Chloroplast genome sequencing analysis of Heterosigma akashiwo CCMP452 (West Atlantic) and NIES293 (West Pacific) strains

Table 5 Conservation of gene-associated repeats

				Cytochrome Associated Genes
Organism	rbc S	rps 10	atp A	pet A	B/D	F	G	J	L	M/N	css A
Heterosigma akashiwo CCMP452	IR	T/IR	T	IR	IR	IR	IR	IR	-	IR^#	IR
Heterosigma akashiwo NIES293	IR	-	T	IR	IR	IR	IR	IR	-	IR^#	IR
(C) Odontella sinensis	IR	IR	IR	IR/T*	-	IR/T*	IR/IR	0	-	IR^#	-
(C) Thalassiosira pseudonana	-	T/IR	IR/T	IR	-	-	-	0	-	IR	-
(P) Phaeodactylum tricornutum	IR	IR	IR	IR*	IR	IR*	-	0	IR^#	-	-
Emiliana huxleyi	IR	IR	-	IR	-	0	IR	0	-	-	IR
Guillardia theta	IR	T/IR*	-	IR	T	T*	IR^#	0	-	-	IR^#
(F) Graciliaria tenuistipitata	-	IR*	-	-	IR	IR*	-	IR	0	-	-
(F) Porphyra purpurea	-	IR	IR	-	IR	-	IR	IR	-	-	-
(F) Porphyra yezoensis	IR	IR	IR	-	-	-	IR/T	IR	-	-	-
(B) Cyanidium caldarium	IR	-	-	-	-	T	-	-	0	-	-
(B) Cyanidioschyzon merolae	IR	-	T/T	T	-	T^#	-	-	-	-	T/T
Cyanophora paradoxa	IR	IR	IR	IR	IR	IR	IR	0	IR	IR	IR

IR: inverted repeat; T: tandem repeat; – no repeat; 0 gene absent from cpDNA ; * shared repeat; # located 5' to the gene. All other repeats are 3' to the gene.

ISSN: 1471-2164