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Table 1 Differentially expressed genes in both Cln1-/- and Cln5-/- mice at 1 and 4 months of age. Double/triple values indicate multiple appearances in the gene expression data.

From: Brain gene expression profiles of Cln1 and Cln5 deficient mice unravels common molecular pathways underlying neuronal degeneration in NCL diseases

ID number Cln1 1 mo Cln1 4mo Cln5 1mo Cln5 4mo Symbol
NM_011213 -2,2/-1,8 -3,3/-1,9 -1,3 2,6/2,5 Ptprf
BE134116 -1,5 3,8 1,7 -3,7 Ptp4a2
AF378831 -1,2 -3,7 1,6 -5,7 Gprc5b/raig2
BC023103 1,5/1,3 2,7   4,0 Camkk2
AI844677 -1,5 2,1   -6,4 Kif5c
BC021452 -1,2 2,2   -3,2/-6,0 Ddx6
BG071068 1,3 -2,4   -5,0/-3,4 Gnb1
BB647052 1,3 1,8 1,5   Tex261
BG065186 -1,2/-1,3 2,3 1,4   Ywhaz
BM214109   2,6 -1,3 -2,5 Tpr
BI692255 -1,5   -1,3 -3,8 Prkwnk1
BE447456 -1,2   -1,3/-1,5 -2,7 Khdrbs1/sam68
AI788623 1,3   -1,4 -3,6/-2,7 Ramp2
AY026947 -1,3   -1,3 -2,6 Rab3c
AU080702 1,3    2,8 Mapt
BG962849 1,5    2,7 Foxp1
AK002933 1,2    2,6 Nrgn
AU067745 1,2    2,6 Elavl3
BE952057 1,2    2,5 Fscn1
U00689 1,6/1,3    2,5 Tia1
AV139249 1,3    2,4 Bsn
BB419318 -1,3    -3,5 Gda
BB283759 -1,3    -3,5 Csnk2a1
AV083741 -1,3    -3,4 Mtdh
NM_018733 -1,2    -3,0 Scn1a
NM_008066 -1,3    -2,7 Gabra2
AW060288 -1,2    -2,6 Qk
NM_008845 -1,2    -2,5 Pip5k2a
BG067003 -1,2    -2,4 Zrf2
BC005446   32,2 3,9/3,2   Cap1
NM_018798   2,4 1,3   Ubqln2
BM224327   2,4 1,3   Fcgr2b
BB538325   2,2 -1,4   Ccnd1
AV102733   1,8 -1,3   Scpep1
AW049660   -1,9/-1,8 -1,3   Nfix
AV147875   2,3/2,7/2,9   -3,1 Vim
AF363030   2,9   3,2 Ogt
AJ457190   2,3   3,4 Phospho1
NM_007881   2,1   4,1 Drpla
NM_016782   2,1   3,3 Cntnap1
BG868120   2,0   2,4 Src
NM_016789 1,2   1,7   Nptx2
AA673371 1,4/1,3/1,2   1,4   4933439C20Rik
NM_010444 1,2   1,3   Nr4a1
AK019164 -1,2   -1,5   Mpdz
BC006680 -1,2   -1,4/-1,3   Ubc
NM_016916 -1,2   -1,3   Blcap
AF370126 -1,3   -1,3   Dner
NM_011599 -1,5   -1,3   Tle1
BB429612 1,2   -1,3   Scn8a
BQ175532 -1,2   -1,3/-1,4   Ahi1