Skip to main content

Table 3 Pairwise Ka/Ks estimates for ZP ortholog pairs

From: Gonadal transcriptomics elucidate patterns of adaptive evolution within marine rockfishes (Sebastes)

ZP ID S. goodei EST ID S. saxicola EST ID Method Ka Ks Ka/Ks Nuc. length
ZPAX TesSgooContig1520 Contig7124 YN 0.008 0.028 0.304 468
ZPB SgooContig582 Contig2319 YN 0.007 0.015 0.435 663
ZPB homolog 1 TesSgooContig1769 Contig9672 YN 0.048 0.042 1.136 402
ZPB homolog 2 SgooContig184 Contig10146 YN 0.003 0.03 0.11 402
ZPC homolog 1 SgooContig366 Saxicola_C47406 YN 0.011 0.061 0.186 342
ZPC homolog 2 SgooContig166 Contig6798 YN 0.009 0.034 0.274 957
ZPC1 SgooContig100 Contig18166 YN 0.002 0.013 0.187 558
ZPC3 SgooContig80 Contig9633 YN 0.005 0.021 0.253 525
ZPC4 SgooContig309 Contig20794 YN 0.005 0.012 0.381 300
ZPC5 SgooContig179 Contig9252 YN 0.006 0.026 0.223 471
  1. Bold face indicates an ortholog pair that is found under positive selection