Skip to main content

Table 3 Pairwise Ka/Ks estimates for ZP ortholog pairs

From: Gonadal transcriptomics elucidate patterns of adaptive evolution within marine rockfishes (Sebastes)

ZP ID

S. goodei EST ID

S. saxicola EST ID

Method

Ka

Ks

Ka/Ks

Nuc. length

ZPAX

TesSgooContig1520

Contig7124

YN

0.008

0.028

0.304

468

ZPB

SgooContig582

Contig2319

YN

0.007

0.015

0.435

663

ZPB homolog 1

TesSgooContig1769

Contig9672

YN

0.048

0.042

1.136

402

ZPB homolog 2

SgooContig184

Contig10146

YN

0.003

0.03

0.11

402

ZPC homolog 1

SgooContig366

Saxicola_C47406

YN

0.011

0.061

0.186

342

ZPC homolog 2

SgooContig166

Contig6798

YN

0.009

0.034

0.274

957

ZPC1

SgooContig100

Contig18166

YN

0.002

0.013

0.187

558

ZPC3

SgooContig80

Contig9633

YN

0.005

0.021

0.253

525

ZPC4

SgooContig309

Contig20794

YN

0.005

0.012

0.381

300

ZPC5

SgooContig179

Contig9252

YN

0.006

0.026

0.223

471

  1. Bold face indicates an ortholog pair that is found under positive selection