| Whole genome | Up-regulated genes | Down-regulated genes | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleotide | Â | Coding | Promoter | Coding | Promoter | Coding | Promoter |
Mononucleotide | A | 0.36 | 0.40 | 0.42 | 0.40 | 0.40 | 0.40 |
 | C | 0.14 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.11 |
 | G | 0.14 | 0.12 | 0.16 | 0.12 | 0.15 | 0.12 |
 | T | 0.36 | 0.36 | 0.31 | 0.37 | 0.34 | 0.36 |
Dinucleotide | AA | 0.14 | 0.19 | 0.18 | 0.18 | 0.17 | 0.19 |
 | AC | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 |
 | AG | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 |
 | AT | 0.12 | 0.12 | 0.12 | 0.13 | 0.13 | 0.12 |
 | CA | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 |
 | CC | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 |
 | CG | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 |
 | CT | 0.05 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.04 |
 | GA | 0.06 | 0.06 | 0.08 | 0.05 | 0.07 | 0.05 |
 | GC | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 |
 | GG | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 |
 | GT | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.04 |
 | TA | 0.09 | 0.11 | 0.09 | 0.11 | 0.10 | 0.11 |
 | TC | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.05 | 0.04 | 0.05 |
 | TG | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 |
 | TT | 0.14 | 0.15 | 0.11 | 0.16 | 0.13 | 0.16 |