/MAPK1

+++

++

 

Crk

+++

+

 

eIF-4E

+++

++

 

ShcC

+++

-

 

PAI-1/SERPINE1

+++

-

 

C-Raf

++

++

 

SHC

++

+++

 

PKC beta/PRKCB1

++

++

 

NCK

++

++

 

PKB alpha/Akt

++

+

 

GSK-3 beta

++

++

 

Ercc-1

++

++

 

Fatty Acid Synthase/FASN

++

+++

 

Jun

++

+

 

RAFT1/FRAP

++

++

 

PTP1D/SHP2/PTPN11

++

++

 

SCAMP1

++

++

 

Bcl-x/BCL2L1

++

++

 

p70s6k/RPS6KB1

+

-

 

PI3-Kinase p170/PIK3C2A

+

+

 

PTP1B/PTPN1

+

++

 

Dok1/p62dok

+

++

 

PI3-Kinase p110 alpha/PIK3CA

+

-

ERBB

EphA4/Sek

++++

-

 

ShcC/SHC3

+++

-

 

c-erb-B2/ERBB2

++

++

 

C-Raf/RAF1

++

++

 

SHC/SHC1

++

+++

GDNF

I kappa B epsilon/NFKBIE

++++

++

 

GRB2

++++

++

 

MEK2

+++

+++

 

NCK

+++

++

 

C-Raf

++

++

 

Ras-GAP/RASA1

++

++

 

SHC

++

+++

 

GDNFR-alpha/Gfra1

++

-

 

Jun

++

+

 

IKK beta

++

++

 

pan-JNK/SAPK1/MAPK10

++

+

 

NBS1/ARTN

+

+

 

Dok1/p62dok

+

++

Tight Junction

PTEN

++++

++

 

PP2A Catalytic alpha

++++

+++

 

PKC iota

++++

++

 

Sec8/SEC8L1

+++

++

 

beta-Catenin/CTNNB1

+++

+

 

CDC42

+++

++

 

AF6/MLLT4

+++

++

 

PKC alpha

++

-

 

Yes

++

++

 

Rho/ARHA

++

+++

 

ZO-1/TJP1

++

+++

 

CASK

++

+

 

Symplekin/SYMPK

++

-

 

Ras/NRAS

++

++

 

Casein Kinase II alpha/CSNK2A1

++

++

 

VAP33/VAPA

++

+

 

alpha-Catenin/Ctnna1

+

++

MAPK

pan ERK

++++

++

 

MEK1

++++

++

 

Rsk

++++

++

 

ERK2

++++

++

 

MEK2/Map2k2

+++

+++

 

MST3/STK25

+++

+++

 

ERK1

+++

++

 

CDC42

+++

++

 

C-Raf

++

++

 

p38 alpha/SAPK2a

++

-

 

G3BP

++

+++

 

TFII-I/GTF2IRD1

++

++

 

MST1/STK4

++

++

 

MKP2/Dusp4

++

++

 

Ras

++

++

 

Phospho-p38MAPK (T180/Y182)

++

+

 

pan-JNK/SAPK1

++

+

 

Inhibitor2/PPP1R2

++

++

 

ABP-280

++

++++

 

14-3-3 epsilon/YWHAE

++

++

 

MAPKAPK-5

+

++

 

TAO1

+

*

 

PBK

+

++

 

MKK3b/Map2k3

+

+

  1. Protein expression level: > 10,000: ++++; 5,000–10,000: +++; 1,000–5,000:++; 100–1,000: + mRNA gene expression level: > 5,000:++++; 1,000–5,000: +++; 100–1,000: ++; 30–100: +
  2. *: not included in the gene expression array