Skip to main content

Table 2 Signal pathways that may be active in hESCs

From: A large-scale proteomic analysis of human embryonic stem cells

  Name Protein mRNA
TGF β Stat1 ++++ ++
  PAI-1/SERPINE1 +++ -
  Smad2/3 ++ ++
  Jun ++ +
  Smad4/DPC4 + ++
  Endoglin + -
Wnt CtBP2 ++++ +++
  PP2A Catalytic alpha/PPP2CA ++++ +++
  EBP50/SLC9A3R1 ++++ ++
  beta-Catenin/Ctnnb1 +++ +
  Cyclin D3/CCND3 ++ ++
  GSK-3 beta ++ ++
  Jun ++ +
  Casein Kinase II alpha/CSNK2A1 ++ ++
Jak-Stat Stat1 ++++ ++
  Crk +++ +
  Stat3/2 +++ ++
  Stat6 +++ ++
  PTP1B +++ ++
  JAK1 ++ -
  Glucocorticoid R/NR3C1 ++ -
  Thrombin Receptor/PAR1/F2R ++ +
  SHPS-1/PTPNS1 ++ ++
  MCM5 ++ +++
  Smad2/3 ++ ++
  Tyk2 ++ ++
  Jun ++ +
  Bcl-x/BCL2L1 ++ ++
  Smad4/DPC4 + ++
  Stat5A + +
GPCR B2 Bradykinin Receptor/BDKRB2 ++++ -
  Neurotensin Receptor 3/SORT1 +++ -
  Endopeptidase 3.4.24.16/NLN ++ ++
  IP3R-3 ++ ++
  SHC + +++
Gap Junction Cdk1/Cdc2 ++++ ++
  GRB2 ++++ ++
  MEK1/MAP2K1 ++++ ++
  PKA C ++ -
  PKA RI alpha ++ -
  PKC alpha ++ -
  C-Raf/RAF1 ++ ++
  ZO-1/TJP1 ++ +++
  Connexin-43/GJA1 ++ ++
IGF PKC iota ++++ ++
  MEK1/MAP2K1 ++++ ++
  Rsk/RPS6KA1 ++++ +
  GRB2 ++++ ++
  MEK2/MAP2K2 +++ +++
  PI3Kinase/PIK3R1 +++ ++
  pan ERK/MAPK1 +++ ++
  Crk +++ +
  eIF-4E +++ ++
  ShcC +++ -
  PAI-1/SERPINE1 +++ -
  C-Raf ++ ++
  SHC ++ +++
  PKC beta/PRKCB1 ++ ++
  NCK ++ ++
  PKB alpha/Akt ++ +
  GSK-3 beta ++ ++
  Ercc-1 ++ ++
  Fatty Acid Synthase/FASN ++ +++
  Jun ++ +
  RAFT1/FRAP ++ ++
  PTP1D/SHP2/PTPN11 ++ ++
  SCAMP1 ++ ++
  Bcl-x/BCL2L1 ++ ++
  p70s6k/RPS6KB1 + -
  PI3-Kinase p170/PIK3C2A + +
  PTP1B/PTPN1 + ++
  Dok1/p62dok + ++
  PI3-Kinase p110 alpha/PIK3CA + -
ERBB EphA4/Sek ++++ -
  ShcC/SHC3 +++ -
  c-erb-B2/ERBB2 ++ ++
  C-Raf/RAF1 ++ ++
  SHC/SHC1 ++ +++
GDNF I kappa B epsilon/NFKBIE ++++ ++
  GRB2 ++++ ++
  MEK2 +++ +++
  NCK +++ ++
  C-Raf ++ ++
  Ras-GAP/RASA1 ++ ++
  SHC ++ +++
  GDNFR-alpha/Gfra1 ++ -
  Jun ++ +
  IKK beta ++ ++
  pan-JNK/SAPK1/MAPK10 ++ +
  NBS1/ARTN + +
  Dok1/p62dok + ++
Tight Junction PTEN ++++ ++
  PP2A Catalytic alpha ++++ +++
  PKC iota ++++ ++
  Sec8/SEC8L1 +++ ++
  beta-Catenin/CTNNB1 +++ +
  CDC42 +++ ++
  AF6/MLLT4 +++ ++
  PKC alpha ++ -
  Yes ++ ++
  Rho/ARHA ++ +++
  ZO-1/TJP1 ++ +++
  CASK ++ +
  Symplekin/SYMPK ++ -
  Ras/NRAS ++ ++
  Casein Kinase II alpha/CSNK2A1 ++ ++
  VAP33/VAPA ++ +
  alpha-Catenin/Ctnna1 + ++
MAPK pan ERK ++++ ++
  MEK1 ++++ ++
  Rsk ++++ ++
  ERK2 ++++ ++
  MEK2/Map2k2 +++ +++
  MST3/STK25 +++ +++
  ERK1 +++ ++
  CDC42 +++ ++
  C-Raf ++ ++
  p38 alpha/SAPK2a ++ -
  G3BP ++ +++
  TFII-I/GTF2IRD1 ++ ++
  MST1/STK4 ++ ++
  MKP2/Dusp4 ++ ++
  Ras ++ ++
  Phospho-p38MAPK (T180/Y182) ++ +
  pan-JNK/SAPK1 ++ +
  Inhibitor2/PPP1R2 ++ ++
  ABP-280 ++ ++++
  14-3-3 epsilon/YWHAE ++ ++
  MAPKAPK-5 + ++
  TAO1 + *
  PBK + ++
  MKK3b/Map2k3 + +
  1. Protein expression level: > 10,000: ++++; 5,000–10,000: +++; 1,000–5,000:++; 100–1,000: + mRNA gene expression level: > 5,000:++++; 1,000–5,000: +++; 100–1,000: ++; 30–100: +
  2. *: not included in the gene expression array