TY - JOUR AU - Schmid, K. J. AU - Sorensen, T. R. AU - Stracke, R. AU - Torjek, O. AU - Altmann, T. AU - Mitchell-Olds, T. AU - Weisshaar, B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Large-scale identification and analysis of genome-wide single-nucleotide polymorphisms for mapping in Arabidopsis thaliana JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.728603 DO - 10.1101/gr.728603 ID - Schmid2003 ER - TY - JOUR AU - Feltus, F. A. AU - Wan, J. AU - Schulze, S. R. AU - Estill, J. C. AU - Jiang, N. AU - Paterson, A. H. PY - 2004 DA - 2004// TI - An SNP resource for rice genetics and breeding based on subspecies indica and japonica JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2479404 DO - 10.1101/gr.2479404 ID - Feltus2004 ER - TY - JOUR AU - Falque, M. AU - Decousset, L. AU - Dervins, D. AU - Jacob, A. M. AU - Joets, J. AU - Martinant, J. P. AU - Raffoux, X. AU - Ribiere, N. AU - Ridel, C. AU - Samson, D. AU - Charcosset, A. AU - Murigneux, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Linkage mapping of 1454 new maize candidate gene loci JO - Genetics VL - 170 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.104.040204 DO - 10.1534/genetics.104.040204 ID - Falque2005 ER - TY - JOUR AU - Moran, J. L. AU - Bolton, A. D. AU - Tran, P. V. AU - Brown, A. AU - Dwyer, N. D. AU - Manning, D. K. AU - Bjork, B. C. AU - Li, C. AU - Montgomery, K. AU - Siepka, S. M. AU - Vitaterna, M. H. AU - Takahashi, J. S. AU - Wiltshire, T. AU - Kwiatkowski, D. J. AU - Kucherlapati, R. AU - Beier, D. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Utilization of a whole genome SNP panel for efficient genetic mapping in the mouse JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.4563306 DO - 10.1101/gr.4563306 ID - Moran2006 ER - TY - JOUR AU - Stein, N. AU - Prasad, M. AU - Scholz, U. AU - Thiel, T. AU - Zhang, H. AU - Wolf, M. AU - Kota, R. AU - Varshney, R. K. AU - Perovic, D. AU - Grosse, I. AU - Graner, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - A 1,000-loci transcript map of the barley genome: new anchoring points for integrative grass genomics JO - Theor Appl Genet VL - 114 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0480-2 DO - 10.1007/s00122-006-0480-2 ID - Stein2007 ER - TY - JOUR AU - Troggio, M. AU - Malacarne, G. AU - Coppola, G. AU - Segala, C. AU - Cartwright, D. A. AU - Pindo, M. AU - Stefanini, M. AU - Mank, R. AU - Moroldo, M. AU - Morgante, M. AU - Grando, M. S. AU - Velasco, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - A dense SNP-based genetic linkage map of grapevine (Vitis vinifera L.) anchoring Pinot Noir BAC contigs JO - Genetics VL - 176 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.106.067462 DO - 10.1534/genetics.106.067462 ID - Troggio2007 ER - TY - JOUR AU - Lazarus, R. AU - Vercelli, D. AU - Palmer, L. J. AU - Klimecki, W. J. AU - Silverman, E. K. AU - Richter, B. AU - Riva, A. AU - Ramoni, M. AU - Martinez, F. D. AU - Weiss, S. T. AU - Kwiatkowski, D. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Single nucleotide polymorphisms in innate immunity genes: abundant variation and potential role in complex human disease JO - Immunol Rev VL - 190 UR - https://doi.org/10.1034/j.1600-065X.2002.19002.x DO - 10.1034/j.1600-065X.2002.19002.x ID - Lazarus2002 ER - TY - JOUR AU - Rafalski, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Applications of single nucleotide polymorphisms in crop genetics JO - Curr Opin Plant Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1016/S1369-5266(02)00240-6 DO - 10.1016/S1369-5266(02)00240-6 ID - Rafalski2002 ER - TY - JOUR AU - Gibbs, J. R. AU - Singleton, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Application of genome-wide single nucleotide polymorphism typing: simple association and beyond JO - PLoS Genet VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0020150 DO - 10.1371/journal.pgen.0020150 ID - Gibbs2006 ER - TY - JOUR AU - Kiyohara, C. AU - Yoshimasu, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genetic polymorphisms in the nucleotide excision repair pathway and lung cancer risk: a meta-analysis JO - Int J Med Sci VL - 4 UR - https://doi.org/10.7150/ijms.4.59 DO - 10.7150/ijms.4.59 ID - Kiyohara2007 ER - TY - JOUR AU - Salisbury, B. A. AU - Pungliya, M. AU - Choi, J. Y. AU - Jiang, R. AU - Sun, X. J. AU - Stephens, J. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - SNP and haplotype variation in the human genome JO - Mutat Res VL - 526 UR - https://doi.org/10.1016/S0027-5107(03)00014-9 DO - 10.1016/S0027-5107(03)00014-9 ID - Salisbury2003 ER - TY - JOUR AU - McEvoy, B. AU - Beleza, S. AU - Shriver, M. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - The genetic architecture of normal variation in human pigmentation: an evolutionary perspective and model JO - Hum Mol Genet VL - 15 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddl217 DO - 10.1093/hmg/ddl217 ID - McEvoy2006 ER - TY - JOUR AU - Altschuler, D. AU - Brooks, L. D. AU - Chakravarti, A. AU - Collins, F. S. AU - Daly, M. J. AU - Donnelly, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - International HapMap Consortium. A haplotype map of the human genome JO - Nature VL - 437 UR - https://doi.org/10.1038/nature04226 DO - 10.1038/nature04226 ID - Altschuler2005 ER - TY - JOUR AU - Fung, H. C. AU - Scholz, S. AU - Matarin, M. AU - Simon-Sanchez, J. AU - Hernandez, D. AU - Britton, A. AU - Gibbs, J. R. AU - Langefeld, C. AU - Stiegert, M. L. AU - Schymick, J. AU - Okun, M. S. AU - Mandel, R. J. AU - Fernandez, H. H. AU - Foote, K. D. AU - Rodriguez, R. L. AU - Peckham, E. AU - De Vrieze, F. W. AU - Gwinn-Hardy, K. AU - Hardy, J. A. AU - Singleton, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genome-wide genotyping in Parkinson's disease and neurologically normal controls: first stage analysis and public release of data JO - Lancet Neurol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1016/S1474-4422(06)70578-6 DO - 10.1016/S1474-4422(06)70578-6 ID - Fung2006 ER - TY - JOUR AU - Zhu, Y. L. AU - Song, Q. J. AU - Hyten, D. L. AU - Van Tassell, C. P. AU - Matukumalli, L. K. AU - Grimm, D. R. AU - Hyatt, S. M. AU - Fickus, E. W. AU - Young, N. D. AU - Cregan, P. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Single-nucleotide polymorphisms in soybean JO - Genetics VL - 163 ID - Zhu2003 ER - TY - JOUR AU - Cordeiro, G. M. AU - Eliott, F. AU - McIntyre, C. L. AU - Casu, R. E. AU - Henry, R. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Characterisation of single nucleotide polymorphisms in sugarcane ESTs JO - Theor Appl Genet VL - 113 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0300-8 DO - 10.1007/s00122-006-0300-8 ID - Cordeiro2006 ER - TY - JOUR AU - Dantec, L. L. AU - Chagne, D. AU - Pot, D. AU - Cantin, O. AU - Garnier-Gere, P. AU - Bedon, F. AU - Frigerio, J. M. AU - Chaumeil, P. AU - Leger, P. AU - Garcia, V. AU - Laigret, F. AU - De Daruvar, A. AU - Plomion, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Automated SNP detection in expressed sequence tags: statistical considerations and application to maritime pine sequences JO - Plant Mol Biol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1023/B:PLAN.0000036376.11710.6f DO - 10.1023/B:PLAN.0000036376.11710.6f ID - Dantec2004 ER - TY - JOUR AU - Pavy, N. AU - Parsons, L. S. AU - Paule, C. AU - Mackay, J. AU - Bousquet, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Automated SNP detection from a large collection of white spruce expressed sequences: contributing factors and approaches for the categorization of SNPs JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-174 DO - 10.1186/1471-2164-7-174 ID - Pavy2006 ER - TY - CHAP AU - Bousquet, J. AU - Isabel, N. AU - Pelgas, B. AU - Cottrell, J. AU - Rungis, D. AU - Ritland, K. ED - Kole, C. PY - 2007 DA - 2007// BT - Chapter 3 Spruce. Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants ID - Bousquet2007 ER - TY - JOUR AU - Pelgas, B. AU - Isabel, N. AU - Bousquet, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Efficient screening for expressed sequence tag polymorphisms (ESTPs) by DNA pool sequencing and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) in spruces JO - Mol Breed VL - 13 UR - https://doi.org/10.1023/B:MOLB.0000022528.01656.c8 DO - 10.1023/B:MOLB.0000022528.01656.c8 ID - Pelgas2004 ER - TY - JOUR AU - Rungis, D. AU - Hamberger, B. AU - Berube, Y. AU - Wilkin, J. AU - Bohlmann, J. AU - Ritland, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Efficient genetic mapping of single nucleotide polymorphisms based upon DNA mismatch digestion JO - Mol Breed VL - 16 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-005-3424-7 DO - 10.1007/s11032-005-3424-7 ID - Rungis2005 ER - TY - JOUR AU - Kirst, M. AU - Johnson, A. F. AU - Baucom, C. AU - Ulrich, E. AU - Hubbard, K. AU - Staggs, R. AU - Paule, C. AU - Retzel, E. AU - Whetten, R. AU - Sederoff, R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Apparent homology of expressed genes from wood-forming tissues of loblolly pine (Pinus taeda L.) with Arabidopsis thaliana JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 100 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1132171100 DO - 10.1073/pnas.1132171100 ID - Kirst2003 ER - TY - JOUR AU - Cairney, J. AU - Zheng, L. AU - Cowels, A. AU - Hsiao, J. AU - Zismann, V. AU - Liu, J. AU - Ouyang, S. AU - Thibaud-Nissen, F. AU - Hamilton, J. AU - Childs, K. AU - Pullman, G. S. AU - Zhang, Y. AU - Oh, C. T. AU - Buell, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Expressed Sequence Tags from loblolly pine embryos reveal similarities with angiosperm embryogenesis JO - Plant Mol Biol VL - 62 UR - https://doi.org/10.1007/s11103-006-9035-9 DO - 10.1007/s11103-006-9035-9 ID - Cairney2006 ER - TY - JOUR AU - Lorenz, W. W. AU - Sun, F. AU - Liang, C. AU - Kolychev, D. AU - Wang, H. AU - Zhao, X. AU - Cordonnier-Pratt, M. M. AU - Pratt, L. H. AU - Dean, J. F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Water stress-responsive genes in loblolly pine (Pinus taeda) roots identified by analyses of expressed sequence tag libraries JO - Tree Physiol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/treephys/26.1.1 DO - 10.1093/treephys/26.1.1 ID - Lorenz2006 ER - TY - JOUR AU - Liang, C. AU - Wang, G. AU - Liu, L. AU - Ji, G. AU - Fang, L. AU - Liu, Y. AU - Carter, K. AU - Webb, J. S. AU - Dean, J. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - ConiferEST: an integrated bioinformatics system for data reprocessing and mining of conifer expressed sequence tags (ESTs) JO - BMC Genomics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-8-134 DO - 10.1186/1471-2164-8-134 ID - Liang2007 ER - TY - JOUR AU - Syvänen, A. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Toward genome-wide SNP genotyping JO - Nat Genet VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/ng1558 DO - 10.1038/ng1558 ID - Syvänen2005 ER - TY - JOUR AU - Kwok, P. Y. PY - 2001 DA - 2001// TI - Methods for genotyping single nucleotide polymorphisms JO - Ann Rev Hum Genet VL - 2 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.genom.2.1.235 DO - 10.1146/annurev.genom.2.1.235 ID - Kwok2001 ER - TY - JOUR AU - Steemers, F. J. AU - Chang, W. AU - Lee, G. AU - Barker, D. L. AU - Shen, R. AU - Gunderson, K. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Whole-genome genotyping with the single-base extension assay JO - Nat Methods VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth842 DO - 10.1038/nmeth842 ID - Steemers2006 ER - TY - JOUR AU - Shen, R. AU - Fan, J. B. AU - Campbell, D. AU - Chang, W. AU - Chen, J. AU - Doucet, D. AU - Yeakley, J. AU - Bibikova, M. AU - Wickham Garcia, E. AU - McBride, C. AU - Steemers, F. AU - Garcia, F. AU - Kermani, B. G. AU - Gunderson, K. AU - Oliphant, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - High-throughput SNP genotyping on universal bead arrays JO - Mutat Res VL - 573 UR - https://doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2004.07.022 DO - 10.1016/j.mrfmmm.2004.07.022 ID - Shen2005 ER - TY - JOUR AU - Fan, J. B. AU - Oliphant, A. AU - Shen, R. AU - Kermani, B. G. AU - Garcia, F. AU - Gunderson, K. L. AU - Hansen, M. AU - Steemers, F. AU - Butler, S. L. AU - Deloukas, P. AU - Galver, L. AU - Hunt, S. AU - McBride, C. AU - Bibikova, M. AU - Rubano, T. AU - Chen, J. AU - Wickham, E. AU - Doucet, D. AU - Chang, W. AU - Campbell, D. AU - Zhang, B. AU - Kruglyak, S. AU - Bentley, D. AU - Haas, J. AU - Rigault, P. AU - Zhou, L. AU - Stuelpnagel, J. AU - Chee, M. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Highly parallel SNP genotyping JO - Cold Spring Harb Symp Quant Biol VL - 68 UR - https://doi.org/10.1101/sqb.2003.68.69 DO - 10.1101/sqb.2003.68.69 ID - Fan2003 ER - TY - JOUR AU - Gunderson, K. L. AU - Kuhn, K. M. AU - Steemers, F. J. AU - Ng, P. AU - Murray, S. S. AU - Shen, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Whole-genome genotyping of haplotype tag single nucleotide polymorphisms JO - Pharmacogenomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.2217/14622416.7.4.641 DO - 10.2217/14622416.7.4.641 ID - Gunderson2006 ER - TY - JOUR AU - Rostoks, N. AU - Ramsay, L. AU - MacKenzie, K. AU - Cardle, L. AU - Bhat, P. R. AU - Roose, M. L. AU - Svensson, J. T. AU - Stein, N. AU - Varshney, R. K. AU - Marshall, D. F. AU - Graner, A. AU - Close, T. J. AU - Waugh, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Recent history of artificial outcrossing facilitates whole-genome association mapping in elite inbred crop varieties JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0606133103 DO - 10.1073/pnas.0606133103 ID - Rostoks2006 ER - TY - JOUR AU - Hayes, P. AU - Szucs, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Disequilibrium and association in barley: Thinking outside the glass JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0609405103 DO - 10.1073/pnas.0609405103 ID - Hayes2006 ER - TY - JOUR AU - Choi, I. Y. AU - Hyten, D. L. AU - Matukumalli, L. K. AU - Song, Q. AU - Chaky, J. M. AU - Quigley, C. V. AU - Chase, K. AU - Lark, K. G. AU - Reiter, R. S. AU - Yoon, M. S. AU - Hwang, E. Y. AU - Yi, S. I. AU - Young, N. D. AU - Shoemaker, R. C. AU - van Tassell, C. P. AU - Specht, J. E. AU - Cregan, P. B. PY - 2007 DA - 2007// TI - A soybean transcript map: gene distribution, haplotype and SNP analysis JO - Genetics VL - 176 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.107.070821 DO - 10.1534/genetics.107.070821 ID - Choi2007 ER - TY - STD TI - Wheat SNP database. [http://wheat.pw.usda.gov/SNP/new/index.shtml] UR - http://wheat.pw.usda.gov/SNP/new/index.shtml ID - ref35 ER - TY - STD TI - Poplar Biofuels Genome Project. [http://dendrome.ucdavis.edu/pbgp/about.html] UR - http://dendrome.ucdavis.edu/pbgp/about.html ID - ref36 ER - TY - JOUR AU - Ahuja, M. R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Recent advances in molecular genetics of forest trees JO - Euphytica VL - 121 UR - https://doi.org/10.1023/A:1012226319449 DO - 10.1023/A:1012226319449 ID - Ahuja2001 ER - TY - JOUR AU - Kamm, A. AU - Doudrick, R. L. AU - Heslop-Harrison, J. S. AU - Schmidt, T. PY - 1996 DA - 1996// TI - The genomic and physical organization of Ty1-copia-like sequences as a component of large genomes in Pinus elliottii var. elliotti and other gymnosperms JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 93 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.93.7.2708 DO - 10.1073/pnas.93.7.2708 ID - Kamm1996 ER - TY - JOUR AU - Murray, B. G. PY - 1998 DA - 1998// TI - Nuclear DNA amounts in gymnosperms JO - Ann Bot VL - 82 UR - https://doi.org/10.1006/anbo.1998.0764 DO - 10.1006/anbo.1998.0764 ID - Murray1998 ER - TY - JOUR AU - Pavy, N. AU - Paule, C. AU - Parsons, L. AU - Crow, J. A. AU - Morency, M. J. AU - Cooke, J. AU - Johnson, J. E. AU - Noumen, E. AU - Guillet-Claude, C. AU - ButterWeld, Y. AU - Barber, S. AU - Yang, G. AU - Liu, J. AU - Stott, J. AU - Kirkpatrick, R. AU - Siddiqui, A. AU - Holt, R. AU - Marra, M. AU - Seguin, A. AU - Retzel, E. AU - Bousquet, J. AU - MacKay, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Generation, annotation, analysis and database integration of 16,500 white spruce EST clusters JO - BMC Genomics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-144 DO - 10.1186/1471-2164-6-144 ID - Pavy2005 ER - TY - JOUR AU - Pelgas, B. AU - Beauseigle, S. AU - Acheré, V. AU - Jeandroz, S. AU - Bousquet, J. AU - Isabel, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Comparative genome mapping among Picea glauca, P. mariana × P. rubens and correspondence with other Pinaceae JO - Theor Appl Genet VL - 113 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0354-7 DO - 10.1007/s00122-006-0354-7 ID - Pelgas2006 ER - TY - JOUR AU - Pelgas, B. AU - Bousquet, J. AU - Beauseigle, S. AU - Isabel, N. PY - 2005 DA - 2005// TI - A composite linkage map from two crosses for the species complex Picea mariana [Mill.] B.S.P. P. rubens (Sarg.) and analysis of synteny with other Pinaceae JO - Theor Appl Genet VL - 111 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-005-0068-2 DO - 10.1007/s00122-005-0068-2 ID - Pelgas2005 ER - TY - JOUR AU - Fuchs, J. AU - Brandes, A. AU - Schubert, I. PY - 1995 DA - 1995// TI - Telomere sequence localization and karyotype evolution in higher plants JO - P1 Syst Evol VL - 196 UR - https://doi.org/10.1007/BF00982962 DO - 10.1007/BF00982962 ID - Fuchs1995 ER - TY - JOUR AU - Nkongolo, K. K. PY - 1996 DA - 1996// TI - Chromosome analysis and DNA homology in three Picea species, P. mariana, P. rubens, and P. glauca (Pinaceae) JO - P1 Syst Evol VL - 203 UR - https://doi.org/10.1007/BF00985235 DO - 10.1007/BF00985235 ID - Nkongolo1996 ER - TY - JOUR AU - Bouillé, M. AU - Bousquet, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Trans-species shared polymorphisms at orthologous nuclear gene loci among distant species in the conifer Picea (Pinaceae): Implications for the long-term maintenance of genetic diversity in trees JO - Am J Bot VL - 92 UR - https://doi.org/10.3732/ajb.92.1.63 DO - 10.3732/ajb.92.1.63 ID - Bouillé2005 ER - TY - CHAP AU - Rozen, S. AU - Skaletsky, H. J. ED - Krawetz, S. ED - Misener, S. PY - 2000 DA - 2000// TI - Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers BT - Bioinformatics Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology PB - Humana Press CY - Totowa, NJ ID - Rozen2000 ER - TY - STD TI - Illumina Inc. [http://www.illumina.com] UR - http://www.illumina.com ID - ref47 ER - TY - JOUR AU - Grattapaglia, D. AU - Sederoff, R. PY - 1994 DA - 1994// TI - Genetic linkage maps of Eucalyptus grandis and Eucalyptus urophylla using a pseudo-testcross: mapping strategy and RAPD markers JO - Genetics VL - 137 ID - Grattapaglia1994 ER - TY - JOUR AU - Stam, P. PY - 1993 DA - 1993// TI - Construction of integrated genetic linkage maps by means of a new computer package: JOINMAP JO - Plant J VL - 3 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.1993.00739.x DO - 10.1111/j.1365-313X.1993.00739.x ID - Stam1993 ER - TY - CHAP AU - Van Ooijen, J. W. AU - Voorrips, R. E. PY - 2001 DA - 2001// BT - Joinmap 3.0, Software for the calculation of genetic linkage maps PB - Plant Research International CY - Wageningen ID - Van Ooijen2001 ER - TY - CHAP AU - Van Ooijen, J. W. PY - 2006 DA - 2006// BT - Joinmap® 4, software for the calculation of genetic maps in experimental populations PB - Kyazma B.V. CY - Wageningen, Netherlands ID - Van Ooijen2006 ER - TY - JOUR AU - Kosambi, D. PY - 1944 DA - 1944// TI - The estimation of map distances from recombination values JO - Ann Eugen VL - 12 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x DO - 10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x ID - Kosambi1944 ER - TY - JOUR AU - Hulbert, S. AU - Ilott, T. AU - Legg, E. J. AU - Lincoln, S. AU - Lander, E. AU - Michelmore, R. PY - 1988 DA - 1988// TI - Genetic analysis of the fungus Bremia lactucae, using restriction fragment length polymorphism JO - Genetics VL - 120 ID - Hulbert1988 ER - TY - JOUR AU - Lange, K. AU - Boehnke, M. PY - 1982 DA - 1982// TI - How many polymorphic genes will it take to span the human genome? JO - Am J Hum Genet VL - 24 ID - Lange1982 ER - TY - JOUR AU - Perry, D. J. AU - Bousquet, J. PY - 1998 DA - 1998// TI - Sequence-tagged-site (STS) markers of arbitrary genes: the utility of black spruce-derived STS primers in other conifers JO - Theor Appl Genet VL - 97 UR - https://doi.org/10.1007/s001220050950 DO - 10.1007/s001220050950 ID - Perry1998 ER - TY - JOUR AU - Pavy, N. AU - Johnson, J. J. AU - Crow, J. A. AU - Paule, C. AU - Kunau, T. AU - MacKay, J. AU - Retzel, E. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - ForestTreeDB: a database dedicated to the mining of tree transcriptomes JO - Nucl Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkl882 DO - 10.1093/nar/gkl882 ID - Pavy2007 ER - TY - STD TI - Illumina Technology spotlight: Illumina Gencall data analysis software. Available via Illumina. [http://www.illumina.com] UR - http://www.illumina.com ID - ref57 ER - TY - CHAP AU - Sonstegard, T. PY - 2007 DA - 2007// BT - Making a cow jump over the moon: development of a bovine SNP assay PB - Plant Animal Genome Conference XV CY - San Diego ID - Sonstegard2007 ER - TY - JOUR PY - 2004 DA - 2004// TI - Enhancing linkage analysis of complex disorders: an evaluation of high-density genotyping JO - Human Molecular Genetics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddh202 DO - 10.1093/hmg/ddh202 ID - ref59 ER - TY - JOUR AU - Edenberg, H. J. AU - Bierut, L. J. AU - Boyce, P. AU - Cao, M. AU - Cawley, S. AU - Chiles, R. AU - Doheny, K. F. AU - Hansen, M. AU - Hinrichs, T. AU - Jones, K. AU - Kelleher, M. AU - Kennedy, G. C. AU - Liu, G. AU - Marcus, G. AU - McBride, C. AU - Murray, S. S. AU - Oliphant, A. AU - Pettengill, J. AU - Porjesz, B. AU - Pugh, E. W. AU - Rice, J. P. AU - Rubano, T. AU - Shannon, S. AU - Steeke, R. AU - Tischfield, J. A. AU - Tsai, Y. Y. AU - Zhang, C. AU - Begleiter, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Description of the data from the Collaborative Study on the Genetics of Alcoholism (COGA) and single-nucleotide polymorphism genotyping for Genetic Analysis Workshop 14 JO - BMC Genetics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2156-6-S1-S2 DO - 10.1186/1471-2156-6-S1-S2 ID - Edenberg2005 ER - TY - JOUR AU - Garcìa-Closas, M. AU - Malats, N. AU - Real, F. X. AU - Yeager, M. AU - Welch, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Large-scale evaluation of candidate genes for cancer identifies associations between VEGF polymorphisms and bladder cancer risk JO - PLoS Genet VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0030029 DO - 10.1371/journal.pgen.0030029 ID - Garcìa-Closas2007 ER - TY - JOUR AU - Montpetit, A. AU - Nelis, M. AU - Laflamme, P. AU - Magi, R. AU - Ke, X. AU - Remm, M. AU - Cardon, L. AU - Hudson, T. J. AU - Metspalu, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - An evaluation of the performance of tag SNPs derived from HapMap in a Caucasian population JO - PloS Genet VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0020027 DO - 10.1371/journal.pgen.0020027 ID - Montpetit2006 ER - TY - JOUR AU - Khatkar, M. S. AU - Collins, A. AU - Cavanagh, J. A. AU - Hawken, R. J. AU - Hobbs, M. AU - Zenger, K. R. AU - Barris, W. AU - McClintock, A. E. AU - Thomson, P. C. AU - Nicholas, F. W. AU - Raadsma, H. W. PY - 2006 DA - 2006// TI - A first-generation metric linkage disequilibrium map of bovine c hromosome 6 JO - Genetics VL - 174 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.106.060418 DO - 10.1534/genetics.106.060418 ID - Khatkar2006 ER - TY - JOUR AU - Schranz, M. E. AU - Windsor, A. J. AU - Song, B. H. AU - Lawton-Rauh, A. AU - Mitchell-Olds, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Comparative Genetic Mapping in Boechera stricta (Brassicaceae) JO - Plant Physiol VL - 144 UR - https://doi.org/10.1104/pp.107.096685 DO - 10.1104/pp.107.096685 ID - Schranz2007 ER - TY - JOUR AU - Perry, D. J. AU - Furnier, G. R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Pinus banksiana has at least seven expressed alcohol dehydrogenase genes in two linked groups JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 93 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.93.23.13020 DO - 10.1073/pnas.93.23.13020 ID - Perry1996 ER - TY - JOUR AU - Guillet-Claude, C. AU - Isabel, N. AU - Pelgas, B. AU - Bousquet, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - The evolutionary implications of knox-I gene duplications in conifers: correlated evidence from phylogeny, gene mapping, and analysis of functional divergence JO - Mol Biol Evol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msh235 DO - 10.1093/molbev/msh235 ID - Guillet-Claude2004 ER - TY - JOUR AU - Bedon, F. AU - Grima-Pettenati, J. AU - Mackay, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Conifer R2R3-MYB transcription factors: sequence analyses and gene expression in wood-forming tissues of white spruce (Picea glauca) JO - BMC Plant Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-7-17 DO - 10.1186/1471-2229-7-17 ID - Bedon2007 ER - TY - JOUR AU - Temesgen, B. AU - Brown, G. R. AU - Harry, D. E. AU - Kinlaw, C. S. AU - Sewell, M. M. AU - Neale, D. B. PY - 2001 DA - 2001// TI - Genetic mapping of expressed sequence tag polymorphism (ESTP) markers in loblolly pine (Pinus taeda L.) JO - Theor Appl Genet VL - 102 UR - https://doi.org/10.1007/s001220051695 DO - 10.1007/s001220051695 ID - Temesgen2001 ER - TY - JOUR AU - Brown, G. R. AU - Kadel, E. E. AU - Bassoni, D. L. AU - Kiehne, K. L. AU - Temesgen, B. AU - van Buijtenen, J. P. AU - Sewell, M. M. AU - Marshall, K. A. AU - Neale, D. B. PY - 2001 DA - 2001// TI - Anchored reference loci in loblolly pine (Pinus taeda L.) for integrating pine genomics JO - Genetics VL - 159 ID - Brown2001 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Lalanne, C. AU - Madur, D. AU - Kumar, S. AU - Frigério, J. -. M. AU - Krier, C. AU - Decroocq, S. AU - Savouré, A. AU - Bou-Dagher-Kharrat, M. AU - Bertocchi, E. AU - Brach, J. AU - Plomion, C. PY - 2002 DA - 2002// TI - A high density genetic map of martime pine based on AFLPs JO - Ann For Sci VL - 59 UR - https://doi.org/10.1051/forest:2002048 DO - 10.1051/forest:2002048 ID - Chagné2002 ER - TY - JOUR AU - Acheré, V. AU - Faivre Rampant, P. AU - Jeandroz, S. AU - Besnard, G. AU - Markussen, T. AU - Aragones, A. AU - Fladung, M. AU - Ritter, E. AU - Favre, J. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - A full saturated linkage map of Picea abies including AFLP, SSR, ESTP, 5S rDNA and morphological markers JO - Theor Appl Genet VL - 108 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-004-1595-y DO - 10.1007/s00122-004-1595-y ID - Acheré2004 ER - TY - BOOK AU - Liu, B. H. PY - 1998 DA - 1998// TI - Statistical Genomics: Linkage Mapping and QTL Analysis PB - CRC CY - New York ID - Liu1998 ER - TY - JOUR AU - Sewell, M. M. AU - Sherman, B. K. AU - Neale, D. B. PY - 1999 DA - 1999// TI - A consensus map for loblolly pine (Pinus taeda L.). I. Construction and integration of individual linkage maps from two outbred three-generation pedigrees JO - Genetics VL - 151 ID - Sewell1999 ER - TY - JOUR AU - Tani, N. AU - Takahashi, T. AU - Iwata, H. AU - Mukai, Y. AU - Ujino-Ihara, T. AU - Matsumoto, A. AU - Yoshimura, K. AU - Yoshimaru, H. AU - Murai, M. AU - Nagasaka, K. AU - Tsumura, Y. PY - 2003 DA - 2003// TI - A consensus linkage map for sugi (Cryptomeria japonica) from two pedigrees, based on microsatellites and expressed sequence tags JO - Genetics VL - 165 ID - Tani2003 ER - TY - JOUR AU - Gogarten, J. P. AU - Olendzenski, L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Orthologs, paralogs and genome comparisons JO - Curr Opin Genet Dev VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/S0959-437X(99)00029-5 DO - 10.1016/S0959-437X(99)00029-5 ID - Gogarten1999 ER - TY - JOUR AU - Di Gaspero, G. AU - Cipriani, G. AU - Adam-Blondon, A. F. AU - Testolin, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Linkage maps of grapevine displaying the chromosomal locations of 420 microsatellite markers and 82 markers for R-gene candidates JO - Theor Appl Genet VL - 114 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-007-0516-2 DO - 10.1007/s00122-007-0516-2 ID - Di Gaspero2007 ER - TY - JOUR AU - Hulsen, T. AU - de Vlieg, J. AU - Leunissen, J. A. AU - Groenen, P. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Testing statistical significance scores of sequence comparison methods with structure similarity JO - BMC Bioinformatics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-444 DO - 10.1186/1471-2105-7-444 ID - Hulsen2006 ER - TY - STD TI - Arborea project. [http://www.arborea.ulaval.ca] UR - http://www.arborea.ulaval.ca ID - ref78 ER -