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Table 1 Differentially expressed genes in both Cln1-/- and Cln5-/- mice at 1 and 4 months of age. Double/triple values indicate multiple appearances in the gene expression data.

From: Brain gene expression profiles of Cln1 and Cln5 deficient mice unravels common molecular pathways underlying neuronal degeneration in NCL diseases

ID number

Cln1 1 mo

Cln1 4mo

Cln5 1mo

Cln5 4mo

Symbol

NM_011213

-2,2/-1,8

-3,3/-1,9

-1,3

2,6/2,5

Ptprf

BE134116

-1,5

3,8

1,7

-3,7

Ptp4a2

AF378831

-1,2

-3,7

1,6

-5,7

Gprc5b/raig2

BC023103

1,5/1,3

2,7

 

4,0

Camkk2

AI844677

-1,5

2,1

 

-6,4

Kif5c

BC021452

-1,2

2,2

 

-3,2/-6,0

Ddx6

BG071068

1,3

-2,4

 

-5,0/-3,4

Gnb1

BB647052

1,3

1,8

1,5

 

Tex261

BG065186

-1,2/-1,3

2,3

1,4

 

Ywhaz

BM214109

 

2,6

-1,3

-2,5

Tpr

BI692255

-1,5

 

-1,3

-3,8

Prkwnk1

BE447456

-1,2

 

-1,3/-1,5

-2,7

Khdrbs1/sam68

AI788623

1,3

 

-1,4

-3,6/-2,7

Ramp2

AY026947

-1,3

 

-1,3

-2,6

Rab3c

AU080702

1,3

  

2,8

Mapt

BG962849

1,5

  

2,7

Foxp1

AK002933

1,2

  

2,6

Nrgn

AU067745

1,2

  

2,6

Elavl3

BE952057

1,2

  

2,5

Fscn1

U00689

1,6/1,3

  

2,5

Tia1

AV139249

1,3

  

2,4

Bsn

BB419318

-1,3

  

-3,5

Gda

BB283759

-1,3

  

-3,5

Csnk2a1

AV083741

-1,3

  

-3,4

Mtdh

NM_018733

-1,2

  

-3,0

Scn1a

NM_008066

-1,3

  

-2,7

Gabra2

AW060288

-1,2

  

-2,6

Qk

NM_008845

-1,2

  

-2,5

Pip5k2a

BG067003

-1,2

  

-2,4

Zrf2

BC005446

 

32,2

3,9/3,2

 

Cap1

NM_018798

 

2,4

1,3

 

Ubqln2

BM224327

 

2,4

1,3

 

Fcgr2b

BB538325

 

2,2

-1,4

 

Ccnd1

AV102733

 

1,8

-1,3

 

Scpep1

AW049660

 

-1,9/-1,8

-1,3

 

Nfix

AV147875

 

2,3/2,7/2,9

 

-3,1

Vim

AF363030

 

2,9

 

3,2

Ogt

AJ457190

 

2,3

 

3,4

Phospho1

NM_007881

 

2,1

 

4,1

Drpla

NM_016782

 

2,1

 

3,3

Cntnap1

BG868120

 

2,0

 

2,4

Src

NM_016789

1,2

 

1,7

 

Nptx2

AA673371

1,4/1,3/1,2

 

1,4

 

4933439C20Rik

NM_010444

1,2

 

1,3

 

Nr4a1

AK019164

-1,2

 

-1,5

 

Mpdz

BC006680

-1,2

 

-1,4/-1,3

 

Ubc

NM_016916

-1,2

 

-1,3

 

Blcap

AF370126

-1,3

 

-1,3

 

Dner

NM_011599

-1,5

 

-1,3

 

Tle1

BB429612

1,2

 

-1,3

 

Scn8a

BQ175532

-1,2

 

-1,3/-1,4

 

Ahi1