TY - JOUR AU - Hunt, R. H. AU - Brooke, B. D. AU - Pillay, C. AU - Koekemoer, L. L. AU - Coetzee, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Laboratory selection for and characteristics of pyrethroid resistance in the malaria vector Anopheles funestus JO - Med Vet Entomol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2915.2005.00574.x DO - 10.1111/j.1365-2915.2005.00574.x ID - Hunt2005 ER - TY - JOUR AU - Sinkins, S. P. AU - Hackett, B. J. AU - Costantini, C. AU - Vulule, J. AU - Ling, Y. Y. AU - Collins, F. H. AU - Besansky, N. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Isolation of polymorphic microsatellite loci from the malaria vector Anopheles funestus JO - Mol Ecol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.2000.00871-2.x DO - 10.1046/j.1365-294x.2000.00871-2.x ID - Sinkins2000 ER - TY - JOUR AU - Cohuet, A. AU - Simard, F. AU - Berthomieu, A. AU - Raymond, M. AU - Fontenille, D. AU - Weill, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Isolation and characterization of microsatellite DNA markers in the malaria vector Anopheles funestus JO - Molecular Ecology Notes VL - 2 UR - https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2002.00290.x DO - 10.1046/j.1471-8286.2002.00290.x ID - Cohuet2002 ER - TY - JOUR AU - Cohuet, A. AU - Dia, I. AU - Simard, F. AU - Raymond, M. AU - Fontenille, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Population structure of the malaria vector Anopheles funestus in Senegal based on microsatellite and cytogenetic data JO - Insect Mol Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1111/j.0962-1075.2004.00482.x DO - 10.1111/j.0962-1075.2004.00482.x ID - Cohuet2004 ER - TY - JOUR AU - Cohuet, A. AU - Dia, I. AU - Simard, F. AU - Raymond, M. AU - Rousset, F. AU - Antonio-Nkondjio, C. AU - Awono-Ambene, P. H. AU - Wondji, C. S. AU - Fontenille, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene flow between chromosomal forms of the malaria vector Anopheles funestus in Cameroon, Central Africa, and its relevance in malaria fighting JO - Genetics VL - 169 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.103.025031 DO - 10.1534/genetics.103.025031 ID - Cohuet2005 ER - TY - JOUR AU - Michel, A. P. AU - Ingrasci, M. J. AU - Schemerhorn, B. J. AU - Kern, M. AU - Le Goff, G. AU - Coetzee, M. AU - Elissa, N. AU - Fontenille, D. AU - Vulule, J. AU - Lehmann, T. AU - Sagnon, N. AU - Costantini, C. AU - Besansky, N. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Rangewide population genetic structure of the African malaria vector Anopheles funestus JO - Mol Ecol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02754.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2005.02754.x ID - Michel2005 ER - TY - JOUR AU - Wondji, C. S. AU - Hunt, R. H. AU - Pignatelli, P. AU - Steen, K. AU - Coetzee, M. AU - Besansky, N. AU - Lobo, N. AU - Collins, F. H. AU - Hemingway, J. AU - Ranson, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - An integrated genetic and physical map for the malaria vector Anopheles funestus JO - Genetics VL - 171 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.105.044800 DO - 10.1534/genetics.105.044800 ID - Wondji2005 ER - TY - JOUR AU - Cargill, M. AU - Altshuler, D. AU - Ireland, J. AU - Sklar, P. AU - Ardlie, K. AU - Patil, N. AU - Shaw, N. AU - Lane, C. R. AU - Lim, E. P. AU - Kalyanaraman, N. AU - Nemesh, J. AU - Ziaugra, L. AU - Friedland, L. AU - Rolfe, A. AU - Warrington, J. AU - Lipshutz, R. AU - Daley, G. Q. AU - Lander, E. S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Characterization of single-nucleotide polymorphisms in coding regions of human genes JO - Nat Genet VL - 22 UR - https://doi.org/10.1038/10290 DO - 10.1038/10290 ID - Cargill1999 ER - TY - JOUR AU - Hoskins, R. A. AU - Phan, A. C. AU - Naeemuddin, M. AU - Mapa, F. A. AU - Ruddy, D. A. AU - Ryan, J. J. AU - Young, L. M. AU - Wells, T. AU - Kopczynski, C. AU - Ellis, M. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Single nucleotide polymorphism markers for genetic mapping in Drosophila melanogaster JO - Genome Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1101/gr.GR-1780R DO - 10.1101/gr.GR-1780R ID - Hoskins2001 ER - TY - JOUR AU - Morlais, I. AU - Severson, D. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - Intraspecific DNA variation in nuclear genes of the mosquito Aedes aegypti JO - Insect Mol Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2583.2003.00449.x DO - 10.1046/j.1365-2583.2003.00449.x ID - Morlais2003 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. G. AU - Fan, J. B. AU - Siao, C. J. AU - Berno, A. AU - Young, P. AU - Sapolsky, R. AU - Ghandour, G. AU - Perkins, N. AU - Winchester, E. AU - Spencer, J. AU - Kruglyak, L. AU - Stein, L. AU - Hsie, L. AU - Topaloglou, T. AU - Hubbell, E. AU - Robinson, E. AU - Mittmann, M. AU - Morris, M. S. AU - Shen, N. AU - Kilburn, D. AU - Rioux, J. AU - Nusbaum, C. AU - Rozen, S. AU - Hudson, T. J. AU - Lipshutz, R. AU - Chee, M. AU - Lander, E. S. PY - 1998 DA - 1998// TI - Large-scale identification, mapping, and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the human genome JO - Science VL - 280 UR - https://doi.org/10.1126/science.280.5366.1077 DO - 10.1126/science.280.5366.1077 ID - Wang1998 ER - TY - JOUR AU - Black, W. C. AU - Baer, C. F. AU - Antolin, M. F. AU - DuTeau, N. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Population genomics: genome-wide sampling of insect populations JO - Annu Rev Entomol VL - 46 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.ento.46.1.441 DO - 10.1146/annurev.ento.46.1.441 ID - Black2001 ER - TY - JOUR AU - Moriyama, E. N. AU - Powell, J. R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Intraspecific nuclear DNA variation in Drosophila JO - Mol Biol Evol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a025563 DO - 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025563 ID - Moriyama1996 ER - TY - JOUR AU - Moriyama, E. N. AU - Powell, J. R. PY - 1997 DA - 1997// TI - Codon usage bias and tRNA abundance in Drosophila JO - J Mol Evol VL - 45 UR - https://doi.org/10.1007/PL00006256 DO - 10.1007/PL00006256 ID - Moriyama1997 ER - TY - JOUR AU - Powell, J. R. AU - Moriyama, E. N. PY - 1997 DA - 1997// TI - Evolution of codon usage bias in Drosophila JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 94 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.94.15.7784 DO - 10.1073/pnas.94.15.7784 ID - Powell1997 ER - TY - JOUR AU - Holt, R. A. AU - Subramanian, G. M. AU - Halpern, A. AU - Sutton, G. G. AU - Charlab, R. AU - Nusskern, D. R. AU - Wincker, P. AU - Clark, A. G. AU - Ribeiro, J. M. AU - Wides, R. AU - Salzberg, S. L. AU - Loftus, B. AU - Yandell, M. AU - Majoros, W. H. AU - Rusch, D. B. AU - Lai, Z. AU - Kraft, C. L. AU - Abril, J. F. AU - Anthouard, V. AU - Arensburger, P. AU - Atkinson, P. W. AU - Baden, H. AU - de Berardinis, V. AU - Baldwin, D. AU - Benes, V. AU - Biedler, J. AU - Blass, C. AU - Bolanos, R. AU - Boscus, D. AU - Barnstead, M. AU - Cai, S. AU - Center, A. AU - Chaturverdi, K. AU - Christophides, G. K. AU - Chrystal, M. A. AU - Clamp, M. AU - Cravchik, A. AU - Curwen, V. AU - Dana, A. AU - Delcher, A. AU - Dew, I. AU - Evans, C. A. AU - Flanigan, M. AU - Grundschober-Freimoser, A. AU - Friedli, L. AU - Gu, Z. AU - Guan, P. AU - Guigo, R. AU - Hillenmeyer, M. E. AU - Hladun, S. L. AU - Hogan, J. R. AU - Hong, Y. S. AU - Hoover, J. AU - Jaillon, O. AU - Ke, Z. AU - Kodira, C. AU - Kokoza, E. AU - Koutsos, A. AU - Letunic, I. AU - Levitsky, A. AU - Liang, Y. AU - Lin, J. J. AU - Lobo, N. F. AU - Lopez, J. R. AU - Malek, J. A. AU - McIntosh, T. C. AU - Meister, S. AU - Miller, J. AU - Mobarry, C. AU - Mongin, E. AU - Murphy, S. D. AU - O'Brochta, D. A. AU - Pfannkoch, C. AU - Qi, R. AU - Regier, M. A. AU - Remington, K. AU - Shao, H. AU - Sharakhova, M. V. AU - Sitter, C. D. AU - Shetty, J. AU - Smith, T. J. AU - Strong, R. AU - Sun, J. AU - Thomasova, D. AU - Ton, L. Q. AU - Topalis, P. AU - Tu, Z. AU - Unger, M. F. AU - Walenz, B. AU - Wang, A. AU - Wang, J. AU - Wang, M. AU - Wang, X. AU - Woodford, K. J. AU - Wortman, J. R. AU - Wu, M. AU - Yao, A. AU - Zdobnov, E. M. AU - Zhang, H. AU - Zhao, Q. AU - Zhao, S. AU - Zhu, S. C. AU - Zhimulev, I. AU - Coluzzi, M. AU - della Torre, A. AU - Roth, C. W. AU - Louis, C. AU - Kalush, F. AU - Mural, R. J. AU - Myers, E. W. AU - Adams, M. D. AU - Smith, H. O. AU - Broder, S. AU - Gardner, M. J. AU - Fraser, C. M. AU - Birney, E. AU - Bork, P. AU - Brey, P. T. AU - Venter, J. C. AU - Weissenbach, J. AU - Kafatos, F. C. AU - Collins, F. H. AU - Hoffman, S. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - The genome sequence of the malaria mosquito Anopheles gambiae JO - Science VL - 298 UR - https://doi.org/10.1126/science.1076181 DO - 10.1126/science.1076181 ID - Holt2002 ER - TY - JOUR AU - Holliday, R. AU - Grigg, G. W. PY - 1993 DA - 1993// TI - DNA methylation and mutation JO - Mutat Res VL - 285 UR - https://doi.org/10.1016/0027-5107(93)90052-H DO - 10.1016/0027-5107(93)90052-H ID - Holliday1993 ER - TY - JOUR AU - Brookes, A. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - The essence of SNPs JO - Gene VL - 234 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1119(99)00219-X DO - 10.1016/S0378-1119(99)00219-X ID - Brookes1999 ER - TY - JOUR AU - Morlais, I. AU - Poncon, N. AU - Simard, F. AU - Cohuet, A. AU - Fontenille, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Intraspecific nucleotide variation in Anopheles gambiae: new insights into the biology of malaria vectors JO - Am J Trop Med Hyg VL - 71 ID - Morlais2004 ER - TY - JOUR AU - Aquadro, C. F. AU - Bauer DuMont, V. AU - Reed, F. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Genome-wide variation in the human and fruitfly: a comparison JO - Curr Opin Genet Dev VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S0959-437X(00)00245-8 DO - 10.1016/S0959-437X(00)00245-8 ID - Aquadro2001 ER - TY - JOUR AU - Begun, D. J. AU - Aquadro, C. F. PY - 1992 DA - 1992// TI - Levels of naturally occurring DNA polymorphism correlate with recombination rates in D. melanogaster JO - Nature VL - 356 UR - https://doi.org/10.1038/356519a0 DO - 10.1038/356519a0 ID - Begun1992 ER - TY - JOUR AU - Kern, A. D. AU - Begun, D. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Patterns of polymorphism and divergence from noncoding sequences of Drosophila melanogaster and D. simulans: evidence for nonequilibrium processes JO - Mol Biol Evol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msh269 DO - 10.1093/molbev/msh269 ID - Kern2005 ER - TY - JOUR AU - Galtier, N. AU - Bazin, E. AU - Bierne, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - GC-biased segregation of noncoding polymorphisms in Drosophila JO - Genetics VL - 172 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.105.046524 DO - 10.1534/genetics.105.046524 ID - Galtier2006 ER - TY - JOUR AU - Shen, L. X. AU - Basilion, J. P. AU - Stanton, V. P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Single-nucleotide polymorphisms can cause different structural folds of mRNA JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.14.7871 DO - 10.1073/pnas.96.14.7871 ID - Shen1999 ER - TY - JOUR AU - Schmid, K. J. AU - Tautz, D. PY - 1997 DA - 1997// TI - A screen for fast evolving genes from Drosophila JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 94 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.94.18.9746 DO - 10.1073/pnas.94.18.9746 ID - Schmid1997 ER - TY - JOUR AU - Kimura, M. AU - Takahata, N. PY - 1983 DA - 1983// TI - Selective constraint in protein polymorphism: study of the effectively neutral mutation model by using an improved pseudosampling method JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 80 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.80.4.1048 DO - 10.1073/pnas.80.4.1048 ID - Kimura1983 ER - TY - JOUR AU - Sharakhov, I. V. AU - Serazin, A. C. AU - Grushko, O. G. AU - Dana, A. AU - Lobo, N. AU - Hillenmeyer, M. E. AU - Westerman, R. AU - Romero-Severson, J. AU - Costantini, C. AU - Sagnon, N. AU - Collins, F. H. AU - Besansky, N. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Inversions and gene order shuffling in Anopheles gambiae and A. funestus JO - Science VL - 298 UR - https://doi.org/10.1126/science.1076803 DO - 10.1126/science.1076803 ID - Sharakhov2002 ER - TY - JOUR AU - Lynd, A. AU - Ranson, H. AU - McCall, P. J. AU - Randle, N. P. AU - Black, W. C. AU - Walker, E. D. AU - Donnelly, M. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - A simplified high-throughput method for pyrethroid knock-down resistance (kdr) detection in Anopheles gambiae JO - Malar J VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-4-16 DO - 10.1186/1475-2875-4-16 ID - Lynd2005 ER - TY - JOUR AU - Costantini, C. AU - Sagnon, N. AU - Ilboudo-Sanogo, E. AU - Coluzzi, M. AU - Boccolini, D. PY - 1999 DA - 1999// TI - Chromosomal and bionomic heterogeneities suggest incipient speciation in Anopheles funestus from Burkina Faso JO - Parassitologia VL - 41 ID - Costantini1999 ER - TY - JOUR AU - Amenya, D. A. AU - Koekemoer, L. L. AU - Vaughan, A. AU - Morgan, J. C. AU - Brooke, B. D. AU - Hunt, R. H. AU - Ranson, H. AU - Hemingway, J. AU - Coetzee, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Isolation and sequence analysis of P450 genes from a pyrethroid resistant colony of the major malaria vector Anopheles funestus JO - DNA Seq VL - 16 UR - https://doi.org/10.1080/10425170500356727 DO - 10.1080/10425170500356727 ID - Amenya2005 ER - TY - JOUR AU - Collins, F. H. AU - Mendez, M. A. AU - Rasmussen, M. O. AU - Mehaffey, P. C. AU - Besansky, N. J. AU - Finnerty, V. PY - 1987 DA - 1987// TI - A ribosomal RNA gene probe differentiates member species of the Anopheles gambiae complex JO - Am J Trop Med Hyg VL - 37 ID - Collins1987 ER - TY - JOUR AU - Rozen, S. AU - Skaletsky, H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers JO - Methods Mol Biol VL - 132 ID - Rozen2000 ER - TY - JOUR AU - Thompson, J. D. AU - Higgins, D. G. AU - Gibson, T. J. PY - 1994 DA - 1994// TI - CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice JO - Nucleic Acids Res VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/nar/22.22.4673 DO - 10.1093/nar/22.22.4673 ID - Thompson1994 ER - TY - JOUR AU - Rozas, J. AU - Sanchez-DelBarrio, J. C. AU - Messeguer, X. AU - Rozas, R. PY - 2003 DA - 2003// TI - DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg359 DO - 10.1093/bioinformatics/btg359 ID - Rozas2003 ER - TY - JOUR AU - Nei, M. AU - Gojobori, T. PY - 1986 DA - 1986// TI - Simple methods for estimating the numbers of synonymous and nonsynonymous nucleotide substitutions JO - Mol Biol Evol VL - 3 ID - Nei1986 ER - TY - JOUR AU - Black, W. C. AU - Gorrochotegui-Escalante, N. AU - Duteau, N. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Heated oligonucleotide ligation assay (HOLA): an affordable single nucleotide polymorphism assay JO - J Med Entomol VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/jmedent/43.2.238 DO - 10.1093/jmedent/43.2.238 ID - Black2006 ER - TY - JOUR AU - Sharakhov, I. AU - Braginets, O. AU - Grushko, O. AU - Cohuet, A. AU - Guelbeogo, W. M. AU - Boccolini, D. AU - Weill, M. AU - Costantini, C. AU - Sagnon, N. AU - Fontenille, D. AU - Yan, G. AU - Besansky, N. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - A microsatellite map of the African human malaria vector Anopheles funestus JO - J Hered VL - 95 UR - https://doi.org/10.1093/jhered/esh011 DO - 10.1093/jhered/esh011 ID - Sharakhov2004 ER -