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Clean reads
|
16 847 232 ± 1 528 242
|
3 332 304 ± 635 063
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15 403 441 ± 1 282 332
|
2 394 590 ± 675 288
|
18 622 662 ± 1 208 043
|
3 643 737 ± 1 094 125
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9311 rice genome
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10 249 097 ± 1 228 933 (60.8 %)
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1 480 850 ± 296 597 (44.4 %)
|
10 647 829 ± 1 682 873 (69.1 %)
|
793 346 ± 194 986 (33.1 %)
|
13 818 525 ± 2 320 473 (74.2 %)
|
1 614 944 ± 469 863 (44.3 %)
|
|
Exon antisense
|
123 658 ± 31 951 (0.7 %)
|
37 913 ± 10 407 (1.1 %)
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143 789 ± 58 608 (0.9 %)
|
29 918 ± 8184 (1.3 %)
|
135 144 ± 31 018 (0.7 %)
|
43 449 ± 9513 (1.2 %)
|
|
Exon sense
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148 224 ± 44 300 (0.9 %)
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84 852 ± 23 724 (2.6 %)
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159 436 ± 46 424 (1.0 %)
|
80 885 ± 14 721 (3.4 %)
|
184 756 ± 32 941 (1.0 %)
|
85 802 ± 26 065 (2.4 %)
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Intron antisense
|
115 867 ± 30 826 (0.7 %)
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50 016 ± 10 263 (1.5 %)
|
50 944 ± 20 434 (0.3 %)
|
26 964 ± 7620 (1.1 %)
|
132 987 ± 40 799 (0.7 %)
|
55 629 ± 15 460 (1.5 %)
|
|
Intron sense
|
188 761 ± 62 005 (1.1 %)
|
58 543 ± 12 020 (1.8 %)
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83 925 ± 30 603 (0.5 %)
|
33 330 ± 8440 (1.4 %)
|
182 440 ± 36 679 (1.0 %)
|
62 038 ± 15 960 (1.7 %)
|
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Known miRNA
|
4 457 106 ± 1 511 316 (26.5 %)
|
6037 ± 490 (0.2 %)
|
6 769 286 ± 1 144 378 (44.0 %)
|
5598 ± 985 (0.2 %)
|
5 404 163 ± 2 597 947 (29.0 %)
|
5759 ± 556 (0.2 %)
|
|
rRNA
|
1 046 140 ± 299 191 (6.2 %)
|
77 037 ± 12 331 (2.3 %)
|
1 785 015 ± 239 128 (11.6 %)
|
102 438 ± 13 644 (4.3 %)
|
699 723 ± 182 679 (3.8 %)
|
65 568 ± 9341 (1.8 %)
|
|
Repeat
|
2 433 147 ± 506 069 (14.4 %)
|
1 005 986 ± 166 997 (30.2 %)
|
1 547 941 ± 684 735 (10.1 %)
|
666 553 ± 189 898 (27.8 %)
|
2 609 401 ± 865 194 (14.0 %)
|
1 029 967 ± 288 440 (28.3 %)
|
|
snRNA
|
10 215 ± 4326 (0.1 %)
|
2250 ± 489 (0.1 %)
|
17 203 ± 1154 (0.1 %)
|
3136 ± 391 (0.1 %)
|
5920 ± 907 (0.0 %)
|
1566 ± 175 (0.0 %)
|
|
snoRNA
|
18 859 ± 5210 (0.1 %)
|
3261 ± 677 (0.1 %)
|
9806 ± 2330 (0.1 %)
|
2986 ± 598 (0.1 %)
|
9433 ± 2721 (0.1 %)
|
2816 ± 263 (0.1 %)
|
|
tRNA
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2 428 011 ± 1 192 154 (14.4 %)
|
18 784 ± 3404 (0.6 %)
|
2 035 604 ± 2 480 765 (13.2 %)
|
18 371 ± 3104 (0.8 %)
|
4 904 192 ± 5 445 456 (26.3 %)
|
17 397 ± 3844 (0.5 %)
|
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Unannotated
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5 877 246 ± 1 887 347 (34.9 %)
|
1 987 625 ± 398 270 (59.7 %)
|
2 800 494 ± 1 023 410 (18.2 %)
|
1 424 411 ± 473 219 (59.5 %)
|
4 354 504 ± 1 328 748 (23.4 %)
|
2 273 749 ± 737 311 (62.4 %)
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