Genome-wide analysis of the R2R3-MYB transcription factor genes in Chinese cabbage (Brassica rapa ssp. pekinensis) reveals their stress and hormone responsive patterns

Wang, Zhen; Tang, Jun; Hu, Rong; Wu, Peng; Hou, Xi-Lin; Song, Xiao-Ming; Xiong, Ai-Sheng

doi:10.1186/s12864-015-1216-y

Table 1 The selection and divergence of R2R3 type MYB duplication genes in Chinese cabbage

From: Genome-wide analysis of the R2R3-MYB transcription factor genes in Chinese cabbage (Brassica rapa ssp. pekinensis) reveals their stress and hormone responsive patterns

Duplication pair	Duplicated gene 1			Duplicated gene 2			Ka	Ks	Ka/Ks	Purification selection	Divergence time (MYA)
Duplication pair	Gene name	Chromosome	Subgenome	Gene name	Chromosome	Subgenome	Ka	Ks	Ka/Ks	Purification selection	Divergence time (MYA)
BrMYB1-BrMYB56	BrMYB1	A01	LF	BrMYB56	A02	MF1	0.45	2.35	0.19	YES	7.83
BrMYB3-BrMYB91	BrMYB3	A01	LF	BrMYB91	A03	MF2	0.2	0.93	0.22	YES	3.11
BrMYB8-BrMYB99	BrMYB8	A01	LF	BrMYB99	A03	MF1	0.09	0.28	0.33	YES	0.93
BrMYB9-BrMYB100	BrMYB9	A01	LF	BrMYB100	A03	MF1	0.17	0.45	0.38	YES	1.49
BrMYB4R1-BrMYB4R2	BrMYB4R1	A01	LF	BrMYB4R2	A03	MF1	0.1	0.25	0.41	YES	0.84
BrMYB4-BrMYB102	BrMYB4	A01	LF	BrMYB102	A03	MF1	0.24	0.37	0.65	YES	1.23
BrMYB3-BrMYB103	BrMYB3	A01	LF	BrMYB103	A03	MF1	0.09	0.55	0.17	YES	1.83
BrMYB9-BrMYB73	BrMYB9	A01	LF	BrMYB73	A03	MF1	0.25	0.79	0.32	YES	2.64
BrMYB7-BrMYB98	BrMYB7	A01	LF	BrMYB98	A03	MF1	0.08	0.48	0.18	YES	1.59
BrMYB21-BrMYB133	BrMYB21	A01	MF1	BrMYB133	A05	LF	0.06	0.23	0.27	YES	0.76
BrMYB22-BrMYB134	BrMYB22	A01	MF1	BrMYB134	A05	LF	0.08	0.21	0.38	YES	0.68
BrMYB14-BrMYB125	BrMYB14	A01	MF1	BrMYB125	A05	LF	0.08	0.24	0.33	YES	0.81
BrMYB1-BrMYB149	BrMYB1	A01	LF	BrMYB149	A06	LF	0.52	2.61	0.2	YES	8.72
BrMYB3-BrMYB163	BrMYB3	A01	LF	BrMYB163	A06	MF1	0.34	3.85	0.09	YES	12.83
BrMYB4R1-BrMYB4R4	BrMYB4R1	A01	LF	BrMYB4R4	A08	MF2	0.1	0.27	0.36	YES	0.89
BrMYB4-BrMYB198	BrMYB4	A01	LF	BrMYB198	A08	MF2	0.06	0.39	0.16	YES	1.29
BrMYB7-BrMYB196	BrMYB7	A01	LF	BrMYB196	A08	MF2	0.09	0.42	0.21	YES	1.39
BrMYB8-BrMYB197	BrMYB8	A01	LF	BrMYB197	A08	MF2	0.09	0.31	0.27	YES	1.04
BrMYB7-BrMYB222	BrMYB7	A01	LF	BrMYB222	A09	LF	0.2	1.47	0.13	YES	4.91
BrMYB24-BrMYB16	BrMYB24	A02	MF2	BrMYB16	A01	MF1	0.62	2.23	0.28	YES	7.43
BrMYB36-BrMYB72	BrMYB36	A02	MF2	BrMYB72	A03	MF1	0.08	0.34	0.23	YES	1.15
BrMYB48-BrMYB155	BrMYB48	A02	MF1	BrMYB155	A06	LF	0.11	0.2	0.54	YES	0.67
BrMYB40-BrMYB142	BrMYB40	A02	MF1	BrMYB142	A06	LF	0.32	1.09	0.3	YES	3.63
BrMYB39-BrMYB184	BrMYB39	A02	MF1	BrMYB184	A07	LF	0.05	0.28	0.19	YES	0.93
BrMYB40-BrMYB185	BrMYB40	A02	MF1	BrMYB185	A07	LF	0.1	0.29	0.35	YES	0.97
BrMYB43-BrMYB189	BrMYB43	A02	MF1	BrMYB189	A07	LF	0.07	0.33	0.21	YES	1.1
BrMYB39-BrMYB204	BrMYB39	A02	MF1	BrMYB204	A08	MF1	0.23	1.93	0.12	YES	6.45
BrMYB40-BrMYB203	BrMYB40	A02	MF1	BrMYB203	A08	MF1	0.27	1.01	0.27	YES	3.38
BrMYB41-BrMYB202	BrMYB41	A02	MF1	BrMYB202	A08	MF1	0.38	1.92	0.2	YES	6.42
BrMYB56-BrMYB218	BrMYB56	A02	MF1	BrMYB218	A09	MF2	0.08	0.29	0.27	YES	0.95
BrMYB48-BrMYB212	BrMYB48	A02	MF1	BrMYB212	A09	MF2	0.12	0.3	0.41	YES	0.99
BrMYB39-BrMYB233	BrMYB39	A02	MF1	BrMYB233	A09	MF2	0.25	3.41	0.07	YES	11.36
BrMYB85-BrMYB18	BrMYB85	A03	MF2	BrMYB18	A01	MF1	0.09	0.31	0.3	YES	1.04
BrMYB97-BrMYB6	BrMYB97	A03	MF1	BrMYB6	A01	LF	0.07	0.36	0.2	YES	1.21
BrMYB94-BrMYB11	BrMYB94	A03	MF2	BrMYB11	A01	MF1	0.11	0.44	0.25	YES	1.45
BrMYB88-BrMYB13	BrMYB88	A03	MF2	BrMYB13	A01	MF1	0.09	0.38	0.24	YES	1.26
BrMYB90-BrMYB12	BrMYB90	A03	MF2	BrMYB12	A01	MF1	0.09	0.25	0.36	YES	0.84
BrMYB63-BrMYB22	BrMYB63	A03	MF1	BrMYB22	A01	MF1	0.2	1.3	0.16	YES	4.33
BrMYB64-BrMYB21	BrMYB64	A03	MF1	BrMYB21	A01	MF1	0.15	0.78	0.2	YES	2.59
BrMYB96-BrMYB5	BrMYB96	A03	MF1	BrMYB5	A01	LF	0.09	0.31	0.3	YES	1.04
BrMYB3R6-BrMYB3R2	BrMYB3R6	A03	MF2	BrMYB3R2	A01	MF1	0.18	0.36	0.5	YES	1.19
BrMYB57-BrMYB3R1	BrMYB57	A03	MF1	BrMYB3R1	A01	MF1	0.44	2.07	0.21	YES	6.91
BrMYB68-BrMYB32	BrMYB68	A03	MF1	BrMYB32	A02	MF2	0.11	0.25	0.45	YES	0.84
BrMYB69-BrMYB33	BrMYB69	A03	MF1	BrMYB33	A02	MF2	0.06	0.23	0.25	YES	0.76
BrMYB93-BrMYB54	BrMYB93	A03	LF	BrMYB54	A02	MF1	0.1	0.39	0.26	YES	1.31
BrMYB92-BrMYB52	BrMYB92	A03	LF	BrMYB52	A02	MF1	0.14	0.38	0.37	YES	1.27
BrMYB57-BrMYB24	BrMYB57	A03	MF1	BrMYB24	A02	MF2	0.06	0.32	0.19	YES	1.07
BrMYB59-BrMYB25	BrMYB59	A03	MF1	BrMYB25	A02	MF2	0.08	0.8	0.1	YES	2.66
BrMYB66-BrMYB31	BrMYB66	A03	MF1	BrMYB31	A02	MF2	0.04	0.3	0.12	YES	1
BrMYB59-BrMYB51	BrMYB59	A03	MF1	BrMYB51	A02	MF1	0.43	3.27	0.13	YES	10.88
BrMYB60-BrMYB26	BrMYB60	A03	MF1	BrMYB26	A02	MF2	0.11	0.31	0.35	YES	1.02
BrMYB63-BrMYB28	BrMYB63	A03	MF1	BrMYB28	A02	MF2	0.08	0.44	0.19	YES	1.46
BrMYB58-BrMYB93	BrMYB58	A03	MF1	BrMYB93	A03	LF	0.31	1.24	0.25	YES	4.15
BrMYB78-BrMYB115	BrMYB78	A03	MF2	BrMYB115	A04	MF1	0.05	0.29	0.16	YES	0.96
BrMYB77-BrMYB121	BrMYB77	A03	MF2	BrMYB121	A05	LF	0.04	0.44	0.09	YES	1.47
BrMYB78-BrMYB120	BrMYB78	A03	MF2	BrMYB120	A05	LF	0.04	0.25	0.15	YES	0.84
BrMYB79-BrMYB117	BrMYB79	A03	MF2	BrMYB117	A05	LF	0.15	0.29	0.51	YES	0.97
BrMYB82-BrMYB135	BrMYB82	A03	MF2	BrMYB135	A05	LF	0.08	0.26	0.31	YES	0.87
BrMYB83-BrMYB132	BrMYB83	A03	MF2	BrMYB132	A05	LF	0.08	0.28	0.28	YES	0.95
BrMYB84-BrMYB131	BrMYB84	A03	MF2	BrMYB131	A05	LF	0.07	0.21	0.36	YES	0.68
BrMYB86-BrMYB128	BrMYB86	A03	MF2	BrMYB128	A05	LF	0.13	0.96	0.13	YES	3.2
BrMYB3R6-BrMYB3R7	BrMYB3R6	A03	MF2	BrMYB3R7	A05	LF	0.17	0.43	0.39	YES	1.45
BrMYB64-BrMYB133	BrMYB64	A03	MF1	BrMYB133	A05	LF	0.16	0.72	0.23	YES	2.4
BrMYB63-BrMYB134	BrMYB63	A03	MF1	BrMYB134	A05	LF	0.19	1.21	0.15	YES	4.03
BrMYB60-BrMYB148	BrMYB60	A03	MF1	BrMYB148	A06	LF	0.22	0.7	0.31	YES	2.33
BrMYB88-BrMYB166	BrMYB88	A03	MF2	BrMYB166	A07	LF	0.07	0.22	0.3	YES	0.72
BrMYB90-BrMYB165	BrMYB90	A03	MF2	BrMYB165	A07	LF	0.07	0.22	0.33	YES	0.75
BrMYB87-BrMYB191	BrMYB87	A03	MF2	BrMYB191	A08	MF1	0.4	1.45	0.28	YES	4.84
BrMYB96-BrMYB194	BrMYB96	A03	MF1	BrMYB194	A08	MF2	0.1	0.28	0.35	YES	0.95
BrMYB97-BrMYB195	BrMYB97	A03	MF1	BrMYB195	A08	MF2	0.1	0.34	0.28	YES	1.14
BrMYB94-BrMYB225	BrMYB94	A03	MF2	BrMYB225	A09	LF	0.12	0.68	0.17	YES	2.27
BrMYB92-BrMYB215	BrMYB92	A03	LF	BrMYB215	A09	MF2	0.09	0.38	0.24	YES	1.26
BrMYB3R6-BrMYB3R11	BrMYB3R6	A03	MF2	BrMYB3R11	A10	LF	0.38	1.92	0.2	YES	6.4
BrMYB57-BrMYB253	BrMYB57	A03	MF1	BrMYB253	A10	LF	0.07	0.55	0.13	YES	1.83
BrMYB58-BrMYB251	BrMYB58	A03	MF1	BrMYB251	A10	LF	0.01	0.33	0.03	YES	1.11
BrMYB59-BrMYB250	BrMYB59	A03	MF1	BrMYB250	A10	LF	0.09	0.65	0.14	YES	2.16
BrMYB60-BrMYB3R10	BrMYB60	A03	MF1	BrMYB3R10	A10	LF	0.09	0.16	0.55	YES	0.54
BrMYB3R5-BrMYB3R9	BrMYB3R5	A03	MF1	BrMYB3R9	A10	LF	0.1	0.48	0.21	YES	1.59
BrMYB61-BrMYB249	BrMYB61	A03	MF1	BrMYB249	A10	LF	0.08	0.23	0.34	YES	0.76
BrMYB62-BrMYB248	BrMYB62	A03	MF1	BrMYB248	A10	LF	0.08	0.3	0.26	YES	1.01
BrMYB63-BrMYB246	BrMYB63	A03	MF1	BrMYB246	A10	LF	0.07	0.43	0.16	YES	1.44
BrMYB64-BrMYB245	BrMYB64	A03	MF1	BrMYB245	A10	LF	0.08	0.37	0.21	YES	1.25
BrMYB87-BrMYB255	BrMYB87	A03	MF2	BrMYB255	Scaffold000164	-	0.07	0.16	0.46	YES	0.54
BrMYB114-BrMYB76	BrMYB114	A04	MF1	BrMYB76	A03	MF2	0.09	0.24	0.37	YES	0.79
BrMYB106-BrMYB211	BrMYB106	A04	LF	BrMYB211	A09	MF2	0.27	0.61	0.45	YES	2.04
BrMYB3R7-BrMYB3R2	BrMYB3R7	A05	LF	BrMYB3R2	A01	MF1	0.13	0.43	0.29	YES	1.45
BrMYB122-BrMYB76	BrMYB122	A05	LF	BrMYB76	A03	MF2	0.07	0.25	0.28	YES	0.83
BrMYB123-BrMYB75	BrMYB123	A05	LF	BrMYB75	A03	MF2	0.14	0.3	0.45	YES	1.01
BrMYB118-BrMYB116	BrMYB118	A05	LF	BrMYB116	A04	MF1	0.08	0.31	0.27	YES	1.03
BrMYB123-BrMYB113	BrMYB123	A05	LF	BrMYB113	A04	MF1	0.16	0.41	0.39	YES	1.38
BrMYB119-BrMYB228	BrMYB119	A05	LF	BrMYB228	A09	LF	0.3	1.86	0.16	YES	6.18
BrMYB126-BrMYB256	BrMYB126	A05	LF	BrMYB256	Scaffold000164	-	0.09	0.31	0.27	YES	1.05
BrMYB127-BrMYB254	BrMYB127	A05	LF	BrMYB254	Scaffold000164	-	0.06	0.44	0.13	YES	1.46
BrMYB150-BrMYB51	BrMYB150	A06	LF	BrMYB51	A02	MF1	0.27	0.45	0.6	YES	1.49
BrMYB151-BrMYB50	BrMYB151	A06	LF	BrMYB50	A02	MF1	0.12	0.33	0.36	YES	1.1
BrMYB152-BrMYB49	BrMYB152	A06	LF	BrMYB49	A02	MF1	0.1	0.35	0.28	YES	1.18
BrMYB147-BrMYB55	BrMYB147	A06	LF	BrMYB55	A02	MF1	0.06	0.25	0.23	YES	0.83
BrMYB146-BrMYB31	BrMYB146	A06	LF	BrMYB31	A02	MF2	0.13	0.93	0.14	YES	3.12
BrMYB148-BrMYB26	BrMYB148	A06	LF	BrMYB26	A02	MF2	0.19	0.9	0.21	YES	2.99
BrMYB156-BrMYB46	BrMYB156	A06	LF	BrMYB46	A02	MF1	0.04	0.24	0.15	YES	0.82
BrMYB140-BrMYB44	BrMYB140	A06	LF	BrMYB44	A02	MF1	0.14	0.73	0.19	YES	2.43
BrMYB160-BrMYB45	BrMYB160	A06	LF	BrMYB45	A02	MF1	0.19	0.74	0.25	YES	2.48
BrMYB160-BrMYB108	BrMYB160	A06	LF	BrMYB108	A04	LF	0.59	2.63	0.22	YES	8.78
BrMYB158-BrMYB107	BrMYB158	A06	LF	BrMYB107	A04	LF	0.31	2.6	0.12	YES	8.68
BrMYB140-BrMYB161	BrMYB140	A06	LF	BrMYB161	A06	LF	0.16	0.88	0.18	YES	2.92
BrMYB141-BrMYB190	BrMYB141	A06	LF	BrMYB190	A07	LF	0.25	0.86	0.29	YES	2.87
BrMYB137-BrMYB207	BrMYB137	A06	LF	BrMYB207	A08	MF1	0.08	0.3	0.28	YES	1
BrMYB139-BrMYB205	BrMYB139	A06	LF	BrMYB205	A08	MF1	0.03	0.34	0.08	YES	1.13
BrMYB138-BrMYB206	BrMYB138	A06	LF	BrMYB206	A08	MF1	0.07	0.33	0.23	YES	1.08
BrMYB159-BrMYB237	BrMYB159	A06	LF	BrMYB237	A09	MF2	0.06	0.33	0.17	YES	1.1
BrMYB151-BrMYB214	BrMYB151	A06	LF	BrMYB214	A09	MF2	0.09	0.27	0.34	YES	0.9
BrMYB147-BrMYB217	BrMYB147	A06	LF	BrMYB217	A09	MF2	0.07	0.22	0.32	YES	0.74
BrMYB138-BrMYB235	BrMYB138	A06	LF	BrMYB235	A09	MF2	0.11	0.4	0.28	YES	1.32
BrMYB149-BrMYB218	BrMYB149	A06	LF	BrMYB218	A09	MF2	0.07	0.31	0.23	YES	1.05
BrMYB158-BrMYB209	BrMYB158	A06	LF	BrMYB209	A09	MF2	0.1	0.45	0.23	YES	1.51
BrMYB156-BrMYB210	BrMYB156	A06	LF	BrMYB210	A09	MF2	0.06	0.36	0.18	YES	1.2
BrMYB169-BrMYB11	BrMYB169	A07	LF	BrMYB11	A01	MF1	0.3	1.9	0.16	YES	6.34
BrMYB176-BrMYB42	BrMYB176	A07	MF2	BrMYB42	A02	MF1	0.11	0.31	0.35	YES	1.04
BrMYB177-BrMYB41	BrMYB177	A07	MF2	BrMYB41	A02	MF1	0.17	0.41	0.42	YES	1.36
BrMYB181-BrMYB37	BrMYB181	A07	LF	BrMYB37	A02	MF1	0.11	0.35	0.31	YES	1.17
BrMYB167-BrMYB38	BrMYB167	A07	MF2	BrMYB38	A02	MF1	0.33	1.59	0.21	YES	5.3
BrMYB182-BrMYB38	BrMYB182	A07	LF	BrMYB38	A02	MF1	0.08	0.35	0.22	YES	1.16
BrMYB179-BrMYB38	BrMYB179	A07	MF2	BrMYB38	A02	MF1	0.07	0.34	0.21	YES	1.14
BrMYB169-BrMYB104	BrMYB169	A07	LF	BrMYB104	A03	MF1	0.29	3.46	0.08	YES	11.53
BrMYB173-BrMYB105	BrMYB173	A07	MF2	BrMYB105	A04	MF1	0.06	0.27	0.22	YES	0.89
BrMYB169-BrMYB111	BrMYB169	A07	LF	BrMYB111	A04	MF1	0.28	3.42	0.08	YES	11.38
BrMYB164-BrMYB129	BrMYB164	A07	LF	BrMYB129	A05	LF	0.14	0.48	0.29	YES	1.59
BrMYB174-BrMYB141	BrMYB174	A07	MF2	BrMYB141	A06	LF	0.26	1.17	0.23	YES	3.91
BrMYB185-BrMYB142	BrMYB185	A07	LF	BrMYB142	A06	LF	0.29	1.29	0.22	YES	4.29
BrMYB177-BrMYB143	BrMYB177	A07	MF2	BrMYB143	A06	LF	0.34	2.68	0.13	YES	8.95
BrMYB178-BrMYB183	BrMYB178	A07	MF2	BrMYB183	A07	LF	0.1	0.23	0.45	YES	0.75
BrMYB182-BrMYB167	BrMYB182	A07	LF	BrMYB167	A07	MF2	0.28	1.56	0.18	YES	5.2
BrMYB176-BrMYB188	BrMYB176	A07	MF2	BrMYB188	A07	LF	0.08	0.25	0.33	YES	0.85
BrMYB177-BrMYB186	BrMYB177	A07	MF2	BrMYB186	A07	LF	0.08	0.49	0.17	YES	1.62
BrMYB174-BrMYB190	BrMYB174	A07	MF2	BrMYB190	A07	LF	0.11	0.46	0.25	YES	1.53
BrMYB179-BrMYB167	BrMYB179	A07	MF2	BrMYB167	A07	MF2	0.27	1.48	0.18	YES	4.94
BrMYB186-BrMYB202	BrMYB186	A07	LF	BrMYB202	A08	MF1	0.37	1.56	0.23	YES	5.21
BrMYB178-BrMYB201	BrMYB178	A07	MF2	BrMYB201	A08	MF1	0.32	1.76	0.18	YES	5.88
BrMYB172-BrMYB229	BrMYB172	A07	MF2	BrMYB229	A09	LF	0.1	0.54	0.19	YES	1.79
BrMYB168-BrMYB224	BrMYB168	A07	MF2	BrMYB224	A09	LF	0.07	0.3	0.25	YES	1
BrMYB187-BrMYB231	BrMYB187	A07	LF	BrMYB231	A09	MF2	0.45	1.94	0.23	YES	6.48
BrMYB173-BrMYB230	BrMYB173	A07	MF2	BrMYB230	A09	LF	0.06	0.41	0.15	YES	1.35
BrMYB174-BrMYB234	BrMYB174	A07	MF2	BrMYB234	A09	MF2	0.24	1.21	0.2	YES	4.05
BrMYB182-BrMYB3R8	BrMYB182	A07	LF	BrMYB3R8	A09	LF	0.26	1.43	0.18	YES	4.78
BrMYB184-BrMYB233	BrMYB184	A07	LF	BrMYB233	A09	MF2	0.23	1.43	0.16	YES	4.77
BrMYB185-BrMYB232	BrMYB185	A07	LF	BrMYB232	A09	MF2	0.28	1.09	0.25	YES	3.64
BrMYB177-BrMYB231	BrMYB177	A07	MF2	BrMYB231	A09	MF2	0.37	2.82	0.13	YES	9.4
BrMYB169-BrMYB225	BrMYB169	A07	LF	BrMYB225	A09	LF	0.27	1.54	0.18	YES	5.15
BrMYB199-BrMYB2	BrMYB199	A08	MF2	BrMYB2	A01	LF	0.06	0.41	0.15	YES	1.38
BrMYB199-BrMYB104	BrMYB199	A08	MF2	BrMYB104	A03	MF1	0.11	0.33	0.33	YES	1.1
BrMYB192-BrMYB136	BrMYB192	A08	MF1	BrMYB136	A06	LF	0.07	0.36	0.19	YES	1.22
BrMYB203-BrMYB142	BrMYB203	A08	MF1	BrMYB142	A06	LF	0.11	0.3	0.36	YES	1
BrMYB200-BrMYB163	BrMYB200	A08	MF2	BrMYB163	A06	MF1	0.06	0.28	0.23	YES	0.92
BrMYB204-BrMYB233	BrMYB204	A08	MF1	BrMYB233	A09	MF2	0.1	0.44	0.23	YES	1.47
BrMYB3R8-BrMYB38	BrMYB3R8	A09	LF	BrMYB38	A02	MF1	0.3	1.2	0.25	YES	4.01
BrMYB226-BrMYB95	BrMYB226	A09	LF	BrMYB95	A03	MF2	0.1	0.24	0.44	YES	0.8
BrMYB222-BrMYB98	BrMYB222	A09	LF	BrMYB98	A03	MF1	0.22	3.47	0.06	YES	11.57
BrMYB230-BrMYB105	BrMYB230	A09	LF	BrMYB105	A04	MF1	0.08	0.39	0.21	YES	1.31
BrMYB213-BrMYB154	BrMYB213	A09	MF2	BrMYB154	A06	LF	0.1	0.23	0.44	YES	0.75
BrMYB227-BrMYB171	BrMYB227	A09	LF	BrMYB171	A07	MF2	0.09	0.2	0.45	YES	0.68
BrMYB234-BrMYB190	BrMYB234	A09	MF2	BrMYB190	A07	LF	0.24	0.95	0.25	YES	3.16
BrMYB220-BrMYB219	BrMYB220	A09	MF1	BrMYB219	A09	MF1	0.07	0.33	0.2	YES	1.11
BrMYB252-BrMYB15	BrMYB252	A10	LF	BrMYB15	A01	MF1	0.16	0.95	0.16	YES	3.16
BrMYB253-BrMYB3R1	BrMYB253	A10	LF	BrMYB3R1	A01	MF1	0.53	1.85	0.28	YES	6.18
BrMYB3R11-BrMYB3R2	BrMYB3R11	A10	LF	BrMYB3R2	A01	MF1	0.34	2.77	0.12	YES	9.23
BrMYB239-BrMYB34	BrMYB239	A10	LF	BrMYB34	A02	MF2	0.03	0.31	0.09	YES	1.03
BrMYB247-BrMYB27	BrMYB247	A10	LF	BrMYB27	A02	MF2	0.04	0.3	0.13	YES	1.01
BrMYB244-BrMYB29	BrMYB244	A10	LF	BrMYB29	A02	MF2	0.11	0.26	0.43	YES	0.88
BrMYB242-BrMYB30	BrMYB242	A10	LF	BrMYB30	A02	MF2	0.07	0.2	0.34	YES	0.67
BrMYB238-BrMYB35	BrMYB238	A10	LF	BrMYB35	A02	MF2	0.12	0.32	0.38	YES	1.07
BrMYB246-BrMYB28	BrMYB246	A10	LF	BrMYB28	A02	MF2	0.08	0.46	0.17	YES	1.52
BrMYB3R10-BrMYB26	BrMYB3R10	A10	LF	BrMYB26	A02	MF2	0.08	0.35	0.22	YES	1.18
BrMYB250-BrMYB51	BrMYB250	A10	LF	BrMYB51	A02	MF1	0.48	1.54	0.31	YES	5.15
BrMYB241-BrMYB31	BrMYB241	A10	LF	BrMYB31	A02	MF2	0.04	0.29	0.15	YES	0.95
BrMYB244-BrMYB65	BrMYB244	A10	LF	BrMYB65	A03	MF1	0.13	0.29	0.44	YES	0.97
BrMYB241-BrMYB66	BrMYB241	A10	LF	BrMYB66	A03	MF1	0.04	0.37	0.1	YES	1.23
BrMYB240-BrMYB67	BrMYB240	A10	LF	BrMYB67	A03	MF1	0.05	0.45	0.11	YES	1.51
BrMYB238-BrMYB70	BrMYB238	A10	LF	BrMYB70	A03	MF1	0.08	0.46	0.18	YES	1.52
BrMYB236-BrMYB74	BrMYB236	A10	LF	BrMYB74	A03	MF2	0.32	1.3	0.25	YES	4.34
BrMYB236-BrMYB112	BrMYB236	A10	LF	BrMYB112	A04	MF1	0.25	1.34	0.19	YES	4.46
BrMYB242-BrMYB122	BrMYB242	A10	LF	BrMYB122	A05	LF	0.42	2.51	0.17	YES	8.37
BrMYB245-BrMYB133	BrMYB245	A10	LF	BrMYB133	A05	LF	0.17	0.88	0.19	YES	2.95
BrMYB252-BrMYB130	BrMYB252	A10	LF	BrMYB130	A05	LF	0.17	1.18	0.14	YES	3.94
BrMYB252-BrMYB134	BrMYB252	A10	LF	BrMYB134	A05	LF	0.19	1.09	0.18	YES	3.65
BrMYB241-BrMYB146	BrMYB241	A10	LF	BrMYB146	A06	LF	0.14	0.8	0.17	YES	2.68

Abbreviations: LF: Less Fractioned subgenome; MFs (MF1 and MF2), More Fractioned subgenomes; MYA, million year ago.

Back to article page

ISSN: 1471-2164

Contact us

Submission enquiries: bmcgenomics@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com

BMC Genomics

Contact us